J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Créé le 08 juin 1998
Dernière mise à jour le 06 novembre 2002

ACTINOBACTERIA, ACTINOBACTERIDAE

Au sein du domaine (ou de l’empire) des Bacteria, il existe un phyllum constitué par des bactéries à Gram positif dont le G + C p. cent est supérieur (sauf quelques exceptions) à 50. Ce phyllum rassemble des micro-organismes pouvant avoir des caractères phénotypiques variés mais qui descendent tous d’un ancêtre commun. Dans le passé, ces bactéries ont été placées dans des genres, des familles, des tribus et des ordres sur la base de leurs caractères phénotypiques. En 1997, Stackebrandt et al. proposent une nouvelle classification qui, à l’exception des genres et des espèces, repose uniquement sur l’analyse des séquences des ARNr 16S et des gènes codant pour les ARNr 16S ainsi que sur la présence de "séquences signatures".

Ces auteurs définissent une nouvelle classe, la classe des Actinobacteria divisée en 5 sous-classes : Acidimicrobidae, Rubrobacteridae, Coriobacteridae, Sphaerobacteridae et Actinobacteridae. Chacune de ces sous-classes est constituée de un ou de plusieurs ordres eux-mêmes constitués de une ou de plusieurs familles. Dans la sous-classe des Actinobacteridae, l’ordre des Actinomycetales est subdivisé en 10 sous-ordres (Actinomycineae, Propionibacterineae, Micrococcineae, Corynebacterineae, Pseudonocardineae, Streptomycineae, Streptosporangineae, Micromonosporineae, Micromonosporineae et Glycomycineae).
En Janvier 2000, une nouvelle famille, la famille des Actinosynnemataceae, a été incluse dans le sous-ordre des Pseudonocardineae.
En mai 2000, la classification du sous-ordre des Micrococcineae a été modifiée avec la description de trois nouvelles familles (Bogoriellaceae, Dermacocccaceae et Sanguibacteraceae) et la modification de la description des familles des Dermatophilaceae, Cellulomonadaceae et Intrasporangiaceae.

Rappelons que la définition des rangs hiérarchiques supra-génériques, telle qu’elle est proposée par Stackebrandt et al., repose uniquement sur des critères phylogénétiques et, à titre d’exemple, la classe des Actinobacteria se définit comme un ensemble de souches présentant plus de 80 p. cent de similitude dans la séquence des ARNr 16S ou ADNr 16S et possédant un résidu adénine à la position 906 et un résidu adénine ou cytosine à la position 955 (à l’exception des sous-classes Rubrobacteridae et Sphaerobacteridae où l’on trouve un résidu uracile à la position 955). En revanche, la définition des genres demeure inchangée et repose principalement sur des caractères phénotypiques.

A l'exception de la sous-classe des Coriobacteridae qui renferme notamment le genre Atopobium (dont l'espèce ¤ Atopobium fossor) et le genre ¤ Denitrobacterium, seule la sous-classe des Actinobacteridae regroupe des bactéries dont certaines ont un intérêt en médecine vétérinaire. La classification de cette sous-classe est présentée de manière synthétique dans le tableau I.

Orientation bibliographique

LABEDA (D.P.) et KROPPENSTEDT (R.M.) : Phylogenetic analysis of Saccharothrix and related taxa: proposal for Actinosynnemataceae fam. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2000, 50, 331-336.

STACKEBRANDT (E.), RAINEY (F.A.) et WARD-RAINEY (N.L.) : Proposal for a new hierarchic classification system, Actinobacteria classis nov. Int. J. Syst. Bacteriol., 1997, 47, 479-491.

STACKEBRANDT (E.) et SCHUMANN (P.) : Description of Bogoriellaceae fam. nov., Dermacoccaceae fam. nov., Rarobacteraceae fam. nov. and Sanguibacteraceae fam. nov. and emendation of some families of the suborder Micrococcineae. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2000, 50, 1279-1285.

WOESE (C.R.) : Bacterial evolution. Microbiol. Rev., 1987, 51, 221-271.

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