J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 27 avril 2004
AERISCARDOVIA, AERISCARDOVIA AERIPHILA
Autre dénomination :
Aeriscardovia aeriphila : "Bifidobacterium aerophilum".
En 2003, la présence d'une fructose-6-phosphate phosphocétolase permet à Simpson et al. de placer 160 souches bactériennes isolées d'un caecum de porc dans le genre Bifidobacterium*. L'analyse des fragments de macrorestriction obtenus avec l'enzyme XbaI et l'étude de la séquence des ARNr 16S permettent à ces auteurs de reconnaître deux nouvelles espèces qu'ils dénomment "Bifidobacterium psychroaerophilum" et "Bifidobacterium aerophilum". L'analyse phylogénétique révèle que "Bifidobacterium psychroaerophilum" appartient au genre Bifidobacterium sensu stricto (voir le fichier ¤ Bifidobacterium psychraerophilum) alors que "Bifidobacterium aerophilum" est apparenté aux genres Parascardovia** et Scardovia**.
La détermination du G + C p. cent et le séquençage du gène codant pour la protéine du choc thermique de 60 kDa montrent que "Bifidobacterium aerophilum" constitue un nouveau genre et une nouvelle espèce pour lesquels, le 11 mars 2004, Simpson et al. valident les nomenclatures de Aeriscardovia et de Aeriscardovia aeriphila.
La définition du genre Aeriscardovia est la suivante.
Bacilles à Gram positif, courts et de forme irrégulière, immobiles, non sporulés, catalase et oxydase négatives.
La croissance est optimale lorsque les souches sont cultivées en anaérobiose. En aérobiose, la culture permet d'observer des bacilles allongés.
Le G + C p. cent est de 54,7 soit une valeur inférieure au G + C p. cent des Bifidobacterium sp. qui est compris entre 55 et 67.
L'espèce Aeriscardovia aeriphila rassemble des bacilles de 0,6 à 0,9 µm de diamètre sur 0,8 à 1,5 µm de longueur, se présentant de manière isolée ou groupés par deux. Après culture en aérobiose, des formes de 4 à 6 µm de longueur peuvent également être observées.
Les caractères biochimiques ont été étudiés à l'aide de galeries API 20A et API Rapid ID32A.
. Les souches de Aeriscardovia aeriphila donnent une réponse positive aux tests alpha-fucosidase, alpha-galactosidase, bêta-galactosidase, alpha-glucosidase, bêta-glucosidase, alpha-arabinosidase, arginine arylamidase, proline arylamidase, phénylalanine arylamidase, leucine arylamidase, tyrosine arylamidase, glycine arylamidase, histidine arylamidase, sérine arylamidase, fermentation de l'arabinose, du glucose, du maltose, du mannose (réaction faiblement positive), du raffinose et de la salicine.
. Les souches de Aeriscardovia aeriphila donnent une réponse négative aux tests nitrate réductase, uréase, indole, hydrolyse de la gélatine, phosphatase alcaline, bêta-galactosidase-6-phosphate, bêta-glucuronidase, N-acétyl-bêta-glucosaminidase, acide glutamique décarboxylase, leucyl glycine arylamidase, alanine arylamidase, glutamyl acide glutamique arylamidase, fermentation du cellobiose, du glycérol, du lactose, du mannitol, du rhamnose, du sorbitol et du tréhalose.
. Un caractère variable selon les souches est noté pour la fermentation du mélézitose, du saccharose et du xylose.
La température optimale de croissance est de 37 °C et aucune culture n'est obtenue au-dessus de 46 °C ou au-dessous de 30 °C.
En anaérobiose, les colonies obtenues sur une gélose MRS*** contenant 0,5 g/L de chlorydrate de cystéine sont blanches ou grisâtres, circulaires, plates ou convexes, à contour régulier et leur diamètre est d'environ 3 mm après trois jours d'incubation à 37 °C.
Des colonies sont également obtenues après incubation en aérobiose mais leur diamètre ne dépasse pas 1 mm après 5 jours d'incubation.
Les principaux caractères permettant de différencier les genres Aeriscardovia, Bifidobacterium, Parascardovia et Scardovia sont donnés dans le tableau I.
Aeriscardovia aeriphila pourrait avoir pour habitat l'alimentation des porcs ou pourrait être un hôte normal du caecum du porc.
Orientation bibliographique
SIMPSON (P.J.), ROSS (R.P.), FITZGERALD (G.F.) et STANTON (C.) : Bifidobacterium psychraerophilum sp. nov. and Aeriscardovia aeriphila gen. nov., sp. nov., isolated from a porcine caecum. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 401-406.
SIMPSON (P.J.), STANTON (C.), FITZGERALD (G.F.) et ROSS (R.P.) : Genomic diversity and relatedness of bifidobacteria isolated from a porcine cecum. J. Bacteriol., 2003, 185, 2571-2581.
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Les espèces du genre Bifidobacterium sont des bacilles à Gram positif, non acido-résistants, très polymorphes (Cf. infra), immobiles, non sporulés, anaérobies (certaines espèces tolèrent cependant l'oxygène en présence de dioxyde de carbone et ¤ Bifidobacterium psychraerophilum cultive faiblement en aérobiose), catalase négative (à l'exception de Bifidobacterium asteroides qui est catalase positive lorsque les souches sont cultivées en présence d'air et de Bifidobacterium indicum qui est catalase positive lorsque la culture est effectuée en présence d'air et dans un milieu qui contient de l'hémine), nitrate réductase négative (sauf si la culture est effectuée en présence de globules rouges lysés), synthétisant une fructose-6-phosphate phosphocétolase ou EC 4.1.2.22 (enzyme clé du métabolisme des hexoses qui s'effectue selon une voie qualifiée de "bifid shunt"), fermentant le glucose sans production de gaz et produisant de l'acide acétique et de l'acide lactique comme produits terminaux de la fermentation du glucose.
La morphologie est variable selon les espèces et l'aspect bifide n'est pas constant. Par exemple, Bifidobacterium animalis, Bifidobacterium bifidum et Bifidobacterium longum (souches des trois biovars) sont des bacilles généralement bifides alors que Bifidobacterium coryneforme ou Bifidobacterium minimum ressemblent à des corynébactéries.
Les milieux de culture les plus adaptés sont les milieux TGY (trypticase, glucose, extraits de levure), TPY (trypticase phytone, extraits de levure) et TPYG (trypticase phytone, extraits de levure, glucose). Les colonies obtenues après incubation à 37 °C en anaérobiose sont lisses, convexes, à contour régulier, de couleur blanche ou crème et leur diamètre est d'environ 1 à 2 mm.
Quelques caractères permettant de différencier les Bifidobacterium sp. des genres apparentés sont donnés dans le tableau I.
Les bifidobactéries sont le plus souvent présentes dans l'intestin de l'homme et des animaux (y compris chez des insectes comme les abeilles qui hébergent Bifidobacterium coryneforme, Bifidobacterium indicum et Bifidobacterium minimum) et elles peuvent être isolées des eaux usées.
. Quelques espèces comme Bifidobacterium bifidum, Bifidobacterium breve, Bifidobacterium dentium ou Bifidobacterium longum biovar Infantis peuvent également coloniser le vagin de la femme.
. Bifidobacterium dentium a pour habitat la cavité orale de l'homme, mais cette espèce est également retrouvée dans les fèces et dans le vagin.
. Bifidobacterium lactis (qui est peut-être une sous-espèce de Bifidobacterium animalis) est isolé de laits fermentés et Bifidobacterium thermacidophilum n'a été isolé que des eaux usées d'une station d'épuration.
. Bifidobacterium denticolens et Bifidobacterium inopinatum, isolés de caries dentaires chez l'homme, ne sont plus considérés comme des Bifidobacterium sp. Bifidobacterium denticolens a été transféré dans le genre Parascardovia et l'espèce Bifidobacterium inopinatum dans le genre Scardovia.
Bifidobacterium adolescentis, Bifidobacterium breve et Bifidobacterium longum sont occasionnellement mis en évidence dans des prélèvements cliniques, mais les espèces douées du plus fort pouvoir pathogène potentiel sont Bifidobacterium dentium isolé notamment de caries et d'abcès et Bifidobacterium scardovii isolé de divers prélèvements d'origine humaine (sang d'une femme âgée de 50 ans, urines de patients âgés, hanche d'une femme de 44 ans).
Les Bifidobacterium sp. s'opposent à l'implantation intestinale des bactéries à l'origine de putréfaction et de bactéries pathogènes si bien que différentes souches de Bifidobacterium animalis, de Bifidobacterium bifidum, de Bifidobacterium breve, de Bifidobacterium longum biovar Infantis, de Bifidobacterium lactis, de Bifidobacterium longum... sont utilisées comme probiotiques.
** : Les genres Parascardovia et Scardovia
Les genres Parascardovia et Scardovia ont été validement publiés le 15 mai 2002 pour reclasser Bifidobacterium denticolens (Parascardovia denticolens) et Bifidobacterium inopinatum (Scardovia inopinata). Ces reclassements sont basés sur l'analyse des séquences des ARNr 16S, sur l'analyse des séquences des gènes codant pour la protéine du choc thermique de 60 kDa et sur la valeur du G + C p. cent.
Quelques caractères permettant de différencier les genres Parascardovia et Scardovia des genres apparentés sont donnés dans le tableau I.
Référence: JIAN (W.) et DONG (X.) : Transfer of Bifidobacterium inopinatum and Bifidobacterium denticolens to Scardovia inopinata gen. nov., comb. nov., and Parascardovia denticolens gen. nov., comb. nov., respectively. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 809-812.
*** : Composition (pour un litre de milieu) de la gélose MRS (DeMan, Rogosa et Sharpe) :
Glucose : 20,0 g
Peptone : 10,0 g
Agar : 10,0 g
Extraits de viande de bœuf : 8,0 g
Acétate de sodium, 3H2O : 5,0 g
Extraits de levure : 4,0 g
K2HPO4 : 2,0 g
Citrate d'ammonium : 2,0 g
MgSO4.7H2O : 0,2 g
MnSO4.4H2O : 0,05 g
Tween 80 : 1,0 mL