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Créé le 25 septembre 2002
AFIPIA
Voir aussi le fichier ¤ Maladie des griffes du chat.
Systématique
L'étiologie de la maladie des griffes du chat (MGC) a longtemps été controversée. En 1983, Wear et al. demandent la réalisation d’une imprégnation argentique (méthode de Warthin-Starry) sur une coupe de nœud lymphatique d’une fillette de 11 ans suspecte d’être atteinte de MGC. Cette coloration révèle la présence de nombreuses bactéries polymorphes qui se révèlent à Gram négatif lorsque l’on utilise une coloration de Gram adaptée à la recherche des bactéries dans les tissus (technique de Brown et Hopps modifiée). Ultérieurement, d’autres auteurs mettront en évidence de tels bacilles dans les nœuds lymphatiques des malades. Les bactéries de 0,3 à 1,0 µm de diamètre sur 0,6 à 3,0 µm de longueur se présentent de manière isolée ou groupée en chaînes et en amas, elles sont localisées dans la paroi des capillaires, dans les macrophages bordant les sinusoïdes, dans les histiocytes des foyers nécrotiques et dans les débris nécrotiques des micro-abcès. En 1984, Margileth et al. retrouvent des bactéries morphologiquement identiques dans les lésions cutanées de trois malades atteints de MGC.
L’existence de bactéries dans les lésions des patients atteints de MGC a stimulé les essais d’isolement in vitro et, en 1988, English et al. obtiennent les premières cultures bactériennes à partir de nœuds lymphatiques.
English et al. transmettent cette souche, appelée souche G1492 (= B-91-007352 = AFIP strain BV = F6400 = ATCC 53690), au CDC d’Atlanta qui montre qu'elle se caractérise par la possession d’un acide gras particulier, l’acide 11-méthyl-12 octadécénoïque. Cet acide gras, exceptionnellement présent dans le monde bactérien, a également été retrouvé chez une souche bactérienne isolée d’une biopsie de tibia pratiquée à la Cleveland Clinic Foundation. Cette souche, constituée de bactéries similaires à celles de la souche G1492, a été appelée souche G1849 (= B-91-007353 = F6703 = G 1849 = 411m = ATCC 49720).
En 1991, Brenner et al. soumettent à des tests phénotypiques et génotypiques 11 souches bactériennes phénotypiquement apparentées : la souche G1492, la souche G1849, trois souches provenant de malades atteints de MGC et isolées au CDC d’Atlanta en cultures cellulaires et six souches d’origine diverse (1 souche a été isolée de l’eau et 5 souches ont été isolées de prélèvements humains).
En 2000, La Scola et al. publient les résultats d'une étude portant sur 68 souches provenant d'échantillons d'eau d'un hôpital de Marseille et isolées soit par co-culture avec des amibes** soit par culture sur géloses BCYE*** (gélose BCYE contenant 500 unités de colistine par mL ou gélose BCYE contenant 500 unités de colistine et 10 µg de vancomycine par mL). Soixante-cinq de ces souches appartiennent au groupe alpha des Proteobacteria et plusieurs souches sont apparentées au genre Afipia. Cinq des souches isolées par co-culture et apparentées aux Afipia sp. ont fait l'objet d'études complémentaires. L'analyse des séquences des ARNr 16S révèle une parenté avec les Afipia sp. et les hybridations ADN - ADN montrent (i) que deux souches constituent une genomospecies apparentée à la genomospecies 3 et (ii) que trois souches forment trois nouvelles genomospecies.
Les séquences des ARNr 16S de plusieurs autres genomospecies de Afipia sp. sont disponibles dans la base de données GenBank mais aucune description et/ou aucune souche ne sont actuellement disponibles.
Les analyses phylogénétiques montrent que le genre Afipia appartient à la division (ou phylum) des Proteobacteria à la classe des "Alphaproteobacteria", à l'ordre des "Rhizobiales" et à la famille des "Bradyrhizobiaceae" et qu'il est apparenté à Bradyrhizobium japonicum, aux Blastobacter sp. et aux Rhodospeudomonas sp.
Caractères bactériologiques
La description de nouvelles espèces au sein du genre Afipia ont conduit La Scola et al. (2002) à modifier la description de ce genre qui est la suivante :
Outre les caractères communs à toutes les espèces du genre, la description de Afipia felis est la suivante : bacilles de 0,2 à 0,5 µm de diamètre sur 0,2 à 2,5 µm de longueur, donnant des formes polymorphes lorsqu’une culture effectuée à 32 °C est placée à 37 °C durant trois semaines.
Habitat et pouvoir pathogène
L'habitat des Afipia sp. n'est pas connu avec certitude mais les souches de Afipia birgiae, de Afipia felis genomospecies A, de Afipia genomospecies 3, de Afipia genomospecies 3-related et de Afipia massiliensis ont été isolées d'échantillons d'eau et Müller (1995) signale également qu'il a isolé plusieurs souches de Afipia sp. de l'eau de boisson. Afipia birgiae, Afipia felis genomospecies A, Afipia genomospecies 3, Afipia genomospecies 3-related, Afipia massiliensis ainsi que Afipia felis, sont aptes à cultiver en association avec des amibes.
La présence des Afipia sp. dans l'eau et une vie endosymbiotique dans les amibes pourraient être à l'origine d'infections nosocomiales. Le rôle de Afipia clevelandensis comme agent d'une infection nosocomiale est fortement suspecté car l'unique souche de cette espèce a été mise en évidence chez un patient hospitalisé depuis plusieurs mois et des anticorps anti-Afipia clevelandensis ont été détectés chez des patients atteints d'infections nosocomiales. Il faut cependant remarquer qu'il existe des réactions antigéniques croisées entre Afipia clevelandensis et les Brucella sp. ou ¤ Yersinia enterocolitica O:9 et que les résultats des examens sérologiques doivent être pris avec précaution.
Afipia felis Afipia felis est une bactérie intracellulaire facultative. In vitro, elle se multiplie dans des cultures cellulaires (cultures primaires de macrophages humains, cellules HeLa, cellules endothéliales humaines HMEC-1) et in vivo elle est présente dans les macrophages et dans les cellules endothéliales. Dans les macrophages, elle se multiplie après avoir inhibé la fusion phagosome-lysosome. Le rôle étiologique de Afipia felis dans la maladie des griffes du chat est encore controversé.
Les principaux arguments en faveur d'une responsabilité de Afipia felis dans la MGC sont les suivants :
Inversement, d'autres arguments vont à l'encontre du rôle de Afipia felis :
En fait, il semble que Afipia felis soit bien responsable de MGC mais qu'elle soit beaucoup moins fréquemment impliquée que les Bartonella sp. (voir les fichiers ¤ Bartonella clarridgeiae et ¤ Bartonella henselae). Il faut cependant remarquer que dans de nombreuses études récentes, les investigations ne portent que sur la recherche ou la caractérisation des Bartonella sp. (notamment de ¤ Bartonella henselae) et qu'il est donc difficile d'apprécier l'importance réelle de Afipia felis.
Comme d'autres espèces du genre, Afipia felis est certainement capable de survivre dans le milieu extérieur (Cf. supra). Dans ces conditions, le chat et éventuellement d'autres espèces animales pourraient jouer le rôle de simples vecteurs mécaniques portant le germe sur leurs griffes ou dans leur bouche.
Autres taxons du genre Afipia Les autres espèces et genomospecies du genre Afipia ne sont pas associées à la MGC mais certaines d'entre elles sont considérées comme des bactéries pathogènes opportunistes pour les individus âgés ou présentant une affection débilitante. L'unique souche (la souche G1849 = B-91-007353 = F6703 = G 1849 = 411m = ATCC 49720) de Afipia clevelandensis a été obtenue à partir d’une biopsie de tibia effectuée chez un homme de 69 ans. Le pouvoir pathogène de cette espèce est incertain et l'infection semble avoir eu pour origine une transmission nosocomiale. Les souches de Afipia broomeae ont été isolées de crachats, de la moelle osseuse d’une femme âgée de 81 ans et du liquide synovial d’un homme âgé de 60 ans, diabétique et atteint d’artériosclérose. La souche B-91-007287 = ATCC 49721 de Afipia genomospecies 1 provient d’un liquide pleural. La souche B-91-007290 = ATCC 49722 de Afipia genomospecies 2 a été retrouvée dans un liquide de lavage bronchique chez une femme de 80 ans. La souche B-91-007291 = ATCC 49723 de Afipia genomospecies 3 et les deux souches de de Afipia genomospecies 3-related, isolées de l’eau, sont cependant considérée comme potentiellement pathogènes par Brenner et al. et par La Scola et al. La souche 34632 (= CIP 106344 = CCUG 43108) de Afipia birgiae, la souche 76713 (= CIP 106335 = CCUG 43109) de Afipia felis genomospecies A et la souche 34633 (= CIP 107022 = CCUG 45153) de Afipia massiliensis ont été isolées de l'eau mais La Scola et al. n'excluent pas l'existence d'un éventuel pouvoir pathogène (possibilité d'infections nosocomiales).
Diagnostic
Identification de Afipia felis lors d'infections Afipia felis cultive sur gélose au sang frais et sur gélose BCYE, incubées à 25 - 30 °C dans une atmosphère normale. À l'isolement, les colonies apparaissent en 10 à 15 jours et en trois jours lors des repiquages.
Outre la bactérioscopie et la recherche des caractères biochimiques, l'identification peut avoir recours à l'immunofluorescence directe avec des sérums spécifiques ou à l'analyse du chromatogramme des acides gras de la paroi.
La recherche des anticorps anti-Afipia felis fait appel à l'immunofluorescence ou à l'ELISA. Ces tests n'ont pas fait l'objet d'une évaluation systématique et les valeurs prédictives ne sont pas connues. Selon Maurin et Drancourt (2000) "la sérologie ne constitue pas actuellement un outil diagnostique, mais un outil prospectif permettant de conforter le rôle pathogène d'Afipia sp. chez un patient donné." Recherche des autres Afipia sp. dans l'environnement ou dans des prélèvements Peu de données sont disponibles en ce qui concerne la recherche des diverses espèces du genre Afipia (autre que Afipia felis) dans des prélèvements et dans l'environnement. Pour La Scola et al., lors d'infections nosocomiales et notamment lors d'infections respiratoires, cette recherche devrait associer une co-culture et un ensemencement sur gélose BCYE.
Sensibilité aux antibiotiques
La recherche de la sensibilité aux antibiotiques de la souche type de Afipia felis (par la technique API UniSept) donne les résultats suivants :
En 1993, Maurin et al. ont étudié la sensibilité de Afipia felis sur des milieux inertes (gélose et bouillon Schaedler) et en cultures cellulaires (cellules HeLa cultivées dans du milieu de Eagle). En milieu inerte, le germe est sensible à l'impénème, aux aminosides (amikacine, gentamicine, tobramycine) et à la rifampicine mais il présente une résistance ou une sensibilité intermédiaire vis-à-vis de l'amoxicilline, de la ciprofloxacine et de l'association amoxicilline-acide clavulanique. En culture cellulaire, il n'est sensible qu'à l'amikacine et à la tobramycine. Ces divergences sont probablement dues au fait que, parmi les antibiotiques testés, seuls les aminosides sont aptes à pénétrer (lentement) dans les cellules.
Les résultats obtenus par La Scola et al. et portant sur toutes les espèces et genomospecies du genre Afipia sont donnés dans le tableau II. Comme le souligne les auteurs, seuls la rifampicine et la gentamicine ont une bonne efficacité sur l'ensemble des Afipia sp.
Orientation bibliographique
Ouvrage SCHMIDT (A.) (éd.) : Bartonella and Afipia species emphasizing Bartonella henselae. Contributions to Microbiology, vol. 1, Karger, Basel, 1998, 217 pages. Chapitres d'ouvrages LA SCOLA (B.) : Bactéries intracellulaires d'amibes . In : J. FRENEY, F. RENAUD, W. HANSEN et C. BOLLET : Précis de bactériologie clinique, Editions ESKA, Paris, 2000, pp. 1407-1412. MAURIN (M.) et DRANCOURT (M.) : Afipia . In : J. FRENEY, F. RENAUD, W. HANSEN et C. BOLLET : Précis de bactériologie clinique, Editions ESKA, Paris, 2000, pp. 1647-1650. Autres publications BIRKNESS (K.A.), GEORGE (V.M.), WHITE (E.H.), STEPHENS (D.S.) et QUINN (F.D.) : Intracellular growth of Afipia felis, a putative etiologic agent of cat scratch disease. Infect. Immun., 1992, 60, 2281-2287. BRENNER (D.J.), HOLLIS (D.G.), MOSS (C.W.), ENGLISH (C.K.), HALL (G.S.), VINCENT (J.), RADOSEVIC (J.), BIRKNESS (K.A.), BIBB (W.F.), QUINN (F.D.), SWAMINATHAN (B.), WEAVER (R.E.), REEVES (M.W.), O’CONNOR (S.), HAYES (P.S.), TENOVER (F.C.), STEIGERWALT (A.G.), PERKINS (B.A.), DANESHWAR (M.I.), HILL (B.C.), WASHINGTON (J.A.), WOODS (T.C.), HUNTER (S.B.), HADFIELD (T.L.), AJELLO (G.W.), KAUFMANN (A.F.), WEAR (D.J.) et WENGER (J.D.) : Proposal of Afipia gen. nov., with Afipia felis sp. nov. (formerly the cat scratch disease bacillus), Afipia clevelandensis sp. nov. (formerly the Cleveland Clinic Foundation strain), Afipia broomeae sp. nov., and three unnamed genospecies. J. Clin. Microbiol., 1991, 29, 2450-2460. DRANCOURT (M.), BROUQUI (P.) et RAOULT (D.) : Afipia clevelandensis antibodies and cross-reactivity with Brucella spp. and Yersinia enterocolitica O:9. Clin. Diagn. Lab. Immunol., 1997, 4, 748-752. ENGLISH (C.K.), WEAR (D.J.), MARGILETH (A.M.), LISSNER (C.R.) et WALSH (G.P.) : Cat-scratch disease. Isolation and culture of the bacterial agent. J. Amer. Med. Assoc., 1988, 259, 1347-1352. EUZEBY (J.P.) : Le genre "Afipia" et la maladie des griffes du chat. Revue Méd. Vét., 1992, 143, 95-105. FRITSCHE (T.R.), HORN (M.), SEYEDIRASHTI (S.), GAUTOM (R.K.), SCHLEIFER (K.H.) et WAGNER (M.) : In situ detection of novel bacterial ensosymbionts of Acanthamoeba spp. phylogenetically related to members of the order Rickettsiales. Appl. Environ. Microbiol., 1999, 65, 206-212. GILADI (M.), AVIDOR (B.), KLETTER (Y.), ABULAFIA (S.), SLATER (L.N.), WELCH (D.F.), BRENNER (D.J.), STEIGERWALT (A.G.), WHITNEY (A.M.) et EPHROS (M.) : Cat scratch disease: the rare role of Afipia felis. J. Clin. Microbiol., 1998, 36, 2499-2502. HALL (G.S.), PRATT-RIPPIN (K.) et WASHINGTON (J.A.) : Isolation of agent associated with cat scratch disease bacillus from pretibial biopsy. Diagn. Microbiol. Infect. 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AVIS JURIDIQUE IMPORTANT : Les informations qui figurent sur ce site sont soumises à une clause de non responsabilité et sont protégées par un copyright.
* : voir le fichier Définitions d'une genomospecies et d'une espèce bactérienne
** : Technique de co-culture utilisée par La Scola et al. (FEMS Microbiol. Ecol., 2000, 34, 129-137. Les grandes lignes de la technique sont les suivantes (pour plus d'information voir la publication originale) : Culture à 30 °C de la souche Linc AP-1 de Acanthamoeba polyphaga dans des flacons pour cultures cellulaires en présence de bouillon PYG (Peptone Yeast extract Glucose). Lorsque la concentration atteint 105 amibes par mL, les cellules sont centrifugées et le culot de centrifugation est mis en suspension dans du milieu de Page (Cf. infra). Les opérations de centrifugation et de remise en suspension sont répétées deux fois. Le dernier culot de centrifugation est remis en suspension dans 30 mL de milieu de Page puis 1,5 mL de la suspension sont déposés dans chacune des cupules d'une microplaque. Les microplaques doivent être préparées quelques heures avant l'addition des prélèvements. Les prélèvements sont constitués soit par des écouvillonnages de robinets soit par des filtres de porosité 0,22 µm ayant servi à filtrer un litre d'eau. Les écouvillons ou les filtres sont placés dans des tubes contenant 1 mL de milieu de Page. Cent microlitres de chacun des tubes sont inoculés dans les microplaques. Les microplaques sont examinées le troisième et le sixième jour après l'inoculation. Après remise en suspension des amibes, 100 µL de suspension sont centrifugés et le culot est observé par coloration de Gram et de Gimenez (voir la note ****). Si des bactéries sont détectées, le culot est ensemencé sur une gélose BCYE (voir la note ***) contenant 500 unités de colistine par mL ou sur une gélose BCYE contenant 500 unités de colistine par mL et 10 µg/mL de vancomycine.
Milieu de Page (Page's Amoeba Saline Solution)
NaCl : 120 mg
*** : Gélose BCYE (Buffer Charcoal Yeast Extract) :
Extrait de levure : 10 g
**** : Coloration de Gimenez :
Fixer les frottis à la chaleur.
Carbol fuchsine : dissoudre 10 g de fuchsine dans 100 mL d'éthanol à 95 ; mettre 11,25 g de phénol dans 250 mL d'eau à 37 °C ; mélanger ces deux solutions dans 650 mL d'eau. Ce colorant se conserve un an à température ambiante. Solution de carbol fuchsine diluée : mélanger 2 mL de carbol fuchsine et 5 mL de tampon [mélanger 3,5 mL de NaH2PO4 (0,2 M), 15,5 mL de Na2HPO4 (0,2 M) et 19 mL d'eau]. La solution diluée se conserve 48 heures. Vert malachite : dissoudre 2 mg d'oxalate de malachite à 0,8 p. cent dans 250 mL d'eau. La solution se conserve à température ambiante durant 4 mois.
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