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Créé le 05 décembre 2007
ALIIVIBRIO
Autres dénominations :
Voir aussi les fichiers : "Vibrionales", Vibrionaceae, Vibrio et Aliivibrio wodanis
Systématique
Plus de 90 espèces ont été décrites dans le genre ¤ Vibrio (voir Vibrio in List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature). Toutefois, le séquençage des ADNr 16S, des ADNr 23S, des gènes recA et gyrB montre que le genre ¤ Vibrio devrait être limité aux seules espèces Vibrio cholerae et Vibrio mimicus. Les autres espèces du genre ¤ Vibrio devraient être incluses dans un ou plusieurs genres, de la famille des ¤ Vibrionaceae.
Au sein de la famille des ¤ Vibrionaceae, les espèces du groupe Vibrio fischeri (Vibrio fischeri, Vibrio logei, Vibrio salmonicida et Vibrio wodanis) forment un genre distinct dont la classification est controversée. Ainsi, Vibrio fischeri et Photobacterium fischeri sont des synonymes homotypiques tous deux cités dans les Approved Lists of Bacterial Names et Vibrio logei a été primitivement décrit sous le nom de Photobacterium logei.
Les séquences des ARNr 16S de Vibrio fischeri, Vibrio logei, Vibrio salmonicida et Vibrio wodanis présentent plus de 97,4 p. cent d'homologie alors que les pourcentages d'homologie obtenus avec quelques espèces* des genres ¤ Enterovibrio, ¤ Grimontia, ¤ Photobacterium, Salinivibrio et ¤ Vibrio sont inférieurs à 95,6.
Dans la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Farmer III et al. considèrent Vibrio (Aliivibrio) salmonicida et Vibrio (Aliivibrio) logei comme des synonymes hétérotypiques. Cette attitude repose sur les résultats d'hybridations ADN-ADN effectuées sur les souches types de ces deux espèces. Toutefois, les résultats de ces études ne sont pas publiés et ils ne semblent pas avoir été confirmés. Ainsi, pour Urbanczyk et al. ces deux taxons constituent deux espèces distinctes.
Caractères bactériologiques
Le genre Aliivibrio est constitué de bacilles à Gram négatif, mobiles grâce à un ou plusieurs flagelles entourés d'une gaine, aéro-anaérobies, à métabolisme respiratoire et fermentatif, oxydase positive, nitrate réductase positive, chimio-organotrophes, capables d'utiliser l'acétate comme unique source de carbone (à l'exception de Aliivibrio fischeri), fermentant le D-glucose, sensibles à 10 µg de O/129, sensibles à 5 µg de novobiocine, donnant une réponse négative aux tests VP, ODC et hydrolyse de la gélatine. D'autres caractères bactériologiques sont mentionnés dans le tableau I et les caractères permettant de différencier les genres Aliivibrio, ¤ Enterovibrio, ¤ Grimontia, ¤ Photobacterium, Salinivibrio et ¤ Vibrio sont donnés dans le tableau II.
Habitat et pouvoir pathogène
Les Aliivibrio spp. ont pour habitat l'eau de mer.
Aliivibrio fischeri et Aliivibrio logei peuvent vivre en symbiose avec des céphalopodes et des poissons. Ces espèces colonisent les organes lumineux et, grâce à leur bioluminescence, elles jouent un rôle dans la communication, elles attirent les proies et elles repoussent certains prédateurs.
Aliivibrio salmonicida et Aliivibrio wodanis (voir le fichier ¤ Aliivibrio wodanis) sont pathogènes pour les poissons.
Aliivibrio salmonicida est responsable d'infections chez les salmonidés et chez la morue.
Orientation bibliographique
BAUMANN (P.), BAUMANN (L.), BANG (S.S.) et WOOLKALIS (M.J.) : Reevaluation of the taxonomy of Vibrio, Beneckea, and Photobacterium: abolition of the genus Beneckea. Curr. Microbiol., 1980, 4, 127-132. BEAZ-HIDALGO (R.), DOCE (A.), BALBOA (S.), BARJA (J.L.) et ROMALDE (J.L.) : Aliivibrio finisterrensis sp. nov., isolated from Manila clam, Ruditapes philippinarum and emended description of the genus Aliivibrio. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2010, 60, 223-228. EGIDIUS (E.), WIIK (R.), ANDERSEN (K.), HOFF (K.A.) et HJELTNES (B.) : Vibrio salmonicida sp. nov., a new fish pathogen. Int. J. Syst. Bacteriol., 1986, 36, 518-520. FARMER III (J.J.) et JANDA (J.M.) : Family I. Vibrionaceae Véron 1965, 5245AL. In : D.J. BRENNER, N.R. KRIEG, J.T. STALEY and G. M. GARRITY (eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), Springer-Verlag, New York, 2005, pp. 491-494. FARMER III (J.J.), JANDA (J.M.), BRENNER (F.W.), CAMERON (D.N.) et BIRKHEAD (K.M.) : Genus I. Vibrio Pacini 1854, 411AL. In : D.J. BRENNER, N.R. KRIEG, J.T. STALEY and G. M. GARRITY (eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), Springer-Verlag, New York, 2005, pp. 494-546. INGLIS (V.), ROBERTS (R.J.) et BROMAGE (N.R.) : Bacterial diseases of fish. Blackwell Scientific Publications, Oxford, 1993, 308 pages. LUNDER (T.), SØRUM (H.), HOLSTAD (G.), STEIGERWALT (A.G.), MOWINCKEL (P.) et BRENNER (D.J.) : Phenotypic and genotypic characterization of Vibrio viscosus sp. nov. and Vibrio wodanis sp. nov. isolated from Atlantic salmon (Salmo salar) with ‘winter ulcer’. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2000, 50, 427–450. THOMPSON (F.L.), GEVERS (D.), THOMPSON (C.C.), DAWYNDT (P.), NASER (S.), HOSTE (B.), MUNN (C.B.) et SWINGS (J.) : Phylogeny and molecular identification of vibrios on the basis of multilocus sequence analysis. Appl. Environ. Microbiol., 2005, 71, 5107-5115. THOMPSON (F.L.), IIDA (T.) et SWINGS (J.) : Biodiversity of vibrios. Microbiol. Mol. Biol. Rev., 2004, 68, 403-431. TORANZO (A.E.), SANTOS (Y.) et BARJA (J.L.): Immunization with bacterial antigens: Vibrio infections. In : R. GUDDING, A. LILLEHAUG, P. MIDTLYNG et F. BROWN (éditeurs) : Fish vaccinology. Karger, Basel, 1997, pp. 93105. THYSSEN (A.) et OLLEVIER (F.) : Genus II. Photobacterium Beijerinck 1889, 401AL. In : D.J. BRENNER, N.R. KRIEG, J.T. STALEY and G. M. GARRITY (eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), Springer-Verlag, New York, 2005, pp. 546-552. URBANCZYK (H.), AST (J.C.), HIGGINS (M.J.), CARSON (J.) et DUNLAP (P.V.) : Reclassification of Vibrio fischeri, Vibrio logei, Vibrio salmonicida and Vibrio wodanis as Aliivibrio fischeri gen. nov., comb. nov., Aliivibrio logei comb. nov., Aliivibrio salmonicida comb. nov. and Aliivibrio wodanis comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2007, 57, 2823-2829.
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* Espèces étudiées par Urbanczyk et al. 2007 :
Enterovibrio coralii et Enterovibrio norvegicus
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