J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Créé le 13 mars 2010

ARSENICICOCCUS - ARSENICICOCCUS PISCIS

L'exploitation minière de la région de Boliden (district de Västerbotten, Suède) a engendré la production de grandes quantités de résidus miniers contenant environ 0,5 p. cent d'arsenic et la quantité d'arsenic contenu dans ces déchets est estimée à 600 000 tonnes. Cette accumulation de résidus a conduit à une importante pollution de la région (acidification des sols, pollution des eaux souterraines par l'arsenic). Une partie des résidus miniers a été importée dans la région d'Adak afin d'y être retraitée, ce qui a conduit à la pollution des sols et d'un lac artificiel. En étudiant la flore de ce lac artificiel, Collins et al. ont isolé une souche bactérienne appartenant au sous-ordre des Micrococcineae. Une étude chimiotaxonomique et phylogénétique a permis à ces auteurs de proposer un nouveau genre et une nouvelle espèce, Arsenicicoccus bolidensis.

En 2009, Hamada et al. isolent, de la flore intestinale d'un poisson, une souche bactérienne (la souche Kis4-19) phylogénétiquement apparentée à Arsenicicoccus bolidensis (97,5 p. cent de similitude entre la séquences de l'ARNr 16S de la souche Kis4-19 et la séquence de la souche type de Arsenicicoccus bolidensis). Les hybridations ADN-ADN montrent cependant que la souche Kis4-19 appartient à une espèce distincte (moins de 10 p. cent d'homologie entre souche Kis4-19 et la souche type de Arsenicicoccus bolidensis).
Les caractères phénotypiques permettent d'identifier la souche Kis4-19 et Hamada et al. proposent la nouvelle espèce Arsenicicoccus piscis. Cette nomenclature sera validement publiée en mars 2010 par inscription sur la liste de validation 132.

Le genre Arsenicicoccus est constitué de coques à Gram positif, immobiles, non sporulés, groupés en amas, aero-anaérobies, catalase positive, oxydase négative, nitrate réductase positive, ne produisant pas d'acétoïne et capables d'acidifier les sucres dont le glucose. Comme pour les autres représentants de la classe des Actinobacteria, les critères chimiotaxonomiques jouent un rôle important dans la définition du genre.
Pour la classification du genre, voir Arsenicicoccus dans le fichier Classification of genera - List A - C in List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature.

Arsenicicoccus bolidensis est capable de réduire l'arsenic par des processus couplés à la respiration et de résister à de fortes concentrations d'arsenic. Quelques caractères permettant de distinguer les deux espèces du genre Arsenicicoccus sont donnés dans le tableau ci-dessous.

L'unique souche de Arsenicicoccus piscis rassemble des coques d'environ 0,7 µm de diamètre.

Le germe cultive à des températures comprises entre 15 et 37 °C (température optimale de croissance de 28 °C) et à des pH compris entre 5 et 8 (pH optimum de 6 à 7). Une culture est obtenue pour des concentrations en NaCl variant de 0 à 5 p. cent (concentration optimale 1 p. cent) et Arsenicicoccus piscis tolère des concentrations en arsenic de 0,2 à 0,7 mM.
Sur une gélose NBRC 802, les colonies sont circulaires, rugueuses et d'une couleur grisâtre.

En utilisant une galerie API 50CH, une acidification est notée pour l'amidon, le D-fructose, le D-galactose, le D-glucose, le glycogène, le D-maltose, le D-mannose, le D-mélibiose, le D-raffinose, le D-ribose, le D-saccharose et le D-tréhalose.
Une réaction positive (galerie API ZYM, API Coryne, API 20E)) est obtenue pour les tests réduction des nitrates, hydrolyse de l'esculine, hydrolyse de la gélatine, phosphatase acide, phosphatase alcaline, alpha-chymotrypsine, bêta-galactosidase, alpha-glucosidase, bêta-glucosidase, leucine arylamidase, naphthol-AS-BI-phosphohydrolase et trypsine.

Quelques caractères permettant de distinguer les deux espèces du genre Arsenicicoccus sont donnés dans le tableau ci-dessous.

Arsenicicoccus piscis a été isolé de l'intestin d'un pêche-madame japonais (Silago japonica*) capturé au large de Kyonan (baie de Toyo, Japon). L'habitat et le pouvoir pathogène de cette espèce sont inconnus.

Orientation bibliographique

COLLINS (M.D.), ROUTH (J.), SARASWATHY (A.), LAWSON (P.A.), SCHUMANN (P.), WELINDER-OLSSON (C.) et FALSEN (E.) : Arsenicicoccus bolidensis gen. nov., sp. nov., a novel actinomycete isolated from contaminated lake sediment. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 605-608.

HAMADA (M.), IINO (T.), IWAMI (T.), TAMURA (T.), HARAYAMA (S.) and SUZUKI (K.I.): Arsenicicoccus piscis sp. nov., a mesophilic actinobacterium isolated from the intestinal tract of a fish. Actinomycetologica, 2009, 23, 40-45.

STACKEBRANDT (E.), FREDERIKSEN (W.), GARRITY (G.M.), GRIMONT (P.A.D.), KÄMPFER (P.), MAIDEN (M.C.J.), NESME (X.), ROSSELLO-MORA (R.), SWINGS (J.), TRÜPER (H.G.), VAUTERIN (L.), WARD (A.C.) et WHITMAN (W.B.) : Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 1043-1047.

VALIDATION LIST N° 132. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2010, 60, 469-472.

WAYNE (L. G.), BRENNER (D.J.), COLWELL (R.R.), GRIMONT (P.A.D.), KANDLER (O.), KRICHEVSKY (M.I.), MOORE (L.H.), MOORE (W.E.C.), MURRAY (R.G.E.), STACKEBRANDT (E.), STARR (M.P.) et TRÜPER (H.G.): Report of the ad hoc committee on reconciliation of approaches to bacterial systematics. Int. J. Syst. Bacteriol., 1987, 37, 463-464.

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* Pour plus d'informations sur Silago japonica, voir le site FishBase (entrer le nom du genre et le nom de l'espèce dans le fichier Search FishBase).

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