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Créé le 11 mars 2002
ARTHROBACTER NASIPHOCAE
Le genre Arthrobacter appartient à la classe des ¤ Actinobacteria, à la sous-classe des ¤ Actinobacteridae, à l'ordre des Actinomycetales, au sous-ordre des Micrococcineae et à la famille des Micrococcaceae.
L'habitat principal de ces bactéries est constitué par le sol mais certaines espèces peuvent être isolées de biotopes différents.
En 1999, deux souches bactériennes ont été isolées d'écouvillonnages nasaux effectués chez deux phoques (Phoca vitulina), retenus captifs dans un centre médical écossais (l'origine et l'état sanitaire des phoques ne sont précisés). Ces deux souches ont été isolées en association avec ¤ Corynebacterium phocae, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus subsp. aureus et diverses espèces de staphylocoques à coagulase négative si bien que leur pouvoir pathogène est inconnu.
Les caractères phénotypiques de ces deux souches étaient compatibles avec ceux des Arthrobacter sp. et la présence d'un peptidoglycane du type A3a renforce cette affiliation. L'analyse électrophorétique des protéines cellulaires révèle une parenté avec Arthrobacter cumminsii et Arthrobacter albus. Les analyses des séquences des ARNr 16S confirment que ces souches sont apparentées au genre Arthrobacter (pourcentages d'homologie compris entre 94 et 96,5 p. cent) et que l'espèce phylogénétiquement la plus proche est Arthrobacter woluwensis. Il existe toutefois 3,5 p. cent de divergence entre les séquences des ARNr 16S de la souche CCUG 42953 (qui sera désignée comme la souche type de Arthrobacter nasiphocae) et de la souche type de Arthrobacter woluwensis. Selon Stackebrandt et Goebel, ce pourcentage de divergence est compatible avec la création d'une nouvelle espèce et le 11 mars 2002 Collins et al. valident la nomenclature de Arthrobacter nasiphocae.
La majorité des caractères biochimiques a été étudiée à l'aide de galeries API CORYNE et API ZYM. La description de cette espèce ne reposant que sur deux souches, les caractères bactériologiques présentés ci-dessous sont susceptibles d'être modifiés lorsque de nouvelles souches auront été isolées. Arthrobacter nasiphocae se présente sous la forme de courts bacilles à Gram positif (des formes coccoïdes sont parfois observés), de forme irrégulière, non sporulés, aérobies stricts, catalase positive. La croissance a été obtenue sur des géloses Columbia enrichies ou non en sang de cheval et incubées à 25 ou à 37 ou à 42 °C dans une atmosphère contenant 5 p. cent de dioxyde de carbone. Sur gélose Columbia au sang, les colonies obtenues après 24 heures d'incubation à 37 °C sont circulaires, à contour régulier, convexes, grisâtres, non hémolytiques et leur diamètre est d'environ 1 mm. Arthrobacter nasiphocae cultive dans un bouillon contenant 5 p. cent de NaCl mais la croissance est inhibée par 10 p. cent de NaCl. Un caractère positif est noté pour les tests hydrolyse de la gélatine, hydrolyse de l'hippurate, phosphatase alcaline, phosphatase acide, alpha-glucosidase, estérase C4 (réaction faiblement positive), phosphoamidase, pyrazinamidase, acide pyroglutamique arylamidase et leucine arylamidase. Une réponse négative est obtenue pour les tests nitrate réductase, uréase, hydrolyse de l'esculine, hydrolyse de l'amidon, production d'acétoïne, cystine arylamidase, chymotrypsine, trypsine, estérase lipase C8, lipase C14, alpha-fucosidase, alpha-galactosidase, bêta-galactosidase, bêta-glucosidase, bêta-glucuronidase, alpha-mannosidase, N-acétyle-bêta-glucosaminidase, valine arylamidase, acidification des sucres.
Orientation bibliographique
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