J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Dernière mise à jour le 22 novembre 2000

AEROMONAS SALMONICIDA SUBSP. PECTINOLYTICA

Voir aussi le fichier : ¤ "Aeromonadales, Aeromonadaceae".

Aeromonas salmonicida est une des bactéries les plus importantes en aquaculture car elle a une large répartition géographique et elle est responsable d'infections graves et de pertes économiques importantes chez de nombreuses espèces de poissons, notamment chez les salmonidés.

Aeromonas salmonicida est connue depuis longtemps (la première souche a été isolée en 1894) mais, en raison de l'existence de nombreuses souches atypiques, cette espèce suscite des controverses en ce qui concerne d'une part son appartenance au genre Aeromonas (Smith a proposé de transférer cette bactérie dans le genre "Necromonas" dont la nomenclature n'a jamais été validement publiée) et d'autre part sa division en sous-espèces (pour une excellente synthèse voir les pages 66 à 79 de la référence Austin et Austin).

Les Approved Lists of Bacterial Names ont retenu les nomenclatures proposées par Schubert en 1974 : Aeromonas salmonicida subsp. achromogenes, Aeromonas salmonicida subsp. masoucida et Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida. Toutefois, en se basant sur des critères phénotypiques et génotypiques, les souches de Aeromonas salmonicida subsp. achromogenes et de Aeromonas salmonicida subsp. masoucida sont parfois rassemblées au sein d'une unique sous-espèce qui, en raison des règles de priorité, est dénommée Aeromonas salmonicida subsp. achromogenes. De même, les souches atypiques isolées de poissons autres que des salmonidés sont parfois rassemblées dans une autre sous-espèce, "Aeromonas salmonicida subsp. nova". Cette dernière sous-espèce n'a jamais fait l'objet d'une publication valide et "Aeromonas salmonicida subsp. nova" n'a pas de statut dans la nomenclature.

En 1989, Austin et al. regroupent, au sein de la sous-espèce Aeromonas salmonicida subsp. smithia, 18 souches atypiques non pigmentées ou faiblement pigmentées. Cette nomenclature sera validement publiée par inscription sur la liste de validation n° 31.

Quel que soit leur statut taxonomique, toutes les sous-espèces de Aeromonas salmonicida, décrites avant mai 2000, sont susceptibles d'être pathogènes pour les poissons. Dans le numéro de mai 2000 d'International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Pavan et al. valident la nomenclature de Aeromonas salmonicida subsp. pectinolytica pour trois souches de Aeromonas sp. isolées de l'eau de la rivière Matanza (région de Buenos Aires, Argentine). À la connaissance de l'auteur, cette nouvelle sous-espèce n'a jamais été isolée de poissons et son pouvoir pathogène expérimental n'a pas été recherché. Il est cependant important de connaître l'existence de cette bactérie afin de la différencier des autres souches de Aeromonas salmonicida.

Les trois souches étudiées par Pavan et al. présentent entre elles des homologies ADN - ADN supérieures à 99 p. cent et les pourcentages d'homologie ADN - ADN entre la souche 34mel (qui deviendra la souche type de la nouvelle sous-espèce) et les souches types de Aeromonas salmonicida subsp. achromogenes, de Aeromonas salmonicida subsp. masoucida, de Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida et de Aeromonas salmonicida subsp. smithia sont supérieurs à 70. En revanche, les pourcentages d'homologie ADN - ADN entre la souche 34mel et les souches types de Aeromonas eucrenophila, de Aeromonas hydrophila, de Aeromonas media et de Aeromonas sobria sont inférieurs à 35.
La comparaison de la séquence de l'ADNr 16S de la souche 34mel révèle une étroite parenté avec les séquences des ADNr 16S de Aeromonas salmonicida subsp. achromogenes, de Aeromonas salmonicida subsp. masoucida et de Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida.
Ces souches se différencient des autres sous-espèces de Aeromonas salmonicida par leurs caractères phénotypiques et les auteurs proposent de les rassembler sous la nomenclature de Aeromonas salmonicida subsp. pectinolytica.

L'article publié par Pavan et al. renferme des fautes de frappe (notamment dans le tableau 3) ce qui rend difficile une analyse des caractères phénotypiques.
Les souches de Aeromonas salmonicida subsp. pectinolytica présentent les caractères généraux du genre Aeromonas. Ce sont des bacilles à Gram négatif, se présentant de manière isolée ou groupés par deux ou groupés en courtes chaînes, oxydase positive, catalase positive, réduisant les nitrates en nitrites, résistants au composé vibriostatique O129 (2,4-diamino-6,7-diisopropylptéridine), aéro-anaérobies, chimio-organotrophes, métabolisant le glucose par voie respiratoire et fermentative.
Comme les autres souches de Aeromonas salmonicida, les souches de Aeromonas salmonicida subsp. pectinolytica sont immobiles, elles produisent une bêta-galactosidase et une DNase, elles ne synthétisent pas d'ornithine décarboxylase, elles sont uréase négative et elles n'acidifient pas le rhamnose. En revanche, elles présentent la caractéristique de cultiver à 37 °C, d'acidifier le sorbitol, d'être indologènes et de dégrader les polypectates.

Les autres caractères biochimiques sont les suivants :
. Réponse positive aux tests Voges-Proskauer (à 25 °C), citrate de Simmons, hydrolyse de l'ADN, hydrolyse de la gélatine, utilisation de l'acide urocanique, acidification du L-arabinose, du cellobiose, du glucose (avec production de gaz), du glycérol, du lactose, du mannitol et du saccharose.
. Réponse négative aux tests LDC, production d'hydrogène sulfuré, hydrolyse de l'esculine, production d'une élastase, utilisation du DL-lactate et acidification de la salicine.
. Les tests production d'acétoïne à 35 °C, croissance sur un milieu au KCN et production d'une arginine dihydrolase donnent une réponse variable selon les souches.

Les caractères culturaux ne sont pas décrits en détail. Les colonies apparaissent après 24 heures d'incubation (en aérobiose et à 35 °C) sur des milieux d'usage courant et elles produisent un pigment brun diffusible. Sur une gélose au sang de mouton, une souche sur les trois étudiées apparaît hémolytique.

Quelques caractères permettant de différencier Aeromonas salmonicida subsp. pectinolytica des autres sous-espèces de Aeromonas salmonicida sont donnés dans le tableau I.

Aeromonas salmonicida subsp. pectinolytica doit également être différenciée des autres espèces du genre Aeromonas mésophiles et immobiles (Aeromonas media) ou dont certaines souches sont immobiles (Aeromonas bestiarum, Aeromonas caviae et Aeromonas veronii) :
. Aeromonas bestiarum produit une lysine décarboxylase et n'acidifie pas le sorbitol.
. Aeromonas caviae ne produit pas de gaz lors de la fermentation du glucose, utilise généralement le DL-lactate et acidifie la salicine.
. Aeromonas media ne produit pas de gaz lors de la fermentation du glucose, utilise le DL-lactate et fermente généralement la salicine.
. Les souches de Aeromonas veronii pouvant être immobiles (souches du biogroupe Veronii) acidifient la salicine et elles produisent une lysine décarboxylase et une ornithine décarboxylase.

Orientation bibliographique

Les références des articles décrivant et/ou validant les nomenclatures des espèces ou des sous-espèces du genre Aeromonas citées ci-dessus figurent dans le fichier Aeromonas de List of Procaryotic Names with Standing in Nomenclature.

AUSTIN (B.) et AUSTIN (D.A.) : Bacterial fish pathogens. Disease of farmed and wild fish. Third (revised) edition, Springer Praxis, London, 1999, 457 pages.

PAVAN (M.E.), ABBOTT (S.L.), ZORZÓPULOS (J.) et JANDA (J.M.) : Aeromonas salmonicida subsp. pectinolytica subsp. nov., a new pectinase-positive subspecies isolated from a heavily polluted river. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2000, 50, 1119-1124.

POPOFF (M.) : Genus Aeromonas. In : N.R. KRIEG and J.G. HOLT (ed.), Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, vol. 1, The Williams & Wilkins Co, Baltimore, 1984, p. 545-548.

SCHUBERT (R.H.W.) : Genus II. Aeromonas Kluyver and van Niel 1936, 398. In : R.E. BUCHANAN and N.E. GIBBONS (ed.), Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology, eighth edition, 1974, The Williams & Wilkins Co, Baltimore, pp. 345-348.

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