J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 18 mars 2010
BACILLI, BACILLALES, LACTOBACILLALES
Classification :
. Voir Bacilli in Classification of classes ; Bacillales et Lactobacillales in Classification of orders.
. Pour la liste des ordres inclus dans la classe des Bacilli, voir Bacilli in List of orders and suborders included in classes.
. Pour la liste des familles incluses dans l'ordre des Bacillales et des Lactobacillales voir Bacillales et Lactobacillales in List of families included in the orders.
Classe des Bacilli
La classe des Bacilli a été proposée en 2005 dans le "volume 2, partie A" de la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Cette nomenclature ne pouvait pas être validement publiée car aucune description de la famille n'était proposée.
En 2009, dans le volume 3 de la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Ludwig et al. donnent une brève description de cette classe. Cette description est conforme aux règles du Code de Nomenclature et la nomenclature de Clostridia a été validement publiée en mars 2010 par inscription sur la liste de validation 132.
La classe des Bacilli est un synonyme homotypique et ultérieur de la classe des Firmibacteria. La classe des Firmibacteria a été décrite par Murray en 1984 puis cette nomenclature a été validement publiée en 1988 par citation sur la liste de validation 25.
La classe des Bacilli est définie principalement sur la base des analyses phylogénétiques déduites de l'étude des séquences des ARNr 16S.
La description de la classe est la suivante : les taxons incluent dans la classe des Bacilli ont une paroi dont la structure est celle d'une bactérie à Gram positif et ils prennent souvent la coloration de Gram ; ils peuvent ou non former une spore ; le type respiratoire est aérobie ou micro-aérophile ou, plus rarement, aéro-anaérobie.
L'ordre type est l'ordre des Bacillales.
La classe des Bacilli est constituée de l'ordre des Bacillales et des Lactobacillales.
Ordre des Bacillales
L'ordre des Bacillales a été proposé par Prévot en 1953 et cette nomenclature a été inscrite dans les Approved Lists of Bacterial Names.
La définition donnée par Prévot était la suivante : Eubactériales sporulées dont la spore est endobacillaire, en général centrale et ne déforme pas le corps bactérien. Aérobies ou facultatives. Mobiles ou immobiles, hétérotrophes. Parasites, saprophytes ou libres. Deux familles : Bacillaceae et Innominaceae.
Actuellement, l'ordre des Bacillales est défini principalement sur la base des analyses phylogénétiques déduites de l'étude des séquences des ARNr 16S.
Seuls quelques caractères sont communs à l'ensemble des représentants de cet ordre : présence d'une spore (mais il existe des exceptions), paroi dont la structure est celle d'une bactérie à Gram positif (la plupart des espèces prennent la coloration de Gram, au moins dans cultures jeunes), les quinones isoprénoïdes sont des ménaquinones à sept unités isoprènes (mais il existe des exceptions, notamment pour les espèces de la famille des Thermoactinomycetaceae dont les ménaquinones possèdent 6 à 11 unités isoprènes).
Le genre type est le genre ¤ Bacillus.
Pour la liste des familles et des genres inclus dans l'ordre des Bacillales, voir Bacillales in List of families included in the orders et Bacillales in List of genera included in orders.
Ordre des Lactobacillales
L'ordre des Lactobacillales a été proposé en 2005 dans le "volume 2, partie A" de la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Cette nomenclature ne pouvait pas être validement publiée car aucune description de la famille n'était proposée.
En 2009, dans le volume 3 de la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Ludwig et al. donnent une brève description de cet ordre. Cette description est conforme aux règles du Code de Nomenclature et la nomenclature de Lactobacillales a été validement publiée en mars 2010 par inscription sur la liste de validation 132.
L'ordre des Lactobacillales est défini principalement sur la base des analyses phylogénétiques déduites de l'étude des séquences des ARNr 16S.
La description de l'ordre est la suivante : bacilles ou coques à Gram positif, non sporulés, habituellement aéro-anaérobies et catalase négative.
Le genre type est le genre Lactobacillus.
Pour la liste des familles et des genres inclus dans l'ordre des Lactobacillales, voir Lactobacillales in List of families included in the orders et Lactobacillales in List of genera included in orders.
Orientation bibliographique
BRENNER (D.J.), KRIEG (N.R.), STALEY (J.T.) et GARRITY (G.M.) (eds): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part A (Introductory Essays), Springer, New York, 2005, pp. 1-304.
DE VOS : Order I. Bacillales Prévot 1953, 60AL. In: P. DE VOS, G.M. GARRITY, D. JONES, N.R. KRIEG, W. LUDWIG, F.A. RAINEY, K.H. SCHLEIFER and W.B. WHITMAN (eds): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 3 (The Firmicutes), Springer, Dordrecht, Heidelberg, London, New York, 2009, p. 20.
LUDWIG (W.), SCHLEIFER (K.H.) et WHITMAN (W.B.) : Class I. Bacilli class nov. In: P. DE VOS, G.M. GARRITY, D. JONES, N.R. KRIEG, W. LUDWIG, F.A. RAINEY, K.H. SCHLEIFER and W.B. WHITMAN (eds): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 3 (The Firmicutes), Springer, Dordrecht, Heidelberg, London, New York, 2009, pp. 19-20.
LUDWIG (W.), SCHLEIFER (K.H.) et WHITMAN (W.B.) : Order II. Lactobacillales ord. nov. In: P. DE VOS, G.M. GARRITY, D. JONES, N.R. KRIEG, W. LUDWIG, F.A. RAINEY, K.H. SCHLEIFER and W.B. WHITMAN (eds): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 3 (The Firmicutes), Springer, Dordrecht, Heidelberg, London, New York, 2009, p. 464.
MURRAY (R.G.E.): The higher taxa, or, a place for everything...? In: N.R. KRIEG and J.G. HOLT (eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, first edition, vol. 1, The Williams & Wilkins Co., Baltimore, 1984, pp. 31-34.
PRÉVOT (A.R.) in: P. HAUDUROY, G. EHRINGER, G. GUILLOT, J. MAGROU, A.R. PRÉVOT, ROSSET et A. URBAIN : Dictionnaire des Bactéries Pathogènes, 2nd ed., Masson, Paris, 1953, pp. 1-692.
VALIDATION LIST N° 25. Int. J. Syst. Bacteriol., 1988, 38, 220-222.
VALIDATION LIST N° 132. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2010, 60, 469-472.
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