J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 21 janvier 2002
BRACKIELLA, BRACKIELLA OEDIPODIS
Voir aussi les fichiers : ¤ Alcaligenaceae et ¤ Burkholderiales, Burkholderiaceae.
Brackiella oedipodis est la nomenclature proposée par Willems et al. pour une souche bactérienne isolée d'un Pinché à crête blanche ou Tamarin de Geoffroy (Saguinus oedipus)* élevé au German Primate Center (Deutsches Primatenzentrum) de Göttingen. Ce centre se consacre à la biologie des primates, à leur intérêt dans la recherche biomédicale mais aussi à la reproduction et à la préservation des espèces en voie de disparition. C'est à ce titre qu'il possède une colonie d'environ 60 tamarins de Geoffroy. Cette espèce a pour habitat naturel les forêts du Nord-Ouest de la Colombie mais sa survie est menacée par la déforestation.
L'animal qui a permis l'isolement de Brackiella oedipodis était un mâle, âgé de plus de 10 ans, mort soudainement lors d'une extraction dentaire. À l'autopsie, l'animal présentait une hypertrophie cardiaque, des lésions d'épicardite chronique et des lésions d'endocardite qui ont conduit à réaliser un prélèvement de sang du cœur en vue d'une analyse bactériologique. Les examens anatomopathologiques ont confirmé l'existence d'une épicardite suppurée et d'une endocardite.
La souche isolée du tamarin est l'unique souche de l'espèce Brackiella oedipodis si bien que l'habitat et le pouvoir pathogène de cette bactérie sont mal connus. Il est toutefois possible que cette souche soit à l'origine de la pathologie observée.
Les caractères phénotypiques, étudiés avec le système GN MicroPlate (Biolog), montrent une certaine similitude avec Comamonas terrigena. Toutefois, le pourcentage d'identification normalisé n'est que de 83, 2 p. cent ce qui correspond à une identification tout juste acceptable.
L'analyse électrophorétique des protéines cellulaires révèle un profil différent des profils obtenus avec les Comamonas sp. et l'analyse de la séquence des ARNr 16S permet de classer la souche isolée du tamarin dans la classe des ¤ Betaproteobacteria. Les espèces phylogénétiquement les plus proches (pourcentages d'homologie de l'ordre de 92 à 93 p. cent) sont les Alcaligenes sp., les Achromobacter sp., les Bordetella sp., ¤ Pelistega europaea, ¤ Taylorella asinigenitalis et ¤ Taylorella equigenitalis.
Même s'il n'existe pas de normes précises permettant de définir un genre (ni même une espèce) sur la base des homologies de séquences des ARNr 16S, Willems et al. se rallient à la proposition de Collins et al qui considèrent que des souches bactériennes peuvent appartenir à des genres différents lorsque les séquences de leurs ARNr 16S présentent moins de 94 p. cent d'homologie. Les caractères phénotypiques permettant une identification, Willems et al. proposent la création d'un nouveau genre (Brackiella) et d'une nouvelle espèce (Brackiella oedipodis) inclus dans la famille des ¤ Alcaligenaceae (ordre des ¤ Burholderiales, classe des ¤ Betaproteobacteria, phylum des ¤ "Proteobacteria, domaine ou empire des "Bacteria" ou des "Eubacteria").
On peut remarquer que la description de Brackiella oedipodis repose sur une seule souche alors que la description correcte d'une espèce bactérienne devrait reposer sur l'étude d'un minimum de 5 à 10 souches (voir Christensen et al. 2001 ou Rosselló-Mora et Amann 2001).
Le genre Brackiella rassemble des coccobacilles à Gram négatif, de 0,9 à 1,1 µm, entourés de nombreuses fimbriae, immobiles, chimio-organotrophes, aérobies, catalase et oxydase positives, réduisant les nitrates en nitrites, uréase négative, mésophiles.
Outre les caractères du genre Brackiella, l'unique souche de Brackiella oedipodis présente les caractères suivants :
. Caractères positifs : L-alanine aminopeptidase, ornithine décarboxylase, rouge de méthyle, hydrolyse de l'amidon, acidification du maltose et du D-mannose.
. Caractères négatifs : production d'indole, VP, citrate de Simmons, production d'hydrogène sulfuré (milieu de Kligler), lysine décarboxylase, arginine di-hydrolase, phénylalanine désaminase, hydrolyse de l'esculine, l'hydrolyse du Tween 80, DNase, lipase, gélatinase, bêta-D-galactosidase, bêta-D-glucuronidase, acidification de l'adonitol, du L-arabinose, du cellobiose, du dulcitol, de l'érythritol, du glucose, du méthyle alpha-D-glucoside, du glycérol, du m-inositol, du lactose, du mannitol, du mélibiose, du raffinose, du L-rhamnose, du saccharose, de la salicine, du D-sorbitol, du tréhalose et du D-xylose.
. En utilisant le système GN MicroPlate de Biolog (résultats lus après 3 jours d'incubation à 37 °C), Brackiella oedipodis assimile le Tween 40, le Tween 80, le méthyle pyruvate, l'acide cis-aconitique, l'acide formique, l'acide alpha-hydroxybutyrique, l'acide bêta-hydroxybutyrique, l'acide gamma-hydroxybutyrique, l'acide alpha-cétobutyrique, l'acide alpha-cétoglutarique, l'acide alpha-cétovalérique, l'acide DL-lactique, l'acide sébacique, l'acide succinique, l'acide bromosuccinique, l'acide succinamique, la D-alanine, l'acide L-glutamique, l'acide glycyl-L-glutamique et la L-sérine.
La culture est obtenue pour des températures comprises entre 30 et 37 °C mais aucune culture n'est observée à 4, 20 ou 42 °C. La croissance est observée en aérobiose mais elle est favorisée par incubation dans une atmosphère microaérophile (méthode à la bougie). Brackiella oedipodis ne cultive pas sur une gélose de MacConkey ou sur une gélose au cetrimide ou sur le milieu de King B ou dans un bouillon contenant 6,5 p. cent de NaCl.
Après 24 heures d'incubation à 37 °C, les colonies obtenues sur une gélose trypticase soja, éventuellement additionnées de 5 p. cent de sang de mouton, sont de deux types : des colonies de 0,5 mm de diamètre et des colonies de 1 mm de diamètre. Après deux jours d'incubation, toutes les colonies ont un diamètre compris entre 1 et 2 mm. Elles sont légèrement grisâtres, d'aspect un peu sec et elles sont non hémolytiques.
Brackiella oedipodis est sensible à de nombreux antibiotiques dont l'ampicilline, la mezlocilline, la céfotaxime, le céfotiam, la céfoxitine, la ceftazidime, l'amikacine, la gentamicine, la streptomycine, le chloramphénicol, l'acide nalidixique, la ciprofloxacine, la tétracycline et la sulfamérazine.
Orientation bibliographique
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COLLINS (M.D.), LAWSON (P.A.), WILLEMS (A.), CORDOBA (J.J.), FERNANDEZ-GARAYZABAL (J.), GARCIA (P.), CAI (J.), HIPPE (H.) et FARROW (J.A.E.): The phylogeny of the genus Clostridium: proposal of five new genera and eleven new species combinations. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 812-826.
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ROSSELLÓ-MORA (R.) et AMANN (R.) : Review. The species concept for prokaryotes. FEMS Microbiol. Rev., 2001, 25, 39-67.
WILLEMS (A.), GILHAUS (H.), BEER (W.), MIETKE (H.), GELDERBLOM (H.R.), BURGHARDT (B.), VOIGT (W.) et REISSBRODT (R.) : Brackiella oedipodis gen. nov., sp. nov., Gram-negative, oxidase-positive rods that cause endocarditis of cotton-topped tamarin (Saguinus oedipus). Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 179-186.
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* : Quelques informations sur Saguinus oedipus :
. Classification d'après le NCBI Taxonomy Browser : Eukaryota ; Metazoa ; Chordata ; Craniata ; Vertebrata ; Euteleostomi ; Mammalia ; Eutheria ; Primates ; Platyrrhini ; Callitrichidae ; Saguinus ; Saguinus oedipus.
. Caractéristiques physiques, biologie, éthologie : University of Michigan Museum of Zoology, Animal Diversity Web : Saguinus oedipus
. Mesure de protection : espèce inscrite à l'annexe I de la Convention sur le commerce international des espèces de faune et de flore sauvages menacées d'extinction, signée à Washington D.C., le 3 mars 1973 et modifiée à Bonn, le 22 juin 1979.
. Photographies :
1) German Primate Center (Deutsches Primatenzentrum), Species of Interest
2) Departament de Psiquiatria i Psicobiologia clínica Universitat de Barcelona Etologia dels Primats, Taxonomia i imatges de primats, Saginus oedipus