J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

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Créé le 01 décembre 2005

 

BURKHOLDERIALES, BURKHOLDERIACEAE

 

Voir aussi les fichiers :
. ¤ Alcaligenaceae
. ¤ Burkholderia
. ¤ Burkholderia gladioli
. ¤ Burkholderia mallei
. ¤ Burkholderia pseudomallei, Burkholderia thailandensis
. ¤ Oxalobacteraceae

 

Ordre des Burkholderiales

 

L'ordre des Burkholderiales a été proposé dans la deuxième édition du "Bergey's Manual of Systematic Bacteriology" et cette nomenclature sera validement publiée en janvier 2006 par citation sur la liste de validation 107.
Comme c'est le cas pour la très grande majorité des ordres décrits dans le "Bergey's Manual", l'ordre des Burkholderiales est défini sur la base des séquences des ARNr 16S. Cet ordre rassemble des procaryotes à Gram négatif, non sporulés, présentant une grande diversité morphologique, métabolique et écologique. Il inclut des bactéries chimio-organotrophes aérobies ou aéro-anaérobies, des bactéries chimiolithotrophes obligatoires ou facultatives, des bactéries fixatrices d'azote et des bactéries pathogènes pour l'homme, les animaux et les plantes.

L'ordre des Burkholderiales est placé dans la classe des ¤ Betaproteobacteria (phylum des ¤ "Proteobacteria", domaine ou empire des "Bacteria" ou des "Eubacteria"). Il est constitué de quatre familles, ¤ Alcaligenaceae, Burkholderiaceae, Comamonadaceae et ¤ Oxalobacteraceae. Les genres Mitsuaria et Paucibacter sont des genres incertae sedis de l'ordre des Burkholderiales.
Seules les familles des ¤ Alcaligenaceae, des Burkholderiaceae (Cf. Infra) et, dans une moindre mesure, la famille des ¤ Oxalobacteraceae présentent un intérêt en médecine vétérinaire.

La famille des Comamonadaceae comprend les genres Acidovorax, Alicycliphilus, Brachymonas, Caenibacterium, Caenimonas, Caldimonas, Comamonas, Curvibacter, Delftia, Diaphorobacter, "Doohwaniella", Giesbergeria, Hydrogenophaga, Hylemonella, Lampropedia, Macromonas, Malikia, Ottowia, Pelomonas, Polaromonas, Pseudacidovorax, Ramlibacter, Rhodoferax, Roseateles, Schlegelella, Simplicispira, Variovorax, ¤ Verminephrobacter et Xenophilus. 
Cette famille rassemble des bacilles à Gram négatif, droits ou légèrement incurvés ou spiralés, souvent mobiles grâce à une ciliature polaire, amphitriche ou péritriche, non sporulés, chimio-organotrophes ou chimiolithotrophes facultatifs, aérobies (quelques espèces utilisent également les nitrates comme accepteurs d'électrons), oxydase positive, cultivant pour une température optimale comprise entre 24 et 33 °C (à l'exception des Polaromonas spp. dont la température optimale de croissance est de 4 °C), pouvant produire un pigment jaune (genres Hydrogenophaga et Variovorax), pouvant fixer l'azote (quelques espèces du genre Hydrogenophaga) et dont le G + C p. cent varie de 52 à 70.
Les représentants de la famille des Comamonadaceae sont isolés du sol, de la boue, de l'eau et de l'environnement industriel. Quelques espèces sont des bactéries phytopathogènes (Acidovorax spp.). Des souches de Acidovorax spp. et de Comamonas spp. peuvent être isolées de prélèvements cliniques, mais elles sont considérées comme non pathogènes.

 

Famille des Burkholderiaceae

 

La famille des Burkholderiaceae est décrite dans la deuxième édition du "Bergey's Manual of Systematic Bacteriology" et cette nomenclature sera validement publiée en janvier 2006 par citation sur la liste de validation 107.
Cette famille est définie sur la base des séquences des ARNr 16S. La famille des Burkholderiaceae rassemble des procaryotes à Gram négatif, présentant une grande diversité morphologique, métabolique et écologique. Elle inclut des bactéries chimio-organotrophes aérobies ou aéro-anaérobies et des bactéries chimiolithotrophes obligatoires ou facultatives.

La famille des Burkholderiaceae est constituée des genres ¤ Burkholderia, Cupriavidus, Lautropia, Limnobacter, Pandoraea, Paucimonas, Polynucleobacter, Ralstonia et Thermothrix.

Le genre Cupriavidus a été proposé en 1987 pour une unique espèce, Cupriavidus necator. En 2004, Vandamme et Coenye transfèrent dans le genre Cupriavidus neuf espèces du genre Wautersia (voir le fichier Cupriavidus in List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature).
Le genre Cupriavidus Makkar et Casida 1987 emend. Vandamme et Coenye 2004 rassemble des bacilles à Gram négatif, mobiles grâce à une ciliature péritriche, chimiohétérotrophes ou chimiolithotrophes, à métabolisme respiratoire, pouvant utiliser plusieurs acides aminés comme unique source de carbone et d'azote, catalase et oxydase positives, résistants à plusieurs métaux dont le cuivre.
Cupriavidus necator est une bactérie du sol capable de tuer, par un mécanisme encore inconnu, des bactéries à Gram positif ou négatif (Agromyces ramosus, Arthrobacter globiformis, Azotobacter vinelandii, Bacillus subtilis, Bacillus thuringiensis, Ensifer adhaerens, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Staphylococcus aureus, ...).
Les autres espèces du genre Cupriavidus ont pour habitat le sol.
Cupriavidus gilardii, Cupriavidus pauculus et Cupriavidus respiraculi sont également isolés de cas d'infections humaines chez des sujets affaiblis.

Lautropia mirabilis (unique espèce du genre) est un coque à Gram négatif, aéro-anaérobie mais cultivant mieux en aérobiose, oxydase, catalase et uréase positives. Les souches de Lautropia mirabilis se présentent sous trois formes différentes : (i) des coques de 1 à 2 µm de diamètre, capsulés, immobiles et qui se groupent en amas ; (ii) des coques isolés de 1 à 2 µm de diamètre, non capsulés et mobiles grâce à une touffe de 3 à 9 flagelles ; et (iii) des coques isolés, de grande taille (diamètre supérieur à 5 µm) et immobiles.
Lautropia mirabilis est isolée de la bouche de l'homme et une souche a été isolée d'un patient atteint de mucoviscidose.

Limnobacter thiooxidans, unique espèce du genre, se présente sous la forme de bacilles incurvés à Gram négatifs, mobiles grâce à un unique flagelle polaire, aérobies, catalase et oxydase positives, cultivant pour des températures comprises entre 4 et 38 °C et pour des pH variant de 5,5 à 10,5, chimiolithohétérotrophes, oxydant le thiosulfate et isolés de l'eau douce et de sédiments.

Les Pandoraea spp. (Pandoraea apista, Pandoraea norimbergensis, Pandoraea pnomenusa, Pandoraea pulmonicola et Pandoraea sputorum) sont des bacilles à Gram négatif, mobiles grâce à un unique flagelle polaire, donnant une réponse positive aux tests catalase, phosphatase alcaline et leucine arylamidase, donnant une réponse négative aux tests réduction des nitrates, bêta-galactosidase, indole, DNase, hydrolyse de l'esculine, hydrolyse de la gélatine et hydrolyse du Tween 80, capables de croître sur une gélose de Drigalsky et en présence de 1,5 p. cent de NaCl.
Les Pandorea spp. sont isolées de l'environnement, de lait en poudre et de prélèvement cliniques, notamment des crachats de sujets atteints de mucoviscidose.

Paucimonas lemoignei (Pseudomonas lemoignei), seule espèce du genre, est un bacille à Gram négatif, mobile grâce à un unique flagelle polaire, chimio-organotrophe à métabolisme respiratoire, catalase et oxydase positives.
Paucimonas lemoignei est isolée du sol.

Polynucleobacter necessarius, unique espèce du genre, est un endosymbionte obligatoire de protozoaires vivant en eau douce et appartenant au genre Euplotes.

Le genre Ralstonia, proposé par Yabuuchi et al. en 1995 puis validement publié le 03 avril 1996 par citation dans la liste de validation 57, est actuellement réduit aux espèces Ralstonia insidiosa, Ralstonia mannitolilytica, Ralstonia pickettii, Ralstonia solanacearum et Ralstonia syzygii.
Les Ralstonia spp. sont des bacilles à Gram négatif, mobiles ou immobiles, aérobies, à métabolisme respiratoire, oxydase et catalase positives.
Ralstonia syzygii est pathogène pour les plantes du genre Syzygium et notamment pour Syzygium aromaticum (girofle ou giroflier, arbre utilisé pour ses boutons floraux ou clous de girofle).
Ralstonia solanacearum est une bactérie phytopathogène d'une importance considérable car elle est pathogène pour plus de 200 espèces de plantes réparties dans 50 familles. Elle est notamment importante pour son pouvoir pathogène vis-à-vis de la tomate, de la pomme de terre, du tabac, du bananier et de l'arachide.
Ralstonia insidiosa, Ralstonia mannitolilytica et Ralstonia pickettii sont isolées de l'environnement et de malades affaiblis. Elles sont notamment responsables de méningites, d'ostéomyélites et d'infections nosocomiales.

Les Thermothrix spp. (Thermothrix azorensis et Thermothrix thiopara) sont des bacilles à Gram négatif, mobiles grâce à un flagelle polaire, thermophiles (température de croissance comprise entre 63 et 86 °C), aérobies, chimiolithotrophes facultatifs ou obligatoires. Lorsque les conditions sont défavorables (température proche de la température maximale de croissance, pH voisin de 8,5 ou manque d'oxygène), les cellules donnent des filaments de grande taille.
Les Thermothrix spp. sont isolées d'eaux géothermales dont le pH est proche de la neutralité.

 

Orientation bibliographique

 

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