J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 16 novembre 2005
BACTEROIDES COPROSUIS
Les élevages de porcs engendrent des quantités importantes d'excréments qui sont une source de nuisance, de pollution et parfois de conflits entre les éleveurs et leurs proches voisins.
Les excréments liquides, traités dans des fosses à lisier, dégagent une odeur désagréable et produisent de l'ammoniac éventuellement nocif pour l'homme et les animaux. L'émission d'odeurs nauséabondes et d'ammoniac est due au métabolisme bactérien et notamment à l'action de bactéries anaérobies strictes. Le brassage des lisiers permet une aération et donc une limitation du développement des micro-organismes anaérobies sans toutefois abolir totalement les nuisances.
Les bactéries présentes dans les lisiers de porcs sont mal connues. Whitehead et Cotta ont cependant caractérisé de nombreuses espèces dont des Clostridium spp., ¤ Hespellia porcina, ¤ Hespellia stercorisuis, des Lactobacillus spp., des Streptococcus spp. et de nombreuses espèces encore innomées.
Lors d'une étude cherchant à apprécier la diversité des populations bactériennes présentes dans les lisiers de porcs, Whitehead et al. ont isolé deux souches d'un bacille à Gram négatif et anaérobie.
Les séquences des ARNr 16S des deux souches présentent 99,7 p. cent d'homologie. L'analyse de ces séquences montre que les deux souches appartiennent à la classe des "Bacteroidetes" et qu'elles sont phylogénétiquement proches des Bacteroides spp. Toutefois, les pourcentages d'homologie obtenus entre les ARNr 16S des deux souches isolées de lisier de porc et les autres Bacteroides spp. sont inférieurs ou égaux à 90. En accord avec les conclusions de Stackebrandt et Goebel de telles valeurs sont compatibles avec la description d'une nouvelle espèce. Aussi, le 07 novembre 2005, Whitehead et al. valident la nomenclature de Bacteroides coprosuis.
Les deux souches de Bacteroides coprosuis sont constituées de bacilles à Gram négatif, de 0,8 à 3,0 µm de longueur sur 0,5 à 1,5 µm de longueur, immobiles, non sporulés, anaérobies, fermentant le glucose en produisant de l'acétate, du succinate et du propionate, catalase et oxydase négatives.
La majorité des caractères présentés ci-dessous a été étudiée à l'aide de galeries API Rapid ID32AN et de galeries API ZYM.
. Une réponse positive est notée pour les tests hydrolyse de l'esculine, hydrolyse de l'amidon, phosphatase acide, phosphatase alcaline, alanine arylamidase, arginine arylamidase, cystine arylamidase, glutamyl acide glutamique arylamidase, leucine glycine arylamidase, N-acétyl-bêta-glucosaminidase, chimotrypsine, estérase C4, estérase lipase C8, lipase C14, alpha-galactosidase (réaction faiblement positive), bêta-galactosidase, alpha-glucosidase, bêta-glucosidase, alpha-fucosidase* et acidification du mannose.
. Une réponse négative est obtenue avec les tests nitrate réductase, uréase, indole, gélatinase, ADH, alpha-arabinosidase, bêta-galactosidase-6-phosphate, bêta-glucuronidase, acide glutamique arylamidase, glycine arylamidase, histidine arylamidase, leucine arylamidase, alpha-mannosidase, phénylalanine arylamidase, proline arylamidase, phosphoamidase, acide pyroglutamique arylamidase, sérine arylamidase, tyrosine arylamidase, valine arylamidase, trypsine et acidification du raffinose.
Une croissance est observée à 25 ou à 37 °C (température optimale de croissance), mais le germe ne cultive pas pour des températures égales ou supérieures à 42 °C.
Après 48 heures d'incubation à 37 °C dans une atmosphère contenant 96 p. cent de dioxyde de carbone et 4 p. cent d'hydrogène, les colonies obtenues sur une gélose cœur-cervelle sont circulaires, convexes, à contour régulier, opaques, de couleur crème et leur diamètre est d'environ 1 mm.
Bacteroides coprosuis est résistant à 100 µg/mL d'ampicilline, à 20 µg/mL de céfoxitine, à 10 µg/mL d'érythromycine, à 200 µg/mL de gentamicine et à 3 µg/mL de tétracycline.
Orientation bibliographique
LESER (T.D.), AMENUVOR (J.Z.), JENSEN (T.K.), LINDECRONA (R.H.), BOYE (M.) et MOLLER (K.) : Culture-independent analysis of gut bacteria: the pig gastrointestinal tract microbiota revisited. Appl. Environ. Microbiol., 2002, 68, 673-690.
MILLER (D.N.) : Accumulation and consumption of odorous compounds in feedlot soils under aerobic, fermentative, and anaerobic respiratory conditions. J. Anim. Sci., 2001, 79, 2503-2512.
STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.
WHITEHEAD (T.R.) et COTTA (M.A.) : Characterisation and comparison of microbial populations in swine faeces and manure storage pits by 16S rDNA gene sequence analyses. Anaerobe, 2001, 7, 181-187.
WHITEHEAD (T.R.), COTTA (M.A.), COLLINS (M.D.), FALSEN (E.) et LAWSON (P.A.) : Bacteroides coprosuis sp. nov., isolated from swine-manure storage pits. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 2515-2518.
WHITEHEAD (T.R.), COTTA (M.A.), COLLINS (M.D.) et LAWSON (P.A.) : Hespellia stercorisuis gen. nov., sp. nov. and Hespellia porcina sp. nov., isolated from swine manure storage pits. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 241-245.
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Dans le "protologue", la réponse au test alpha-fucosidase est citée une fois comme étant positive et une fois comme étant négative ! Toutefois, dans le reste du texte et dans le tableau 1 la réponse à ce test est indiquée comme étant positive.