J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

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Créé le 04 décembre 2003

 

Hors texte : Principales conclusions de quelques travaux concernant la systématique des espèces du "groupe Bacillus cereus"

 

Voir aussi les fichiers
. Bacillus
. Bacillus anthracis
. Bacillus cereus
. Systématique des espèces placées dans le "groupe Bacillus cereus"
. Bacillus weihenstephanensis

 

Le document présenté ci-dessous est divisé en deux parties :

1) Un texte extrait de la référence suivante :

Daniel R. Zeigler, Ph.D. - The Bacillus Genetic Stock Center, Department of Biochemistry, The Ohio State University
484 West Twelfth Avenue, Columbus, Ohio 43210 - Bacillus Genetic Stock Center Catalog of Strains, Seventh Edition, Part 2: Bacillus thuringiensis and Bacillus cereus. 56 pages. © 1999.

Daniel R. Zeigler écrit "Permission is given to copy this material or portions of it freely, provided that no alterations are made and that this copyright page is included". La reproduction de ce texte, sans altération et en mentionnant le copyright, semble donc légale.

L'original de ce document est disponible sur Internet.

2) Un tableau complétant les données présentées par Daniel R. Zeigler.

 

 

B. CEREUS & B. THURINGIENSIS-THE SPECIES QUESTION

 

Extrait de
Bacillus Genetic Stock Center Catalog of Strains, Seventh Edition,
Part 2: Bacillus thuringiensis and Bacillus cereus

© 1999

Permission is given to copy this material or portions of it freely, provided that no alterations are made and that this copyright page is included.

Daniel R. Zeigler, Ph.D.
The Bacillus Genetic Stock Center
Department of Biochemistry
The Ohio State University
484 West Twelfth Avenue
Columbus, Ohio 43210

 

The species status of members of the B. cereus group has been a persistent question among bacterial taxonomists. The data summarized below suggest strongly that these organisms are as closely related genetically as are members of other recognized bacterial species. Further, no physiological or molecular character has been discovered that correlates with the presence of parasporal crystals, the classical definition of B. thuringiensis, other than the presence of the cry genes themselves. A model in which B. cereus-like organisms exchange genetic material, especially plasmid borne genes, could easily account for the occurrence of crystal-producing strains in nature. It is perhaps inconvenient that highly beneficial organisms and pathogenic ones co-exist under the same taxonomic identifier. Yet the safe use of Bt products for over three decades argues strongly that many B. cereus-like organisms can indeed be harnessed for applications in industry and agriculture. If so, it may be more productive to work towards eliminating a few hazardous genes than to regard an entire species as somehow unsuitable for use.

 

Numbers Analyzeda
(Bc, Bt, Bm, Ba)

Method

Conclusions

Ref.

44, 15, 13, 23

30 morphological and physiological characters

"We are bound by our data" that there is no "basis for separation" into more than one species

6

35, 137, 0, 0

99 phenotypic traits

"Strains of Bt were indistinguishable from B. cereus, except for their ability to produce parasporal crystals."

2

39, 12, 16, 0

329 physiological tests

Strains clustered in one main group, distinct from the other Bacillus species tested

7

149, 55, 25, 37

API test strips

"The results suggest that B. mycoides and Bt should be considered as varieties of B. cereus."

10

17, 35, 4, 0

118 morphological and physiological tests

"The numerical phenetic data underline the close relationship between B. cereus and B. thuringiensis.

12

33, 9, 0, 0

Fatty acid analysis

All strains tested clustered together, distinct from the other Bacillus species tested.

8

24, 12, 0, 0

NotI profiles, multilocus enzyme electrophores

"On the basis of these results...we conclude that strains typed as B. cereus and Bt belong to the same species."

4

1, 2, 1, 78

Amplification fragment length polymorphism

"AFLP similarities are consistent with...close relationships" among these strains.

9

4, 3, 0, 0

Physical mapping of chromosomes

Some B. cereus genomes are more similar to Bt genomes than to those of other B. cereus strains.

5

3, 3, 0, 3

Phospholipid analysis

 The three "species" tested clustered into a "B. cereus group" readily distinguishable from B. subtilis.

3

2, 6, 1, 2

DNA reassociation

"The available DNA reassociation data indicate a single species."

11

2, 1, 1, 1

16S rRNA sequencing

"These 'species' form a genealogically tight group" comparable to "other gram-positive species."

1

 

aSpecies abbreviations: Bc, B. cereus; Bt, B. thuringiensis; Bm, B. mycoides; Ba, B. anthracis

 

References

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AUTRES DONNÉES

 

Nombres de souches1
(Ba, Bc, Bm, Bpm, Bt, Bw)

Méthodes

Conclusions

Réf.

0, 5, 0, 0, 3, 0

Hybridations ADN-ADN

B. cereus et B. thuringiensis peuvent être considérés comme une unique espèce.

17

1, 2, 0, 0, 5, 0

Hybridations ADN-ADN

B. anthracis, B. cereus et B. thuringiensis semblent constituer une unique espèce.

11

0, 6, 2, 0, 21, 0

MLEE

B. cereus et B. thuringiensis ne peuvent être distingués.
B. mycoides semble constituer une espèce particulière.

22

40, 7, 1, 0, 5, 0

PCR

Les souches de B. anthracis sont homogènes et distinctes des autres représentants du groupe B. cereus.

9

0, 16, 18, 14, 11, 0

Hybridations ADN-ADN

B. cereus et B. thuringiensis sont génétiquement apparentés mais distincts.
Bacillus mycoides sensu lato est un taxon particulier.

16

0, 3, 9, 0, 4, 0

Electrophorèse des ARNr 5S et des ARNt, ribotypage

Il est impossible de différencier B. cereus, B. mycoides et B. thuringiensis.

7

1, 1, 0, 0, 24, 0

Séquençage de l'espace intergénique 16S-23S

Les séquences de B. anthracis, de B. cereus et de B. thuringiensis présentent de fortes homologies.

2

78, 1, 1, 0, 2, 0

AFLP

B. anthracis, B. cereus et B. thuringiensis sont apparentés alors que B. mycoides est une espèce plus éloignée.

12

0, 15, 13, 0, 13, 0

Spectroscopie infrarouge transformée de Fourier

La spectroscopie infrarouge transformée de Fourier permet de différencier B. cereus, B. mycoides et B. thuringiensis.

1

0, 0, 18, 18, 0, 0

Hybridations ADN-ADN, séquençage de l'ARNr 16S

Les séquences des ARNr 16S de B. mycoides et de B. pseudomycoides présentent 98 p. cent d'homologie mais les homologies ADN-ADN permettent de distinguer ces deux espèces.

15

0, 21, 5, 0, 14, 10

Hybridations ADN-ADN, séquençage de l'ARNr 16S, séquençage partiel de l'ARNr 23S, séquençage de l'espace intergénique 16S-23S, séquençage du gène cspA, RAPD, caractères phénotypiques

Les hybridations ADN-ADN montrent que les cinq espèces sont étroitement apparentées.
L'étude des séquences des ARNr 16S et 23S, l'étude des séquences des gènes cspA, ainsi que la RAPD permettent de distinguer deux espèces au sein de B. cereus : B. cereus et B. weihenstephanensis.
B. weihenstephanensis est plus proche de B. mycoides que de B. cereus ou de B. thuringiensis.

13

1, 1, 1, 0, 1, 0

Sondes spécifiques des séquence du gène gyrB

Les sondes décrites permettent de différencier B. anthracis, B. cereus, B. mycoides et B. thuringiensis.

21

1, 1, 1, 1, 1, 1

Séquence des ARNr 16S

B. anthracis, B. cereus et B. thuringiensis ne peuvent être distingués.
B. mycoides et B. weihenstephanensis sont apparentés.

10

1, 3, 0, 0, 1, 0

MLEE, séquençage de 9 gènes

B. anthracis, B. cereus et B. thuringiensis constituent une unique espèce

8

27, 23, 21, 8, 58, 4

Amplification de l'espace intergénique 16S-23S

Les souches du groupe B. cereus se répartissent en deux groupes.
Le premier groupe rassemble B. anthracis, B. cereus et B. thuringiensis qui forment une unique espèce.
Le deuxième groupe est constitué de B. mycoides, de B. pseudomycoides et de B. weihenstephanensis.

6

0, 22, 0, 0, 0, 4

Croissance à 6 et à 42 °C, PCR

Toutes les souches psychrotolérantes de B. cereus ne sont pas des souches de B. weihenstephanensis.

18

2, 8, 0, 0, 2, 0
(ainsi que154 souches étiquetées B. cereus/B. thuringiensis)

AFLP

B. anthracis semble constituer une espèce distincte de B. cereus et de B. thuringiensis.

19

0, 100, 0, 0, 98, 0

MLEE

La parenté génétique des souches d'une même espèce (B. cereus ou B. thuringiensis) est plus importante que la parenté existant entre les souches d'espèces différentes.

20

0, 82, 0, 0, 73, 0

Séquence des ARNr 16S et du gène gyrB

Il est difficile de distinguer B. cereus et B. thuringiensis.

3

4, 4, 3, 1, 5, 3

Séquençage de l'espace intergénique 16S-23S

B. cereus et B. thuringiensis forment un unique groupe.
B. anthracis forme un groupe distinct.
B. mycoides et B. weihenstephanensis sont des espèces très proches.
B. pseudomycoides est une espèce particulière.

4

17, 19, 21, 8, 43, 4

PCR des régions répétées (rep-PCR)

Les six espèces du groupe Bacillus cereus peuvent être considérées comme des espèces distinctes.

5

0, 3, 2, 0, 2, 0

PCR-RE (amplification du gène gyrB et utilisation des enzymes de restriction sau3AI et EcoRI)

B. cereus, B. mycoides et B. thuringiensis peuvent être distingués par une technique de PCR-RE.

14

 

1 : Ba : Bacillus anthracis ; Bc : Bacillus cereus ; Bm : Bacillus mycoides ; Bpm : Bacillus pseudomycoides ; Bt : Bacillus thuringiensis ; Bw : Bacillus weihenstephanensis.

Références

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