J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Créé le 01 juin 2010

BARTONELLA JAPONICA, BARTONELLA SILVATICA

Voir aussi le fichier ¤ Bartonella.

Les nomenclatures de Bartonella japonica et de Bartonella silvatica ont été validement publiées le 14 avril 2010 pour deux souches bactériennes (les souches Fuji 18-1 et Fuji 23-1) isolées du sang de mulots (Apodemus argenteus* et Apodemus speciosus**) capturés dans la forêt du Mont Fuji (Japon).

Les caractères phénotypiques et la valeur du G + C p. cent montrent que ces deux souches appartiennent au genre ¤ Bartonella.
L'analyse des séquences des ARNr 16S de la souche Fuji 18-1 (souche type de Bartonella japonica isolée de Apodemus argenteus) et de la souche Fuji 23-1 (souche type de Bartonella silvatica isolée de Apodemus speciosus)  révèle qu'elles sont phylogénétiquement apparentées à ¤ Bartonella grahamii (souche Fuji 18-1)  et à ¤ Bartonella koehlerae (souche Fuji 23-1).

Au sein du genre ¤ Bartonella l'étude des séquences des gènes rpoB et gltA se révèle plus performante que l'étude des ARNr 16S pour différencier les espèces. Selon La Scola et al., deux souches appartiennent à des espèces différentes lorsque les pourcentages de similitude sont inférieurs à 95,4 p. cent pour les gènes rpoB ou à 96,0 p. cent pour les gènes gltA.
. Les séquences des gènes rpoB des souches Fuji 18-1 et Fuji 23-1 présentent respectivement 91,4 p. cent et 89,9 p. cent de similitude avec l'espèce la plus proche (¤ Bartonella alsatica).
. Les séquences des gènes gltA des souches Fuji 18-1 et Fuji 23-1 présentent respectivement 89,1 p. cent et 90,4 p. cent de similitude avec les espèces les plus proches (¤ Bartonella vinsonii subsp. arupensis pour la souche Fuji 18-1 et ¤ Bartonella taylorii pour la souche Fuji-23-1).
. L'analyse des séquences des gènes ftsZ, groEL, ribC et des espaces intergéniques ARNr 16S-ARNr 23S confirment que les deux souches étudiées diffèrent des autres espèces du genre ¤ Bartonella.
. L'ensemble de ces résultats a permis à Inoue et al. de proposer deux nouvelles espèces, Bartonella japonica et Bartonella silvatica.

Bartonella japonica et Bartonella silvatica sont phénotypiquement proches.
. Ces deux espèces rassemblent de courts bacilles ou cocco-bacilles à Gram négatif, dépourvus de flagelles et de pili, oxydase et catalase négatives.
. Les cellules de la souche Fuji 18-1 (Bartonella japonica) ont une longueur de 0,74 µm et un diamètre de 0,36 µm. La taille des cellules de la souche Fuji 23-1 (Bartonella silvatica) est de 1,16 µm de longueur sur 0,43 µm de diamètre.
. Après 14 jours d'incubation à 35 °C dans une atmosphère humide et enrichie en dioxyde de carbone, les colonies obtenues sur une gélose HIA (hearth infusion agar) sont lisses, transparentes ou légèrement grisâtres et leur diamètre atteint 1 à 2 mm.

La majorité des caractères biochimiques a été étudiée à l'aide de galeries MicroScan® Rapid Anaerobe Panel***.
. Bartonella japonica et Bartonella silvatica donnent une réponse positive aux tests hydrolyse du bis-p-nitrophényl-phosphate, L-leucine-bêta-naphthylamide, DL-méthionine-bêta-naphthylamide, L-lysine-bêta-naphthylamide (alcaline), L-lysine-bêta-naphthylamide (acide), glycine-bêta-naphthylamide, glycylglycine-bêta-naphthylamide, L-arginine-bêta-naphthylamide et L-tryptophane-bêta-naphthylamide.
. Une réponse négative pour les deux espèces est notée avec les tests uréase, hydrolyse du tréhalose, hydrolyse du p-nitrophényl-N-acétyl-bêta-D-glucosaminide et L-pyrrolidonyl-bêta-naphthylamide.
. Contrairement à Bartonella japonica, la souche Fuji 23-1 de Bartonella silvatica donne une réponse positive au test L-proline-bêta-naphthylamide.
. Les séquences des espaces intergéniques ARNr 16S-ARNr 23S, les séquences des ARNr 16S et les séquences des gènes rpoB, gltA, ftsZ, groEL et ribC permettent de distinguer Bartonella japonica et Bartonella silvatica des autres espèces du genre.

Le pouvoir pathogène de ces deux espèces n'est pas documenté.

Orientation bibliographique

Voir aussi le fichier ¤ Bartonella.

BRENNER (D.J.), O'CONNOR (S.P.), WINKLER (H.H.) et STEIGERWALT (A.G.) : Proposals to unify the genera Bartonella and Rochalimaea, with descriptions of Bartonella quintana comb. nov., Bartonella vinsonii comb. nov., Bartonella henselae comb. nov., and Bartonella elizabethae comb. nov., and to remove the family Bartonellaceae from the order Rickettsiales. Int. J. Syst. Bacteriol., 1993, 43, 777-786.

BIRTLES (R.J.), HARRISON (T.G.), SAUNDERS (N.A.) et MOLYNEUX (D.H.) : Proposals to unify the genera Grahamella and Bartonella, with descriptions of Bartonella talpae comb. nov., Bartonella peromysci comb. nov., and three new species, Bartonella grahamii sp. nov., Bartonella taylorii sp. nov., and Bartonella doshiae sp. nov. Int. J. Syst. Bacteriol., 1995, 45, 1-8.

BIRTLES (R.J.) et RAOULT (D.) : Comparison of partial citrate synthase gene (gltA) sequences for phylogenetic analysis of Bartonella species. Int. J. Syst. Bacteriol., 1996, 46, 891-897.

INOUE (K.), KABEYA (H.), SHIRATORI (H.), UEDA (K.), KOSOY (M.Y.), CHOMEL (B.B.), BOULOUIS (H.J.) et MARUYAMA (S.) : Bartonella japonica sp. nov. and Bartonella silvatica sp. nov., isolated from Apodemus mice. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2010, 60, 759-763.

INOUE (K.), MARUYAMA (S.), KABEYA (H.), YAMADA (N.), OHASHI (N.), SATO (Y.), YUKAWA (M.), MASUZAWA (T.), KAWAMORI (F.), KADOSAKA (T.), TAKADA (N.), FUJITA (H.) et KAWABATA (H.) : Prevalence and genetic diversity of Bartonella species isolated from wild rodents in Japan. Appl. Environ. Microbiol., 2008, 74, 5086–5092.

LA SCOLA (B.), ZEAITER (Z.), KHAMIS (A.) et RAOULT (D.) : Gene-sequence-based criteria for species definition in bacteriology: the Bartonella paradigm. Trends Microbiol., 2003, 11, 318-321.

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* Apodemus argenteus (petite souris des champs japonaise)

Classification selon The NCBI Entrez Taxonomy Homepage : Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Coelomata ; Deuterostomia ; Chordata ; Craniata ; Vertebrata ; Gnathostomata ; Teleostomi ; Euteleostomi ; Sarcopterygii ; Tetrapoda ; Amniota ; Mammalia ; Theria ; Eutheria ; Euarchontoglires ; Glires ; Rodentia ; Sciurognathi ; Muroidea ; Muridae ; Murinae ; Apodemus ; Apodemus argenteus.

Pour une photographie de cette espèce voir Apodemus argenteus in Wikipedia

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**Apodemus speciosus (mulot du Japon)

Classification selon The NCBI Entrez Taxonomy Homepage : Eukaryota  ; Fungi/Metazoa group  ; Metazoa  ; Eumetazoa  ; Bilateria  ; Coelomata  ; Deuterostomia  ; Chordata  ; Craniata  ; Vertebrata  ; Gnathostomata  ; Teleostomi  ; Euteleostomi  ; Sarcopterygii  ; Tetrapoda  ; Amniota  ; Mammalia  ; Theria  ; Eutheria  ; Euarchontoglires  ; Glires  ; Rodentia  ; Sciurognathi  ; Muroidea  ; Muridae  ; Murinae  ; Apodemus, Apodemus speciosus.

Pour une photographie de cette espèce voir Apodemus speciosus sur le site Shikoku Research Center.

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***Galerie MicroScan^® Rapid Anaerobe Panel
(d'après la documentation technique MicroScan^®, Dade International Inc., West Sacramento, CA 95691, U.S.A.)
L'auteur remercie le Vétérinaire Biologiste M. Boni (Secteur Vétérinaire de Marseille) qui lui a transmis la documentation technique MicroScan Rapid Anaerobe Panel.

La galerie MicroScan^® Rapid Anaerobe Panel a été conçue pour l'identification des bactéries anaérobies mais elle est fréquemment utilisée pour les espèces du genre Bartonella.

La galerie comprend 24 substrats déshydratés et elle est inoculée (50 µL par puits) avec une suspension bactérienne dont l'opacité est comprise entre les valeurs 3 et 5 de l'échelle de McFarland. Les tests détectent des enzymes préformées et la croissance du germe n'est pas nécessaire si bien que la galerie est incubée sous une atmosphère normale durant 4 heures à 35 - 37 °C. Après incubation, la lecture repose sur les changements de pH et l'apparition de colorations après adjonction éventuelle de réactifs. Deux cupules de contrôle sont prévues pour faciliter la lecture. Un contrôle au nitrophényl qui doit rester incolore et un contrôle au bêta-naphthylamide qui doit virer au jaune-orange après addition du réactif "peptidase".

La liste des 24 substrats ainsi que le principe de la lecture sont donnés dans le tableau ci-dessous :

* : Les substrats d'ortho- ou de para-nitrophényl sont incolores. L'enzyme, lorsqu'elle est présente, hydrolyse le substrat et libère de l'ortho- ou du para-nitrophénol de couleur jaune.

** : Lorsque le substrat est hydrolysé par l'arylamidase appropriée, le bêta-naphthylamide est libéré et détecté par l'addition du réactif "peptidase" qui crée un complexe chimique de coloration rose à pourpre magenta.

La recherche de la catalase peut s'effectuer dans la cupule p-nitrophényl-bêta-D-galactopyranoside. En cas de réaction positive, l'adjonction de deux à trois gouttes d'eau oxygénée à 3 p. cent provoque l'apparition de bulles après 2 à 3 minutes.

Les tests sont séparés par groupe de trois et une valeur 4, 2 ou 1 est attribuée à chaque test. La valeur 4 est attribuée à une réponse positive notée pour le premier test d'un groupe de trois. La valeur 2 est attribuée à une réponse positive notée pour le deuxième test d'un groupe de trois. La valeur 1 est attribuée à une réponse positive notée pour le troisième test d'un groupe de trois. L'addition des valeurs pour chacun des groupes permet d'obtenir un profil numérique à huit chiffres.

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