J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 07 août 2003
CORYNEBACTERIUM AQUILAE
Lors d'une étude portant sur la flore respiratoire d'aigles retenus en captivité dans un centre espagnol de réhabilitation, Fernández-Garayzábal et al. isolent quatre souches dont les caractères phénotypiques sont compatibles avec un représentant du genre Corynebacterium. Trois souches proviennent des choanes d'aigles royaux (Aquila chrysaetos*) et la quatrième a pour origine la bouche d'un jeune aigle ibérique (Aquila adalberti**).
L'étude des séquences des ARNr 16S montre que ces quatre souches forment un groupe homogène au sein du genre Corynebacterium. Les pourcentages d'homologie obtenus entre l'ARNr 16S de la souche S-613 (qui sera désignée comme la souche type de Corynebacterium aquilae) et les souches types des espèces phylogénétiquement les plus proches sont de 96,4 pour Corynebacterium argentoratense, de 95,9 pour ¤ Corynebacterium testudinoris, de 95,6 pour ¤ Corynebacterium ulcerans, de 95,4 pour ¤ Corynebacterium pseudotuberculosis, de 95,2 pour Corynebacterium vitaeruminis et de 95,1 pour Corynebacterium diphtheriae et ¤ Corynebacterium felinum. En accord avec Stackebrandt et Goebel, de tels pourcentages sont compatibles avec l'existence d'une nouvelle genomospecies***. Cette genomospecies pouvant être identifiée par ses caractères bactériologiques, Fernández-Garayzábal et al. proposent la nomenclature de Corynebacterium aquilae qui sera validement publiée le 07 juillet 2003.
Les souches de Corynebacterium aquilae sont constituées de bacilles à Gram positif, immobiles, non sporulés, aéro-anaérobies, catalase positive, oxydase négative, non lipophiles, donnant une réponse négative au test de CAMP réalisé avec la souche ATCC 25923 de Staphylococcus aureus subsp. aureus. La paroi renferme de l'acide meso-diaminopimélique et des acides mycoliques à courtes chaînes (C30 à C36). Les acides gras sont non ramifiés, saturés ou mono-insaturés.
Les principaux caractères biochimiques ont été étudiés à l'aide de galeries API Coryne, API 50CH et API ZYM.
. En utilisant une galerie API Coryne, une réponse positive est notée pour les tests pyrazinamidase, phosphatase alcaline, acidification du glucose et du ribose. La réponse est négative pour les autres tests (pyrrolidonyl arylamidase, bêta-glucuronidase, bêta-galactosidase, alpha-glucosidase, N-acétyl-bêta-glucosaminidase, esculine, uréase, gélatine, acidification du xylose, du mannitol, du maltose, du lactose, du saccharose et du glycogène). Dans la base de données API, le profil numérique obtenu (2 1 0 0 3 0 4) correspond à une bonne identification de Corynebacterium jeikeium. Toutefois, Corynebacterium jeikeium est lipophile et ne cultive pas en anaérobiose.
. Seuls le D-fructose, le galactose, la N-acétyl-glucosamine, le D-glucose, le glycérol, le D-mannose et le ribose sont acidifiés en galerie API 50CH.
. Avec une galerie API ZYM, une réponse positive est observée pour les tests phosphatase alcaline, phosphatase acide, estérase C4, estérase lipase C8, naphtol-AS-BI-phosphohydrolase, leucine arylamidase et chymotrypsine.
. Les principaux caractères permettant de différencier Corynebacterium aquilae des espèces phylogénétiquement proches sont donnés dans le tableau I.
Après 48 heures d'incubation à 37 °C, les colonies obtenues sur une gélose Columbia enrichie de 5 p. cent de sang de mouton sont non hémolytiques, blanchâtres, légèrement convexes, d'aspect sec et rugueux et leur diamètre est compris entre 1 et 2 mm.
Une autre espèce du genre Corynebacterium, ¤ Corynebacterium falsenii, a également été isolée de la flore respiratoire de Aquila chrysaetos et de Aquila adalberti. Les principaux caractères permettant de différencier Corynebacterium aquilae et ¤ Corynebacterium falsenii figurent dans le tableau II.
Orientation bibliographique
FERNÁNDEZ-GARAYZÁBAL (J.F.), EGIDO (R.), VELA (A.I.), BRIONES (V.), COLLINS (M.D.), MATEOS (A.), HUTSON (R.A.), DOMÍNGUEZ (L.) et GOYACHE (J.) : Isolation of Corynebacterium falsenii and description of Corynebacterium aquilae sp. nov., from eagles. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 1135-1138.
FUNKE (G.), VON GRAEVENITZ (A.), CLARRIDGE III (J.E.) et BERNARD (K.A.) : Clinical microbiology of coryneform bacteria. Clin. Microbiol. Rev., 1997, 10, 125-159.
STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.
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Classification de Aquila chrysaetos (aigle royal) d'après le NCBI Taxonomy Browser : Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Coelomata ; Deuterostomia ; Chordata ; Craniata ; Vertebrata ; Gnathostomata ; Teleostomi ; Euteleostomi ; Sarcopterygii ; Tetrapoda ; Amniota ; Sauropsida ; Sauria ; Archosauria ; Aves ; Neognathae ; Falconiformes ; Accipitridae ; Accipitrinae ; Aquila ; Aquila chrysaetos.
Des renseignements sur cette espèce, ainsi que des photographies, sont disponibles sur le site de l'University of Michigan, Museum of Zoology. Voir le fichier Aquila chrysaetos.
Classification de Aquila adalberti (aigle ibérique) d'après le NCBI Taxonomy Browser : Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Coelomata ; Deuterostomia ; Chordata ; Craniata ; Vertebrata ; Gnathostomata ; Teleostomi ; Euteleostomi ; Sarcopterygii ; Tetrapoda ; Amniota ; Sauropsida ; Sauria ; Archosauria ; Aves ; Neognathae ; Falconiformes ; Accipitridae ; Accipitrinae ; Aquila ; Aquila adalberti.
Pour une photographie de Aquila adalberti voir le fichier Águila imperial ibérica sur le site La Web de los Animales.
Voir le fichier Définitions d'une genomospecies et d'une espèce bactérienne.