J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Crée le 22 novembre 2007
CAMPYLOBACTER CANADENSIS
Voir aussi : ¤ Campylobacter.
Systématique
En 2004, Hoar et al. isolaient cinq souches de Campylobacter spp. à partir de la flore fécale de cinq grues blanches d'Amérique (Grus americana1) maintenues en captivité au zoo de Calgary (Canada). Une souche appartenait à l'espèce Campylobacter jejuni, une souche à l'espèce Campylobacter upsaliensis et trois souches semblaient constituer une nouvelle espèce du genre Campylobacter. En 2006, sept souches supplémentaires de Campylobacter spp. ont été isolées de grues blanches du zoo de Calgary.
Ces dix souches ont fait l'objet d'une étude taxonomique. Des tests de PCR montrent que ces souches constituent bien une nouvelle espèce au sein du genre Campylobacter. L'analyse des séquences des ARNr 23S, des ARNr 16S, du gène rpoB (groEl) et du gène cpn60 (hsp60) confirment ce résultat, même si la séquence du gène cpn60 indique que les souches sont plus voisines des ¤ Arcobacter spp. que des Campylobacter spp.
La séquence de l'ARNr 16S de la souche L266 (souche type de la nouvelle espèce Campylobacter canadensis) révèle que les espèces phylogénétiquement les plus proches sont Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, Campylobacter lari, ¤ Campylobacter insulaenigrae, Campylobacter helveticus et Campylobacter upsaliensis. Toutefois, les pourcentages d'homologie obtenus entre la souche L266 et les souches types de ces espèces ne dépassent pas 92. En accord avec les conclusions de Stackebrandt et Goebel, les souches isolées de grues blanches méritent d'être placées dans une nouvelle espèce. Les résultats d'hybridation ADN-ADN, effectuées entre deux souches isolées de grues blanches et neuf souches appartenant à diverses espèces du genre Campylobacter, vont dans le même sens.
Les caractères phénotypiques permettent d'identifier les souches isolées des grues blanches et, en novembre 2007, Inglis et al. valident la nomenclature de Campylobacter canadensis.
Caractères bactériologiques
Les souches de Campylobacter canadensis sont constituées de bactéries à Gram négatif, mobiles grâce à un unique flagelle polaire, micro-aérophiles et thermophiles.
La morphologie est variée : formes coccoïdes (d'environ 0,7 µm de longueur sur 0,6 µm de diamètre), formes en S (d'environ 2,7 µm de longueur sur 0,5 µm de diamètre), formes en demi-cercles.
Une réponse positive pour 100 p. cent des souches (n = 10) est observée pour les tests oxydase, réduction des nitrates, croissance à 35 °C, croissance à 37 °C, croissance à 42 ° C, croissance en anaérobiose, croissance sur milieu CCDA2, croissance sur gélose de MacConkey.
Une réponse négative pour 100 p. cent des souches (n = 10) est notée pour les tests hydrolyse de l'hippurate, phosphatase alcaline, hydrolyse de l'acétate d'indoxyl, sensibilité à la céfalotine, hémolyse alpha, croissance en aérobiose, exigence en hydrogène, croissance à 25 °C, croissance à 30 °C (une faible croissance peut être observée à 30 °C), croissance sur gélose nutritive.
Une réponse variable selon les souches (n = 10) est obtenue pour les tests γ-glutamyl transpeptidase (80 p. cent des souches donnent un résultat positif), réduction des nitrates (50 p. cent des souches donnent un résultat positif), uréase (50 p. cent des souches donnent un résultat positif), catalase (40 p. cent des souches donnent un résultat positif), production d'hydrogène sulfuré en milieu TSI (40 p. cent des souches donnent un résultat positif), résistance à l'acide nalidixique (40 p. cent des souches donnent un résultat positif), croissance en présence de 1 p. cent de glycine (30 p. cent des souches donnent un résultat positif), croissance en présence de 3,5 p. cent de NaCl (10 p. cent des souches donnent un résultat positif).
Dans une atmosphère micro-aérophile (5 p. cent d'oxygène, 10 p. cent de dioxyde de carbone, 3 p. cent d'hydrogène et 82 p. cent d'azote), après 48 heures d'incubation à 37 ou à 40 °C, les colonies obtenues sur une gélose de Karmali3 sont rondes, plates, lisses, blanchâtres ou grisâtres avec un centre plus clair et leur diamètre est compris entre 0,3 et 2 mm.
L'aspect des colonies est identique sur une gélose CCDA, une gélose Columbia ou une gélose trypticase soja, mais la croissance est moins abondante. La croissance est très faible sur une gélose de Mueller-Hinton.
Habitat et pouvoir pathogène
Les dix souches ont été isolées du cloaque de grues blanches d'Amérique. Les auteurs ne donnent aucune indication sur l'état de santé des oiseaux et il est probable qu'il s'agissait d'animaux ne présentant aucun signe clinique.
Pour Inglis et al. il n'est pas exclu que certaines souches de Campylobacter spp., hippurate négative et isolées de divers d'oiseaux appartiennent à l'espèce Campylobacter canadensis.
Diagnostic bactériologique
Le germe peut être isolé sur une gélose de Preston4 rendue sélective grâce au supplément Oxoid SR1175, sur une gélose de Karmali contenant le supplément sélectif Oxoid SR1676 et sur une gélose CCDA additionnée du supplément sélectif Oxoid SR1557. Les boîtes peuvent être incubées à 37 ou à 42 °C dans une atmosphère micro-aérophile (5 p. cent d'oxygène, 10 p. cent de dioxyde de carbone, 3 p. cent d'hydrogène et 82 p. cent d'azote) ou anaérobie (10 p. cent de dioxyde de carbone, 10 p. cent d'hydrogène, 80 p. cent d'azote).
Quelques caractères permettant de distinguer Campylobacter canadensis des autres espèces du genre sont donnés dans le tableau I.
D'après Inglis et al., les caractères les plus utiles pour le diagnostic différentiel sont l'absence d'hydrolyse de l'hippurate et de l'acétate d'indoxyl, la réduction des nitrites, la production d'une γ-glutamyl transpeptidase, la sensibilité à la céfalotine, la croissance sur gélose de MacConkey, la croissance en anaérobiose, l'absence de croissance en aérobiose, l'absence de croissance à 25 °C, l'absence de croissance sur une gélose nutritive et l'absence de croissance en présence de 3,5 p. cent de NaCl.
Un test PCR, amplifiant une séquence de 253 bases du gène cpn60, est spécifique de Campylobacter canadensis et il pourrait être utile pour l'identification de cette espèce.
Orientation bibliographique
Voir aussi le fichier ¤ Campylobacter.
HOAR (B.M.), WHITESIDE (D.P.), WARD (L.), INGLIS (G.D.) et MORCK (D.W.) : Evaluation of the enteritic microflora of captive whooping cranes (Grus americana) and sandhill cranes (Grus canadensis). Zoo Biol., 2007, 26, 141-153, résumé disponible sur le site Wiley InterScience.
INGLIS (G.D.), HOAR (B.M.), WHITESIDE (D.P.) and MORCK (D.W.): Campylobacter canadensis sp. nov., from captive whooping cranes in Canada. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2007, 57, 2636-2644.
INGLIS (G.D.) et KALISCHUK (L.D.) : Use of PCR for direct detection of Campylobacter species in bovine feces. Appl. Environ. Microbiol., 2003, 69, 3435-3447.
INGLIS (G.D.), McCONVILLE (M.) et DE JONG (A.) : Atypical Helicobacter canadensis strains associated with swine. Appl. Environ. Microbiol., 2006, 72, 4464-4471.
KORCZAK (B.M.), STIEBER (R.), EMLER (S.), BURNENS (A.P.), FREY (J.) et KUHNERT (P.) : Genetic relatedness within the genus Campylobacter inferred from rpoB sequences. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2006, 56, 937-945.
LAWSON (A.J.), ON (S.L.W.), LOGAN (J.M.J.) and STANLEY (J.): Campylobacter hominis sp. nov., from the human gastrointestinal tract. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001, 51, 651-660.
ON (S.L.W.) : Identification methods for campylobacters, helicobacters, and related organisms. Clin. Microbiol. Rev., 1996, 9, 405-422.
ON (S.L.W.) et HOLMES (B.) : Classification and identification of campylobacters, helicobacters and allied taxa by numerical analysis of phenotypic tests. Syst. Appl. Microbiol., 1995, 18, 374-390.
ON (S.L.W.), HOLMES (B.) et SACKIN (M.J.) : A probability matrix for the identification of campylobacters, helicobacters and allied taxa. J. Appl. Bacteriol., 1996, 81, 425-432.
STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.
WALDENSTRÖM (J.), BROMAN (T.), CARLSSON (I.), HASSELQUIST (D.), ACHTERBERG (R.P.), WAGENAAR (J.A.) et OLSEN (B.) : Prevalence of Campylobacter jejuni, Campulobacter lari, and Campylobacter coli in different ecological guilds and taxa of migrating birds. App. Environ. Microbiol., 2002, 68, 5911-5917.
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1 : Grus americana (grue blanche d'Amérique)
Classification d'après le NCBI Taxonomy Browser : Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Coelomata ; Deuterostomia ; Chordata ; Craniata ; Vertebrata ; Gnathostomata ; Teleostomi ; Euteleostomi ; Sarcopterygii ; Tetrapoda ; Amniota ; Sauropsida ; Sauria ; Archosauria ; Dinosauria ; Saurischia ; Theropoda ; Coelurosauria ; Aves ; Neognathae ; Gruiformes ; Gruidae ; Grus ; Grus americana.
La Grue blanche d'Amérique est une espèce en voie de disparition et elle fait l'objet d'une protection aussi bien au Canada qu'aux USA [voir Grue blanche d'Amérique in Espèces en péril (Canada)]
Pour des renseignements complémentaires sur cette espèce, voir La Grue blanche in Faune et Flore du Pays (Canada)
2 : CCDA : Campylobacter Charcoal-Deoxycholate Agar (Oxoid)
Bouillon nutritif n° 2 : 25 g/L
Charbon bactériologique : 4 g/L
Hydrolysat de caséine : 3 g/L
Désoxycholate de sodium : 1 g/L
Sulfate ferreux : 0,25 g/L
Pyruvate de sodium : 0,25 g/L
Agar : 12 g/L
pH : 7,4 ± 0,2
3 : Gélose de base Karmali (Oxoid)
Gélose Columbia : 39 g/L
Charbon activé : 4g/L
Hémine : 32 mg/L
pH : 7,4 ± 0,2
4 : Gélose de base Preston (Oxoid)
Extraits de viande de boeuf : 10g/L
Peptone : 10 g/L
NaCl : 5 g/L
Agar : 12 g/L
pH : 7,5 ± 0,2
5 : Supplément SR117 (Oxoid)
Colistine : 5 000 UI/L
Cycloheximide : 100 mg/L
Rifampicine : 10 mg/L
Triméthoprime : 10 mg/L
6 : Supplément SR167 (Oxoid)
Pyruvate de sodium : 100 mg/L
Céfopérazone : 32 mg/L
Vancomycine : 20 mg/L
Cycloheximide : 100 mg/L
7 : Supplément SR155 (Oxoid)
Amphotéricine B : 10 mg/L
Céfopérazone : 32 mg/L