J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Dernière mise à jour le 09 juin 2008
"CANDIDATUS HELICOBACTER BOVIS"
Voir aussi les fichiers : ¤ Helicobacter, ¤ "Campylobacterales, Campylobacteraceae, Helicobacteraceae".
Notes :
. Pour des renseignements complémentaires sur la catégorie Candidatus, voir l'entrée "Candidatus" in Glossaire de nomenclature bactérienne ou le fichier "Candidatus" in : List of Procaryotic Names with Standing in Nomenclature.
. Bien que n'étant pas régi par les règles du Code de Nomenclature, le nom d'un Candidatus correspondant au rang d'espèce est généralement écrit, entre guillemets, de la manière suivante : Candidatus (écrit en italique avec la première lettre en capitale) + nom du genre (écrit en caractères romains avec la première lettre en capitale) + nom d'espèce (écrit en caractères romains avec la première lettre en minuscule). Exemple : "Candidatus Helicobacter bovis".
Le concept de "Candidatus" a été proposé, en 1994, par Murray et Schleifer pour des taxons qui ne peuvent être décrits selon les normes du Code de Nomenclature. Les "Candidatus" ne sont pas pris en compte par le Code de Nomenclature mais la réalité de ce concept a été reconnue par l'International Committee on Systematic of Prokaryotes.
La nomenclatures de "Candidatus Helicobacter bovis" a été publiée en 1999 pour des souches bactériennes présentes dans l'estomac des bovins et ressemblant à des Helicobacter spp.
Le genre Helicobacter a été créé en 1989 pour Helicobacter pylori et ¤ Helicobacter mustelae, bactéries préalablement placées dans le genre Campylobacter. L'individualisation de ce genre a été établie sur la base de caractères génétiques (séquences des ARNr 16S, valeur du G + C p. cent) et phénotypiques (morphologie, structure, composition en acides gras, nature des ménaquinones, caractères culturaux et activités enzymatiques). Le genre Helicobacter constitue, avec les genres ¤ Arcobacter, Caminibacter, ¤ Campylobacter, Dehalospirillum, Hydrogenimonas, Lebetimonas, Nautilia, Nitratifractor, Nitratiruptor, Sulfuricurvum, Sulfurimonas, Sulfurospirillum, Sulfurovum, Thioreductor, Thiovulum et Wolinella la classe des ¤ Epsilonproteobacteria (phylum des ¤ "Proteobacteria", domaine ou empire des "Bacteria" ou des "Eubacteria"). Les principales caractéristiques phénotypiques des hélicobactéries sont données dans le fichier ¤ Helicobacter.
À la date du 09 juin 2008, le genre Helicobacter regroupe 31 espèces différantes ayant un statut dans la nomenclature bactérienne (voir le fichier Helicobacter in List of Procaryotic Names with Standing in Nomenclature"), mais de nombreuses autres espèces n'ont pas encore été validement publiées ou sont placées dans la catégorie Candidatus : "Helicobacter colifelis", "Helicobacter muricola", "Helicobacter suncus", "Helicobacter westmeadii" (cette espèce est en fait un synonyme posterieur de ¤ Helicobacter cinaedi), "Helicobacter winghamensis", ¤ "Candidatus Helicobacter heilmannii", "Helicobacter (Flexispira) rappini"*, "Helicobacter-like organisms". Selon les espèces, l'habitat des hélicobactéries est soit l'estomac soit l'intestin de l'homme et/ou des animaux (voir le fichier ¤ "Habitat des espèces du genre Helicobacter").
En 1992, des bactéries ressemblant à des hélicobactéries ont été mises en évidence dans l'abosamum de veaux et de bovins adultes. Ultérieurement, des enquêtes sérologiques, effectuées chez des bovins, ont révélé la présence d'anticorps reconnaissant des épitopes de Helicobacter pylori. De tels anticorps ont été mis en évidence dans des sérums de veau, dans des sérums de bovins adultes, dans du colostrum et dans du lait. Ces bactéries n'ont jamais été cultivées in vitro et leur statut taxonomique était inconnu.
En 1999, De Groote et al. proposent la dénomination de "Candidatus Helicobacter bovis" pour les "Helicobacter-like organisms" mis en evidence dans sept biopsies d'abosamums de bovins adultes.es bovins. Les animaux inclus dans ces études provenaient de différents élevages belges et hollandais. Les biopsies ont été sélectionnées sur la base de données biochimiques (synthèse d'une uréase), sur la base de données immunohistochimiques (fixation d'anticorps polyclonaux anti-Helicobacter pylori révélée par la peroxydase) et sur la base d'observations effectuées en microscopie électronique (mise en évidence de bactéries dont la morphologie et la structure évoquent une hélicobactérie). Les gènes codant pour les ARNr 16S ont été amplifiés par PCR et les amplicons ont été soumis à des analyses phylogénétiques.
Les sept séquences obtenues à partir des biopsies prélevées chez les bovins présentent plus de 99 p. cent d'homologie ce qui suggère que les souches bactériennes appartiennent à une même espèce. L'espèce phylogénétiquement la plus proche est Helicobacter bilis. Toutefois, le pourcentage d'homologie observé entre l'ADNr 16S des souches bovines et l'ADNr 16S de Helicobacter bilis n'est que de 92,8 p. cent ce qui semble indiquer que ces bactéries forment une nouvelle espèce. Ces bactéries ne sont pas cultivables in vitro et il n'est donc pas possible de les décrire complètement. Pour cette raison, les auteurs les placent dans la catégorie Candidatus avec la dénomination de "Candidatus Helicobacter bovis".
Les souches de "Candidatus Helicobacter bovis" sont constituées de bactéries à Gram négatif, de morphologie hélicoïdale (1 à 3 spires peu serrées), mesurant 0,3 µm de diamètre sur 1,5 à 2,5 µm de longueur, présentant au moins 4 flagelles à l'un des pôles de la cellule, pouvant donner des formes coccoïdes, uréase positive et présentant des communautés antigéniques avec Helicobacter pylori. In vivo, elles sont présentes dans la couche de mucus et dans la lumière des cryptes où elles forment de petits amas.
Orientation bibliographique
BRAUN (U.), ANLIKER (H.), CORBOZ (L.) et OSSENT (P.) : Untersuchungen über das vorkommen von spiralförmigen bakterien im labmagen des rindes. Schweiz. Arch. Tierheilk., 1997, 139, 507-516.
DE GROOTE (D.), VAN DOORN (L.J.), DUCATELLE (R.), VERSCHUUREN (A.), TILMANT (K.), QUINT (W.G.V.), HAESEBROUCK (F.) et VANDAMME (P.) : Phylogenetic characterization of 'Candidatus Helicobacter bovis', a new gastric helicobacter in cattle. Int. J. Syst. Bacteriol., 1999, 49, 1707-1715.
GOODWIN (C.S.), ARMSTRONG (J.A.), CHILVERS (T.), PETERS (M.), COLLINS (M.D.), SLY (L.), McCONNELL (W.) et HARPER (W.E.S.) : Transfer of Campylobacter pylori and Campylobacter mustelae to Helicobacter gen. nov. as Helicobacter pylori comb. nov. and Helicobacter mustelae comb. nov., respectively. Int. J. Syst. Bacteriol., 1989, 39, 397-405.
GRASSO (G.M.), SAMMARCO (M.L.), RIPABELLI (G.), RUBERTO (A.) et IANNITTO (G.) : In situ mapping of urease-positive areas in porcine gastric mucosa. Microbios, 1995, 82, 245-249.
GÜNTHER (H.) et SCHULZE (F.) : Histologische untersuchungen zum vorkommen von Campylobacter-ähnlich geformten keimen in labmagen von kälbern. J. Vet. Med. B., 1992, 39, 737-745.
INTERNATIONAL COMMITTEE ON SYSTEMATIC BACTERIOLOGY : VIIth International Congress of Microbiology and Applied Bacteriology. Minutes of the meetings, 17, 18, and 22 August 1996, Jerusalem, Israel. Int. J. Syst. Bacteriol., 1997, 47, 597-600.
KORHONEN (H.), SYVÄOJA (E.L.), AHOLA-LUTILA (H.), SIVELÄ (S.), KOPOLA (S.), HUSU (J.) et KOSUNEN (T.U.) : Bactericidal effect of bovine normal and immune serum, colostrum and milk against Helicobacter pylori. J. Appl. Bacteriol., 1995, 78, 655-662.
MURRAY (R.G.E.) et SCHLEIFER (K.H.) : Taxonomic notes: a proposal for recording the properties of putative taxa of procaryotes. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 174-176.
MURRAY (R.G.E.) et STACKEBRANDT (E.) : Taxonomic note: implementation of the provisional status Candidatus for incompletely described procaryotes. Int. J. Syst. Bacteriol., 1995, 45, 186-187.
STRACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (E.) : Taxonomic note: a place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.
TREBESIUS (K.), ADLER (K.), VIETH (M.), STOLTE (M.) et HASS (R.) : Specific detection and prevalence of Helicobacter heilmannii-like organisms in the human gastric mucosa by fluorescent in situ hybridization and partial 16S ribosomal DNA sequencing. J. Clin. Microbiol., 2001, 39, 1510-1516.
VANDAMME (P.), FALSEN (E.), ROSSAU (R.), HOSTE (B.), SEGERS (P.), TYTGAT (R.) et DE LEY (J.) : Revision of Campylobacter, Helicobacter, and Wolinella taxonomy: emendation of generic descriptions and proposal of Arcobacter gen. nov. Int. J. Syst. Bacteriol., 1991, 41, 88-103.
AVIS JURIDIQUE IMPORTANT : Les informations qui figurent sur ce site sont soumises à une clause de non responsabilité et sont protégées par un copyright.
*
Pour des informations sur les "Flexispira" sp. voir le fichier Caractères généraux des genres Helicobacter et "Flexispira.