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Créé le 18 mai 2004
CORYNEBACTERIUM CASPIUM
La nomenclature de Corynebacterium caspium a été validement publiée le 10 mai 2004 pour une souche bactérienne isolée en juin 2000 du pénis d'un phoque de la Caspienne (Phoca caspica*). L'âge et l'état de santé de l'animal ne sont pas précisés. Il semble que le prélèvement ait été effectué à la faveur d'une autopsie et on sait que la souche a été isolée en association avec une souche de ¤ Atopobacter phocae et une souche de streptocoques du groupe G (¤ Streptococcus canis ?).
En dépit de l'absence d'acides corynémycoliques, la présence d'acide meso-diaminopimélique en position 3 de l'unité tétrapeptidique, les caractères morphologiques et les caractères biochimiques évoquaient une corynébacterie. L'étude de la séquence de 1351 bases de l'ARNr 16S a confirmé que la souche isolée était bien un représentant du genre Corynebacterium et a montré qu'elle était phylogénétiquement apparentée à Corynebacterium renale et, dans une moindre mesure, à ¤ Corynebacterium mastitidis. Toutefois, le pourcentage d'homologie obtenu entre cette séquence et la séquence de la souche type de Corynebacterium renale est de 94,7. Selon les conclusions de Stackebrandt et Goebel un tel pourcentage d'homologie permet de proposer une nouvelle espèce.
La souche de Corynebacterium caspium rassemble des bacilles à Gram positif, non acidorésistants, de forme irrégulière, non sporulés, aéro-anaérobies, catalase positive, oxydase négative, nitrate réductase négative, non lipophiles et donnant une réponse négative au test de CAMP**.
Après 24 heures d'incubation à 37 °C, les colonies obtenues sur une gélose Columbia au sang de mouton sont non hémolytiques et leur diamètre est d'environ 0,5 mm. Après 72 heures d'incubation, les colonies ont un diamètre de 2 mm, elles sont circulaires, convexes, opaques, ternes et elles peuvent être déplacées à la surface de la gélose. Quelques caractères permettant de différencier Corynebacterium caspium des espèces phylogénétiquement proches sont donnés dans le tableau I. L'habitat de cette bactérie est encore inconnu.
Orientation bibliographique
COLLINS (M.D.), HOYLES (L.), FOSTER (G.) et FALSEN (E.) : Corynebacterium caspium sp. nov., from a Caspian seal (Phoca caspica). Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 925-928. FUNKE (G.), VON GRAEVENITZ (A.), CLARRIDGE III (J.E.) et BERNARD (K.A.) : Clinical microbiology of coryneform bacteria. Clin. Microbiol. Rev., 1997, 10, 125-159. ROSSELLÓ-MORA (R.) et AMANN (R.) : Review. The species concept for prokaryotes. FEMS Microbiol. Rev., 2001, 25, 39-67. STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.
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Classification d'après le NCBI Taxonomy Browser : Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Coelomata ; Deuterostomia ; Chordata ; Craniata ; Vertebrata ; Gnathostomata ; Teleostomi ; Euteleostomi ; Sarcopterygii ; Tetrapoda ; Amniota ; Mammalia ; Theria ; Eutheria ; Carnivora ; Pinnipedia ; Phocidae ; Phoca ; Phoca caspica. Pour des renseignements complémentaires sur cette espèce voir le fichier Phoca (Pusa) caspica Gmelin, 1788 (Caspian Sea Biodiversity Database).
** : Test de CAMP (Christie, Atkins, Munch-Petersen)
La réalisation du test de CAMP est simple : sur une gélose au sang de mouton on ensemence en strie une souche de Staphylococcus aureus subsp. aureus bêta hémolytique puis la souche à étudier est ensemencée selon une strie perpendiculaire réalisée sans toucher celle de S. aureus subsp. aureus.
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