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Créé le 17 juin 1998
CHRYSEOBACTERIUM
Autres dénominations :
Systématique
Dans la première édition du Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, le genre ¤ Flavobacterium rassemble 24 espèces (dont 17 sont considérées comme incertae sedis) ainsi que les bactéries des groupes IIf et IIj. La définition du genre Flavobacterium reposait sur des critères phénotypiques qui ne sont plus considérés comme important en taxonomie et ce genre a subi de nombreux remaniements. En 1994, Vandamme et al. montrent que Flavobacterium balustinum, Flavobacterium gleum, Flavobacterium indologenes, Flavobacterium indoltheticum, Flavobacterium meningosepticum et Flavobacterium scophthalmum sont phylogéniquement proches et doivent être transférées dans un nouveau genre, Chryseobacterium. Ulterieurement, de nouvelles espèces ont été placées dans le genre Chrysobacterium (voir Chrysobacterium in List of prokaryotic names with Standing in Nomenclature). Aussi, comme l'écrivent Herzog et al. 2008, le genre Chryseobacterium est l'un des genres dont le nombre d'espèces augmente rapidement. En mai 2005, Kim et al. montrent que Chryseobacterium meningosepticum et Chryseobacterium miricola forment un genre distinct pour lequel ces auteurs valident la publication de ¤ Elizabethkingia.
Caractères bactériologiques
Le genre Chryseobacterium rassemble des bacilles à Gram négatif, non sporulés, immobiles, dépourvus de granules de poly-bêta-hydroxybutyrate, aérobies, chimio-organotrophes, oxydase et catalase positives, hydrolysant généralement l’esculine, protéolytiques, cultivant à 30 °C et souvent à 37 °C en donnant des colonies translucides (parfois opaques), circulaires, convexes, lisses, brillantes, typiquement pigmentées en jaune, en orange ou en crème. Une réponse variable selon les espèces est notée pour les tests croissance sur une gélose de MacConkey, reduction des nitrates, indole, production d'hydrogène sulfuré, hydrolyse de l'urée, hydrolyse du Tween 80, hydrolyse de la tyrosine, acidification des sucres. Les principaux caractères permettant de différencier le genre Chryseobacterium des genres apparentés sont présentés dans le tableau I et dans le tableau II. Les caractères permettant de différencier quelques espèces du genre sont présentés sur le tableau III.
Habitat et pouvoir pathogène
Les espèces du genre Chryseobacterium ont pour habitat le milieu extérieur (sol, plantes, eau douce, eau de mer, eaux usées), mais elles sont également isolées de divers prélèvements et de denrées alimentaires (lait, produits laitiers, poissons, carcasses de volailles, de porcs, de bœufs, d'agneaux). . Chryseobacterium hominis a été isolé de divers prélèvements (sang, liquide de dialyse, pus, etc.) effectués en milieu hospitalier. . Chryseobacterium bovis, Chryseobacterium haifense, Chryseobacterium indologenes, Chryseobacterium joostei, Chryseobacterium gleum, Chryseobacterium oranimense et des souches non identifiées du genre Chryseobacterium sont isolés du lait et certaines souches pourraient être à l'origine d'altérations des produits laitiers et notamment du beurre [modification de la couleur et de l'odeur (odeur de pomme)]. . Chryseobacterium balustinum, Chryseobacterium gleum, Chryseobacterium indologenes et Chryseobacterium piscium peuvent être des agents d'altération des carcasses de poissons. . Chryseobacterium shigense est considéré comme faisant partie de la flore normale d'un lait fermenté japonais. . Chryseobacterium vrystaatense a été isolé de volailles, de carcasses de volailles et de l'environnement des abattoirs. Sa capacité à altérer la viande n'a pas été étudiée. . L'unique souche de Chryseobacterium arothri a pour origine les reins d'un poisson-ballon à taches blanches (Arothron hispidus).
Les seules espèces présentant un intérêt certain en médecine vétérinaire sont Chryseobacterium balustinum, Chryseobacterium indologenes, ¤ Chryseobacterium piscicola et ¤ Chryseobacterium scophthalmum. . Chryseobacterium balustinum est, peut être, un agent de la maladie des branchies. . Chryseobacterium indologenes a été isolé chez des grenouilles (Rana pipiens) élevés en laboratoire et atteintes de la maladie des "jambes rouges "(infection généralement attribuée à Aeromonas hydrophila). . ¤ Chryseobacterium piscicola provoque des infections cliniquement proches de la maladie des eaux froides (voir ¤ Flavobacterium pychrophilum). . ¤ Chryseobacterium scophthalmum est responsable d’infections branchiales et de septicémies chez le turbot.
Orientation bibliographique
Voir aussi le fichier Chryseobacterium in List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. AUSTIN (B.) et AUSTIN (D.A.) : Bacterial fish pathogens : Disease in farmed and wild fish. 1987, Ellis Horwood Limited, chapitre 11 : Gram-negative pigmented rods, 225-249. BERNARDET (J.F.), NAKAGAWA (Y.) et HOLMES (B.) : Proposed minimal standards for describing new taxa of the family Flavobacteriaceae and emended description of the family. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 1049-1070. BERNARDET (J.F.), VANCANNEYT (M.), MATTE-TAILLIEZ (O.), GRISEZ (L.), TAILLIEZ (P.), BIZET (C.), NOWAKOWSKI (M.), KEROUAULT (B.) et SWINGS (J.) : Polyphasic study of Chryseobacterium strains isolated from diseased aquatic animals. Sys. Appl. Microbiol., 2005, 28, 640-660. CAMPBELL (S.), HARADA (R.M.) et LI (Q.X.) : Chryseobacterium arothri sp. nov., isolated from the kidneys of a pufferfish. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2008, 58, 290-293. DE BEER (H.), HUGO (C.J.), JOOSTE (P.J.), VANCANNEYT (M.), COENYE (T.) et VANDAMME (P.) : Chryseobacterium piscium sp. nov., isolated from fish of the South Atlantic Ocean off South Africa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2006, 56, 1317-1322. DE BEER (H.), HUGO (C.J.), JOOSTE (P.J.), WILLEMS (A.), VANCANNEYT (M.), COENYE (T.) et VANDAMME (P.A.R.) : Chryseobacterium vrystaatense sp. nov., isolated from raw chicken in a chicken-processing plant. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 2149-2153. EUZÉBY (J.P.) : Chryseobacterium in List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. HANTSIS-ZACHAROV (E.), SHAKÉD (T.), SENDEROVICH (Y.) et HALPERN (M.) : Chryseobacterium oranimense sp. nov., a psychrotolerant, proteolytic and lipolytic bacterium isolated from raw cow’s milk. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2008, 58, 2635-2639. HUGO (C.J.) et JOOSTE (P.J.) : Preliminary differentiation of food strains of Chryseobacterium and Empedobacter using multilocus enzyme electrophoresis. Food Microbiol., 1997, 14, 133-142. HUGO (C.J.), SEGERS (P.), HOSTE (B.), VANCANNEYT (M.) et KERSTERS (K.) : Chryseobacterium joostei sp. nov., isolated from the dairy environment. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 771-777. KÄMPFER (P.), DREYER (U.), NEEF (A.), DOTT (W.) et BUSSE (H.J.) : Chryseobacterium defluvii sp. nov., isolated from wastewater. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 93-97. KIM (K.K.), KIM (M.K.), LIM (J.H.), PARK (H.Y.) et LEE (S.T.) : Transfer of Chryseobacterium meningosepticum and Chryseobacterium miricola to Elizabethkingia gen. nov. as Elizabethkingia meningoseptica comb. nov. and Elizabethkingia miricola comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 1287-1293. MUDARRIS (M.), AUSTIN (B.), SEGERS (P.), VANCANNEYT (M.), HOSTE (B.) et BERNARDET (J.F.) : Flavobacterium scophthalmum sp. nov., a pathogen of turbot (Scophthalmus maximus L.). Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 447-453. OLSON (M.E.), GARD (S.), BROWN (M.), HAMPTON (R.) et MORCK (D.W.) : Flavobacterium indologenes infection in leopard frogs. J. Amer. Vet. Med. Assoc., 1992, 201, 1766-1770. RICHARD (C) et KIREDJIAN (M.) : Méthodes de laboratoire pour l’identification des bacilles à gram négatif aérobies stricts (Pseudomonas, Alcaligenes, Flavobacterium, Acinetobacter, Brucella, Bordetella), 319 pages, Institut Pasteur, Paris, 1992. VANDAMME (P.), BERNARDET (J.F.), SEGERS (P.), KERSTERS (K.) et HOLMES (B.) : Newperspectives in the classification of the flavobacteria : description of Chryseobacterium gen. nov., Bergeyella gen. nov., and Empedobacter nom. rev. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 827-831.
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