J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 04 avril 2003
CLOSTRIDIUM COLICANIS
La flore intestinale du chien n'a fait l'objet que d'un nombre limité d'études et, à la connaissance de l'auteur, les plus récentes sont celle de Benno et Mitsuoka et celle de Benno et al. Ces derniers auteurs notaient la présence d'un nombre important de clostridies lécithinase négative chez des chiens âgés de 11 ans ou plus.
Le 7 février 2003, Greetham et al. proposent la nomenclature de Clostridium colicanis pour une souche de clostridies, lécithinase négative, isolée des fèces d'un Labrador mâle dont l'âge n'est pas précisé.
Le G + C p. cent de l'unique souche (la souche 3WC2) et la séquence de son ARNr 16S montrent qu'elle appartient au genre Clostridium sensu stricto*. Au sein de ce genre, elle est phylogénétiquement apparentée à Clostridium absonum, à Clostridium baratii, à Eubacterium budayi, à Eubacterium moniliforme, à Eubacterium multiforme et à Eubacterium nitritogenes. Toutefois, les séquences des ARNr 16S de la souche 3WC2 et des souches types des espèces apparentées présentent au moins 3,6 p. cent de divergence. Cette valeur est compatible avec la création d'une nouvelle espèce que Greetham et al. dénomment Clostridium colicanis.
On peut toutefois remarquer que les auteurs n'ont effectué aucune hybridation ADN - ADN (voir le fichier ¤ "Définitions d'une genomospecies et d'une espèce bactérienne") et que la création d'une nouvelle espèce sur la base d'une unique souche ne semble pas toujours opportune.
La souche 3WC2 se présente sous la forme de bacilles ne retenant pas la coloration de Gram, de 0,9 à 1,0 µm de diamètre sur 3 à 10 µm de longueur, sporulés (spore de forme oblongue dont la position est généralement subterminale mais pouvant également occuper une position centrale ou terminale), immobiles, anaérobies, catalase négative et nitrate réductase négative. La valeur du G + C p. cent est de 31,7.
En utilisant des techniques classiques, Clostridium colicanis est indologène, il hydrolyse l'esculine et l'urée, il acidifie l'amidon (réaction faiblement positive), l'esculine (réaction faiblement positive), le cellobiose, le fructose, le galactose, le glucose** (le pH d'un bouillon PY contenant 1 p. cent de glucose est de 4,8 après six jours d'incubation), le lactose, le maltose, le mannose, le ribose, le saccharose et la salicine (réaction faiblement positive). En revanche une réaction négative est obtenue pour les tests acidification de l'amygdaline, du L-arabinose, du glycogène, de l'inositol, du mannitol, du mélézitose, du mélibiose, du raffinose, du rhamnose, du sorbitol, du tréhalose et du xylose.
Avec une galerie API Rapid ID32AN, une réponse positive est observée avec les tests phosphatase alcaline, arginine arylamidase, arginine di-hydrolase, bêta-galactosidase, glycine arylamidase, histidine arylamidase, leucine arylamidase, leucyl glycine arylamidase et N-acétyl-bêta-glucosaminidase. Une réponse négative est obtenue pour les autres réactions enzymatiques.
Une croissance est observée pour des températures comprises entre 30 et 45 °C (température optimale comprise entre 37 et 40 °C), mais aucune culture n'est observée à 20 ou à 50 °C.
Après 4 jours d'incubation en anaérobiose et à 37°C, les colonies obtenues sur différents milieux (Wilkins Chalgren, Columbia au sang de mouton, PYG) sont rondes, à contour irrégulier, légèrement convexes, opaques, luisantes, grisâtres ou blanchâtres, non hémolytiques et leur diamètre est de 3 à 5 mm.
La présence d'une spore différencie Clostridium colicanis des Eubacterium sp. L'absence de lécithinase différencie Clostridium colicanis de Clostridium baratii et de Clostridium absonum.
Orientation bibliographique
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En 1994, Collins et al. réalisent une étude phylogénétique (analyse de la séquence des ADNr 16S) des espèces du genre Clostridium et des bactéries apparentées. Leurs résultats montrent que le genre Clostridium devrait être restreint aux espèces apparentées à Clostridium butyricum (espèce type du genre) et que les autres clostridies se répartissent dans au moins 24 genres appartenant à au moins neuf familles différentes.
Outre les espèces du genre Clostridium phylogénétiquement proches de Clostridium butyricum, le genre Clostridium sensu stricto inclut Sarcina ventriculi (espèce type du genre Sarcina) et des espèces classées dans le genre Eubacterium comme Eubacterium budayi, Eubacterium moniliforme, Eubacterium multiforme et Eubacterium nitritogenes.
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La nature des produits de fermentation n'est pas indiquée alors que, dans la description des techniques, les auteurs indiquent qu'elle a été recherchée en employant la technique de Holdeman, Cato et Moore, 1977.