J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Crée le 26 février 2010

CAMPYLOBACTER PELORIDIS

Voir aussi : ¤ Campylobacter.

Systématique

En 1980, Skirrow et Benjamin décrivent une souche thermophile de Campylobacter spp. qui se distinguait de Campylobacter jejuni par sa résistance à l'acide nalidixique. En 1984, Benjamin et al. décrivent une nouvelle espèce, Campylobacter laridis. L'épithète laridis (sic) a été choisie car la majorité des souches a pour origine l'intestin de mouettes (Larus sp.).
Le 13 avril 1984, la nomenclature de Campylobacter laridis a été validement publiée par citation sur la liste de validation 14. Cette nomenclature était incorrecte et, en 1990, elle a été corrigée en Campylobacter lari.

Campylobacter lari est une espèce hétérogène.
. Initialement, elle avait été appelée groupe NARTC (Nalidixic-Acid-Resistant Thermophilic Campylobacter). Par la suite, plusieurs variants biochimiques ont été décrits : souches uréase positive (UPTC pour Urease-Producing Thermophilic Campylobacter), souches sensibles à l'acide nalidixique (NASC pour Nalidixic-Acid-Susceptible Campylobacter), souches uréase positive et sensibles à l'acide nalidixique (UP-NASC pour Urease-Producing Nalidixic-Acid-Susceptible).
. L'utilisation de la technique AFLP (Amplified Fragment-Length Polymorphism, polymorphisme de taille des fragments de restriction) avait permis à Duim et al. d'identifier quatre groupes au sein de cette espèce.

En 2009, Debruyne et al. étudient 33 souches de Campylobacter lari.

L'analyse par AFLP (polymorphisme de taille des fragments de restriction) permet de séparer les souches en cinq groupes : un groupe correspond aux souches classiques de Campylobacter lari (ce groupe comprend la souche type de l'espèce), deux groupes correspondent aux souches de Campylobacter lari uréase positive, un groupe de dix souches est dénommé groupe I (cluster I) et un groupe de six souches est baptisé groupe II (cluster II). Les groupes I et II de Debruyne et al. correspondent, respectivement, aux génogroupes IV et III de Duim et al.

L'analyse électrophorétique des protéines cellulaires met en évidence quatre groupes : l'un correspondant aux souches classiques de Campylobacter lari, un groupe regroupe toutes les souches uréase positive et les deux autres groupes correspondent aux clusters I et II préalablement individualisés. Les souches du cluster II étant plus proches de Campylobacter lari sensu stricto que les souches du cluster I.

Pour apprécier la position phylogénétique des clusters I et II, le séquençage de l'ARNr 16S a été effectué sur deux souches de chacun des groupes.
. Les deux souches du groupe I présentent une similitude de séquence de 100 p. cent et les deux souches du groupe II présentent une similitude de 99,9 p. cent.
. La similitude entre une souche du groupe I et une souche du groupe II est 97,6 p. cent.
. Les espèces les plus proches de ces deux groupes (similitude supérieure à 97 p. cent) sont Campylobacter lari, Campylobacter jejuni, Campylobacter coli et ¤ Campylobacter insulaenigrae.

L'étude des séquences des gènes groEL montre que les souches du cluster I présentent 88 à 90 p. cent de similitude avec Campylobacter lari et que les souches du groupe II présentent plus de 96 p. cent de similitude avec Campylobacter lari.

Des hybridations ADN-ADN ont été réalisées entre une souche du groupe I (la souche LMG 23910), une souche du groupe II (la souche LMG 21009) et les souches types des espèces apparentées (Campylobacter lari, Campylobacter jejuni, Campylobacter coli et ¤ Campylobacter insulaenigrae).
. Le pourcentage d'homologie obtenu entre la souche LMG 23910 et la souche LMG 21009 est de 51.
. Les pourcentages d'homologie obtenus entre la souche LMG 23910 et les souches types des autres espèces sont égaux ou inférieurs à 45.
. Le pourcentage d'homologie obtenu entre la souche LMG 21009 et la souche type de Campylobacter lari est de 78. Les pourcentages d'homologie obtenus entre la souche LMG 23910 et les souches types des trois autres espèces (Campylobacter jejuni, Campylobacter coli et ¤ Campylobacter insulaenigrae) sont égaux ou inférieurs à 35.
. Les souches du groupe I, représenté par la souche LMG 23910, constituent donc une nouvelle espèce. En revanche, les souches du groupe II appartiennent à l'espèce Campylobacter lari.

Au vu de l'ensemble de ces résultats, Debruyne et al. proposent que les souches du groupe I soient placées dans une nouvelle espèce, Campylobacter peloridis et que les souches du groupe II soient considérées comme une sous-espèce de Campylobacter lari, Campylobacter lari subsp. concheus. La description de Campylobacter lari subsp. concheus conduit, de manière automatique, à la création de la sous-espèce Campylobacter lari subsp. lari (règle 40d du Code de Nomenclature).
Toutes ces nomenclatures ont été validement publiées le 12 mai 2009.

Caractères bactériologiques

Les souches de Campylobacter peloridis rassemblent des bactéries à Gram négatif, légèrement incurvées, n'hydrolysant pas l'hippurate, cultivant à 42 °C, oxydase et catalase positives.

Une croissance est observée sur des milieux contenant 1 p. cent de glycine et sur des milieux contenant 4 mg de métronidazole par litre. En revanche aucune culture n'est obtenue sur un milieu contenant 0,05 p. cent de safranine ou sur un milieu contenant 32 mg par litre de carbénicilline.

Huit souches sur les 10 étudiées cultivent en présence de 2 p. cent de NaCl ou en présence de 32 mg par litre d'acide nalidixique.
Neuf souches sur dix sont incapables de cultiver en présence de 32 mg par litre de céfalotine.

Après 72 heures d'incubation à 37 °C dans une atmosphère micro-aérophile, les colonies obtenues sur une gélose au sang de mouton sont circulaires, à contour régulier, convexes et leur diamètre atteint 1 à 1,5 mm.

Quelques caractères permettant de différencier Campylobacter peloridis des autres espèces du genre sont donnés dans le tableau I.

Habitat et pouvoir pathogène

Huit souches sur les dix étudiées ont été isolées, en Hollande, de coquillages (sans aucune précision complémentaire). Les deux autres souches ont pour origine la Belgique. L'une a été isolée de fèces humaines et l'autre d'un liquide de dialyse. Le pouvoir pathogène de cette espèce est inconnu.

Orientation bibliographique

Voir aussi le fichier ¤ Campylobacter.

DEBRUYNE (L.), ON (S.L.W.), DE BRANDT (E.) et VANDAMME (P.) : Novel Campylobacter lari-like bacteria from humans and molluscs: description of Campylobacter peloridis sp. nov., Campylobacter lari subsp. concheus subsp. nov. and Campylobacter lari subsp. lari subsp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2009, 59, 1126-1132.

DUIM (B.), WAGENAAR (J.A.), DIJKSTRA (J.R.), GORIS (J.), ENDTZ (H.P.) et VANDAMME (P.A.) : Identification of distinct Campylobacter lari genogroups by amplified fragment length polymorphism and protein electrophoretic profiles. Appl. Environ. Microbiol., 2004, 70, 18–24.

DUIM (B.), WASSENAAR (T.M.), RIGTER (A.) et WAGENAAR (J.) : High-resolution genotyping of Campylobacter strains isolated from poultry and humans with amplified fragment length polymorphism fingerprinting. Appl. Environ. Microbiol., 1999, 65, 2369–2375.

KÄRENLAMPI (R.I.), TOLVANEN (T.P.) et HÄNNINEN(M.L.) : Phylogenetic analysis and PCR-restriction fragment length polymorphism identification of Campylobacter species based on partial groEL gene sequences. J. Clin. Microbiol., 2004, 42, 5731–5738.

LIOR (H.) : New, extended biotyping scheme for Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, and "Campylobacter laridid". J. Clin. Microbiol., 1984, 20, 636-640.

MATSUDA (M.), KANEKO (A.), STANLEY (T.), MILLAR (B.C.), MIYAJIMA (M.), MURPHY (P.G.) et MOORE (J.E.) : Characterization of urease-positive thermophilic Campylobacter subspecies by multilocus enzyme electrophoresis typing. Appl. Environ. Microbiol., 2003, 69, 3308–3310.

MILLER (W.G.), ON (S.L.), WANG (G.), FONTANOZ (S.), LASTOVICA (A.J.) et MANDRELL (R.E.) : Extended multilocus sequence typing system for Campylobacter coli, C. lari, C. upsaliensis, and C. helveticus. J. Clin. Microbiol., 2005, 43, 2315–2329.

ON (S.L.W.) : Identification methods for campylobacters, helicobacters, and related organisms. Clin. Microbiol. Rev., 1996, 9, 405-422.

ON (S.L.) et HOLMES (B.) : Effect of inoculum size on the phenotypic characterization of Campylobacter species. J. Clin. Microbiol., 1991, 29, 923–926.

ON (S.L.) et HOLMES (B.) : Reproducibility of tolerance tests that are useful in the identification of campylobacteria. J. Clin. Microbiol., 1991, 29, 1785–1788.

ON (S.L.) et HOLMES (B.) : Assessment of enzyme detection tests useful in identification of campylobacteria. J. Clin. Microbiol., 1992, 30, 746–749.

ON (S.L.W.) et HOLMES (B.) : Classification and identification of campylobacters, helicobacters and allied taxa by numerical analysis of phenotypic tests. Syst. Appl. Microbiol., 1995, 18, 374-390.

ON (S.L.W.), HOLMES (B.) et SACKIN (M.J.) : A probability matrix for the identification of campylobacters, helicobacters and allied taxa. J. Appl. Bacteriol., 1996, 81, 425-432.

SKIRROW (M.B.) et BENJAMIN (J.) : '1001' Campylobacters: cultural characteristics of intestinal campylobacters from man and animals. J .Hyg. (Lond)., 1980, 85, 427-442.

STACKEBRANDT (E.), FREDERIKSEN (W.), GARRITY (G.M.), GRIMONT (P.A.D.), KÄMPFER (P.), MAIDEN (M.C.J.), NESME (X.), ROSSELLO-MORA (R.), SWINGS (J.), TRÜPER (H.G.), VAUTERIN (L.), WARD (A.C.) et WHITMAN (W.B.) : Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 1043-1047.

STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.

URSING (J.B.), LIOR (H.) et OWEN (R.J.) : Proposal of minimal standards for describing new species of the family Campylobacteraceae. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 842–845.

WAYNE (L. G.), BRENNER (D.J.), COLWELL (R.R.), GRIMONT (P.A.D.), KANDLER (O.), KRICHEVSKY (M.I.), MOORE (L.H.), MOORE (W.E.C.), MURRAY (R.G.E.), STACKEBRANDT (E.), STARR (M.P.) et TRÜPER (H.G.): Report of the ad hoc committee on reconciliation of approaches to bacterial systematics. Int. J. Syst. Bacteriol., 1987, 37, 463-464.

VON GRAEVENITZ (A.): Revised nomenclature of Campylobacter laridis, Enterobacter intermedium, and "Flavobacterium branchiophila". Int. J. Syst. Bacteriol., 1990, 40, 211.

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