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Créé le 17 février 2010
CHRYSEOBACTERIUM PISCICOLA
Note : Pour une information concernant les poissons cités dans ce fichier, voir le site FishBase (rentrer le nom du genre et le nom de l'espèce dans le fichier Search FishBase).
Systématique
Des examens bactériologiques, pratiqués sur des poissons élevés au Chili et présentant des signes évoquant une infection à ¤ Flavobacterium psychrophilum, ont permis d'isoler huit souches bactériennes. Trois souches ont pour origine des alevins de saumons de l'Atlantique (Salmo salar) et cinq souches proviennent d'alevins de truites arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss). Les isolements ont été réalisées sur des géloses d’Anacker et Ordal* incubées à 15 °C durant trois jours.
L'analyse des séquences des ARNr 16S montre que les huit souches appartiennent au genre ¤ Chryseobacterium. Les espèces phylogénétiquement les plus proches sont Chryseobacterium soldanellicola (96, 9 p. cent de similitude) et Chryseobacterium soli (97,1 p, cent de similitude).
Les hybridations ADN-ADN réalisées avec la souche VQ-6316s et les souches types de Chryseobacterium soldanellicola et de Chryseobacterium soli montrent que la souche VQ-6316s mérite d'être placée dans une nouvelle espèce (pourcentages d'homologie inférieurs 17,1). Les caractères phénotypiques permettent de caractériser les huit souches isolées au Chili, ce qui conduit Ilardi et al. à proposer la nomenclature de Chryseobacterium piscicola (nomenclature validement publiée le 12 décembre 2009).
Caractères bactériologiques
Les souches de Chryseobacterium piscicola se présentent comme des bacilles à Gram négatif, de 1,6 à 3,5 µm de longueur sur 0,8 à 1,2 µm de diamètre, immobiles, catalase et oxydase positives, à métabolisme non fermentatif. . Une réponse positive est observée pour les tests hydrolyse de l'ADN (réaction faiblement positive), hydrolyse de l'esculine et hydrolyse de la gélatine. . Une réponse négative est obtenue pour les tests réduction des nitrates, ADH, LDC, ODC, uréase, indole, production d'hydrogène sulfuré, RM, VP, hydrolyse de l'agar, hydrolyse de l'amidon, hydrolyse de la caséine, hydrolyse de la tyrosine et hydrolyse du Tween 80. . Les huit souches donnent un profil numérique identique (0006024) sur des galeries API 20E incubées à 15 °C. Il convient de remarquer que les résultats obtenus pour l'acidification du glucose et du saccharose sont positifs alors que les résultats obtenus par des techniques traditionnelles en tubes sont négatifs.
. En utilisant des galeries API ZYM incubées à 15 °C, une réponse positive est obtenue pour les tests phosphatase alcaline, estérase, estérase lipase, lipase, leucine arylamidase, valine arylamidase, cystine arylamidase, alpha-chymotrypsine, phosphatase acide , naphthol-AS-BI-phosphohydrolase, bêta-glucuronidase, alpha-glucosidase, bêta-glucosidase et N-acétyl-bêta-glucosaminidase.
Une culture est observée pour des températures comprises entre 4 et 28 °C (température optimale de croissance égale à 15 °C) et pour des concentrations en NaCl comprises entre 0 et 3 p. cent (croissance optimale pour une concentration de 0,5 p. cent).
Les caractères permettant de différencier Chryseobacterium piscicola d'autres espèces du genre sont donnés dans le tableau I. Chryseobacterium piscicola est souvent isolé en association avec ¤ Flavobacterium psychrophilum. Les principaux caractères permettant de différencier ces deux espèces sont présentés dans le tableau ci-dessous.
Habitat et pouvoir pathogène
Les poissons infectés présentent des ulcères de la peau et des muscles, retrouvés principalement sur les flancs, la région anale et le pédoncule caudal. Cliniquement, l'infection est comparable à la maladie des eaux froides due à ¤ Flavobacterium psychrophilum.
Expérimentalement, l'immersion de saumons de l'Atlantique (poids de 8 à 10 grammes) durant 18 heures, dans une eau à 15 °C contenant cinq millions bactéries par mL, ne conduit pas à l'apparition de signes cliniques. Il en va de même lorsque l'eau contient une souche de ¤ Flavobacterium psychrophilum. En revanche, l'immersion dans une eau contenant un mélange d'une souche de Chryseobacterium piscicola (2,5 x 106 cellules par mL) et d'une souche de ¤ Flavobacterium psychrophilum (2,5 x 106 cellules par mL), permet de reproduire la maladie et les germes peuvent être isolés des poissons malades. Une mortalité apparaît 11 jours après l'infection expérimentale et le taux de mortalité atteint 100 p. cent 23 jours après l'infection. Cliniquement, l'infection est identique à l'infection naturelle.
Sensibilité aux antibiotiques
La sensibilité aux antibiotiques, mesurée après 48 ou 72 heures d'incubation sur une gélose de Müller-Hinton incubée à 15 °C, est identique pour les huit souches. Une résistance est observée pour l'oxytétracycline (disques chargés à 30 µg). En revanche les souches sont sensibles à l'amoxicilline (disques chargés à 25 µg), au triméthoprime-sulfaméthoxazole (disques chargés à 1,25/23,75 µg), à l'enrofloxacins (disques chargés à 5 µg) et au florfénicol (disques chargés à 30 µg).
Orientation bibliographique
BERNARDET (J.F.), NAKAGAWA (Y.) et HOLMES (B.) : Proposed minimal standards for describing new taxa of the family Flavobacteriaceae and emended description of the family. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 1049-1070. BERNARDET (J.F.), VANCANNEYT (M.), MATTE-TAILLIEZ (O.), GRISEZ (L.), TAILLIEZ (P.), BIZET (C.), NOWAKOWSKI (M.), KEROUAULT (B.) et SWINGS (J.) : Polyphasic study of Chryseobacterium strains isolated from diseased aquatic animals. Sys. Appl. Microbiol., 2005, 28, 640-660. ILARDI (P.) et AVENDAÑO-HERRERA (R.) : Isolation of Flavobacterium-like bacteria from diseased salmonids cultured in Chile. Bull. Eur. Assoc. Fish Pathol., 2008, 28, 176–185. ILARDI (P.), FERNÁNDEZ (J.) et AVENDAÑO-HERRERA (R.) : Chryseobacterium piscicola sp. nov., isolated from diseased salmonid fish. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2009, 59, 3001-3005. VANDAMME (P.), BERNARDET (J.F.), SEGERS (P.), KERSTERS (K.) et HOLMES (B.) : New perspectives in the classification of the flavobacteria: description of Chryseobacterium gen. nov., Bergeyella gen. nov., and Empedobacter nom. rev. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 827-831.
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Tryptone : 0,5 p. cent
La composition du milieu est donnée dans le fichier R2A (Agar).
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