J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 04 août 2003
CORYNEBACTERIUM SPHENISCI
La nomenclature de Corynebacterium sphenisci a été validement publiée le 7 juillet 2003 pour six souches bactériennes isolées du cloaque de pingouins (Spheniscus magellanicus*) apparemment sains.
Les caractères phénotypiques des six souches et les caractères chimiotaxonomiques de la souche CECT 5990 (qui sera désignée comme la souche type) sont compatibles avec leur classement au sein du genre Corynebacterium.
Les séquences des ARNr 16S des six souches présentent des homologies égales ou supérieures à 99,9 p. cent. Une comparaison avec les séquences disponibles dans les bases de données EMBL/GenBank confirme l'appartenance des souches au genre Corynebacterium. Les espèces phylogénétiquement les plus proches sont ¤ Corynebacterium amycolatum, Corynebacterium xerosis et Corynebacterium freneyi. Toutefois, les homologies entre les séquences des ARNr 16S ne dépassent pas 97 p. cent et, selon Stackebrandt et Goebel, cette valeur est compatible avec la reconnaissance d'une nouvelle espèce.
Les souches de Corynebacterium sphenisci sont constituées de bacilles à Gram positif dont le peptidoglycane renferme de l'acide meso-diaminopimélique, dépourvus d'acide tuberculostéarique mais possédant des acides mycoliques à courtes chaînes (C22 à C32), immobiles, non sporulés, non lipophiles, aéro-anaérobies, catalase positive, oxydase négative, nitrate réductase positive et donnant une réponse négative au test de CAMP** effectué avec une souche de Staphylococcus aureus subsp. aureus.
Les caractères biochimiques ont été étudiés à l'aide de galeries API CORYNE, API 50CH et API ZYM.
. Un réponse négative est observée pour les tests hydrolyse de l'esculine, hydrolyse de la gélatine et hydrolyse de l'urée.
. Les six souches acidifient le fructose, le galactose, le glucose, le maltose, le mannose et le tréhalose mais elles n'acidifient pas le glycogène, le lactose, le mannitol, le ribose, le saccharose ou le xylose.
. Les six souches donnent une réponse positive aux tests pyrazinamidase, estérase C4, estérase lipase C8, lipase C14, leucine arylamidase, valine arylamidase, cystine arylamidase, chymotrypsine, phosphatase acide et naphtol-AS-BI-phosphohydrolase. La réponse est négative pour les autres tests d'une galerie API ZYM.
. En utilisant une galerie API CORYNE, on obtient le profil numérique 3 0 0 0 1 2 4.
Dans la base de données API, un tel profil correspond à une bonne identification de Corynebacterium striatum/¤ Corynebacterium amycolatum.
. Quelques caractères permettant de différencier Corynebacterium sphenisci des espèces phylogénétiquement proches figurent dans le tableau I.
Après 48 heures d'incubation en aérobiose et à 37 °C, les colonies obtenues sur une gélose Columbia au sang de mouton sont blanchâtres, légèrement surélevées, sèches et d'aspect rugueux, non hémolytiques et leur diamètre est compris entre 1 et 2 mm.
La description de Corynebacterium sphenisci a été effectuée sous la responsabilité de Fernández-Garayzábal. En février 2003, le même auteur assumait la responsabilité de la description de ¤ Corynebacterium spheniscorum également isolé du cloaque de pingouins de Magellan apparemment sains. De manière un peu surprenante, l'article consacré à Corynebacterium sphenisci ne fait pas allusion à ¤ Corynebacterium spheniscorum et, inversement, l'article décrivant cette dernière espèce ne mentionne pas Corynebacterium sphenisci.
Corynebacterium sphenisci et ¤ Corynebacterium spheniscorum se différencient facilement par les caractères mentionnés dans le tableau II.
Corynebacterium sphenisci a été isolé, en association avec Staphylococcus sciuri (sans précision en ce qui concerne la sous-espèce), du cloaque de pingouins de Magellan. L'habitat de ces oiseaux n'est pas précisé. Toutefois, comme l'isolement de ¤ Corynebacterium spheniscorum a été effectué chez des pingouins de la péninsule de Valdes*** (Patagonie, Argentine), on peut supposer que les oiseaux hébergeant Corynebacterium sphenisci vivaient également dans la péninsule de Valdes.
Orientation bibliographique
FUNKE (G.), VON GRAEVENITZ (A.), CLARRIDGE III (J.E.) et BERNARD (K.A.) : Clinical microbiology of coryneform bacteria. Clin. Microbiol. Rev., 1997, 10, 125-159.
GOYACHE (J.), BALLESTEROS (C.), VELA (A.I.), COLLINS (M.D.), BRIONES (V.), HUTSON (R.A.), POTTI (J.), GARCÍA-BORBOROGLU (P.), DOMÍNGUEZ (L.) et FERNÁNDEZ-GARAYZÁBAL (J.F.) : Corynebacterium sphenisci sp. nov., isolated from wild penguins. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 1009-1012.
GOYACHE (J.), VELA (A.I.), COLLINS (M.D.), BALLESTEROS (C.), BRIONES (V.), MORENO (J.), YORIO (P.), DOMÍNGUEZ (L.), HUTSON (R.) et FERNÁNDEZ-GARAYZÁBAL (J.F.) : Corynebacterium spheniscorum sp. nov., isolated from the cloacae of wild penguins. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 43-46.
STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.
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La systématique ainsi qu'une photographie du pingouin de Magellan (Spheniscus magellanicus) figurent dans le fichier PINGUINO DE MAGALLANES (site Aves de Chile réalisé par le Dr. Héctor Hito Andrés Sepúlveda Allende).
** Test de CAMP (Christie, Atkins, Munch-Petersen) :
La réalisation du test de CAMP est simple. Sur une gélose au sang de mouton on ensemence en strie une souche de Staphylococcus aureus subsp. aureus bêta hémolytique puis la souche à étudier est ensemencée selon une strie perpendiculaire réalisée sans toucher celle de Staphylococcus aureus subsp. aureus.
. Un CAMP test positif se traduit par une augmentation de la zone d'hémolyse à la jonction des deux stries.
. Un CAMP test est négatif lorsque l'hémolyse de la souche de Staphylococcus aureus subsp. aureus est inchangée.
. Un CAMP test est qualifié de "reverse positif" si on observe une inhibition de la zone d’hémolyse à la jonction des deux stries.
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Pour quelques renseignements concernant la péninsule de Valdes voir le site PATAGONIA Life at the end of the Earth.