J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Crée le 31 mai 2010

CAMPYLOBACTER SUBANTARCTICUS

Voir aussi : ¤ Campylobacter.

Systématique

En février et mars 1996, des écouvillonnages rectaux ont été effectués chez des animaux vivant dans les îles de la Géorgie du Sud : 50 otarie de Kerguelen (Arctocephalus gazella), 30 manchots papou (Pygoscelis papua), 50 gorfous dorés (Eudyptes chrysolophus), 50 albatros à sourcils noirs (Thalassarche melanophris) et 50 albatros à tête grise (Thalassarche chrysostoma).
Pour une information sur les espèces animales citées dans ce fichier, voir la note infrapaginale.

Plusieurs souches bactériennes, évoquant ¤ Campylobacter lari, ont été isolées des oiseaux. En revanche, aucune souche n'a pu être isolée des otaries.
Trois souches isolées d'albatros à tête grise, deux souches isolées d'albatros à sourcils noirs et une souche isolée d'un manchot papou ont fait l'objet d'une étude taxonomique.

L'analyse électrophorétique des protéines cellulaires et l'analyse par AFLP (polymorphisme de taille des fragments de restriction) indiquent que ces souches forment un groupe distinct de toutes les autres espèces du genre ¤ Campylobacter.
Le séquençage de l'ARNr 16S, effectué sur quatre souches, révèle que trois souches présentent 100 p. cent de similitude et qu'une souche se distingue par une divergence de 0,5 p. cent. Les espèces phylogénétiquement les plus proches (pourcentages de similitude supérieurs à 97) sont ¤ Campylobacter lari subsp. concheus, ¤ Campylobacter lari subsp. lari, Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, ¤ Campylobacter insulaenigrae et ¤ Campylobacter peloridis.
Les hybridations ADN-ADN effectuées entre la souche LMG 24377 (qui sera désignée comme la souche type de Campylobacter subantarcticus) et les souches types des espèces phylogénétiquement les plus proches révèlent des pourcentages d'homologie inférieurs ou égaux à 57.

Les caractères phénotypiques permettent d'identifier ces souches ce qui conduit Debruyne et al. à proposer une nouvelle espèce, Campylobacter subantarcticus dont la nomenclature a été validement publiée le 14 avril 2010.

Caractères bactériologiques

Les souches de Campylobacter subantarcticus sont constituées de bacilles à Gram négatif, légèrement incurvés, micro-aérophiles, mobiles grâce à un unique flagelle polaire, oxydase et catalase positives, résistants à l'acide nalidixique (32 mg/mL) et sensibles à la céfalotine (32 mg/mL).

. Une réponse positive est notée pour les tests croissance en anaérobiose (à 37 °C), croissance en présence de 0,1 p. cent d'oxyde de triméthylamine, croissance en présence de 1 à 2 p. cent de bile de bœuf, croissance en présence de 2 p. cent de NaCl, croissance en présence de 100 U de 5-fluorouracile et croissance en présence de 0,05 p. cent de fluoride de sodium.
. Une réponse négative est observée avec les tests hydrolyse de l'hippurate, hydrolyse de l'indoxyl acétate, production d'hydrogène sulfuré (milieu TSI), réduction du sélénite, culture sur gélose nutritive, culture en présence de 0,02 ou de 0,05 p. cent de safranine, culture en présence de 0,1 p. cent de permanganate de potassium, culture en présence de 0,005 p. cent de cristal violet, culture en présence de 3,5 p. cent de NaCl, culture en présence de 0,1 p. cent de désoxycholate de sodium et culture en présence de 32 mg/mL de carbénicilline.
. La croissance en présence de 1 p. cent de glycine, de 4 mg de métronidazole ou la culture sur une gélose de MacConkey sont des caractères variables selon les souches.

Dans une atmosphère micro-aérophile, après 72 heures de culture sur une gélose Columbia ou sur une gélose de Mueller-Hinton enrichie de 5 p. cent de sang de cheval, les colonies sont incolores, rondes, convexes, leur diamètre atteint 1 à 1,5 mm et elles s'entourent d'une zone d'hémolyse alpha.
Une croissance est observée après incubation à 37 ou à 42 °C. En revanche aucune culture n'est obtenue en aérobiose ou après incubation à 18, 22 ou 25 °C.

Habitat et pouvoir pathogène

Toutes les souches de Campylobacter subantarcticus ont pour origine des oiseaux sauvages et l'absence d'isolement à partir d'otaries suggère que l'habitat de cette espèce soit le tube digestif des oiseaux. Le pouvoir pathogène de Campylobacter subantarcticus est inconnu.

Diagnostic bactériologique

Les souches ont été isolées sur une gélose sélective (gélose Columbia enrichie de sang de cheval et contenant 2500 UI/L de polymyxine B, 10 mg/L de vancomycine et 5 mg/L de triméthoprime) incubée 48 heures à 42 °C dans une atmosphère micro-aérophile (4 p. cent d'oxygène, 6,5 p. cent de dioxyde de carbone, 6,5 p. cent d'hydrogène, 83 p. cent d'azote).
L'identification est difficile. Elle repose sur l'aspect des colonies, la morphologie des cellules et sur les caractères listés dans le tableau I.

Orientation bibliographique

Voir aussi le fichier ¤ Campylobacter.

DEBRUYNE (L.), BROMAN (T.), BERGSTRÖM (S.), OLSEN (B.), ON (S.L.W.) et VANDAMME (P.) : Campylobacter subantarcticus sp. nov., isolated from birds in the sub-Antarctic region. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2010, 60, 815-819.

DEBRUYNE (L.), ON (S.L.W.), DE BRANDT (E.) et VANDAMME (P.) : Novel Campylobacter lari-like bacteria from humans and molluscs: description of Campylobacter peloridis sp. nov., Campylobacter lari subsp. concheus subsp. nov. and Campylobacter lari subsp. lari subsp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2009, 59, 1126-1132.

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STACKEBRANDT (E.), FREDERIKSEN (W.), GARRITY (G.M.), GRIMONT (P.A.D.), KÄMPFER (P.), MAIDEN (M.C.J.), NESME (X.), ROSSELLO-MORA (R.), SWINGS (J.), TRÜPER (H.G.), VAUTERIN (L.), WARD (A.C.) et WHITMAN (W.B.) : Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 1043-1047.

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URSING (J.B.), LIOR (H.) et OWEN (R.J.) : Proposal of minimal standards for describing new species of the family Campylobacteraceae. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 842–845.

WALDENSTRÖM (J.), BROMAN (T.), CARLSSON (I.), HASSELQUIST (D.), ACHTERBERG (R.P.), WAGENAAR (J.A.) et OLSEN (B.) : Prevalence of Campylobacter jejuni, Campylobacter lari, and Campylobacter coli in different ecological guilds and taxa of migrating birds. Appl. Environ. Microbiol., 2002, 68, 5911–5917.

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Quelques informations sur les espèces animales citées dans ce fichier

Thalassarche chrysostoma ou Diomedea chrysostoma (albatros à tête grise)

Classification d'après The NCBI Entrez Taxonomy Homepage : Eukaryota , Fungi/Metazoa group , Metazoa , Eumetazoa , Bilateria , Coelomata , Deuterostomia , Chordata , Craniata , Vertebrata , Gnathostomata , Teleostomi , Euteleostomi , Sarcopterygii , Tetrapoda , Amniota , Sauropsida , Sauria , Archosauria , Dinosauria , Saurischia , Theropoda , Coelurosauria , Aves , Neognathae , Procellariiformes , Diomedeidae , Thalassarche, Thalassarche chrysostoma.

Pour plus d'informations sur cette espèce, voir Albatros à tête grise in Wikipedia.

Thalassarche melanophris ou Diomedea melanophris (albatros à sourcils noirs)

Pour plus d'informations sur cette espèce, voir Albatros à sourcils noirs in Wikipedia.

Pygoscelis papua (manchot papou)

Classification d'après The NCBI Entrez Taxonomy Homepage : Eukaryota , Fungi/Metazoa group , Metazoa , Eumetazoa , Bilateria , Coelomata , Deuterostomia , Chordata , Craniata , Vertebrata , Gnathostomata , Teleostomi , Euteleostomi , Sarcopterygii , Tetrapoda , Amniota , Sauropsida , Sauria , Archosauria , Dinosauria , Saurischia , Theropoda , Coelurosauria , Aves , Neognathae , Sphenisciformes , Spheniscidae , Pygoscelis, Pygoscelis papua.

Pour plus d'informations sur cette espèce, voir Pygoscelis papua in Animal Diversity Web, University of Michigan Museum of Zoology.

Arctocephalus gazella (otarie à fourrure antarctique, ou otarie de Kerguelen)

Classification d'après The NCBI Entrez Taxonomy Homepage : Eukaryota , Fungi/Metazoa group , Metazoa , Eumetazoa , Bilateria , Coelomata , Deuterostomia , Chordata , Craniata , Vertebrata , Gnathostomata , Teleostomi , Euteleostomi , Sarcopterygii , Tetrapoda , Amniota , Mammalia , Theria , Eutheria , Laurasiatheria , Carnivora , Caniformia , Otariidae , Arctocephalus, Arctocephalus gazella.

Pour plus d'informations sur cette espèce, voir Arctocephalus gazella in Animal Diversity Web, University of Michigan Museum of Zoology.

Eudyptes chrysolophus (gorfou doré ou gorfou macaroni)

Classification d'après The NCBI Entrez Taxonomy Homepage : Eukaryota , Fungi/Metazoa group , Metazoa , Eumetazoa , Bilateria , Coelomata , Deuterostomia , Chordata , Craniata , Vertebrata , Gnathostomata , Teleostomi , Euteleostomi , Sarcopterygii , Tetrapoda , Amniota , Sauropsida , Sauria , Archosauria , Dinosauria , Saurischia , Theropoda , Coelurosauria , Aves , Neognathae , Sphenisciformes , Spheniscidae , Eudyptes, Eudyptes chrysolophus.

Pour plus d'informations sur cette espèce, voir Eudyptes chrysolophus in Animal Diversity Web, University of Michigan Museum of Zoology.

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