J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Créé le 07 décembre 2001
Dernière mise à jour le 10 décembre 2004

EHRLICHIACEAE, EHRLICHIEAE

Voir aussi les fichiers Anaplasmataceae, "Candidatus Neoherlichia mikurensis", Ehrlichia, Neorickettsia, Rickettsiaceae, Rickettsiales, Groupes génomiques de la tribu des Ehrlichieae ou de la famille des Ehrlichiaceae ou de la famille des Anaplasmataceae et Classification de l'ordre des Rickettsiales.

Ehrlichiaceae

La famille des Ehrlichiaceae a été décrite en 1945 et cette nomenclature est inscrite dans les Approved Lists of Bacterial Names. Toutefois, ce rang hiérarchique était peu utilisé et la majorité des auteurs préférait étudier les divers genres de cette famille (notamment les genres Ehrlichia, Cowdria et Neorickettsia) au sein de la tribu des Ehrlichieae. Ainsi, dans la huitième édition du Bergey's Manual of Determinative Bacteriology ou dans la première édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, la famille des Ehrlichiaceae ne fait pas l'objet d'une étude particulière et elle est considérée comme équivalente à la tribu des Ehrlichieae.

Ehrlichieae

La tribu des Ehrlichieae a été proposée en 1957 par Philip pour classer des bactéries de petite taille, ressemblant à des rickettsies, pathogènes pour des vertébrés mais pas pour l'homme et aptes à infecter des invertébrés, notamment (mais pas exclusivement) des arthropodes. Cette nomenclature a été retenue par les Approved Lists of Bacterial Names, mais depuis 1957, la description de cette tribu a évolué et, actuellement, l'existence même de cette tribu est remise en cause.

La tribu des Ehrlichieae en 1957

Pour Philip, la tribu des Ehrlichieae appartenait à la famille des Rickettsiaceae et elle comprenait trois genres, le genre Ehrlichia (Ehrlichia canis, "Ehrlichia bovis", "Ehrlichia ovina"), le genre Cowdria (Cowdria ruminantium) et le genre Neorickettsia (Neorickettsia helminthoeca). En dépit de changements concernant les espèces, l'organisation de cette tribu est restée stable pendant une trentaine d'années. Ainsi, dans la première édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology publiée en 1984, la tribu des Ehrlichieae était toujours placée dans la famille des Rickettsiaceae et elle rassemblait toujours les genres Ehrlichia (Ehrlichia canis, Ehrlichia phagocytophila, Ehrlichia equi, Ehrlichia sennetsu), Cowdria (Cowdria ruminantium) et Neorickettsia (Neorickettsia helminthoeca).

La tribu des Ehrlichieae à la date du 14 novembre 2001

Les premiers bouleversements importants ont résulté des études phylogénétiques. En effet, les études comparatives des séquences de l'ADN codant pour les ARNr 16S montrent : 1) qu'il est possible de séparer la tribu des Ehrlichieae en quatre groupes génomiques (voir tableau I) ; 2) que Anaplasma marginale et Anaplasma ovis (bactéries autrefois classées dans l'ordre des Rickettsiales, famille des Anaplasmataceae) appartiennent au groupe génomique II ; 3) que les espèces du genre Wolbachia (bactéries autrefois placées dans l'ordre des Rickettsiales, famille des Rickettsiaceae, tribu des Wolbachieae) appartiennent au groupe génomique IV.
Une souche bactérienne, préalablement connue sous le nom d'agent WSU 86-1044, avait été rapprochée de la tribu des Ehrlichieae sur la base de communautés antigéniques avec ¤ Ehrlichia (Cowdria) ruminantium. En fait, elle constitue une espèce de l'ordre des ¤ Chlamydiales et elle a été placée dans le genre ¤ Waddlia avec la nomenclature de ¤ Waddlia chondrophila.

Sur le plan phénotypique, à l'exception des espèces du genre Wolbachia, la tribu des Ehrlichieae se définissait comme un groupe rassemblant des micro-organismes généralement de forme arrondie, présentant un tropisme pour diverses cellules dont les globules rouges et doués d’un pouvoir pathogène pour certains mammifères dont l'homme. Ce sont des bactéries à Gram négatif, colorées en pourpre par le May-Grümwald-Giemsa, immobiles, non cultivables sur milieux inertes, non cultivables sur œufs embryonnés, parasites intracellulaires obligatoires et se multipliant dans le cytoplasme des cellules infectées.
Les représentants de la tribu des Ehrlichieae se transmettent aux hôtes vertébrés par des vecteurs : helminthes ou arthropodes (voir tableau I).
Au sein d'un même groupe génomique, il existe de fortes réactivités antigéniques croisées alors que les réactions sérologiques croisées sont plus faibles entre espèces appartenant à des groupes génomiques différents.

La tribu des Ehrlichieae depuis le 15 novembre 2001

Dans un article paru le 15 novembre 2001, Dumler et al. procèdent à une réorganisation de l'ordre des Rickettsiales basée sur l'analyse des séquences des ARNr 16S, l'analyse des gènes des opérons groESL et l'analyse des gènes codant pour des protéines de surface. En fait, les conclusions de Dumler et al. confirment de nombreux travaux antérieurs mais ces auteurs franchissent un cap supplémentaire dans la mesure où ils en tirent toutes les conséquences sur le plan de la nomenclature. Pour Dumler et al., la notion de tribu au sein de la famille des Rickettsiaceae doit être abolie et tous les représentants de la tribu des Ehrlichieae sont reclassés dans la famille des Anaplasmataceae.

. Les espèces du groupe génomique I constituent le genre Ehrlichia sensu stricto si bien que Cowdria ruminantium est reclassée dans le genre Ehrlichia sous la forme d'une nouvelle combinaison, ¤ Ehrlichia ruminantium.
Comme Cowdria ruminantium est l'unique espèce du genre Cowdria, l'existence de ce genre doit être abolie par tous les bactériologistes adhérent à la proposition de Dumler et al. (règle 37a du Code de Nomenclature).

. Les espèces du groupe génomique II sont regroupées en un seul genre qui, en raison des règles de priorité, est appelé Anaplasma.
- Les espèces Ehrlichia phagocytophila, Ehrlichia equi ainsi que l'agent de l'ehrlichiose granulocytique humaine (agent EGH) présentent de nombreuses similitudes génotypiques si bien qu'elles sont regroupés au sein d'une unique taxon appelé Anaplasma phagocytophilum (l'épithète spécifique phagocytophilum a priorité.
L'analyse des séquences des gènes gltA (codant pour la citrate synthétase), effectuée par Inokuma et al., montre cependant que Ehrlichia phagocytophila, Ehrlichia equi et l'agent de l'ehrlichiose granulocytique humaine pourraient constituer un groupe proche mais différent du genre Anaplasma. De plus, ces auteurs rappellent que les Anaplasma infectent les globules rouges alors que Ehrlichia phagocytophila, Ehrlichia equi et l'agent EGH infectent principalement les granulocytes. Inokuma et al. estiment que ces différences génétiques et biologiques pourraient justifier la création d'un nouveau genre destiné à accueillir Ehrlichia phagocytophila, Ehrlichia equi et l'agent de l'ehrlichiose granulocytique humaine. Les articles de Dumler et al. et de Inokuma et al. ont été publiés de manière pratiquement simultanée (respectivement novembre 2001 et septembre 2001) si bien que les résultats de Inokuma et al. n'ont pu être pris en compte par Dumler et al.
Inokuma et al. ne font aucune proposition formelle concernant la nomenclature, mais il n'est pas impossible que dans l'avenir de nouveaux changements soient proposés.
- La nomenclature de "Ehrlichia platys" était dépourvue de statut dans la nomenclature. Son transfert dans le genre Anaplasma conduit à la publication valide de Anaplasma platys.
- Dumler et al. incluent également dans le genre Anaplasma une espèce décrite en 1936 par Donatien et Lestoquard et désignée sous les appellations de "Ehrlichia bovis" ou de "Rickettsia bovis". Cette espèce n'avait pas fait l'objet de nombreuses études phylogénétiques mais l'analyse des séquences des ARNr 16S montre qu'elle est proche de Anaplasma centrale, de Anaplasma marginale et de Anaplasma ovis si bien que Dumler et al. valident pour elle la nomenclature de Anaplasma bovis.

. Les espèces du groupe génomique III doivent être rassemblées en un unique genre qui, en raison des règles de priorité doit être appelé Neorickettsia. Le genre Neorickettsia comprend ainsi trois espèces Neorickettsia helminthoeca, Neorickettsia risticii et Neorickettsia sennetsu.

. Le groupe génomique IV constitue le genre Wolbachia réduit à sa seule espèce type, Wolbachia pipientis.

Ultérieurement, le genre ¤ Aegyptianella a été rapproché des Anaplasma sp. et Kawahara et al. ont décrit un nouveau genre et une nouvelle espèce "Candidatus Neoherlichia mikurensis".

Il est important de rappeler qu'il n'existe pas de classification officielle des bactéries et qu'un bactériologiste n'est pas tenu d'adopter les propositions de Dumler et al. si elles vont à l'encontre de son opinion scientifique. La publication de Dumler et al. ne rend pas illégitime les nomenclatures validement publiées avant le 15 novembre 2001 et un auteur a tout à fait le droit de conserver la famille des Ehrlichiaceae ou la tribu des Ehrlichieae de même qu'il a le droit d'utiliser les nomenclatures de Cowdria ruminantium, de Ehrlichia equi, de Ehrlichia phagocytophila, de Ehrlichia risticii ou de Ehrlichia sennetsu. En revanche, dans la mesure où il n'existait aucune nomenclature validement publiée, tous les auteurs doivent adopter les noms de Anaplasma platys et de Anaplasma bovis.

Orientation bibliographique

BREITSCHWERDT (E.B.), HEGARTY (B.C.) et HANCOCK (S.I.) : Sequential evaluation of dogs naturally infected with Ehrlichia canis, Ehrlichia chaffeensis, Ehrlichia equi, Ehrlichia ewingii, or Bartonella vinsonii. J. Clin. Microbiol., 1998, 36, 2645-2651.

BROUQUI (P.) : L'ehrlichiose humaine. Une maladie infectieuse émergente. Méd. Mal. Infect., 1997, 27, 256-266.

BROUQUI (P.) Ehrlichia. In : J. FRENEY, F. RENAUD, W. HANSEN et C. BOLLET : Précis de Bactériologie Clinique, Editions ESKA, Paris, 2000, pp. 1651-1662.

DUMLER (J.S.), BARBET (A.F.), BEKKER (C.P.J.), DASCH (G.A.), PALMER (G.H.), RAY (S.C.), RIKIHISA (Y.) et RURANGIRWA (F.R.) : Reorganization of genera in the families Rickettsiaceae and Anaplasmataceae in the order Rickettsiales: unification of some species of Ehrlichia with Anaplasma, Cowdria with Ehrlichia and Ehrlichia with Neorickettsia, description of six new species combinations and designation of Ehrlichia equi and 'HGE agent' as subjective synonyms of Ehrlichia phagocytophila. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001, 51, 2145-2165.
Deux tableaux annexés à cet article sont disponibles uniquement sur Internet au format PDF :
Additional Table 1. Similarity matrix of 16S rRNA sequences of selected ehrlichiae
Additional Table 2. Similarity matrix for groESL sequences of selected ehrlichiae

INOKUMA (H.), BROUQUI (P.), DRANCOURT (M.) et RAOULT (D.) : Citrate synthase gene sequence: a new tool for phylogenetic analysis and identification of Ehrlichia. J. Clin. Microbiol., 2001, 39, 3031-3039.

INOKUMA (H.), TERADA (Y.), KAMIO (T.), RAOULT (D.) et BROUQUI (P.) : Analysis of the 16S rRNA gene sequence of Anaplasma centrale and its phylogenetic relatedness to other ehrlichiae. Clin. Diagn. Lab. Immunol., 2001, 8, 241-244.

KAWAHARA (M.), RIKIHISA (Y.), ISOGAI (E.), TAKAHASHI (M.), MISUMI (H.), SUTO (C.), SHIBATA (S.), ZHANG (C.) et TSUJI (M.) : Ultrastructure and phylogenic analysis of 'Candidatus Neoehrlichia mikurensis' in the family Anaplasmataceae, isolated from wild rats and found in Ixodes ovatus ticks. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 1837-1843.

NEER (T.M.) : Canine monocytic and granulocytic ehrlichiosis. In : GREENE (G.E.) : Infectious Diseases of the Dog and Cat. W.B. Saunders Company, Philadelphie, second edition, 1998, pp. 139-147.

PHILIP (C.B.) : Tribe II. Ehrlichieae Philip, trib. nov. In R.S. BREED, E.G.D. MURRAY, N.R SMITH (eds.) Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology. 7ème éd. The Williams and Wilkins Compagny, Baltimore, 1957, pp. 948-949.

PHILIP (C.B.) : Tribe II. Ehrlichieae Philip 1957, 948. In R.S. R.E. BUCHANAN et N.E. GIBBONS (eds.) Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology. 8ème éd. The Williams and Wilkins Compagny, Baltimore, 1974, pp. 893-897.

RIKIHISA (Y.) : The tribe Ehrlichieae and ehrlichial diseases. Clin. Microbiol. Rev., 1991, 4, 286-308.

RIKIHISA (Y.), ZHANG (C.) et CHRISTENSEN (B.M.) : Molecular characterization of Aegyptianella pullorum (Rickettsiales, Anaplasmataceae). J. Clin. Microbiol., 2003, 41, 5294-5297.

RISTIC (M.) et HUXSOLL (D.L.) : Tribe II. Ehrlichieae Philip 1957, 948^AL. In : N.R. KRIEG and J.G. HOLT (ed.), Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, vol. 1, The Williams & Wilkins Co, Baltimore, 1984, pp. 704-711.

SHIBATA (S.I.), KAWAHARA (M.), RIKIHISA (Y.), FUJITA (H.), WATANABE (Y.), SUTO (C.) et ITO (T.) : New Ehrlichia species closely related to Ehrlichia chaffeensis isolated from Ixodes ovatus ticks in Japan. J. Clin. Microbiol., 2000, 38, 1331-1338.

VAN VLIET (A.H.M.), JONGEJAN (F.) et VAN DER ZEIJST (B.A.M.) : Phylogenetic position of Cowdria ruminantium (Rickettsiales) determined by analysis of Amplified 16S ribosomal DNA sequences. Int. J. Syst. Bacteriol., 1992, 42, 494-498.

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