J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 20 mars 2010
EUBACTERIACEAE
Voir aussi le fichier ¤ Eubacterium.
Classification :
. Voir Eubacteriaceae in Classification of families (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature).
. Pour la liste des genres inclus dans la famille des Eubacteriaceae voir Eubacteriaceae in List of genera included in families (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature).
La famille des Eubacteriaceae a été proposée en 2005 dans le "volume 2, partie A" de la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Cette nomenclature ne pouvait pas être validement publiée car aucune description de la famille n'était proposée.
En 2009, dans le volume 3 de la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Ludwig et al. donnent une brève description de cette famille. Cette description est conforme aux règles du Code de Nomenclature et la nomenclature de Eubacteriaceae a été validement publiée en mars 2010 par inscription sur la liste de validation 132.
La famille des Eubacteriaceae est définie principalement sur la base des analyses phylogénétiques déduites de l'étude des séquences des ARNr 16S.
Plus de 50 espèces ont été décrites au sein du genre ¤ Eubacterium (voir Eubacterium in List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature). Toutefois, ce taxon est très hétérogène et de nombreuses espèces ont été abusivement incluses dans le genre ¤ Eubacterium. Les analyses phylogénétiques montrent que le genre ¤ Eubacterium devrait être restreint à l'espèce type (Eubacterium limosum) et à quelques espèces fortement apparentées comme Eubacterium aggregans, Eubacterium barkeri et Eubacterium callanderi.
La définition phénotypique de cette famille est la suivante :
. Fins bacilles à Gram positif dont le diamètre est souvent inférieur ou égal à 0,5 µm, immobiles ou mobiles grâce à un seul flagelle, anaérobies, catalase négative, chimio-organotrophes, alcalophiles ou neutrophiles, parfois halotolérants.
. À l'exception de Garciella nitratireducens qui forme des spores terminales dans les vieilles cultures, les autres espèces sont non sporulées.
. De nombreuses espèces fermentent les sucres et utilisent les protéines comme source d'azote.
. Garciella nitratireducens est une espèce thermophile (température optimale de croissance de 55 °C). Les autres espèces sont mésophiles ou modérément thermophiles.
. Le genre type est le genre ¤ Eubacterium.
Les six genres actuellement inclus dans la famille des Eubacteriaceae (Acetobacterium, Alkalibacter, Anaerofustis, ¤ Eubacterium, Garciella et Pseudoramibacter) sont monophylétiques. Le genre Garciella est, peut-être, plus proche des genres Thermohalobacter et Caloranaerobacter que du genre ¤ Eubacterium. Il est donc possible que ce genre ne soit pas maintenu au sein de la famille des Eubacteriaceae.
Orientation bibliographique
BRENNER (D.J.), KRIEG (N.R.), STALEY (J.T.) et GARRITY (G.M.) (eds): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part A (Introductory Essays), Springer, New York, 2005, pp. 1-304.
LUDWIG (W.), SCHLEIFER (K.H.) et WHITMAN (W.B.) : Revised road map to the phylum Frmicutes. In: P. DE VOS, G.M. GARRITY, D. JONES, N.R. KRIEG, W. LUDWIG, F.A. RAINEY, K.H. SCHLEIFER and W.B. WHITMAN (eds): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 3 (The Firmicutes), Springer, Dordrecht, Heidelberg, London, New York, 2009, pp. 1-13.
LUDWIG (W.), SCHLEIFER (K.H.) and WHITMAN (W.B.): Family II. Eubacteriaceae fam. nov. In: P. DE VOS, G.M. GARRITY, D. JONES, N.R. KRIEG, W. LUDWIG, F.A. RAINEY, K.H. SCHLEIFER and W.B. WHITMAN (eds): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 3 (The Firmicutes), Springer, Dordrecht, Heidelberg, London, New York, 2009, p. 865.
VALIDATION LIST N° 132. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2010, 60, 469-472.
WADE (W.G.) : Genus I. Eubacterium Prévot 1938, 294AL. In: P. DE VOS, G.M. GARRITY, D. JONES, N.R. KRIEG, W. LUDWIG, F.A. RAINEY, K.H. SCHLEIFER and W.B. WHITMAN (eds): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 3 (The Firmicutes), Springer, Dordrecht, Heidelberg, London, New York, 2009, pp. 865-891.
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