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Créé le 18 octobre 2000
Dernière mise à jour le 15 janvier 2009
Groupes génomiques de la tribu des Ehrlichieae ou de la famille des Ehrlichiaceae ou de la famille des Anaplasmataceae
Remarque : la tribu des Ehrlichieae et la famille des Ehrlichiaceae sont considérées comme équivalentes par la plupart des auteurs. Actuellement la nomenclature de Anaplasmataceae est beaucoup plus utilisée que les nomenclatures de Ehrlichieae ou de Ehrlichiaceae.
D'après :
. BREITSCHWERDT (E.B.), HEGARTY (B.C.) et HANCOCK (S.I.) : Sequential evaluation of dogs naturally infected with Ehrlichia canis, Ehrlichia chaffeensis, Ehrlichia equi, Ehrlichia ewingii, or Bartonella vinsonii. J. Clin. Microbiol., 1998, 36, 2645-2651.
. BROUQUI (P.) : L'ehrlichiose humaine. Une maladie infectieuse émergente. Méd. Mal. Infect., 1997, 27, 256-266.
. BROUQUI (P.) Ehrlichia. In : J. FRENEY, F. RENAUD, W. HANSEN et C. BOLLET : Précis de Bactériologie Clinique, Editions ESKA, Paris, 2000, pp. 1651-1662.
. DUMLER (J.S.), BARBET (A.F.), BEKKER (C.P.J.), DASCH (G.A.), PALMER (G.H.), RAY (S.C.), RIKIHISA (Y.) et RURANGIRWA (F.R.) : Reorganization of genera in the families Rickettsiaceae and Anaplasmataceae in the order Rickettsiales: unification of some species of Ehrlichia with Anaplasma, Cowdria with Ehrlichia and Ehrlichia with Neorickettsia, description of six new species combinations and designation of Ehrlichia equi and 'HGE agent' as subjective synonyms of Ehrlichia phagocytophila. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001, 51, 2145-2165.
. KAWAHARA (M.), RIKIHISA (Y.), ISOGAI (E.), TAKAHASHI (M.), MISUMI (H.), SUTO (C.), SHIBATA (S.), ZHANG (C.) et TSUJI (M.) : Ultrastructure and phylogenic analysis of 'Candidatus Neoehrlichia mikurensis' in the family Anaplasmataceae, isolated from wild rats and found in Ixodes ovatus ticks. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 1837-1843.
. NEER (T.M.) : Canine monocytic and granulocytic ehrlichiosis. In : GREENE (G.E.) : Infectious Diseases of the Dog and Cat. W.B. Saunders Company, Philadelphie, second edition, 1998, pp. 139-147.
. RIKIHISA (Y.), ZHANG (C.) et CHRISTENSEN (B.M.) : Molecular characterization of Aegyptianella pullorum (Rickettsiales, Anaplasmataceae). J. Clin. Microbiol., 2003, 41, 5294-5297.
. SHIBATA (S.I.), KAWAHARA (M.), RIKIHISA (Y.), FUJITA (H.), WATANABE (Y.), SUTO (C.) et ITO (T.) : New Ehrlichia species closely related to Ehrlichia chaffeensis isolated from Ixodes ovatus ticks in Japan. J. Clin. Microbiol., 2000, 38, 1331-1338.
. YABSLEY (M.J.), MURPHY (S.M.), LUTTRELL (M.P.), WILCOX (B.R.), HOWERTH (E.W.) et MUNDERLOH (U.G.) : Characterization of ‘Candidatus Neoehrlichia lotoris’ (family Anaplasmataceae) from raccoons (Procyon lotor). Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2008, 58, 2794-2798.
NOTES :
Le 15 novembre 2001, Dumler et al. ont modifié la description de l'ordre des Rickettsiales, de la famille des Rickettsiaceae (abolition de la subdivision en tribus), de la famille des Anaplasmataceae, du genre Anaplasma, du genre Ehrlichia et du genre Neorickettsia.
Les propositions de Dumler et al. ont de nombreuses conséquences concernant les groupes génomiques et les espèces présentées ci-dessous :
1) La tribu des Ehrlichieae n'est plus reconnue.
2) Les espèces du groupe génomique I constituent le genre Ehrlichia sensu stricto si bien que Cowdria ruminantium est reclassée dans le genre Ehrlichia avec la nomenclature de Ehrlichia ruminantium.
3) Les espèces du groupe génomique II sont regroupées en un seul genre qui, en raison des règles de priorité, est appelé Anaplasma. Les espèces Ehrlichia phagocytophila, Ehrlichia equi ainsi que l'agent de l'ehrlichiose granulocytique humaine présentent de nombreuses similitudes génotypiques si bien qu'elles sont regroupés au sein d'un unique taxon appelé Anaplasma phagocytophilum corrig.
4) Les espèces du groupe génomique III doivent être rassemblées en un unique genre qui, en raison des règles de priorité doit être appelé Neorickettsia.
5) Le groupe génomique IV constitue le genre Wolbachia réduit à sa seule espèce type, Wolbachia pipientis.
Ultérieurement, le genre Aegyptianella a été rapproché des Anaplasma sp., Kawahara et al. 2004 ont décrit un nouveau genre et une nouvelle espèce "Candidatus Neoherlichia mikurensis" et Yabsley et al. 2008 ont proposé la nomenclature de "Candidatus Neoehrlichia lotoris".
"Candidatus Neoherlichia mikurensis" occupe une position intermédiaire entre les Anaplasma sp. et les Ehrlichia sp. et dans le tableau ci-dessous, cette bactérie est placée dans un groupe génomique que nous qualifierons de I bis.
Il est important de rappeler qu'il n'existe pas de classification officielle des bactéries et qu'un bactériologiste n'est pas tenu d'adopter les propositions de Dumler et al. si elles vont à l'encontre de son opinion scientifique. La publication de Dumler et al. ne rend pas illégitime les nomenclatures validement publiées avant le 15 novembre 2001 et un auteur a tout à fait le droit de reconnaître l'existence de la famille des Ehrlichiaceae ou de la tribu des Ehrlichieae de même qu'il a le droit d'utiliser les nomenclatures de Cowdria ruminantium, de Ehrlichia phagocytophila, de Ehrlichia risticii ou de Ehrlichia sennetsu. En revanche, dans la mesure où il n'existait aucune nomenclature validement publiée, tous les auteurs doivent adopter les noms de Anaplasma platys et de Anaplasma bovis.
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Espèces
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Hôtes
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Transmission, vecteurs
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Tropisme cellulaire
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Répartition géographique
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Groupe génomique I
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Ehrlichia canis
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Chiens et autres canidés
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Tiques : Rhipicephalus sanguineus
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Monocytes, macrophages, lymphocytes
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Mondiale
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Ehrlichia chaffeensis
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Cervidés (Odocoileus virginianus), hommes, canidés, chèvres
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Tiques : Amblyomma americanum++, Dermacentor variabilis, Ixodes scapularis, Amblyomma testudinarium*, Haemaphysalis yeni*
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Monocytes, macrophages
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USA++, Asie ? Afrique ? Europe ?
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Ehrlichia ewingii
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Chiens, hommes
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Tiques : Amblyomma americanum++, Dermacentor variabilis**, Rhipicephalus sanguineus**.
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Granulocytes
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USA
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Ehrlichia muris
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Souris, campagnols, autres espèces animales ? homme ?
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Tiques : Haemaphysalis flava, Ixodes persulcatus ?
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Monocytes, macrophages
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Japon, Russie ?
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Ehrlichia ruminantium (Cowdria ruminantium)
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Ruminants
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Tiques : Amblyomma sp.
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Cellules endothéliales
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Afrique, Caraïbes
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Ehrlichia sp. souches HF et Anan
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Souris, rats
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Tiques : Ixodes ovatus
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Monocytes, macrophages, éosinophiles
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Japon
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Agent de l'ehrlichiose humaine du Venezuela
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Hommes
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?
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Monocytes
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Venezuela
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Groupe génomique I bis
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"Candidatus Neoeherlichia mikurensis"
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Rats, souris, campagnols
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Tiques : Ixodes ovatus, Ixodes persulcatus, Ixodes ricinus
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Cellules endothéliales
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Chine, Italie, Japon, Pays Bas, Russie
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"Candidatus Neoeherlichia lotoris"
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Raton laveur (Procyon lotor)
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?
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?
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USA
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Groupe génomique II
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Anaplasma bovis ("Ehrlichia bovis")
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Bovins
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Tiques : Hyalomma excavatum, Hyalomma truncatum (?), Rhipicephalus appendiculatus, Amblyomma variegatum, Amblyomma cajennense (?).
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Monocytes
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Afrique ++, Amérique du Sud, Iran, Inde.
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Anaplasma marginale
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Bovins
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Tiques : Boophilus sp.
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Erythrocytes
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Mondiale
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Anaplasma ovis
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Moutons
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Tiques : Rhipicephalus sp., Dermacentor sp.
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Erythrocytes
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Mondiale
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Anaplasma phagocytophilum (Ehrlichia equi)
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Equidés
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Tiques : Ixodes pacificus, Ixodes scapularis ? Ixodes ricinus ?
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Granulocytes
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Mondiale
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Anaplasma phagocytophilum (Ehrlichia phagocytophila)
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Ruminants
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Tiques : Ixodes ricinus
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Granulocytes
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Europe++
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Anaplasma phagocytophilum (Agent de l'ehrlichiose granulocytique humaine)
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Homme, chevaux, chiens, ruminants sauvages, rongeurs
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Tiques : Ixodes scapularis, Ixodes pacificus, Ixodes ricinus, Ixodes trianguliceps
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Granulocytes
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USA, Europe
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Anaplasma platys ("Ehrlichia platys")
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Chiens, impalas ? moutons ? cervidés sauvages ?
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Tiques : Rhipicephalus sanguineus, Amblyomma americanum ?
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Plaquettes
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Mondiale (USA++)
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Agent de l'ehrlichiose granulocytique du lama
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Lamas
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Tiques : Ixodes pacificus
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Granulocytes
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USA
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Aegyptianella
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Oiseaux
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Tiques : Argas (Persicargus) persicus
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Erythrocytes
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Mondiale
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Groupe génomique III
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Agent SF
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? Expérimentalement, le chien et la souris sont réceptifs
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Trématodes : Stellantchasmus falcatus
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Monocytes, macrophages
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Japon
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"Candidatus Xenohaliotis californiensis"
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Ormeaux (Haliotis cracherodii et Haliotis rufescens)
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Aucun vecteur, transmission par contact
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Cellules épithéliales
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USA
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"Ehrlichia risticii subsp. atypicalis"
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Chiens
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?
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Monocytes, macrophages, entérocytes
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USA
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Neorickettsia helminthoeca
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Canidés
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Trématodes : Nanophyetus salmincola
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Macrophages
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USA
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Neorickettsia risticii (Ehrlichia risticii)
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Chevaux
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Trématodes : Acanthatrium oregonense, Allassogonoporus vespertilionis, autres trématodes ?
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Monocytes, macrophages, entérocytes
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USA ++, Europe
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Neorickettsia sennetsu (Ehrlichia sennetsu)
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Homme
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Ingestion de poissons crus infestés par des métacercaires de trématodes
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Monocytes, macrophages
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Japon, Malaisie
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Groupe génomique IV
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Wolbachia spp.
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Arthropodes, nématodes
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Aucun vecteur, transmission transovarienne
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?
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Mondiale
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* : Amblyomma testudinarium et Haemaphysalis yeni sont des tiques présentes en Chine. La première a pour hôte habituel le bétail et la seconde est apte à parasiter le bétail, des lagomorphes sauvages (Lepus sinensis, Caprologus sinensis) et des caprins sauvages (Muntiacus reevesi).
CAO (W.C.), GAO (Y.M.), ZHANG (P.H.), ZHANG (X.T.), DAI (Q.H.), DUMLER (J.S.), FANG (L.Q.) et YANG (H.) : Identification of Ehrlichia chaffeensis by nested PCR in ticks from southern China. J. Clin. Microbiol., 2000, 38, 2778-2780.
** : Amblyomma americanum est considérée comme l'unique vecteur de Ehrlichia ewingii. Toutefois, par PCR, Murphy et al. ont mis en évidence cette bactérie chez Dermacentor variabilis et Rhipicephalus sanguineus.
MURPHY (G.L.), EWING (S.A.), WHITWOTH (L.C.), FOX (J.C.) et KOCAN (A.A.) : A molecular and serologic survey of Ehrlichia canis, E. chaffeensis, and E. ewingii in dogs and ticks from Oklahoma. Vet. Parasitol., 1998, 79, 325-339.
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