J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Créé le 23 novembre 2007

FLAVOBACTERIUM CETI (la première espèce du genre Flavobacterium isolée d'un mammifère !)

Voir aussi : ¤ Flavobacterium.

La nomenclature de Flavobacterium ceti a été validement publiée le 08 novembre 2007 pour trois souches bactériennes isolées de deux baleines à bec de Cuvier (Ziphius cavirostris*). Deux souches ont pour origine le foie et une souche a pour origine un poumon. La souche type de l'espèce (454-2 = CCUG 52969 = CECT 7184) a été isolée en culture pure du foie d'un cétacé. Les autres souches ont été isolées en association avec des bactéries du genre Vibrio. Les animaux ne présentaient aucun signe clinique et aucune lésion n'a été détectée à l'autopsie. À la connaissance de l'auteur, Flavobacterium ceti est la première espèce du genre à avoir été isolée d'un mammifère**.
L'étude des séquences des ARNr 16S montre que les espèces les plus proches sont Flavobacterium johnsoniae, Flavobacterium frigidimaris, Flavobacterium aquidurense, Flavobacterium hibernum et Flavobacterium degerlachei. Toutefois, le pourcentage d'homologie obtenu avec l'espèce phylogénétiquement la plus proche (Flavobacterium johnsoniae) est de 93,7. En accord avec les conclusions de Stackebrandt et Goebel une telle valeur est compatible avec la création d'une nouvelle espèce. Les auteurs ont cependant réalisé des hybridations ADN-ADN avec la souche type de Flavobacterium johnsoniae. Les résultats confirment que les souches isolées de Ziphius cavirostris méritent d'être individualisées au sein d'une nouvelle espèce (15 p. cent d'hybridation entre la souche 454-2 et la souche type de Flavobacterium johnsoniae).

Les souches de Flavobacterium ceti sont constituées de bacilles à Gram négatif, de 2,0 µm de longueur sur 0,3 µm de diamètre, immobiles, non sporulés et dont la principale quinone respiratoire est une ménaquinone à 6 unités isoprénoïdes.

Les caractères biochimiques ont été étudiés à l'aide de galeries API 20NE, API 20E et API ZYM.
. Une réponse positive est obtenue avec les tests catalase, oxydase, hydrolyse de la gélatine, hydrolyse de la caséine et hydrolyse de l'amidon.
. Une réponse négative est observée avec les tests réduction des nitrates, réduction des nitrites, VP, uréase, indole, production d'hydrogène sulfuré, LDC, ODC, ADH, adsorption du rouge Congo, hydrolyse de l'ADN, hydrolyse de l'agar, hydrolyse de l'alginate, hydrolyse de la carboxyméthylcellulose, hydrolyse de l'esculine, hydrolyse de la pectine, hydrolyse de la tyrosine, acidification de l'amygdaline, de l'arabinose, du glucose, de l'inositol, du mannitol, du mélibiose, du rhamnose, du saccharose et du sorbitol, assimilation de l'apidate, du L-arabinose, du caprate, du citrate, du gluconate, du D-glucose, de la N-acétylglucosamine, du malate, du maltose, du D-mannose, du D-mannitol et du phényl acétate.
. En utilisant une galerie API ZYM une réponse positive est notée pour les tests leucine arylamidase, estérase lipase C8 (réaction faiblement positive), naphtol-AS-BI-phosphohydrolase (réaction faiblement positive), phosphatase acide (réaction faiblement positive), phosphatase alcaline (réponse faiblement positive) et valine arylamidase.

Flavobacterium ceti cultive à des températures comprises entre 22 et 37 °C (température optimale de croissance 35 °C). Aucune culture n'est visible à 4, 15 ou 42 °C.
Une culture abondante est obtenue en aérobiose alors que le germe cultive faiblement dans une atmosphère micro-aérophile et très faiblement en anaérobiose.
La culture peut être réalisée sur une gélose trypticase soja ou une gélose Columbia, mais aucune culture n'est observée sur gélose de MacConkey. Dans un bouillon cœur-cervelle, le germe se développe en présence de 3 p. cent de NaCl, mais il ne tolère pas une concentration en NaCl supérieure ou égale à 4,5.
Les colonies obtenues sur une gélose Columbia au sang après 24 heures d'incubation à 37 °C sont circulaires, lisses, non hémolytiques et pigmentées en orange.

Orientation bibliographique

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* : Ziphius cavirostris (baleine à bec de Cuvier)

Classification d'après le NCBI Taxonomy Browser : Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Coelomata ; Deuterostomia ; Chordata ; Craniata ; Vertebrata ; Gnathostomata ; Teleostomi ; Euteleostomi ; Sarcopterygii ; Tetrapoda ; Amniota ; Mammalia ; Theria ; Eutheria ; Laurasiatheria ; Cetartiodactyla ; Cetacea ; Odontoceti ; Ziphiidae ; Ziphius ; Ziphius cavirostris

Pour plus d'informations sur cette espèce voir le fichier Ziphius cavirostris in Animal Diversity Web (University of Michigan Museum of Zoology).

** : Isolement de Flavobacterium spp. chez les mammifères

Des personnes travaillant dans une usine textile aux USA ont présenté une pathologie pulmonaire évoquant une légionellose. Les examens bactériologiques effectués sur les systèmes d'aération ont permis d'isoler une souche de Flavobacterium spp. apparentée à Flavobacterium johnsoniae. Des analyses sérologiques ont montré que les patients possédaient des anticorps dirigés contre cette bactérie. Toutefois, l'isolement de la souche de Flavobacterium spp. à partir des malades n'a jamais été réalisé.
Flavobacterium ceti est donc la seule espèce du genre Flavobacterium isolée d'un mammifère.

Référence: BERNARDET (J.F.) : Communication personnelle en date du 22 novembre 2007.