J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Créé le 27 juillet 2001

FACKLAMIA, FACKLAMIA MIROUNGAE

Voir aussi le fichier  ¤ Aerococcaceae.

Systématique

En juillet 1997, Collins et al. valident les nomenclatures de Facklamia et de Facklamia hominis pour six souches de coques à Gram positif, aéro-anaérobies, catalase négative, possédant un peptidoglycane du type A4alpha (voir le fichier ¤ "Classification des peptidoglycanes selon Schleifer et Kandler") et isolées de divers prélèvements d'origine humaine (urine, vagin, sang, abcès). L'analyse des séquences des ARNr 16S montre que ces souches forment un groupe homogène apparenté à ¤ Globicatella sanguinis (pourcentage d'homologie de 93,9 p. cent) et dans une moindre mesure à ¤ Abiotrophia defectiva, ¤ Granulicatella adiacens, Lactosphaera pasteurii, ¤ Aerococcus urinae et ¤ Carnobacterium maltaromaticum (Carnobacterium piscicola).
Facklamia hominis se distingue cependant de ¤ Globicatella sanguinis par l'analyse électrophorétique des protéines, la nature de son peptidoglycane (le peptidoglycane de Globicatella sanguinis est du type A1alpha) et par ses caractères phénotypiques (voir tableau I et le fichier ¤ Globicatella).

Par la suite, le genre Facklamia s'est enrichi de trois espèces isolées chez l'homme (Facklamia ignava, Facklamia languida, Facklamia sourekii) et d'une espèce isolée de tabac à priser (Facklamia tabacinasalis).
L'intérêt (relatif) de ce genre pour la médecine vétérinaire est lié à la description d'une sixième espèce, Facklamia miroungae, isolée chez un éléphant de mer ou phoque éléphant (Mirounga leonina)*.

La nomenclature de Facklamia miroungae a été validée en juillet 2001 par Hoyles et al. pour une unique souche bactérienne isolée lors d'une étude effectuée en 1993 par le Bristish Antarctic Survey au large de l'archipel des Orcades du Sud ou South Orkneys (archipel situé à la limite des océans Atlantique et Antactique, au bord du continent Antarctique). Cette souche n'a pu être identifiée par le SAC Veterinary Sciences Division d'Inverness et elle a été transmise à la CCUG (Culture Collection, University of Göteborg).
L'analyse de la séquence des ARNr 16S révèle une parenté phylogénétique avec Facklamia languida (96,8 p. cent d'homologie), Facklamia hominis (96,3 p. cent d'homologie) et, dans une moindre mesure, avec les autres espèces du genre Facklamia et avec Ignavigranum ruoffiae (espèce décrite en 1999 et dont les souches ont été isolées de prélèvements d'origine humaine). L'électrophorèse des protéines permet également de séparer cette souche des autres espèces du genre Facklamia et elle peut être caractérisée par ses caractères bactériologiques classiques (voir infra et tableau II).
Il convient de noter que la description de Facklamia miroungae repose sur une unique souche alors que la description correcte d'une espèce bactérienne devrait reposer sur l'étude d'un minimum de 10 souches (voir Rosselló-Mora et Amann 2001).

Le genre Facklamia est actuellement classé dans la famille des ¤ Aerococcaceae.

Caractères bactériologiques

Initialement, le genre Facklamia a été défini de la manière suivante :
Coques ovoïdes, à Gram positif, groupés par deux ou en amas (selon LaClaire et Facklam, Facklamia hominis est constituée de cellules principalement groupées en chaînes), non sporulés, immobiles, aéro-anaérobies, catalase négative, nitrate réductase négative, ADH positive, hydrolysant l'hippurate et l'amidon, n'hydrolysant pas l'esculine (LaClaire et Facklam), donnant une réponse négative au test de Voges-Proskauer, n'acidifiant pas les sucres, possédant un peptidoglycane du type A4alpha et présentant un G + C p. cent de 41.

Ultérieurement, la description de nouvelles espèces a conduit à modifier les caractères biochimiques du genre et, en fait, l'acidification des sucres, la production d'arginine di-hydrolase et l'hydrolyse de l'hippurate sont des caractères variables selon les espèces.

Outre les caractères du genre, les souches de Facklamia miroungae, seule espèce d'intérêt vétérinaire, regroupent des coques ovoïdes, de 0,8 à 0,9 µm de diamètre, groupés par deux ou en courtes chaînes.
Les caractères biochimiques ont été étudiés en utilisant des galeries API Rapid ID32S et API ZYM. Rappelons que la description de Facklamia miroungae est basée sur l'étude d'une unique souche et les caractères présentés ci-dessous sont peut-être provisoires.
. Caractères positifs : uréase, ADH, alanine-phénylalanine-proline arylamidase, acide pyroglutamique arylamidase, leucine arylamidase, valine arylamidase (réaction faiblement positive), cystéine arylamidase (réaction faiblement positive), chymotrypsine (réaction faiblement positive), phosphoaminidase (réaction faiblement positive), glycyl-tryptophane arylamidase (réaction faiblement positive), phosphatase acide, acidification du glucose et du tréhalose.
. Caractères négatifs : VP, hydrolyse de l'esculine, hydrolyse de la gélatine, hydrolyse de l'hippurate, estérase C4, estérase lipase C8, lipase C14, trypsine, alpha-glucosidase, bêta-glucosidase, alpha-mannosidase, bêta-mannosidase, alpha-fucosidase, alpha-galactosidase, bêta-galactosidase, bêta-glucuronidase, acidification du L-arabinose, du D-arabitol, de la cyclodextrine, de l'alpha-méthyl-bêta-D-glucopyranoside, du glycogène, du lactose, du maltose, du mannitol, du mélézitose, du mélibiose, du pullulane, du raffinose, du saccharose, du sorbitol, du tagatose.
. La croissance est obtenue à 25 et à 42 °C, en présence de 5 p. cent de NaCl et elle n'est pas stimulée par la présence de dioxyde de carbone. Les colonies obtenues à 37 °C, sur gélose Columbia au sang de cheval, sont circulaires, à contour régulier, convexes, brillantes, de couleur grise, non hémolytiques et leur diamètre est d'environ 0,5 mm après 24 heures d'incubation.

Comme le souligne LaClaire et Facklam, le diagnostic des espèces du genre Facklamia est délicat. Le tableau I présente quelques caractères permettant de distinguer le genre Facklamia des autres genres rassemblant des coques à Gram positif ne synthétisant pas de catalase alors que les caractères différentiels des six espèces sont donnés dans le tableau II.

Habitat, pouvoir pathogène, sensibilité aux antibiotiques

. Facklamia hominis, Facklamia ignava, Facklamia languida et Facklamia sourekii sont des germes pathogènes opportunistes isolés de divers prélèvements humains, notamment d'hémocultures, du vagin et d'urocultures. D'après LaClaire et Facklam l'habitat de ces bactéries pourrait être l'appareil génito-urinaire de la femme.
. L'unique souche de Facklamia tabacinasalis a été isolée de tabac à priser.
. L'habitat et le pouvoir pathogène de Facklamia miroungae sont inconnus. L'unique souche de cette espèce a été isolée d'un écouvillonnage nasal effectué sur un jeune éléphant de mer (état de santé de l'animal non précisé).

La sensibilité à 15 antibiotiques a été déterminée pour 18 souches appartenant aux espèces Facklamia hominis, Facklamia ignava, Facklamia languida et Facklamia sourekii. Les résultats indiquent une sensibilité variable selon les espèces, mais environ 70 p. cent des souches présentent une sensibilité intermédiaire vis-à-vis de la pénicilline, 44 p. cent une résistance au céfotaxime, 33 p. cent une résistance au céfuroxime, 33 p. cent une résistance à la clindamycine, 28 p. cent une résistance au trimétoprime-sulfaméthoxazole, 22 p. cent une résistance à l'érythromycine et 17 p. cent une résistance à la rifampicine.

Orientation bibliographique

COLLINS (M.D.), FALSEN (E.), LEMOZY (J.), ÅKERVALL (E.), SJÖDÉN (B.) et LAWSON (P.A.) : Phenotypic and phylogenetic characterization of some Globicatella-like organisms from human sources: description of Facklamia hominis gen. nov., sp. nov. Int. J. Syst. Bacteriol., 1997, 47, 880-882.

COLLINS (M.D.), HUTSON, (R.A.), FALSEN (E.) et SJÖDÉN (B.) : Facklamia sourekii sp. nov., isolated from human sources. Int. J. Syst. Bacteriol., 1999, 49, 635-638.

COLLINS (M.D.), HUTSON (R.A.), FALSEN (E.) et SJÖDÉN (B.) : Facklamia tabacinasalis sp. nov., from powdered tobacco. Int. J. Syst. Bacteriol, 1999, 49, 1247-1250.

COLLINS (M.D.), LAWSON (P.A.), MONASTERIO (R.), FALSEN (E.), SJÖDEN (B.) et FACKLAM (R.R.) : Facklamia ignava sp. nov., isolated from human clinical specimens. J. Clin. Microbiol., 1998, 36, 2146-2148.

HOYLES (L.), FOSTER (G.), FALSEN (E.), THOMSON (L.F.) et COLLINS (M.D.) : Facklamia miroungae sp. nov., from a juvenile southern elephant seal (Mirounga leonina). Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2001, 51, 1401-1403.

LACLAIRE (L.L.) et FACKLAM (R.R.) : Antimicrobial susceptibilities and clinical sources of Facklamia species. Antimicrob. Agents Chemother., 2000, 44, 2130-2132.

LACLAIRE (L.) et FACKLAM (R.) : Comparison of three commercial rapid identification systems for the unusual gram-positive cocci Dolosigranulum pigrum, Ignavigranum ruoffiae, and Facklamia species. J. Clin. Microbiol., 2000, 38, 2037-2042.

LAWSON (P.A.), COLLINS (M.D.), FALSEN (E.), SJÖDÉN (B.) et FACKLAM (R.R.) : Facklamia languida sp. nov., isolated from human clinical specimens. J. Clin. Microbiol., 1999, 37, 1161-1164.

ROSSELLÓ-MORA (R.) et AMANN (R.) : Review. The species concept for prokaryotes. FEMS Microbiol. Rev., 2001, 25, 39-67.

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* :
Mirounga leonina est une espèce appartenant à l'embranchement des Vertébrés, à la classe des Mammifères, à l'ordre des Carnivores, au sous-ordre des Pinnipèdes et à la famille des Phocidae.

L'éléphant de mer est une espèce protégée sur le territoire français par un arrêté du 27 juillet 1995.

D'autres informations ainsi que des photographies peuvent être trouvées sur de nombreux sites, notamment sur les sites suivants :
LES PINNIPEDES
ELEPHANT DE MER AUSTRAL Mirounga leonina
Southern Elephant Seal (Seal Conservation Society)

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