J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 29 novembre 2002
FAECALIBACTERIUM, FAECALIBACTERIUM PRAUSNITZII
Voir aussi le fichier ¤ Ruminococcaceae.
Autres dénominations :
Faecalibacterium prausnitzii : Fusobacterium prausnitzii, "Bacteroides praussnitzii" (sic), "Bacillus mucosus anaerobius".
Faecalibacterium prausnitzii, unique espèce du genre Faecalibacterium, est la nomenclature validement publiée le 29 novembre 2002 pour reclasser Fusobacterium prausnitzii.
Les Fusobacterium sp. sont des bacilles à Gram négatif, polymorphes, non sporulés, immobiles et anaérobies. Les caractères phénotypiques, les valeurs des G + C p. cent et les analyses phylogénétiques révèlent que le genre Fusobacterium, qui comprend plus de 20 espèces ou sous-espèces différentes (voir le fichier Fusobacterium in List of Procaryotic Names with Standing in Nomenclature), est un genre hétérogène. Notamment, l'espèce Fusobacterium prausnitzii diffère de la majorité des espèces du genre par ses caractères phénotypiques (absence de culture sur une gélose Brucella enrichie en hémine et en vitamine K1, grande sensibilité à l'oxygène, absence de production d'acétate), par la valeur de son G + C p. cent comprise entre 47 et 57 (contre 26 à 34 pour la plupart des autres espèces), par la séquence de son espace intergénique 16S-23S et par la séquence des ARNr 16S qui présente moins de 77 p. cent d'homologie avec la séquence des ARNr 16S de la souche type de Fusobacterium nucleatum (espèce type du genre Fusobacterium).
Duncan et al. estiment que la création d'un nouveau genre peut faciliter les recherches portant sur l'écologie microbienne du tube digestif de l'homme et des animaux et ces auteurs reclassent Fusobacterium prausnitzii dans le nouveau genre Faecalibacterium, sous la forme d'une nouvelle combinaison : Faecalibacterium prausnitzii.
Sur le plan phylogénétique, Faecalibacterium prausnitzii est apparenté aux espèces placées par Collins et al. dans le groupe IV des clostridies*. Actuellement , le genre Faecalibacterium ainsi que l'espèce Clostridium leptum (préalablement incluse dans le groupe IV de Collins et al.) sont classés dans la famille des ¤ Ruminococcaceae.
Les souches de Faecalibacterium prausnitzii (quatre souches testées) sont constituées de bacilles à Gram négatif, de 0,5 à 0,8 µm de diamètre sur 2,0 à 9,0 µm de longueur (les formes longues sont incurvées), non sporulés, dépourvus de flagelles et immobiles, entourés d'une fine capsule, strictement anaérobies et incapables de survivre plus de 2 minutes dans une atmosphère normale, chimio-organotrophes, fermentant le glucose en produisant du formate, du butyrate et du D-lactate, ne produisant pas d'acétate, ne réduisant pas les nitrates, non indologènes.
En milieu YCFA** (contenant 0,5 p. cent du substrat étudié), toutes les souches assimilent l'amidon, le fructose, les petits polymères de fructose et l'inuline. L'assimilation de l'arabinose, du mélibiose, du raffinose, du rhamnose, du ribose et du xylose est négative.
En utilisant des galeries API 32A, toutes les souches donnent une réponse positive pour les tests bêta-galactosidase, alpha-glucosidase, phosphatase, arginine et histidine arylamidase. L'hydrolyse de la proline, de la leucine-glycine, de la phénylalanine, de la leucine, de la tyrosine, de l'alanine, de la sérine, de l'acide pyroglutamique et de l'acide glutamyl glutamique est négative. Il en va de même pour la synthèse d'une uréase, d'une arginine di-hydrolase, d'une bêta-glucosidase et d'une alpha-fucosidase.
La croissance nécessite des milieux enrichis en jus de rumen ou des milieux YCFA contenant 25 mM de glucose.
Faecalibacterium prausnitzii est l'une des bactéries les plus abondantes dans la flore fécale de l'homme, dans la flore caecale des poulets et dans le tube digestif du rat, de la souris, du chat, du chien, du singe et du lapin.
Cette espèce produit du butyrate dont le rôle est important pour la prolifération, la différentiation et le fonctionnement des cellules épithéliales du colon ainsi que pour la prévention des colites et des cancers du colon et du rectum. Compte tenu de son importance quantitative dans l'intestin de l'homme et des animaux, Faecalibacterium prausnitzii jouerait un rôle majeur dans la protection de la muqueuse intestinale.
Inversement, la production de D-lactate peut être à l'origine de rares encéphalopathies consécutives à des interventions chirurgicales intéressant l'intestin.
Orientation bibliographique
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* : Le groupe IV, tel qu'il a été défini par Collins et al. rassemble Clostridium leptum, Clostridium sporosphaeroides et Clostridium cellulosi.
** : Milieu YCFA (composition pour 100 mL)
Casitone : 1 g
Extraits de levure : 0,25 g
NaHCO3 : 0,4 g
Cystéine : 0,1 g
K2HPO4 : 0,045 g
NaCl: 0,09 g
MgSO4.7H2O : 0,009 g
CaCl2 : 0,009 g
Résazurine : 0,1 mg
Hémine : 1 mg
Biotine : 1 µg
Cobalamine : 1 µg
Acide para-aminobenzoique : 3 µg
Acide folique : 5 µg
Pyridoxamine : 15 µg