J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

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Créé le 22 mars 2010

 

FILIFACTOR

 

Voir aussi le fichier ¤ Peptostreptococcaceae.

Classification :
Voir Filifactor in Classification of genera List D - L (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature).

 

Historiquement, le genre Clostridium était défini sur des critères phénotypiques et il rassemblait des bacilles anaérobies, sporulées, incapables de réduire les sulfates et présentant une paroi dont la structure est celle des bactéries à Gram positif. Plus de 200 espèces et sous-espèces ont été décrites dans le genre Clostridium (voir Clostridium in List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) qui est placé dans le groupe des bactéries à Gram positif dont le G + C p. cent est inférieur à 50.
Phénotypiquement, les clostridies sont très hétérogènes et des études portant sur l’homologie des ARNr et sur la séquence des ARNr 16S confirment cette diversité. De plus, les études de phylogénie révèlent que certaines espèces sont parfois plus proches de bactéries non sporulées que des autres clostridies, si bien que la formation d’une spore n’est pas un critère de classification acceptable.

En 1994, Collins et al. déterminent les séquences des ARNr 16S de 34 espèces de clostridies et ces auteurs les comparent à celles obtenues à partir de plus de 80 espèces de bactéries à Gram positif possédant un G + C p. cent inférieur à 50. Les résultats de cette étude confirment la grande hétérogénéité du genre Clostridium et les principales conclusions des auteurs sont les suivantes :
. Les clostridies et les bactéries apparentées se répartissent en 20 groupes ou sous-groupes d’après la séquence de leurs ARNr 16S.
. Le genre Clostridium sensu stricto devrait être réservé aux espèces placées dans le groupe I qui comprend Sarcina ventriculi, Sarcina maxima, Clostridium tetani et les espèces appartenant au groupe d’homologie I de Johnson et Francis.
. Les caractères phylogéniques et phénotypiques permettent de proposer 5 nouveaux genres (Oxobacter, Oxalophagus, Caloramator, Filifactor et Moorella) pour reclasser 6 espèces de clostridies. Parmi ces genres, seul le genre Filifactor présente un intérêt en médecine vétérinaire.

Le genre Filifactor, tel qu'il a été proposé par Collins et al. comprenait une seule espèce, Filifactor villosus, préalablement connue sous le nom de Clostridium villosum.
En 1999, Jalava and Eerola reclassent Fusobacterium alocis dans le genre Filifactor et ces auteurs proposent la nouvelle combinaison de Filifactor alocis.

Le genre Filifactor est constitué de bacilles aux extrémités arrondies, d'environ 0,5 µm de diamètre sur 1,5 à 7 µm de longueur, se présentant de manière isolée ou groupés par deux ou, parfois, en courtes chaînes, dépourvus de flagelles (mais quelques souches présentent une mobilité en saccades), anaérobies, chimio-organotrophes, produisant de l'acétate et du butyrate, ne réduisant pas les nitrates, non indologènes, catalase négative, n'utilisant ni le lactate ni la thréonine, lipase négative, incapables d'acidifier l'esculine, le fructose, le glucose, le maltose, le mannitol, le mannose, le mélibiose, le ribose, le saccharose et le xylose.
Filifactor villosus peut donner de longs filaments (20 à 30 µm) dans les vieilles cultures.
Les souches du genre Filifactor sont difficiles à identifier par leurs caractères phénotypiques et le séquençage des ARNr 16S peut s'avérer très utile.

Les Filifactor spp. cultivent à 37 °C en donnant, sur une gélose au sang de mouton, des colonies de petite taille (0,5 à 1 mm de diamètre) et non hémolytiques.
Les colonies de Filifactor villosus ont une forme irrégulière, elles sont convexes, rugueuses, d'une couleur blanchâtre ou jaunâtre et elles sont très adhérentes à la gélose.
Les colonies de Filifactor alocis sont circulaires, à contour régulier, plates ou légèrement convexes, lisses et brillantes.

Filifactor villosus est une espèce sporulée (spore ovale et sub-terminale), prenant la coloration de Gram (à condition d'effectuer la coloration sur des cultures de moins de 24 heures) et utilisant le pyruvate, alors que Filifactor alocis ne produit pas de spore, se colore comme une bactérie à Gram négatif et n'utilise pas le pyruvate.

Filifactor villosus et Filifactor alocis peuvent être isolés chez le chat d'abcès sous cutanés consécutifs à des morsures. Filifactor alocis a également été isolé de la cavité buccale du chat et de la bouche d'individus présentant une gingivite ou une périodontite.

Toutes les souches testées sont sensibles au chloramphénicol (12 µg/mL) et à l'érythromycine (3 µg/mL). La plupart d'entre elles sont également sensibles à la pénicilline (2U/mL).
Les souches de Filifactor villosus sont sensibles à l'amoxicilline (2,5 µg/mL), à la carbénicilline (100 µg/mL) et à la doxycycline (6 µg/mL).
Les souches de Filifactor alocis sont sensibles à la clindamycine (1,6 µg/mL) et à la tétracycline (6 µg/mL).

 

Orientation bibliographique

 

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