J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Créé le 9 juillet 2001
Dernière mise à jour le 23 novembre 2007

Caractères bactériologiques permettant de différencier quelques genres de la famille des Flavobacteriaceae

Sommaire:

Tableau I : Genres dont les espèces sont mobiles par glissement
Tableau II : Genres dont les espèces sont immobiles
Références bibliographiques

Tableau I : Genres dont les espèces sont mobiles ou peuvent être mobiles par glissement

1) Algibacter ; 2) Aquimarina ; 3) Arenibacter ; 4) Capnocytophaga ; 5) Cellulophaga ; 6) Flavobacterium ; 7) Formosa ; 8) Gelidibacter ; 9) Gramella ; 10) Leeuwenhoekiella ; 11) Maribacter ; 12) Olleya ; 13) Pibocella ; 14) Psychroflexus ; 15) Subsaxibacter ; 16) Subsaximicrobium ; 17) Tenacibaculum ; 18) Winogradskyella ; 19) Zobellia.

Habitat*

me, s

me, s, p

me, s

p, s

Mobilité par glissement

Pigment

Type respiratoire**

Catalase

Oxydase

Réduction des nitrates

Croissance à 25 °C

Halophilie

Acidification des sucres

Agar***

Amidon***

Esculine***

Gélatine***

ONPG

H₂S

Uréase

Indole

* :
me : vie libre dans le milieu extérieur et/ou isolé de végétaux ;
s : saprophyte et éventuellement pathogène opportuniste ;
p : pathogène.

** :
A : aérobie ;
mA : micro-aérophile ;
F : aéro-anaérobie.

*** : Hydrolyse.

Notes :

Mobilité
Arenibacter echinorum et Arenibacter palladensis sont mobiles par glissement, les autres espèces sont immobiles.
Une mobilité par glissement n'a pas été décrite pour Flavobacterium branchiophilum.
Les souches de Psychroflexus gondwanensis sont immobiles.

Oxydase
Cellulophaga lytica est oxydase positive.
Flavobacterium saccharophilum est oxydase négative.

Halophilie
Contrairement aux autres espèces du genre, Arenibacter certesii et Arenibacter latericius sont halophiles obligatoires.
Flavobacterium flevense est halophile.

Hydrolyse de la gélatine
La gélatinase peut être négative pour quelques souches de Flavobacterium aquatile et de Flavobacterium flevense.
Quelques souches de Psychroflexus gondwanensis hydrolysent la gélatine.

Hydrolyse de l'agar
Flavobacterium flevense et Flavobacterium saccharophilum hydrolysent l'agar.

Indole
Psychroflexus torquis est indole négative. Ce caractère n'a pas été recherché pour Psychroflexus gondwanensis.

Sommaire

Tableau II : Genres dont les espèces sont immobiles

1) Aequorivita ; 2) Bergeyella ; 3) Bizionia ; 4) Chryseobacterium ; 5) Coenonia ; 6) Croceibacter ; 7) Elizabethkingia ; 8) Empedobacter ; 9) Gillisia ; 10) Kaistella ; 11) Kordia ; 12) Lacinutrix ; 13) Mesonia ; 14) Muricauda ; 15) Myroides ; 16) Ornithobacterium ; 17) Polaribacter ; 18) Psychroserpens ; 19) Riemerella ; 20) Robiginitalea ; 21) Salegentibacter ; 22) Sejongia ; 23) Stanierella ; 24) Ulvibacter ; 25) Vitellibacter ; 26) Weeksella
	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26
Habitat*	me	me, s	s	me, s	p	me	me, p	me, s	me	me	me	me	me	me	me, s	p	me	me	p	me	me, s	me	me	me	me, s	me, s
Pigment	+	-	+	+	-	+	-	(+)	+	+	+	+	+	+	+	-	+	+	-/(+)	+	+	+	+	+	+	-
Type respiratoire**	A	A	A	A	mA	A	A	A	A	A	A	A	A	A, F	A	mA	A	A	mA	A	A	mA	A	A	A	A
Catalase	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	-	+	+	d	+	-	+	+	+	+	+	+	-	-	+
Oxydase		+	+	+	+	-	+	+	+	+	+		+	+	+	+	d	-	+	+	+	+	+	-	+
Réduction des nitrates	-	-		d	-	-	-		-	-	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	d	-	-	+	-
Halophilie	d	-	+	-	-	+	-	-	+	-	+	+	+	+	-	-	+	+	-	+	+	-	+	+	+	-
Croissance à 25 °C	+	+	+	+	(+)	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	-	-	-	+	+	+	d	+	+	+	+
Acidification des sucres	-	-	-	+	+	-	+	+	-	-	-	-	-	+	-	+	+	-	+	-	+	+	-	-	-	-
Agar***	-	-	-	-	-	-		-	-		-	-	-	-	-	-	-	-	-		-	-	+	-	-
Amidon***	d	-	-	d		+	-		-	-	+	-	-	-	-		+	-		+	+	+	-	-	-	d
Esculine***	d	-		+	+	-	+	-	+	+	-	-		+	-	-	d	-	d	+		+			-
Gélatine***	+	+	+	+	-	+			+	+	+	+	+	-	+	-	d	d	+	-	+	+	+	+	+	+
ONPG	-	-		d	+	-	+		+	-	-	-			-	+	d	d	-	+	+	-	+
H₂S	-	-	+				-		-	-	-	-	+	-		-	-	-			+	-	+	-	-
Uréase	d	+	-	d	-	+	d	-	-	d	-	-	-	-	+	+	-	-	d	-	+	-	-	-	-	-
Indole		+	-	+	-	-	d	+	-	+	-	-	-	-	-	-	-	-	d	-	-	+		-	-	+
	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26
1) Aequorivita ; 2) Bergeyella ; 3) Bizionia ; 4) Chryseobacterium ; 5) Coenonia ; 6) Croceibacter ; 7) Elizabethkingia ; 8) Empedobacter ; 9) Gillisia ; 10) Kaistella ; 11) Kordia ; 12) Lacinutrix ; 13) Mesonia ; 14) Muricauda ; 15) Myroides ; 16) Ornithobacterium ; 17) Polaribacter ; 18) Psychroserpens ; 19) Riemerella ; 20) Robiginitalea ; 21) Salegentibacter ; 22) Sejongia ; 23) Stanierella ; 24) Ulvibacter ; 25) Vitellibacter ; 26) Weeksella

* :
me : vie libre dans le milieu extérieur et/ou isolé de végétaux ;
s : saprophyte et éventuellement pathogène opportuniste ;
p : pathogène.

** :
A : aérobie ;
mA : micro-aérophile ;
F : aéro-anaérobie.

*** : Hydrolyse.

Notes :

Robiginitalea
Dans la publication de Cho et Giovannoni, certains caractères phénotypiques sont variables selon qu'ils sont mentionnés dans le tableau 1, dans le tableau 2 ou dans le texte !

Mobilité
La souche type de Polaribacter irgensii possède des flagelles polaires, mais aucune mobilité n'a été observée.

Pigment
Les souches de Chryseobacterium meningosepticum peuvent être non pigmentées.

Type respiratoire
Ornithobacterium rhinotracheale et les Riemerella sp. peuvent cultiver en anaérobiose.

Acidification du glucose
Chryseobacterium scophthalmum n'acidifie pas le glucose.
L'acidification des sucres par les souches de Riemerella sp. est irrégulière et sa mise en évidence nécessite souvent l'utilisation d'un milieu BBS (Buffered Single Substrate). Voir le fichier ¤ Riemerella.

Indole
Tous les Chryseobacterium sp. sont indologènes à l'exception de Chryseobacterium scophthalmum.

Sommaire

Références bibliographiques

. BARBEYRON (T.), L'HARIDON (S.), CORRE (E.), KLOAREG (B.) et POTIN (P.) : Zobellia galactanovorans gen. nov., sp. nov., a marine species of Flavobacteriaceae isolated from a red alga, and classification of [Cytophaga] uliginosa (ZoBell and Upham 1944) Reichenbach 1989 as Zobellia uliginosa gen. nov., comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2001, 51, 985-997.
. BERNARDET (J.F.), NAKAGAWA (Y.) et HOLMES (B.) : Proposed minimal standards for describing new taxa of the family Flavobacteriaceae, and emended description of the family. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 1049-1070.
. BOWMAN (J.P.) et NICHOLS (D.S.) : Aequorivita gen. nov., a member of the family Flavobacteriaceae isolated from terrestrial and marine Antarctic habitats. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 1533-1541.
. BOWMAN (J.P.) et NICHOLS (D.S.) : Novel members of the family Flavobacteriaceae from Antarctic maritime habitats including Subsaximicrobium wynnwilliamsii gen. nov., sp. nov., Subsaximicrobium saxinquilinus sp. nov., Subsaxibacter broadyi gen. nov., sp. nov., Lacinutrix copepodicola gen. nov., sp. nov., and novel species of the genera Bizionia, Gelidibacter and Gillisia. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 1471-1486.
. BRUNS (A.), ROHDE (M.) et BERTHE-CORTI (L.) : Muricauda ruestringensis gen. nov., sp. nov., a facultatively anaerobic, appendaged bacterium from German North Sea intertidal sediment. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001, 51, 1997-2006.
. CHO (J.C.) et GIOVANNONI (S.J.) : Croceibacter atlanticus gen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium in the family Flavobacteriaceae. Syst. Appl. Microbiol., 2003, 26, 76-83.
. CHO (J.C.) et GIOVANNONI (S.J.) : Robiginitalea biformata gen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium in the family Flavobacteriaceae with a higher G+C content. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 1101-1106.
. IVANOVA (E.P.), ALEXEEVA (Y.V.), FLAVIER (S.), WRIGHT (J.P.), ZHUKOVA (N.V.), GORSHKOVA (N.M.), MIKHAILOV (V.V.), NICOLAU (D.V.) et CHRISTEN (R.) : Formosa algae gen. nov., sp. nov., a novel member of the family Flavobacteriaceae. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 705-711.
. IVANOVA (E.P.), NEDASHKOVSKAYA (O.I.), CHUN (J.), LYSENKO (A.M.), FROLOVA (G.M.), SVETASHEV (V.I.), VYSOTSKII (M.V.), MIKHAILOV (V.V.), HUQ (A.) et COLWELL (R.R.) : Arenibacter gen. nov., new genus of the family Flavobacteriaceae and description of a new species, Arenibacter latericius sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001, 51, 1987-1995.
. KIM (M.K.), IM (W.T.), SHIN (Y.K.), LIM (J.H.), KIM (S.H.), LEE (B.C.), PARK (M.Y.), LEE (K.Y.) et LEE (S.T.) : Kaistella koreensis gen. nov., sp. nov., a novel member of the Chryseobacterium-Bergeyella-Riemerella branch. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 2319-2324.
. KIM (K.K.), KIM (M.K.), LIM (J.H.), PARK (H.Y.) et LEE (S.T.) : Transfer of Chryseobacterium meningosepticum and Chryseobacterium miricola to Elizabethkingia gen. nov. as Elizabethkingia meningoseptica comb. nov. and Elizabethkingia miricola comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 1287-1293.
. LAU (S.C.K.), TSOI (M.M.Y.), LI (X.), PLAKHOTNIKOVA (I.), DOBRETSOV (S.), LAU (K.W.K.), WU (M.), WONG (P.K.), PAWLIK (J.R.) et QIAN (P.Y.) : Winogradskyella poriferorum sp. nov., a novel member of the family Flavobacteriaceae isolated from a sponge in the Bahamas. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 1589-1592.
. MANCUSO NICHOLS (C.), BOWMAN (J.P.) et GUEZENNEC (J.) : Olleya marilimosa gen. nov., sp. nov., an exopolysaccharide-producing marine bacterium from the family Flavobacteriaceae, isolated from the Southern Ocean. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 1557-1561.
. NEDASHKOVSKAYA (O.I.), KIM (S.B.), HAN (S.K.), LYSENKO (A.M.), ROHDE (M.), RHEE (M.S.), FROLOVA (G.M.), FALSEN (E.), MIKHAILOV (V.V.) et BAE (K.S.) : Maribacter gen. nov., a new member of the family Flavobacteriaceae, isolated from marine habitats, containing the species Maribacter sedimenticola sp. nov., Maribacter aquivivus sp. nov., Maribacter orientalis sp. nov. and Maribacter ulvicola sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 1017-1023.
. NEDASHKOVSKAYA (O.I.), KIM (S.B.), HAN (S.K.), LYSENKO (A.M.), ROHDE (M.), ZHUKOVA (N.V.), FALSEN (E.), FROLOVA (G.M.), MIKHAILOV (V.V.) et BAE (K.S.) : Mesonia algae gen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium of the family Flavobacteriaceae isolated from the green alga Acrosiphonia sonderi (Kütz) Kornm. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 1967-1971.
. NEDASHKOVSKAYA (O.I.), KIM (S.B.), HAN (S.K.), SNAUWAERT (C.), VANCANNEYT (M.), SWINGS (J.), KIM (K.O.), LYSENKO (A.M.), ROHDE (M.), FROLOVA (G.M.), MIKHAILOV (V.V.) et BAE (K.S.) : Winogradskyella thalassocola gen. nov., sp. nov., Winogradskyella epiphytica sp. nov. and Winogradskyella eximia sp. nov., marine bacteria of the family Flavobacteriaceae. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 49-55.
. NEDASHKOVSKAYA (O.I.), KIM (S.B.), HAN (S.K.), RHEE (M.S.), LYSENKO (A.M.), ROHDE (M.), ZHUKOVA (N.V.), FROLOVA (G.M.), MIKHAILOV (V.V.) et BAE (K.S.) : Algibacter lectus gen. nov., sp. nov., a novel member of the family Flavobacteriaceae isolated from green algae. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 1257-1261.
. NEDASHKOVSKAYA (O.I.), KIM (S.B.), HAN (S.K.), RHEE (M.S.), LYSENKO (A.M.), FALSEN (E.), FROLOVA (G.M.), MIKHAILOV (V.V.) et BAE (K.S.) : Ulvibacter litoralis gen. nov., sp. nov., a novel member of the family Flavobacteriaceae isolated from the green alga Ulva fenestrata. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 119-123.
. NEDASHKOVSKAYA (O.I.), KIM (S.B.), LEE (K.H.), BAE (K.S.), FROLOVA (G.M.), MIKHAILOV (V.V.) et KIM (I.S.) : Pibocella ponti gen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium of the family Flavobacteriaceae isolated from the green alga Acrosiphonia sonderi. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 177-181.
. NEDASHKOVSKAYA (O.I.), KIM (S.B.), LYSENKO (A.M.), FROLOVA (G.M.), MIKHAILOV (V.V.) et BAE (K.S.) : Bizionia paragorgiae gen. nov., sp. nov, a novel member of the family Flavobacteriaceae isolated from the soft coral Paragorgia arborea. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 375-378.
. NEDASHKOVSKAYA (O.I.), KIM (S.B.), LYSENKO (A.M.), FROLOVA (G.M.), MIKHAILOV (V.V.), LEE (K.H.) et BAE (K.S.) : Description of Aquimarina muelleri gen. nov., sp. nov., and proposal of the reclassification of [Cytophaga] latercula Lewin 1969 as Stanierella latercula gen. nov., comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 225-229.
. NEDASHKOVSKAYA (O.I.), KIM (S.B.), LYSENKO (A.M.), FROLOVA (G.M.), MIKHAILOV (V.V.), BAE (K.S.), LEE (D.H.) et KIM (I.S.) : Gramella echinicola gen. nov., sp. nov, a novel halophilic bacterium of the family Flavobacteriaceae isolated from the sea urchin Strongylocentrotus intermedius. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 391-394.
. NEDASHKOVSKAYA (O.I.), KIM (S.B.), LYSENKO (A.M.), LEE (K.H.), BAE (K.S.) and MIKHAILOV (V.V.): Arenibacter echinorum sp. nov., isolated from the sea urchin Strongylocentrotus intermedius. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2007, 57, 2655-2659.
. NEDASHKOVSKAYA (O.I.), SUZUKI (M.), VANCANNEYT (M.), CLEENWERCK (I.), ZHUKOVA (N.V.), VYSOTSKII (M.V.), MIKHAILOV (V.V.) et SWINGS (J.) : Salegentibacter holothuriorum sp. nov, isolated from the edible holothurian Apostichopus japonicus. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 1107-1110.
. NEDASHKOVSKAYA (O.I.), SUZUKI (M.), VYSOTSKII (M.V.) et MIKHAILOV (V.V.) : Arenibacter troitsensis sp. nov., isolated from marine bottom sediment. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 1287-1290.
. NEDASHKOVSKAYA (O.I.), SUZUKI (M.), VYSOTSKII (M.V.) et MIKHAILOV (V.V.) : Vitellibacter vladivostokensis gen. nov., sp. nov., a new member of the phylum Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 1281-1286.
. NEDASHKOVSKAYA (O.I.), VANCANNEYT (M.), DAWYNDT (P.), ENGELBEEN (K.), VANDEMEULEBROECKE (K.), CLEENWERCK (I.), HOSTE (B.), MERGAERT (J.), TAN (T.L.), FROLOVA (G.M.), MIKHAILOV (V.V.) et SWINGS (J.) : Reclassification of [Cytophaga] marinoflava Reichenbach 1989 as Leeuwenhoekiella marinoflava gen. nov., comb. nov. and description of Leeuwenhoekiella aequorea sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 1033-1038.
. SOHN (J.H.), LEE (J.H.), YI (H.), CHUN (J.), BAE (K.S.), AHN (T.Y.) et KIM (S.J.) : Kordia algicida gen. nov., sp. nov., an algicidal bacterium isolated from red tide. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 675-680.
. SUZUKI (M.), NAKAGAWA (Y.), HARAYAMA (S.) et YAMAMOTO (S.) : Phylogenetic analysis and taxonomic study of marine Cytophaga-like bacteria: proposal for Tenacibaculum gen. nov. with Tenacibaculum maritimum comb. nov. and Tenacibaculum ovolyticum comb. nov., and description of Tenacibaculum mesophilum sp. nov. and Tenacibaculum amylolyticum sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2001, 51, 1639-1652.
. VANCANNEYT (M.), SEGERS (P.), TORCK (U.), HOSTE (B.), BERNARDET (J.F.), VANDAMME (P.) et KERSTERS (K.) : Reclassification of Flavobacterium odoratum (Stutzer 1929) strains to a new genus, Myroides, as Myroides odoratus comb. nov. and Myroides odoratimimus sp. nov. Int. J. Syst. Bacteriol., 1996, 46, 926-932.
. VAN TRAPPEN (S.), VANDECANDELAERE (I.), MERGAERT (J.) et SWINGS (J.) : Gillisia limnaea gen. nov., sp. nov., a new member of the family Flavobacteriaceae isolated from a microbial mat in Lake Fryxell, Antarctica. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 445-448.
. YI (H.), YOON (H.I.) et CHUN (J.) : Sejongia antarctica gen. nov., sp. nov. and Sejongia jeonii sp. nov., isolated from the Antarctic. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 409-416.

Sommaire

AVIS JURIDIQUE IMPORTANT : Les informations qui figurent sur ce site sont soumises à une clause de non responsabilité et sont protégées par un copyright.