J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Dernière mise à jour le 27 décembre 2002

Fichier rédigé par V. Guérin-Faublée (Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon) et J.P. Euzéby (Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse).

Flores normales et pathologiques du cheval

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Introduction

Ce fichier a été conçu pour faciliter le diagnostic, effectué par les laboratoires d'analyses médicales, des principales infections bactériennes du cheval. Il est divisé en deux grandes parties, l'une consacrée aux espèces bactériennes isolées d'animaux sains et l'autre aux bactéries isolées dans les différents types d'infections.

Il est relativement difficile d'établir une liste des bactéries isolées dans les différents types d'infections car la preuve du rôle étiologique de l'espèce bactérienne citée n'est le plus souvent pas démontré. Les espèces mentionnées en gras sont celles auxquelles il est attribué un rôle majeur dans les processus infectieux de part la fréquence de leur isolement et/ou de leur caractère virulent.

Pour faciliter l'interprétation du résultat de l'examen bactériologique, des notes complètent éventuellement les listes.

Le lecteur doit être conscient du caractère imparfait de ce fichier. En particulier, il est le plus souvent impossible de vérifier l'exactitude de l'identification mentionnée dans la littérature et les bactéries anaérobies ne sont que rarement recherchées.

BACTÉRIES ISOLÉES CHEZ LES ANIMAUX SAINS

Appareil respiratoire

Cavités nasales

Bactéries à Gram positif (flore dominante) : streptocoques alpha hémolytiques, bactéries corynéformes, Micrococcus sensu lato, Bacillus sp., staphylocoques à coagulase négative, entérocoques, Nocardia sp., streptocoques du groupe C, Rhodococcus equi, Actinomyces viscosus.

Bactéries à Gram négatif (plus rarement isolées) : Acinetobacter sp., Moraxella sp., Alcaligenes sp., Pasteurella sp., Actinobacillus equuli subsp. equuli, Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus, Klebsiella sp., Enterobacter sp., Citrobacter sp., Proteus sp., Providencia sp., Serratia sp., Bordetella bronchiseptica, Pseudomonas sp., Stenotrophomonas maltophilia, Flavobacterium sensu lato.

Trachée

Staphylocoques à coagulase négative, streptocoques alpha hémolytiques, Acinetobacter sp., Bacillus sp., Pasteurella sp., Pseudomonas sp., Klebsiella sp., Enterobacter sp., Nocardia sp., streptocoques bêta hémolytiques, Mycoplasma sp., Acholeplasma sp., Chlamydophila pneumoniae.

Appareil génito-urinaire

Vagin, vestibule, fosse clitoridienne

Streptocoques alpha hémolytiques, streptocoques non hémolytiques, staphylocoques à coagulase négative, bactéries corynéformes, Bacillus sp., Lactobacillus sp., Actinomyces sp., Streptococcus equi subsp. zooepidemicus, Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis, staphylocoques à coagulase positive, Acinetobacter sp., Alcaligenes faecalis, Escherichia coli, Proteus sp., Citrobacter sp., Enterobacter sp., Klebsiella sp. Serratia sp., Pasteurella sp., Actinobacillus equuli subsp. equuli, Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus, Aeromonas sp., Pseudomonas sp., Acholeplasma laidlawii, Eremococcus coleocola (rare), Arcanobacterium hippocoleae ?

Il est fait état de la présence de micro-organismes dans l'utérus de juments saines en particulier après le coït (l'éjaculation est intra-utérine) et après le part.

Sperme

De très nombreuses bactéries (en moyenne 1,5 x 10⁶ bactéries par mL) avec une flore à Gram positif dominante : staphylocoques à coagulase négative, Micrococcus sensu lato, bactéries corynéformes, streptocoques alpha hémolytiques, Lactobacillus sp., Bacillus sp. On note la présence de streptocoques du groupe C, Enterococcus sp., Aerococcus viridans, Rhodococcus equi, staphylocoques à coagulase positive, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Enterobacter sp., Citrobacter sp., Proteus sp., Pasteurella sp., Aeromonas sp., Pseudomonas sp., Alcaligenes faecalis, Moraxella sp., Acinetobacter sp., Mycoplasma sp.

Lait

La majorité des prélèvements de lait chez des juments saines contient des bactéries : Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae, Streptococcus sp. (dont Streptococcus equi subsp. zooepidemicus, Streptococcus uberis), Escherichia coli, Actinobacillus equuli, Staphylococcus aureus subsp. aureus, staphylocoques à coagulase négative, Bacillus sp. (dont Bacillus cereus), Enterococcus sp., Pseudomonas sp., bactéries corynéformes, Enterobacter sp.

Intestin

Très peu d'études. Sont cités des bactéries anaérobies (Clostridium sp., Bacteroides sp., Propionibacterium sp., Eubacterium sp., Veillonella sp., spirochètes) et Lactobacillus sp., Streptococcus sp., Enterococcus sp., Escherichia coli et diverses Enterobacteriaceae, Staphylococcus sp., Aerococcus sp., Rhodococcus equi, Actinobacillus sp.

Peau

Pas d'étude sur la flore cutanée dans son ensemble à notre connaissance.

Œil

Staphylocoques à coagulase négative, Bacillus sp., bactéries corynéformes, Micrococcus sensu lato, streptocoques alpha hémolytiques et non hémolytiques, Moraxella sp., Neisseria sp., Acinetobacter sp. staphylocoques à coagulase positive, streptocoques bêta hémolytiques, Mycoplasma sp., Acholeplasma sp.

BACTÉRIES ASSOCIÉES À DES INFECTIONS

Infections respiratoires

Appareil respiratoire supérieur

Streptococcus equi subsp. equi (+ pharyngite et lymphadénite), Chlamydophila pneumoniae, Burkholderia mallei

Infections respiratoires basses

- Bactéries aérobies ou aéro-anaérobies

Streptococcus equi subsp. zooepidemicus, Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis, Streptococcus equi subsp. equi (poulain), Streptococcus pneumoniae (rare), Actinobacillus equuli subsp. equuli (poulain), Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus (poulain), Escherichia coli (poulain), Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae, Pasteurella multocida subsp. multocida, Pasteurella caballi, Rhodococcus equi (poulain), Staphylococcus aureus subsp. aureus, Bordetella bronchiseptica, Burkholderia mallei, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter sp., Nocardia sp.

- Les bactéries anaérobies sont très rarement recherchées mais ont certainement un rôle dans les infections respiratoires (en particulier Bacteroides sensu lato et Fusobacterium necrophorum).

- Mycoplasma felis, Chlamydophila felis.

L'interprétation des résultats de l'examen bactériologique d'un liquide de lavage broncho-alvéolaire est difficile chez le cheval car les prélèvements sont très souvent contaminés par la flore de l'appareil respiratoire supérieur. La présence de cellules épithéliales à l'examen cytologique doit faire rejeter le prélèvement. Une cellularité élevée accompagnée d'un fort pourcentage de granulocytes neutrophiles amène à la recherche d'une étiologie bactérienne.

Cytologie normale du LBA du cheval (Cadoré, communication personnelle)

Cellularité inférieure à 300 cellules par mm³

Macrophages 30 à 60 %

Lymphocytes 30 à 70 %

Granulocytes neutrophiles inférieurs à 5 %

Granulocytes éosinophiles rares

Mastocytes rares

Infections des poches gutturales

Streptococcus equi subsp. zooepidemicus, Streptococcus equi subsp. equi (poulain), Staphylococcus aureus subsp. aureus, Staphylococcus intermedius, Pasteurella multocida subsp. multocida, Pasteurella caballi, Actinobacillus equuli subsp. equuli, Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, bactéries anaérobies.

Infections génitales

Endométrites, pyomètres, infertilité

Streptococcus equi subsp. zooepidemicus, Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae (sérovars K1, K2, K5), Taylorella equigenitalis, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis, Actinobacillus equuli subsp. equuli, Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus, staphylocoques à coagulase positive, Arcanobacterium pyogenes, Salmonella choleraesuis subsp. choleraesuis, Enterobacter sp., Clostridium perfringens. Le rôle de certaines bactéries anaérobies (Bacteroides sp., Fusobacterium sp.) est mal précisé.

Une demande de diagnostic bactériologique dans le cadre d'endométrite chez la jument doit nécessairement entraîner la recherche de Taylorella equigenitalis et est donc soumis à une réglementation. Les prélèvements sont le plus souvent polymicrobiens. Taylorella equigenitalis, certains sérovars de Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa et Salmonella choleraesuis subsp. choleraesuis n'appartiennent pas à la flore de l'appareil génital de la jument et sont considérés comme pathogènes. L'interprétation de l'isolement d'autres espèces est plus délicate ; elle repose sur la prédominance d'une espèce bactérienne à l'isolement et le résultat de la cytologie utérine (supérieur à 5 granulocytes neutrophiles par champ microscopique à un grossissement 400 lors d'endométrite).

Avortements

Streptococcus equi subsp. zooepidemicus, Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis, Escherichia coli, Leptospira interrogans sensu lato, Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae, Salmonella choleraesuis subsp. choleraesuis (sérovars Typhimurium et Abortusequi), Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter sp. (Enterobacter agglomerans), Actinobacillus equuli subsp. equuli, Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus, Streptococcus uberis, Nocardia sp., Enterococcus faecalis, Aeromonas hydrophila, Staphylococcus aureus subsp. aureus, Ehrlichia risticii, Corynebacterium pseudotuberculosis, Chlamydophila abortus, Rhodococcus equi (rare), Taylorella equigenitalis (très rare), Brucella melitensis biovar Abortus (exceptionnel), Arcobacter cryaerophilus, Crossiella equi, Acholeplasma equifetale (?).

Orchites, épididymites

Infections mal documentées d'origine exogène (Cf. infections des plaies) ou hématogène (Cf. bactériémies).

Mammites (rares)

Streptocoques du groupe C, Streptococcus agalactiae, Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae, Actinobacillus sp., Staphylococcus aureus subsp. aureus, Escherichia coli, Enterobacter aerogenes, Pseudomonas aeruginosa.

Infections digestives

Diarrhées

Salmonella choleraesuis subsp. choleraesuis (sérovars Typhimurium et Enteritidis), Rhodococcus equi (poulain), Actinobacillus equuli subsp. equuli (poulain), Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus (poulain), Clostridium perfringens (toxinovars A, B et C), Clostridium cadaveris, Clostridium difficile, Bacteroides fragilis (poulain), Escherichia coli (poulain), Ehrlichia risticii, Clostridium piliforme, Aeromonas hydrophila (?).

Clostridium perfringens (toxinovar C) et Clostridium sordellii sont responsables d'entérotoxémies. Il est très difficile d'attribuer un rôle étiologique aux clostridies dans les infections digestives et les entérotoxémies ; certains auteurs conseillent de faire un dénombrement et de rechercher la production de toxines in situ.

Péritonites

Bactéries anaérobies (Bacteroides sp., Clostridium sp., Fusobacterium sp., cocci anaérobies) associées à des Enterobacteriaceae (Escherichia coli) et à Streptococcus equi subsp. zooepidemicus, à Pasteurella caballi...

Abcès hépatiques, hépatites

Bactéries anaérobies (Fusobacterium necrophorum, Clostridium sp.), streptocoques du groupe C, Leptospira interrogans sensu lato, Clostridium piliforme.

Infections cutanées

Staphylococcus aureus subsp. aureus*, Staphylococcus intermedius, Staphylococcus hyicus, Dermatophilus congolensis, Streptococcus equi subsp. zooepidemicus*, Corynebacterium pseudotuberculosis, Pseudomonas aeruginosa*, Burkholderia mallei*.

Les espèces bactériennes notées d'une étoile sont également responsables de lymphangites.

Infections des plaies, abcès

Streptococcus equi subsp. zooepidemicus, Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis, Staphylococcus aureus subsp. aureus, Staphylococcus hyicus, Staphylococcus intermedius, Corynebacterium pseudotuberculosis, Escherichia coli, Klebsiella sp., Enterobacter sp., Pseudomonas aeruginosa, Actinobacillus equuli subsp. equuli, Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus, Pasteurella caballi, bactéries anaérobies : Fusobacterium necrophorum, Bacteroides sensu lato, et rarement Clostridium sp. (Clostridium perfringens, Clostridium septicum, Clostridium chauvoei, Clostridium novyi).

Funiculite de castration

Staphylococcus aureus subsp. aureus (botryomycose), streptocoques du groupe C (dont Streptococcus equi subsp. equi), Fusobacterium necrophorum, Pseudomonas aeruginosa, Actinomyces bovis.

Septicémies, bactériémies

Poulain

Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae, Actinobacillus equuli subsp. equuli, Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus, Streptococcus equi subsp. zooepidemicus, Salmonella choleraesuis subsp. choleraesuis (sérovar Typhimurium et autres sérovars), Streptococcus equi subsp. equi, Rhodococcus equi, staphylocoques à coagulase positive, Klebsiella sp., Enterobacter cloacae, Clostridium perfringens.

L'infection de l'ombilic est une cause fréquente de septicémies secondaires chez le poulain. On retrouve donc les espèces bactériennes citées ci-dessus dans les omphalites.

Adulte

Salmonella choleraesuis subsp. choleraesuis, Actinobacillus equuli subsp. equuli, Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus, bactéries anaérobies (Fusobacterium necrophorum, Bacteroides sensu lato, Clostridium sp.), Bacillus anthracis (rare).

Arthrites, ténosynovites, bursites, ostéomyélites

Les arthrites ont soit une origine traumatique, soit une origine hématogène en particulier chez le poulain (Cf. bactéries associées à des septicémies et bactériémies). Y sont associés : Escherichia coli, Streptococcus equi subsp. zooepidemicus, Streptococcus equi subsp. equi (poulain), Actinobacillus equuli subsp. equuli (poulain), Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus (poulain), Staphylococcus aureus subsp. aureus, Klebsiella sp., Salmonella choleraesuis subsp. choleraesuis, Rhodococcus equi (poulain), Pseudomonas aeruginosa, bactéries anaérobies (Fusobacterium necrophorum, Bacteroides sensu lato, Clostridium sp.), Brucella melitensis biovar Abortus.

Les mêmes bactéries sont retrouvées associées à des ténosynovites, à des bursites (maux de garrot) et à des ostéomyélites et ostéites.

L'actinomycose cervico-faciale est due à Actinomyces bovis, à Actinobacillus genomospecies 1 et, peut-être, à Actinobacillus lignieresii.

Infections du système nerveux central

Infections rares. L'atteinte du système nerveux central a lieu par voie hématogène et est donc plus fréquente chez le poulain (Cf. bactéries associées à des septicémies et bactériémies). Ont été isolés : Streptococcus equi subsp. equi (poulain), Streptococcus equi subsp. zooepidemicus, Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae (poulain), Actinobacillus equuli subsp. equuli (poulain), Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus , Escherichia coli (poulain), Staphylococcus aureus subsp. aureus, Actinomyces sp. La listériose n'est pas documentée chez le cheval.

Infections oculaires

Conjonctivites, kératites

Streptocoques du groupe C, staphylocoques à coagulase positive, Enterobacteriaceae, Pseudomonas sp., Pasteurella sp., Actinobacillus sp. Les prélèvements sont polycontaminés et il est très difficile d'attribuer un pouvoir pathogène à une ou des espèces isolées.

Uvéites

Leptospira interrogans sensu lato (plus uvéite isolée = fluxion périodique à déterminisme immunologique), Streptococcus equi, Escherichia coli, Rhodococcus equi, Brucella melitensis biovar Abortus.

Infections de l'appareil urinaire

Les infections du tractus urinaire sont rares chez le cheval et mal documentées. Des espèces bactériennes très variées ont été isolées : Staphylococcus sp., Streptococcus sp., Enterobacteriaceae (Escherichia coli et autres).

La "shigellose" du poulain (Actinobacillus equuli subsp. equuli, Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus) et la leptospirose (Leptospira interrogans sensu lato) s'accompagnent d'une néphrite.

Autres bactéries responsables d'infections

Clostridium tetani

Mycobacterium bovis, Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium avium : la tuberculose est exceptionnelle chez le cheval ; elle se manifeste par un dépérissement progressif et des localisations pulmonaires et abdominales.

Burkholderia pseudomallei

Clostridium botulinum

Ehrlichia equi

Borrelia burgdorferi, Borrelia garinii, Borrelia afzelii : la maladie de Lyme est le plus souvent asymptomatique chez le cheval. Elle est actuellement décrite aux USA et se traduit par de la fièvre, de l'anorexie, des arthrites, des troubles cardiaques et des troubles nerveux.

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