J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 26 septembre 2003
GRIMONTIA, GRIMONTIA HOLLISAE
Autre dénomination : Vibrio hollisae, "EF13", "Enteric Group 42".
Voir aussi le fichier : ¤ "Vibrionales", Vibrionaceae, Vibrio.
Systématique
La nomenclature de Vibrio hollisae a été validement publiée en 1982 par inscription sur la liste de validation n° 9. Dès 1992, une étude phylogénétique suggérait que ce taxon n'était pas une espèce du genre Vibrio. D'autres travaux basés sur l'analyse des séquences des ARNr 16S, sur l'analyse des séquences des gènes toxR*, sur l'analyse des séquences des gènes gyrB (codant pour la sous-unité B de l'ADN gyrase ou topoisomérase de type II) ou sur les résultats obtenus par FAFLP (Fluorescent Amplified Fragment Lenght Polymorphism) allaient dans le même sens. Vibrio hollisae présente également des caractères phénotypiques originaux pour une espèce du genre Vibrio car il ne cultive pas ou mal sur le milieu TCBS**, il est faiblement mobile et il est à la fois LDC-, ODC- et ADH-.
En dépit de ces observations aucune proposition formelle n'avait été formulée pour le reclassement de cette espèce.
En 2003, Thompson et al. soumettent trois souches de Vibrio hollisae (dont la souche type) à une nouvelle analyse phylogénétique. Les séquences des ARNr 16S de ces trois souches présentent 99,5 p. cent d'homologie et le pourcentage d'homologie obtenu avec la séquence de l'espèce la plus proche, ¤ Enterovibrio norvegicus, est de 94,6. Comparées à la séquence de la souche type de l'espèce type du genre Vibrio (Vibrio cholerae), les homologies de séquences sont de 90,8.
Au sein de la famille des Vibrionaceae (au sens de M. Véron 1965) les analyses phylogénétiques montrent qu'un pourcentage d'homologie des séquences des ARNr 16S inférieur à 95 est compatible avec la création d'un nouveau genre. Les résultats obtenus Thompson et al. démontrent que Vibrio hollisae doit être placé dans un nouveau genre de la famille des Vibrionaceae et, le 12 septembre 2003, ces auteurs valident les nomenclature de Grimontia et de Grimontia hollisae.
Le genre Grimontia est actuellement placé dans la famille des "Enterovibrionaceae" (ordre des ¤ "Vibrionales", classe des ¤ Gammaproteobacteria, phylum des ¤ "Proteobacteria", domaine ou empire des "Bacteria" ou des "Eubacteria").
Caractères bactériologiques
Le genre Grimontia rassemble des bacilles à Gram négatif, faiblement mobiles grâce à un unique flagelle polaire, non sporulés, chimio-organotrophes, aéro-anaérobies, à métabolisme fermentatif et oxydatif, fermentant le glucose sans gaz, mésophiles, modérément halophiles, oxydase positive, réduisant les nitrates en nitrites (à condition d'utiliser un bouillon nitraté contenant 1 p. cent de NaCl), indologènes (à condition d'utiliser une eau peptonée contenant 1 p. cent de NaCl), donnant une réponse négative aux tests LDC, ODC, ADH et VP.
La séquence du gène codant pour l'ARNr 16S se caractérise par la présence de la séquence signature TC (position 970-971) au lieu de AG chez les autres représentants de la famille des Vibrionaceae et par la présence de la séquence signature CG (position 1107-1108) au lieu de AA chez les autres représentants de la famille des Vibrionaceae.
Les caractères permettant de différencier le genre Grimontia d'autres genres de la famille des Vibrionaceae sont donnés dans le tableau I.
L'étude des caractères biochimiques doit utiliser des milieux contenant 1 p. cent de NaCl.
. Plus de 95 p. cent des souches donnent une réponse positive aux tests acidification du L-arabinose, du D-galactose et du D-mannose ainsi qu'au "string test"***.
. Toutes les souches donnent une réponse négative aux tests ONPG, RM, lipase, hydrolyse de la gélatine, hydrolyse de l'esculine, hydrolyse de l'ADN, citrate de Simmons, production d'hydrogène sulfuré (milieu TSI), uréase (Farmer et Hickman-Brener ont cependant décrits une souche uréase positive), phénylalanine désaminase, utilisation de l'acétate, utilisation du malonate, croissance dans un bouillon au KCN, acidification du mucate, acidification du D-adonitol, du D-arabitol, du cellobiose, du dulcitol, de l'érythritol, du glycérol, du myo-inositol, du lactose, du maltose, du D-mannitol, du mélibiose, de l'alpha-Méthyl D-glucoside, du raffinose, du L-rhamnose, du saccharose, de la salicine, du D-sorbitol, du tréhalose et du D-xylose.
. La sensibilité au O129 est variable selon les souches.
La croissance de Grimontia hollisae nécessite du NaCl. L'halophilie est cependant modérée car seule 83 p. cent des souches cultivent en présence de 6 p. cent de NaCl et aucune culture n'est obtenue pour des concentrations en NaCl égales ou supérieures à 8 p. cent.
Grimontia hollisae cultive mal sur le milieu TCBS, elle ne cultive pas en 48 heures sur une gélose de MacConkey, en revanche elle cultive bien sur une gélose trypticase soja au sang. Lorsqu'une culture est observée sur milieu TCBS, les colonies ont une couleur verte.
Habitat et pouvoir pathogène
L'habitat de Grimontia hollisae est certainement l'eau de mer et cette espèce semble avoir une vaste distribution géographique (Amérique, Europe, Indonésie, Japon…). Toutefois, Grimontia hollisae n'a jamais été isolée de l'eau de mer et seuls deux isolements ont été effectués à partir de coquillages (huîtres et moules) et deux isolements à partir de poissons (Rhynchopelates oxyrhynchus). L'absence de croissance sur les milieux TCBS et MacConkey et l'inertie biochimique de Grimontia hollisae pourraient expliquer que sa mise en évidence soit rare.
Grimontia hollisae est à l'origine de diarrhées (nécessitant parfois une hospitalisation) observées chez des individus ayant consommé des coquillages crus (notamment des huîtres) ou plus rarement des poissons crus ou insuffisamment cuits. Des cas de septicémies (dont un cas mortel chez un individu co-infecté par Cryptococcus neoformans) et des cas de surinfections des plaies ont également été observés.
Entre 1981 et 1993, 59 souches de Grimontia hollisae ont été isolées en Floride ; entre 1997 et 1999, 21 infections ont été rapportées en Alabama, en Floride, en Louisiane, au Mississippi et au Texas ; plusieurs cas de gastro-entérites ont été décrits dans différentes régions du monde (dont la France) et la prévalence des infections semble sous-estimée car Grimontia hollisae ne cultive pas sur les milieux sélectifs (TCBS et MacConkey) couramment utilisés dans les laboratoires de bactériologie. L'Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments (AFSSA) estime cependant que "les risques sanitaires liés à l'espèce Vibrio hollisae, susceptible d’être détectée dans certains aliments d’origine marine, restent extrêmement faibles, avec l’apparition potentielle de gastro-entérite sans gravité pour la population générale".
Contrairement à ce qui est écrit dans un avis de l'AFSSA en date du 14 août 2002, des facteurs de pathogénicité ont été identifiés chez Grimontia hollisae.
Cette espèce produit une entérotoxine thermolabile responsable d'une élongation des cellules CHO (Chinese Hamster Ovary cell).
Grimontia hollisae synthétise une hémolysine similaire à l'hémolysine thermostable de Vibrio parahaemolyticus et le gène tdh (thermostable direct hemolysin) est présent chez toutes les souches examinées.
In vitro, Grimontia hollisae est capable d'adhérer et de pénétrer dans des cellules épithéliales.
Diagnostic bactériologique
L'isolement au sein d'une flore complexe est difficile car Grimontia hollisae ne cultive pas ou mal sur une gélose TCBS et ne cultive pas sur une gélose de MacConkey. Nishibuchi et al. ont mis au point un milieu d'isolement**** contenant du D-mannitol, du maltose, du bleu de bromothymol et du rouge de crésol. Sur ce milieu, les colonies de Grimontia hollisae sont de couleur rouge (absence d'acidification du mannitol et du maltose).
Le diagnostic biochimique doit être effectué en ajoutant 1 p. cent de NaCl dans les milieux de culture. Même dans ces conditions, quelques souches sont mal identifiées par le système API 20E.
Pour pallier ces difficultés, Vuddhakul et al. ont développé des tests PCR amplifiant des séquences des gènes toxR et gyrB. Ces tests semblent spécifiques. Expérimentalement, l'amplification du gène toxR permet de détecter 1 à 100 UFC (unités formant colonies) de Grimontia hollisae dans une eau peptonée alcaline contenant un broyat de coquillages ou de poissons.
Sensibilité aux antibiotiques
Grimontia hollisae est sensible à de nombreux antibiotiques : pénicilline G, ampicilline, carbénicilline, céfalotine, colistine, tétracycline, chloramphénicol, streptomycine, kanamycine, gentamicine, acide nalidixique. La sensibilité à la sulfadiazine est variable selon les souches.
Orientation bibliographique
ABBOTT (S.L.) et JANDA (J.M.) : Severe gastroenteritis associated with Vibrio hollisae infection: report of two cases and review. Clin. Infect. Dis., 1994, 18, 310-312.
CARNAHAN (A.M.), HARDING (J.), WATSKY (D.) et HANSMAN (S.) : Identification of Vibrio hollisae associated with severe gastroenteritis after consumption of raw oysters. J. Clin. Microbiol., 1994, 32, 1805-1806.
CAVALLO (R.A.) et STABILI (L.) : Presence of vibrios in seawater and Mytilus galloprovincialis (Lam.) from the Mar Piccolo of Taranto (Ionian Sea). Water Research, 2002, 36,3719–3726.
DORSCH (M.), LANE (D.) et STACKEBRANDT (E.) : Towards a phylogeny of the genus Vibrio based on 16S rRNA sequences. Int. J. Syst. Bacteriol., 1992, 42, 58-63.
FARMER III (J.J.) et HICKMAN-BRENNER (F.W.) : The genera Vibrio and Photobacterium. In : M. Dworkin et al., eds., The Prokaryotes: An Evolving Electronic Resource for the Microbiological Community, 3rd edition, release 3.0, 5/21/1999, Springer-Verlag, New York, http://link.springer-ny.com/link/service/books/10125/.
HIRSCH (M.): Avis de l’Agence française de sécurité sanitaire des aliments relatif à l’évaluation des risques liés à la consommation de produits de la pêche importés, contaminés par certaines espèces de Vibrio (autre que V. cholerae, V. parahaemolyticus et V. vulnificus). 14 août 2002. Disponible sur Internet.
HLADY (W.G.) et KLONTZ (K.C.) : The epidemiology of Vibrio infections in Florida, 1981-1993. J. Infect. Dis., 1996, 173, 1176-1183.
HONDA (T.), NI (Y.), YOH (M.) et MIWATANI (T.) : Evidence of immunologic cross-reactivity between hemolysins of Vibrio hollisae and Vibrio parahaemolyticus demonstrated by monoclonal antibodies. J. Infect. Dis., 1989, 160, 1089-1090.
KOTHARY (M.H.), CLAVERIE (E.F.), MILIOTIS (M.D.), MADDEN (J.M.) et RICHARDSON (S.H.) : Purification and characterization of a chinese hamster ovary cell elongation factor of Vibrio hollisae. Infect. Immun., 1995, 63, 2418-2423.
LESMANA (M.), SUBEKTI (D.S.), TJANIADI (P.), SIMANJUNTAK (C.H.), PUNJABI (N.H.), CAMPBELL (J.R.) et OYOFO (B.A.) : Spectrum of vibrio species associated with acute diarrhea in North Jakarta, Indonesia. Diagn. Microbiol. Infect. Dis., 2002, 43, 91-97.
LEVINE (W.C.) et GRIFFIN (P.M.) : Vibrio infections on the Gulf Coast: results of first year of regional surveillance. J. Infect. Dis., 1993, 167, 479-483.
MILIOTIS (M.D.), TALL (B.D.) et GRAY (R.T.) : Adherence to and invasion of tissue culture cells by Vibrio hollisae. Infect. Immun., 1995, 63, 4959-4963.
NISHIBUCHI (M.), DOKE (S.), TOIZUMI (S.), UMEDA (T.), YOH (M.) et MIWATANI (T.) : Isolation from a coastal fish of Vibrio hollisae capable of producing a hemolysin similar to the thermostable direct hemolysin of Vibrio parahaemolyticus. Appl. Environ. Microbiol., 1988, 54, 2144-2146.
OSORIO (C.R.) et KLOSE (K.E.) : A region of the transmembrane regulatory protein ToxR that tethers the transcriptional activation domain to the cytoplasmic membrane displays wide divergence among Vibrio species. J. Bact., 2000, 182, 526-528.
THOMPSON (F.L.), HOSTE (B.), THOMPSON (C.C.), GORIS (J.), GOMEZ-GIL (B.), HUYS (L.), DE VOS (P.) et SWINGS (J.) : Enterovibrio norvegicus gen. nov., sp. nov., isolated from the gut of turbot (Scophthalmus maximus) larvae: a new member of the family Vibrionaceae. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 2015-2022.
THOMPSON (F.L.), HOSTE (B.), VANDEMEULEBROECKE (K.) et SWINGS (J.) : Genomic diversity amongst Vibrio isolates from different sources determined by fluorescent amplified fragment length polymorphism. Syst. Appl. Microbiol., 2001, 24, 520-538.
THOMPSON (F.L.), HOSTE (B.), VANDEMEULEBROECKE (K.) et SWINGS (J.) : Reclassification of Vibrio hollisae as Grimontia hollisae gen. nov., comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 1615-1617.
VUDDHAKUL (V.), NAKAI (T.), MATSUMOTO (C.), OH (T.), NISHINO (T.), CHEN (C.H.), NISHIBUCHI (M.) et OKUDA (J.) : Analysis of gyrb and toxr gene sequences of Vibrio hollisae and development of gyrb- and toxr-targeted PCR methods for isolation of V. hollisae from the environment and its identification. Appl. Environ. Microbiol., 2000, 66, 3506-3514.
WEST (P.A.) : The human pathogenic vibrios - A public health update with environmental perspectives. Epid. Infect., 1989, 103, 1-34.
AVIS JURIDIQUE IMPORTANT : Les informations qui figurent sur ce site sont soumises à une clause de non responsabilité et sont protégées par un copyright.
Le gène toxR a tout d'abord été identifié chez Vibrio cholerae comme un gène régulateur de la transcription du gène ctx codant pour la toxine cholérique. Ultérieurement, on a montré que ce gène joue un rôle central dans la régulation de nombreux gènes de Vibrio cholerae comme le gène tcp (toxin-coregulated pili) et les gènes ompU et ompT (codant pour des protéines de membrane externe). En fait, le gène toxR est un gène régulateur présent chez de nombreux représentants de la famille des Vibrionaceae. Outre Vibrio cholerae, ce gène a été identifié chez Vibrio alginolyticus, Vibrio fisheri, Vibrio fluvialis, Vibrio hollisae, Vibrio mimicus, Vibrio parahaemolyticus, Vibrio vulnificus…
** : Gélose TCBS : Thiosulfate Citrate Bile salt Sucrose
Extraits de levure : 0,5 p. cent (poids/volume)
Peptone : 1,0 p. cent (poids/volume)
Thiosulfate de sodium : 1,0 p. cent (poids/volume)
Citrate de sodium : 1,0 p. cent (poids/volume)
Bile de bœuf : 0,8 p. cent (poids/volume)
Saccharose : 2,0 p. cent (poids/volume)
NaCl : 1,0 p. cent (poids/volume)
Citrate de fer : : 0,1 p. cent (poids/volume)
Bleu de bromothymol : 0,004 p. cent (poids/volume)
Bleu de thymol : 0,004 p. cent (poids/volume)
Agar : 1,4 p. cent (poids/volume)
pH : 8,6
Porter à ébullition pour dissoudre les ingrédients. Ne pas autoclaver.
Le désoxycholate de sodium est un détergent capable de lyser de nombreuses bactéries à Gram négatif. Cette lyse libère l'ADN ce qui rend le milieu visqueux.
La réalisation du test est simple. Une ou plusieurs colonies du germe à étudier sont mises en suspension dans 0,1 mL d'une solution à 0,5 p. cent de désoxycholate de sodium. La réaction est positive si en une minute on observe une viscosité et si des fils sont mis en évidence lorsque l'on retire doucement une öse préalablement plongée dans le milieu.
**** : Milieu d'isolement selon Nishibuchi et al.
Phytone : 5 g
Polypeptone: 5 g
Extraits de viande de boeuf : 5 g
D-mannitol : 10 g
Maltose : 10 g
NaCl : 20 g
Bleu de bromothymol à 0,2 p. cent : 20 mL
Rouge de crésol à 0,2 p. cent : 20 mL
Eau distillée : 1 L
pH à 7,8