J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 12 octobre 2006
HELICOBACTER CETORUM
Voir aussi le fichier Helicobacter
Des ulcères gastriques ont été observés chez des mammifères marins sauvages ou élevés en captivité. Les animaux présentent alors de l'inappétence ou une anorexie, une asthénie et une apathie. Dans quelques cas, les lésions sont associées à la présence d'un corps étranger ou à une infestation par Anisakis simplex, Pholeter gastrophilus ou Braunina cordiformis. Dans d'autres cas, des lésions de l'estomac mécanique*, de l'estomac principal et de l'estomac pylorique sont mises en évidence en l'absence de corps étrangers ou d'infestations parasitaires.
Quelques espèces du genre Helicobacter, notamment Helicobacter pylori, sont responsables de lésions gastriques et l'hypothèse d'une infection des mammifères marins par une hélicobactérie était plausible.
En 2000, Harper et al. isolent trois souches de Helicobacter sp. à partir de l'estomac principal de deux lagénorhynque à flancs blancs de l’Atlantique (Lagenorhynchus acutus**) retrouvés échoués sur une plage. Par PCR ces auteurs montrent que des hélicobactéries sont présentes dans l'estomac mécanique et/ou l'estomac principal de sept dauphins (six lagénorhynque à flancs blancs de l’Atlantique et un d'un dauphin commun, Delphinus delphis***) également retrouvés morts sur une plage.
En 2002, la même équipe isole une souche de Helicobacter sp. à partir des fèces d'un béluga (Delphinapterus leucas****) élevé en captivité et, par un test PCR, les auteurs identifient la présence d'une hélicobactérie dans le mucus gastrique de l'animal.
En décembre 2002 Harper et al. publient les résultats obtenus avec cinq souches de Helicobacter sp. Deux souches isolées en 2000 de deux lagénorhynque à flancs blancs de l’Atlantique, la souche isolée d'un béluga, une souche provenant des fèces et du mucus gastrique d'un lagénorhynque à flancs blancs du Pacifique (Lagenorhynchus obliquidens*****) élevé en captivité et une souche isolée des fèces d'un grand dauphin (Tursiops truncatus******) élevé en captivité.
L'étude des ARNr 16S montre que quatre souches ont des séquences quasiment identiques (les séquences diffèrent entre elles par un maximum de 5 bases). La séquence de la cinquième souche diffère des autres séquences par 18 à 21 bases, mais toutes les séquences peuvent cependant être placées dans un unique groupe monophylétique.
Ce groupe monophylétique est apparenté au groupe formé par Helicobacter pylori et ¤ Helicobacter acinonychis. Les pourcentages d'homologie obtenus entre les séquences des cinq souches isolées des cétacés et la séquence de la souche type de Helicobacter pylori sont compris entre 98,2 et 97,9.
Les caractères phénotypiques permettent de différencier les cinq souches de Helicobacter pylori et de Helicobacter acinonychis et Harper et al. proposent de les placer dans une nouvelle espèce, Helicobacter cetorum. Cette nomenclature a été validement publiée le 11 septembre 2006 par citation sur la liste de validation 111.
On peut remarquer (i) que l'individualisation de Helicobacter cetorum n'est pas en accord avec les recommandations du "Sous-comité de taxonomie des Campylobacter et des bactéries apparentées" et (ii) que selon Stackebrandt et Goebel des souches présentant des homologies de séquence (ARNr 16S) supérieures à 97 p. cent ne constituent pas obligatoirement des espèces distinctes.
Les souches de Helicobacter cetorum sont constituées de bacilles fusiformes à Gram négatif, de 0,6 µm de diamètre sur 4 µm de longueur, dépourvus de fibres périplasmiques, mobiles grâce à un flagelle présent en position sub-polaire à chacune des extrémités de la cellule et micro-aérophiles.
. Une réponse positive est obtenue pour les tests catalase, oxydase, uréase et gamma-glutamyl transférase.
. Une réponse négative est obtenue avec les tests réduction des nitrates, indoxyl acétate estérase et phosphatase alcaline.
. Toutes les souches sont sensibles à la céfalotine. Trois souches sont résistantes à l'acide nalidixique, une souche est sensible à cet antibiotique et une souche présente une sensibilité intermédiaire.
. Les caractères permettant de différencier Helicobacter cetorum des autres espèces isolées de l'estomac sont donnés dans le tableau I.
Aucune culture n'est obtenue en aérobiose, en anaérobiose, à une température de 25 °C ou en présence de 1 p. cent de glycine.
Après deux à quatre semaines d'incubation à 37 ou à 42 °C dans une atmosphère micro-aérophile, la croissance obtenue sur une gélose trypticase soja au sang de mouton se traduit par un film et par la présence de quelques colonies. Lors des repiquages, la croissance est obtenue après 2 à 5 jours d'incubation à 37 °C.
Trois souches de Helicobacter cetorum ont été isolées sur des animaux élevés en captivité. Ces animaux présentaient soit une anorexie et un état léthargique soit des régurgitations et une perte de poids.
Chez les animaux retrouvés morts et chez les animaux élevés en captivité, des ulcères ont été mis en évidence dans l'œsophage et dans les trois poches de l'estomac. Les quelques examens anatomo-pathologiques réalisés révèlent la présence de lésions comparables à celles retrouvées chez l'homme infecté par Helicobacter pylori.
Il est actuellement impossible d'affirmer que Helicobacter cetorum est responsable de lésions de l'estomac chez les mammifères marins (les postulats de Koch n'ont pas été vérifiés), mais il existe une association entre la colonisation par ce germe et la présence de lésions.
Helicobacter cetorum a pu être isolé des fèces ce qui suggère que les animaux se contaminent par voie fécale-orale.
Orientation bibliographique
DEWHIRST (F.E.), FOX (J.G.) et ON (S.L.W.) : Recommended minimal standards for describing new species of the genus Helicobacter. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2000, 50, 2231-2237.
HARPER (C.M.), DANGLER (C.A.), XU (S.), FENG (Y.), SHEN (Z.), SHEPPARD (B.), STAMPER (A.), DEWHIRST (F.E.), PASTER (B.J.) et FOX (J.G.) : Isolation and characterization of a Helicobacter sp. from the gastric mucosa of dolphins, Lagenorhynchus acutus and Delphinus delphis. Appl. Environ. Microbiol., 2000, 66, 4751-4757.
HARPER (C.G.), FENG (Y.), XU (S.), TAYLOR (N.S.), KINSEL (M.), DEWHIRST (F.E.), PASTER (B.J.), GREENWELL (M.), LEVINE (G.), ROGERS (A.) et FOX (J.G.) : Helicobacter cetorum sp. nov., a urease-positive Helicobacter species isolated from dolphins and whales. J. Clin. Microbiol., 2002, 40, 4536-4543.
HARPER (C.M.), XU (S.), FENG (Y.), DUNN (J.L.), TAYLOR (N.S.), DEWHIRST (F.E.) and FOX (J.G.) : Identification of novel Helicobacter spp. from a beluga whale. Appl. Environ. Microbiol., 2002, 68, 2040-2043.
STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.
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Chez les cétacés, l'estomac présente trois poches. La première poche est le pré-estomac ou estomac mécanique qui permet le broyage des aliments. Les proies broyées passent ensuite dans l'estomac principal. Il s'agit de la poche la plus grande, où débute la digestion chimique par l'attaque des sucs digestifs et de l'acide chlorhydrique. La nourriture arrive ensuite dans une troisième poche, l'estomac pylorique où d'autres enzymes participent à la digestion.
Pour plus d'informations, voir Les cétacés Biologie et comportement.
Pour des informations sur cette espèce voir le fichier Lagenorhynchus acutus (Atlantic white-sided dolphin) in Animal Diversity Web (University of Michigan Museum of Zoology).
Pour des informations sur cette espèce voir le fichier Delphinus delphis (Common Dolphin) in MarineBio.
Pour des informations sur cette espèce voir le fichier Delphinapterus leucas (Beluga) in Animal Diversity Web (University of Michigan Museum of Zoology).
***** : Lagenorhynchus obliquidens
Pour des informations sur cette espèce voir le fichier Lagenorhynchus obliquidens (Pacific White-sided Dolphin) in MarineBio.
Pour des informations sur cette espèce voir le fichier Tursiops truncatus (bottlenosed dolphin) in Animal Diversity Web (University of Michigan Museum of Zoology)