J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Créé le 17 mai 2004

JEOTGALICOCCUS, JEOTGALICOCCUS PINNIPEDIALIS

Voir aussi le fichier ¤ Staphylococcaceae.

Systématique

Le 14 mars 2003, Yoon et al. valident les nomenclatures de Jeotgalicoccus, de Jeotgalicoccus halotolerans et de Jeotgalicoccus psychrophilus pour deux souches de coques à Gram positif, aéro-anaérobies, catalase positive, oxydase positive, possédant un peptidoglycane du type A3alpha (voir le fichier ¤ "Classification des peptidoglycanes selon Schleifer et Kandler") et isolés de préparations culinaires coréennes appelées jeotgal (plats fermentésà base de poissons, de fruits de mer et d'eau de mer). L'analyse des séquences des ARNr 16S montre que ces souches forment un groupe homogène au sein de la famille des ¤ Staphylococcaceae et qu'elles sont apparentées au genre Salinicoccus. Toutefois, les pourcentages d'homologie obtenus entre les Jeotgalicoccus sp. et les Salinicoccus sp. sont inférieurs à 94.

Les espèces du genre Jeotgalicoccus se distinguent également des Salinicoccus sp. par la couleur jaune de leurs colonies (les colonies des Salinicoccus sp. sont de couleur rose ou rouge ou orangée), par un G + C p. cent dont la valeur est inférieure à celle des Salinicoccus sp., par l'absence de glycolipide, par leurs ménaquinones à 7 unités isoprènes (ménaquinone MK-6 pour les Salinicoccus sp.) et par la structure du pont interpeptidique du peptidoglycane qui renferme de la L-alanine alors que cette dernière est absente des ponts interpeptidiques des Salinicoccus sp.

L'intérêt (relatif) de ce genre pour la médecine vétérinaire est lié à la description d'une troisième espèce, Jeotgalicoccus pinnipedialis, isolée chez un éléphant de mer ou phoque éléphant (Mirounga leonina)*.
La nomenclature de Jeotgalicoccus pinnipedialis a été validée le 10 mai par Hoyles et al. pour une unique souche bactérienne isolée lors d'une étude effectuée en 1993 par le Bristish Antarctic Survey au large de l'archipel des Orcades du Sud ou South Orkneys (archipel situé à la limite des océans Atlantique et Antarctique, au bord du continent Antarctique).
Les caractères bactériologiques sont compatibles avec une espèce du genre Jeotgalicoccus et l'analyse de la séquence des ARNr 16S révèle une parenté phylogénétique avec le genre Jeotgalicoccus et, dans une moindre mesure, avec les genres Salinicoccus et ¤ Macrococcus.
Il convient de noter que la description de Jeotgalicoccus pinnipedialis repose sur une unique souche alors que la description correcte d'une espèce bactérienne devrait reposer sur l'étude d'un minimum de 10 souches (voir Rosselló-Mora et Amann 2001).

Caractères bactériologiques

Le genre Jeotgalicoccus, tel qu'il a été défini par Yoon et al., est constitué de coques à Gram positif, non acidorésistants, de 0,6 à 1,1 µm de diamètre, immobiles, non sporulés, aéro-anaérobies, catalase et oxydase positives, hydrolysant la tyrosine, donnant une réponse négative aux tests nitrate réductase, hydrolyse de l'amidon, de la caséine, de l'esculine, de l'hypoxanthine, du Tween 80 et de la xanthine.
La croissance est optimale pour un pH de 7 à 8 et aucune culture n'est observée à un pH de 5,5. Les colonies obtenues sur un milieu Marine Agar 2216 (Difco) sont lisses, brillantes, légèrement convexes, circulaires (présentant parfois un contour légèrement irrégulier) et pigmentées en jaune.
Les chaînes tétrapeptidiques du peptidoglycane possèdent une L-lysine en position 3, la principale ménaquinone contient 7 unités isoprènes, le G + C p. cent est inférieur ou égal à 42 (38, 6 pour Jeotgalicoccus pinnipedialis; 42 pour Jeotgalicoccus halotolerans et Jeotgalicoccus psychrophilus).

Outre les caractères du genre, Jeotgalicoccus pinnipedialis, seule espèce d'intérêt vétérinaire, regroupe des coques de 0,7 à 1 µm de diamètre, assemblés en grappe de raisin ou par deux ou en tétrades.
Les caractères biochimiques ont été étudiés en utilisant des galeries API. Rappelons que la description de Jeotgalicoccus pinnipedialis est basée sur l'étude d'une unique souche et les caractères présentés ci-dessous sont peut-être provisoires.
. Aucun caractère n'est positif en utilisant une galerie API STAPH.
. En utilisant une galerie API ID32STAPH, seul le test pyrrolidonyl arylamidase est légèrement positif.
. En utilisant une galerie API CORYNE, seuls les tests pyrrolidonyl arylamidase, pyrazinamidase et gélatinase sont positifs.
. L'utilisation de galeries API ZYM permet d'obtenir une réponse positive pour les seuls tests phosphatase acide, phosphoamidase et estérase lipase C8 (réaction faiblement positive).
. Une croissance est obtenue après incubation à 25 ou à 42 °C, mais Jeotgalicoccus pinnipedialis ne cultive pas à 4 °C. Aucune croissance n'est observée en l'absence de NaCl ou en présence de 14 p. cent de NaCl. En revanche une culture est obtenue pour des concentrations en NaCl de 2 et de 6 p. cent. La croissance n'est pas stimulée par la présence de dioxyde de carbone.
Après 24 heures d'incubation en aérobiose et à 37 °C, les colonies obtenues sur une gélose Columbia au sang de mouton sont non hémolytiques, de couleur jaune ou fauve, circulaires, convexes et leur diamètre est d'environ 2 mm.

Aucun caractère bactériologique classique ne permet de caractériser facilement le genre Jeotgalicoccus. À l'exception du genre ¤ Gemella dont les souches sont catalase négative, seuls les caractères chimiotaxonomiques, la valeur du G + C p. cent et la séquence des ARNr 16S permettent de différencier les Jeotgalicoccus sp. des autres genres de la famille des "Staphylococcaceae" (¤ Macrococcus, Salinicoccus, Staphylococcus).
Les principaux caractères permettant de différencier les espèces du genre Jeotgalicoccus sont donnés dans le tableau I. Rappelons toutefois qu'un laboratoire de bactériologie classique aura certainement beaucoup de peine à caractériser le genre Jeotgalicoccus.

Habitat, pouvoir pathogène, sensibilité aux antibiotiques

. Jeotgalicoccus halotolerans et Jeotgalicoccus psychrophilus sont isolés de plats traditionnels coréens.
. L'habitat et le pouvoir pathogène de Jeotgalicoccus pinnipedialis sont inconnus. L'unique souche de cette espèce a été isolée d'un écouvillonnage buccal effectué sur un éléphant de mer femelle (âge et état de santé de l'animal non précisés).

Orientation bibliographique

HOYLES (L.), COLLINS (M.D.), FOSTER (G.), FALSEN (E.) et SCHUMANN (P.) : Jeotgalicoccus pinnipedialis sp. nov., from a southern elephant seal (Mirounga leonina). Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 745-748.

ROSSELLÓ-MORA (R.) et AMANN (R.) : Review. The species concept for prokaryotes. FEMS Microbiol. Rev., 2001, 25, 39-67.

STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.

YOON (J.H.), LEE (K.C.), WEISS (N.), KANG (K.H.) et PARK (Y.H.) : Jeotgalicoccus halotolerans gen. nov., sp. nov. and Jeotgalicoccus psychrophilus sp. nov., isolated from the traditional Korean fermented seafood jeotgal. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 595-602.

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* :
Mirounga leonina est une espèce appartenant à l'embranchement des Vertébrés, à la classe des Mammifères, à l'ordre des Carnivores, au sous-ordre des Pinnipèdes et à la famille des Phocidae.

L'éléphant de mer est une espèce protégée sur le territoire français par un arrêté du 27 juillet 1995.

D'autres informations ainsi que des photographies peuvent être trouvées sur de nombreux sites, notamment sur les sites suivants :
LES PINNIPEDES
ELEPHANT DE MER AUSTRAL Mirounga leonina
Southern Elephant Seal (Seal Conservation Society)

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