J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 20 mars 2010
LACHNOSPIRACEAE
Voir aussi les fichiers ¤ Hespellia, ¤ Lachnobacterium et ¤ Robinsoniella.
Classification :
. Voir Lachnospiraceae in Classification of families (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature).
. Pour la liste des genres inclus dans la famille des Lachnospiraceae voir Lachnospiraceae in List of genera included in families (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature).
La famille des Lachnospiraceae a été proposée en 2005 dans le "volume 2, partie A" de la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Cette nomenclature ne pouvait pas être validement publiée car aucune description de la famille n'était proposée.
Cette famille rassemblait les genres Acetitomaculum, Anaerofilum, Anaerostipes, Butyrivibrio, Catenibacterium, Catonella, Coprococcus, Johnsonella, ¤ Lachnobacterium, Lachnospira, Pseudobutyrivibrio, Roseburia, Ruminococcus, Shuttleworthia et Sporobacterium.
En 2009, dans le volume 3 de la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Rainey donne une très brève description de cette famille. Cette description est conforme aux règles du Code de Nomenclature et la nomenclature de Lachnospiraceae a été validement publiée en mars 2010 par inscription sur la liste de validation 132.
Les genres Anaerofilum, Catenibacterium et Ruminococcus, primitivement inclus dans cette famille, sont actuellement placés dans la famille des ¤ Ruminococcaceae (Anaerofilum et Ruminococcus) ou dans la famille des ¤ Erysipelotrichaceae (Catenibacterium). En revanche, les espèces du groupe XIVa de Collins et al. appartiennent à la famille des Lachnospiraceae.
La famille des Lachnospiraceae est définie principalement sur la base des analyses phylogénétiques déduites de l'étude des séquences des ARNr 16S.
Rainey se contente de noter que la famille rassemble des taxons anaérobies et morphologiquement très divers (bacilles droits, petits bacilles incurvés, coques).
La mobilité et la présence d'une spore varient selon les genres.
Le genre type est le genre Lachnospira.
Les études phylogénétiques montrent que les espèces suivantes appartiennent à la famille des Lachnospiraceae : Eubacterium cellulosolvens, Eubacterium eligens, Eubacterium hallii, Eubacterium ramulus, Eubacterium rectale, Eubacterium ruminantium, Eubacterium uniforme, Eubacterium ventriosum, Eubacterium xylanophilum, Ruminococcus gauvreauii, Ruminococcus gnavus, Ruminococcus lactaris, Ruminococcus obeum, Ruminococcus torques et Desulfotomaculum guttoideum.
D'autres espèces sont également apparentées à cette famille : Clostridium aerotolerans, Clostridium algidixylanolyticum, Clostridium aminophilum, Clostridium aminovalericum, Clostridium amygdalinum, Clostridium bolteae, Clostridium celerecrescens, ¤ Clostridium colinum, Clostridium fimetarium, Clostridium glycyrrhizinilyticum, Clostridium hathewayi, Clostridium herbivorans, Clostridium hylemonae, Clostridium indolis, Clostridium lactatifermentans, Clostridium lentocellum, Clostridium methoxybenzovorans, Clostridium neopropionicum, Clostridium nexile, Clostridium oroticum, ¤ Clostridium piliforme, Clostridium polysaccharolyticum, Clostridium populeti, Clostridium propionicum, Clostridium proteoclasticum, Clostridium scindens, Clostridium sphenoides, Clostridium saccharolyticum, Clostridium symbiosum, Clostridium xylanolyticum et Clostridium xylanovorans.
Orientation bibliographique
BRENNER (D.J.), KRIEG (N.R.), STALEY (J.T.) et GARRITY (G.M.) (eds): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part A (Introductory Essays), Springer, New York, 2005, pp. 1-304.
COLLINS (M.D.), LAWSON (P.A.), WILLEMS (A.), CORDOBA (J.J.), FERNANDEZ-GARAYZABAL (J.), GARCIA (P.), CAI (J.), HIPPE (H.) et FARROW (J.A.E.) : The phylogeny of the genus Clostridium: proposal of five new genera and eleven new species combinations. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 812-826.
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RAINEY (F.A.) : Family V. Lachnospiraceae fam. nov. In: P. DE VOS, G.M. GARRITY, D. JONES, N.R. KRIEG, W. LUDWIG, F.A. RAINEY, K.H. SCHLEIFER and W.B. WHITMAN (eds): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 3 (The Firmicutes), Springer, Dordrecht, Heidelberg, London, New York, 2009, p. 921.
VALIDATION LIST N° 132. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2010, 60, 469-472.
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