J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 10 octobre 2003
MARINILACTIBACILLUS, MARINILACTIBACILLUS PSYCHROTOLERANS
Voir aussi le fichier ¤ Carnobacteriaceae.
Les nomenclatures de Marinilactibacillus et de Marinilactibacillus psychrotolerans ont été validement publiées le 16 mai 2003 pour huit souches bactériennes isolées d'éponges, d'algues, de mollusques, de crabes ou de poissons collectés dans des régions tempérées ou subtropicales du Japon. Les noms communs et scientifiques des divers végétaux et animaux ne sont pas donnés à l'exception de celui du buccin du Japon (Babylonia japonica*). Les auteurs précisent que les prélèvements ont été effectués à partir d'organismes vivants ou de spécimens commercialisés pour la consommation ou d'organismes en voie de décomposition.
Aucun pouvoir pathogène n'a été attribué à Marinilactibacillus psychrotolerans.
Les huit souches présentent des caractères phénotypiques homogènes et elles constituent une unique genomospecies puisque les pourcentages d'homologie ADN-ADN sont égaux ou supérieurs à 74 (voir le fichier ¤ " Définitions d'une genomospecies et d'une espèce bactérienne").
Les séquences des ARNr 16S présentent 96,2 p. cent de similitude avec la séquence de la souche type de Alkalibacterium olivapovliticus** ; 94,3 p. cent de similitude avec la séquence de la souche WN16*** ; et 92,1 à 92,6 avec les séquences des espèces du genre ¤ Carnobacterium.
Le peptidoglycane des huit souches est du type A4bêta avec présence d'acide glutamique dans les ponts interpeptidiques alors que le peptidoglycane des ¤ Carnobacterium sp. est du type A1gamma et que le peptidoglycane de Alkalibacterium olivapovliticus est du type A4bêta avec présence d'acide aspartique dans les ponts interpeptidiques (voir le fichier ¤ "Classification des peptidoglycanes selon Schleifer et Kandler").
Pour ces différentes raisons, Ishikawa et al. ont placé les huit souches isolées d'organismes marins dans le nouveau genre Marinilactibacillus.
Le genre Marinilactibacillus est actuellement classé dans la famille des ¤ Carnobacteriaceae.
La description du genre Marinilactibacillus est la suivante.
Bacilles droits à Gram positif, non sporulés, se présentant de manière isolée ou groupés par deux ou en courtes chaînes, mobiles grâce à une ciliature péritriche, aéro-anaérobies, catalase négative, oxydase négative, ne réduisant pas les nitrates, n'hydrolysant pas la gélatine, métabolisant l'arginine en produisant de faibles quantités d'ammoniac et fermentant le glucose (sans gaz) en produisant principalement de l'acide L-lactique (les autres produits du métabolisme sont l'acide formique, l'acide acétique et l'éthanol).
Les Marinilactibacillus sp. sont des bactéries modérément halophiles (la croissance est optimale pour des concentrations en NaCl comprises entre 2,0 et 3,75 p. cent, mais quelques souches cultivent en l'absence de NaCl), halotolérantes (toutes les souches cultivent en présence de 17 p. cent de NaCl et quelques souches se multiplient en présence de 20,5 p. cent de NaCl), alcalophiles (la croissance est optimale pour un pH compris entre 8,5 et 9, mais une culture peut être obtenue pour des pH variant de 6 à 10) et aptes à croître pour des températures allant de -1,8 °C à 40-45 °C (température optimale 37-40 °C).
Le peptidoglycane est du type A4bêta avec présence d'acide glutamique dans les ponts interpeptidiques, les acides gras sont principalement des acides non ramifiés, saturés ou mono-insaturés et le G + C p. cent varie de 34,6 à 36,2.
Les souches de Marinilactibacillus psychrotolerans sont des bacilles de 0,4 à 0,5 µm de diamètre sur 2,3 à 4,5 µm de longueur, pouvant donner des formes longues dans les cultures âgées, acidifiant le D-cellobiose, le fructose, le gluconate de sodium, l'alpha-méthyl-D-glucoside, le maltose, le D-mannitol, le D-mannose, le D-ribose, le saccharose, la salicine, le D-tréhalose et le D-xylose.
L'acidification de l'adonitol, de l'amidon, du D-arabinose, du L-arabinose, du dulcitol, du D-galactose, du glycérol, de l'inuline, du lactose, du D-mélézitose, du mélibiose, du D-raffinose, du D-rhamnose et du D-sorbitol est un caractère variable selon les souches.
La croissance nécessite la présence de glucose. Marinilactibacillus psychrotolerans cultive mal en surface des milieux de culture et la croissance est plus abondante lorsqu'elle est observée au sein d'un milieu semi-gélosé. Les colonies ont alors un aspect lenticulaire, elles sont jaunes pâles, opaques et leur diamètre est compris entre 2 à 4 mm après 48-72 heures d'incubation à 30 °C. La composition d'un des milieux de culture utilisé par Ishikawa et al. est donnée dans la note ****.
Orientation bibliographique
DUCKWORTH (A.W.), GRANT (W.D.), JONES (B.E.) et VAN STEENBERGEN (R.) : Phylogenetic diversity of soda lake alkaliphiles. FEMS Microbiol. Ecol., 1996, 19, 181-191.
ISHIKAWA (M.), NAKAJIMA (K.), YANAGI (M.), YAMAMOTO (Y.) et YAMASATO (K.) : Marinilactibacillus psychrotolerans gen. nov., sp. nov., a halophilic and alkaliphilic marine lactic acid bacterium isolated from marine organisms in temperate and subtropical areas of Japan. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 711-720.
NTOUGIAS (S.) et RUSSELL (N.J.) : Alkalibacterium olivoapovliticus gen. nov., sp. nov., a new obligately alkaliphilic bacterium isolated from edible-olive wash-waters. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2001, 51, 1161-1170.
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Classification d'après le NCBI Taxonomy Browser : Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Coelomata ; Protostomia ; Mollusca ; Gastropoda ; Orthogastropoda ; Apogastropoda ; Caenogastropoda ; Sorbeoconcha ; Hypsogastropoda ; Neogastropoda ; Buccinoidea ; Buccinidae ; Babylonia ; Babylonia japonica.
Quelques informations complémentaires sont disponibles dans le fichier Babylonia japonica (SHELLS DATABASE).
** Alkalibacterium olivapovliticus
Alkalibacterium olivapovliticus est une espèce isolée de solutions de soude utilisées pour adoucir les olives vertes.
C'est un bacille à Gram positif (bien que coloré en rose ou rouge à la coloration de Gram), mobile (ciliature polaire), non sporulé, alcalophile obligatoire (selon les souches, le pH optimal est compris entre 9 et 9,4 ou entre 9,8 et 10,2), psychrotolérant, halotolérant, aéro-anaérobie, catalase négative, oxydase négative, métabolisant les hexoses ou les di-saccharides mais non les pentoses.
La souche WN16 est une souche alcalophile, mal caractérisée, isolée de la boue et de l'eau du lac Nakuru (Vallée du Rift). Elle est phylogénétiquement apparentée aux bactéries à Gram positif possédant un faible G + C p. cent et notamment aux ¤ Carnobacterium sp.
**** Milieu semi-solide utilisé pour la culture de Marinilactibacillus psychrotolerans (NaCl GYPFK agar)
Glucose : 10 g
Extrait de levure : 5 g
Polypeptone : 5g
Extraits de chair de bonito (un poisson de la famille des Scombridae) : 5g
K2HPO4 : 10 g
NaCl : 25 g
Thioglycolate de sodium : 1 g
Solution saline (Cf. infra) : 5 mL
Agar : 1,5 g
Eau distillée : qsp 1000 mL
pH : 9
Solution saline : 40 mg/mL de MgSO4.7H2O, 2 mg/mL de MnSO4.4H2O et 2 mg/mL de FeSO4.7H2O