J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Dernière mise à jour le 18 août 1999
Classification des peptidoglycanes selon Schleifer et Kandler
Schleifer et Kandler (1972) ont classé les peptidoglycanes* en fonction de la position des ponts interpeptidiques (lettre A ou B), de la nature des ponts interpeptidiques (chiffre arabe) et de la nature du troisième acide aminé des unités tétrapeptidiques (lettres grecques).
Référence : SCHLEIFER (K.H.) et KANDLER (O.) : Peptidoglycan types of bacterial cell walls and their taxonomic implications. Bacteriol. Rev., 1972, 36, 407-477.
Groupe A :
. Les ponts interpeptidiques unissent l'un des groupes amines du troisième acide aminé (acide aminé "basique") d'une unité tétrapeptidique au groupe carboxyle du quatrième acide aminé (très généralement la D-alanine) d'une autre unité tétrapeptidique.
. Lorsque le peptidoglycane appartient au groupe A, le premier acide aminé de l'unité tétrapeptidique est la L-alanine ou, plus rarement, la glycine. Dans ce dernier cas on ajoute un signe prime (par exemple A3g').
Le troisième acide aminé est toujours un acide aminé "basique".
Sous-groupe A1 : Ponts interpeptidiques réduits à une liaison peptidique entre un groupe aminé du troisième acide aminé d'une unité tétrapeptidique et le groupe carboxyle de la D-alanine d'une autre unité tétrapeptidique.
A1α : Présence de L-lysine en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
A1β : Présence de L-ornithine en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
A1γ : Présence d'acide meso-diaminopimélique en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
Sous-groupe A2 : Ponts interpeptidiques constitués de un ou de plusieurs peptides dont la structure est identique à une unité tétrapeptidique.
Sous-groupe A3 : Ponts interpeptidiques constitués soit d'acides aminés "neutres" sous forme L (L-alanine, L-sérine, L-thréonine) soit de glycine soit d'acides aminés "neutres" et de glycine.
A3α : Présence de L-lysine en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
A3β : Présence de L-ornithine en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
A3γ : Présence d'acide L,L-diaminopimélique en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
Sous-groupe A4 : Ponts interpeptidiques dont la structure renferme un acide aminé "acide" (acide aspartique ou acide glutamique).
A4α : Présence de L-lysine en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
A4β : Présence de L-ornithine en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
A4γ : Présence d'acide meso-diaminopimélique en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
Groupe B :
. Les ponts interpeptidiques unissent l'un des groupes carboxyles du deuxième acide aminé (acide aminé "acide", généralement l'acide D-glutamique) d'une unité tétrapeptidique au groupe carboxyle du quatrième acide aminé (la D-alanine) d'une autre unité tétrapeptidique.
. Lorsque le peptidoglycane appartient au groupe B, le premier acide aminé de l'unité tétrapeptidique est la glycine ou la L-sérine et le troisième acide aminé n'est pas obligatoirement un acide aminé "basique".
Sous-groupe B1 : Ponts interpeptidiques dont la structure renferme un acide aminé "basique" sous forme L (très généralement la L-lysine).
B1α : Présence de L-lysine en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
B1β : Présence de L-homosérine en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
B1γ : Présence d'acide L-glutamique en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
B1δ : Présence de L-alanine en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
Sous-groupe B2 : Ponts interpeptidiques contenant un acide aminé "basique" sous forme D (D-lysine, D-ornithine ou acide D-diaminobutyrique).
B2α : Présence de L-ornithine en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
B2β : Présence de L-homosérine en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
B2γ : Présence d'acide L-diaminobutyrique en position 3 de l'unité tétrapeptidique.
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* : Le peptidoglycane est un polymère présent dans la paroi des bactéries à Gram positif et à Gram négatif. Plusieurs sites, disponibles sur Internet, étudient la structure de la paroi bactérienne. Le lecteur intéressé pourra se reporter, par exemple, au fichier Morphologie et structure des bactéries (procaryotes).