J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 18 mars 2010
PAENIBACILLACEAE
Voir aussi le fichier ¤ Paenibacillus.
Classification :
. Voir Paenibacillaceae in Classification of families (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature).
. Pour la liste des genres inclus dans la famille des Paenibacillaceae voir Paenibacillaceae in List of genera included in families (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature).
La famille des Paenibacillaceae a été proposée en 2005 dans le "volume 2, partie A" de la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Cette nomenclature ne pouvait pas être validement publiée car aucune description de la famille n'était proposée.
En 2009, dans le volume 3 de la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, De Vos et al. donnent une brève description de cette famille. Cette description est conforme aux règles du Code de Nomenclature et la nomenclature de Paenibacillaceae a été validement publiée en mars 2010 par inscription sur la liste de validation 132.
La famille des Paenibacillaceae est définie principalement sur la base des analyses phylogénétiques déduites de l'étude des séquences des ARNr 16S.
La description de cette famille est la suivante :
. Bacilles droits ou incurvés dont la taille est généralement de 0,5 à 1,0 µm de diamètre sur 2 à 6 µm de longueur, généralement mobiles grâce à une ciliature péritriche, chimio-organo-hétérotrophes, aérobies, micro-aérophiles, aéro-anaérobies ou anaérobies, mésophiles ou thermophiles, neutrophiles ou alcalophiles.
. La paroi a la structure de la paroi d'une bactérie à Gram positif et le peptidoglycane contient de l'acide meso-diaminopimélique. Toutefois, les cellules peuvent apparaître Gram positif ou Gram négatif ou Gram variable.
. Les différentes espèces de la famille rassemblent des bactéries sporulées (spores généralement ovales et déformantes).
. Quelques espèces sont capables d'utiliser l'acide oxalique comme unique source de carbone et d'énergie.
. Les principales quinones isoprénoïdes sont des ménaquinones à sept ou six unités isoprènes.
. Les représentants de la famille des Paenibacillaceae sont isolés du sol, des végétaux, des insectes, des fèces, du sang ...
Le genre type de la famille est le genre ¤ Paenibacillus.
Il est possible de distinguer deux groupes phylogénétiques au sein de la famille des Paenibacillaceae :
. Le premier groupe, monophylétique, rassemble les genres ¤ Paenibacillus, Brevibacillus, Cohnella, Fontibacillus, Saccharibacillus et Thermobacillus.
. Le deuxième groupe, également monophylétique, est constitué des genres Ammoniphilus, Aneurinibacillus et Oxalophagus.
Le genre Thermicanus, préalablement inclus dans la famille, est actuellement classé dans une famille incertae sedis de l'ordre des Bacillales.
Orientation bibliographique
BRENNER (D.J.), KRIEG (N.R.), STALEY (J.T.) et GARRITY (G.M.) (eds): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part A (Introductory Essays), Springer, New York, 2005, pp. 1-304.
DE VOS (P.), LUDWIG (W.), SCHLEIFER (K.H.) et WHITMAN (W.B.) : Family IV. Paenibacillaceae fam. nov. In: P. DE VOS, G.M. GARRITY, D. JONES, N.R. KRIEG, W. LUDWIG, F.A. RAINEY, K.H. SCHLEIFER et W.B. WHITMAN (eds) : Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 3 (The Firmicutes), Springer, Dordrecht, Heidelberg, London, New York, 2009, p. 269.
VALIDATION LIST N° 132. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2010, 60, 469-472.
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