J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

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Créé le 22 mars 2010

 

PLANOCOCCACEAE, CARYOPHANACEAE

  

Voir aussi le fichier ¤ Planococcus.

Classification :
. Voir Planococcaceae et Caryophanaceae in Classification of families (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature).
. Pour la liste des genres inclus dans les familles des Planococcaceae et des Caryophanaceae voir Planococcaceae et Caryophanaceae in List of genera included in families (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature).

 

La famille des Planococcaceae a été proposée en 1949 par Krasil'nikov dans une revue de langue russe. Cette famille n'est étudiée ni dans les septième, huitième et neuvième édition du Bergey's Manual of Determinative Bacteriology ni dans la première édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Une recherche, effectuée le 20 mars 2010, sur la base de données PubMed permet de retrouver quatre documents citant la famille des Planococcaceae. Trois de ces documents sont en chinois. Le quatrième est consacré à la description du genre Enterorhabdus et le mot Planococcaceae n'apparaît qu'une fois dans le résumé.

Dans le volume 3 de la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, cette famille fait l'objet d'une brève description.
. La famille des Planococcaceae est définie principalement sur la base des analyses phylogénétiques déduites de l'étude des séquences des ARNr 16S.
. Elle rassemble des coques ou des bacilles, formant parfois de longs filaments ou des trichomes, mobiles par glissement ou grâce à la présence de flagelles, pouvant ou non former des endospores, habituellement aérobies (quelques espèces sont aéro-anaérobies), hétérotrophes, catalase positive, oxydase positive ou négative.
. Même si la description du Bergey's Manual omet de le mentionner, les taxons de la famille des Planococcaceae sont à Gram positif.
. Le G + C p. cent est compris entre 34 et 48.
. Le genre type est le genre Planococcus.

Outre les genres Filibacter, Jeotgalibacillus, Kurthia, Marinibacillus, Planococcus, Planomicrobium, Sporosarcina et Ureibacillus, le Bergey's Manual inclut le genre Caryophanon au sein de la  famille des Planococcaceae.
Préalablement, le genre Caryophanon était le genre type de la famille des Caryophanaceae qui n'est plus étudiée dans le volume 3 de la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology.
La famille des Caryophanaceae a été proposée en 1939 par Peshkoff et l'inclusion du genre Caryophanon dans la famille des Planococcaceae n'est pas en accord avec les règles 38 et 42 du Code de Nomenclature. Pour Ludwig et al., le nom Caryophanon, qui signifie "qui a un noyau apparent", n'est pas correct et cette appellation résulte d'une erreur d'observation. Selon ces auteurs, cela justifie une entorse au Code de Nomenclature !
Les espèces Bacillus massiliensis, Bacillus psychrodurans, Bacillus psychrotolerans, Lysinibacillus fusiformis et ¤ Lysinibacillus sphaericus pourraient également appartenir à la famille des Planococcaceae.

La famille des Caryophanaceae n'est étudiée que dans les sixième et septième édition du Bergey's Manual of Determinative Bacteriology. La description de cette famille, telle qu'elle est donnée dans la septième édition du Bergey's Manual, est la suivante :
Bactéries non sporulées, immobiles ou mobiles grâce à une ciliature péritriche et formant des trichomes. Les représentants de cette famille sont présents dans la bouche de l'homme et de diverses espèces animales, dans le tube digestif des ruminants et dans les matières organiques en décomposition.
La famille est constituée des genres Caryophanon, "Lineola" et Simonsiella.

Le genre "Lineola" n'a jamais été validement publiée. Le genre Simonsiella est actuellement classé dans la famille des ¤ Neisseriaceae. Le genre Caryophanon comprend deux espèces, Caryophanon latum et Caryophanon tenue. Les Caryophanon spp. sont des bactéries originales. Elles sont en forme de disques assemblés pour former des trichomes (formations filamenteuses pluricellulaires non bifurquées).

 

Orientation bibliographique

 

BREED (R.S.), MURRAY (E.G.D.) et HITCHENS (A.P.) : Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, sixth edition, The Williams & Wilkins Co, Baltimore, 1948, pp. 1- 1529.

BREED (R.S.), MURRAY (E.G.D.) et SMITH (N.R.) : Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, seventh edition, The Williams & Wilkins Co, Baltimore, 1957, pp. 1- 1094.

BUCHANAN (R.E.) et GIBBONS (N.E.) : Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, 8th ed., The Williams & Wilkins Co, Baltimore, 1974, pp. 1-1268.

CLAVEL (T.), CHARRIER (C.), BRAUNE (A.), WENNING (M.), BLAUT (M.) and HALLER (D.): Isolation of bacteria from the ileal mucosa of TNFdeltaARE mice and description of Enterorhabdus mucosicola gen. nov., sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2009, 59, 1805-1812.

HOLT (J.G.), KRIEG (N.R.), SNEATH (P.H.A.), STALEY (J.T.) et WILLIAMS (S.T.) : Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, ninth edition, The Williams & Wilkins Co, Baltimore, 1974, pp. 1-787.

LUDWIG (W.), SCHLEIFER (K.H.) et WHITMAN (W.B.) : Revised road map to the phylum Frmicutes. In: P. DE VOS, G.M. GARRITY, D. JONES, N.R. KRIEG, W. LUDWIG, F.A. RAINEY, K.H. SCHLEIFER and W.B. WHITMAN (eds): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 3 (The Firmicutes), Springer, Dordrecht, Heidelberg, London, New York, 2009, pp. 1-13.

LUDWIG (W.), SCHLEIFER (K.H.) et WHITMAN (W.B.) : Family VI. Planococcaceae Krasil'nikov 1949, 328AL. In: P. DE VOS, G.M. GARRITY, D. JONES, N.R. KRIEG, W. LUDWIG, F.A. RAINEY, K.H. SCHLEIFER and W.B. WHITMAN (eds): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 3 (The Firmicutes), Springer, Dordrecht, Heidelberg, London, New York, 2009, p. 348.

SNEATH (P.H.A.), MAIR (N.S.), SHARPE (M.E.) et HOLT (J.G.) : Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, vol. 2, The Williams & Wilkins Co., Baltimore, 1986, pp. 965-1599.

 

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