J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Créé le 22 septembre 2005

"PROTEOBACTERIA", ALPHAPROTEOBACTERIA, BETAPROTEOBACTERIA, GAMMAPROTEOBACTERIA, DELTAPROTEOBACTERIA, EPSILONPROTEOBACTERIA

Le phylum des "Proteobacteria" ainsi que les classes des Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Deltaproteobacteria et Epsilonproteobacteria sont décrits dans le volume 2, parties B et C, de la seconde édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology.
À l'exception du phylum des "Proteobacteria", rang taxonomique non couvert par les règles du Code de Nomenclature, toutes ces nomenclatures ont été validement publiées le 07 novembre 2005 par citation dans la liste de validation 106 ou seront validement publiées dans la liste de validation 107.

Tous ces taxons sont définis uniquement sur la base des analyses phylogénétiques déduites de l'étude des séquences des ARNr 16S.
. Le phylum des "Proteobacteria" regroupe des prokaryotes très divers, mais descendant d'un ancêtre commun et qui présentent des séquences d'ARNr 16S apparentées à celles des représentants de l'ordre des Pseudomonadales (ordre type du phylum).
. La classe des Alphaproteobacteria rassemble des bactéries dont les séquences des ARNr 16S sont apparentées à celles des membres de l'ordre des Caulobacterales (ordre type de la classe).
. La classe des Betaproteobacteria accueille des bactéries dont les séquences des ARNr 16S sont apparentées à celles des membres de l'ordre des Burkholderiales (ordre type de la classe).
. La classe Gammaproteobacteria est constituée par les bactéries dont les séquences des ARNr 16S sont apparentées à celles des membres de l'ordre des Pseudomonadales (ordre type de la classe).
. La classe des Deltaproteobacteria renferme des bactéries dont les séquences des ARNr 16S sont apparentées à celles des membres de l'ordre des Myxococcales (ordre type de la classe).
. La classe des Epsilonproteobacteria rassemble des bactéries dont les séquences des ARNr 16S sont apparentées à celles des membres de l'ordre des Campylobacterales (ordre type de la classe).

Le phylum des "Proteobacteria", ne doit pas être confondu avec la classe des Proteobacteria décrite en 1988 par Stackebrandt et al.
Stackebrandt et al. plaçaient dans la classe des Proteobacteria quatre sous-classes désignées par les noms vernaculaires de Alpha, Beta, Gamma et Delta.

Le phylum des "Proteobacteria" est l'un des phylums du domaine (ou empire) des "Bacteria" (ou "Eubacteria"). La liste des classes, ordres, sous-ordres, familles et genres inclus dans ce phylum, est donnée dans le fichier Classification of domains and phyla - Hierarchical classification of prokaryotes in List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (voir Phylum Proteobacteria).

Orientation bibliographique

BRENNER (D.J.), KRIEG (N.R.), STALEY (J.T.) et GARRITY (G.M.) (éds) : Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part A (Introductory Essays), Springer, New York, 2005, 304 pages.

BRENNER (D.J.), KRIEG (N.R.), STALEY (J.T.) et GARRITY (G.M.) (éds) : Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), Springer, New York, 2005, 1106 pages.

BRENNER (D.J.), KRIEG (N.R.), STALEY (J.T.) et GARRITY (G.M.) (éds) : Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part C (The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria), Springer, New York, 2005, 1256 pages.

LAPAGE (S.P.), SNEATH (P.H.A.), LESSEL (E.F.), SKERMAN (V.B.D.), SEELIGER (H.P.R.) et CLARK (W.A.) : International Code of Nomenclature of Bacteria (1990 Revision). American Society for Microbiology, Washington, D.C., 1992.

STACKEBRANDT (E.), MURRAY (R.G.E.) et TRÜPER (H.G.) : Proteobacteria classis nov., a name for the phylogenetic taxon that includes the "purple bacteria and their relatives". Int. J. Syst. Bacteriol., 1988, 38, 321-325.

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