J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 22 mars 2003
Dernière mise à jour le 25 novembre 2003
PSYCHROBACTER PULMONIS
Systématique
Psychrobacter pulmonis Vela et al. 2003 est la 12ème espèce décrite au sein du genre Psychrobacter*. Cette nomenclature a été validement publiée le 14 mars 2003 pour deux souches bactériennes isolées de poumons d'agneaux atteints de pneumonie.
Les caractères phénotypiques des deux souches sont compatibles avec leur placement dans le genre Psychrobacter et l'analyse des séquences des ARNr 16S confirme leur appartenance à ce genre. Au sein du genre Psychrobacter, elles sont phylogénétiquement apparentées à Psychrobacter glacincola (97,4 p. cent d'homologie entre les séquences des ARNr 16S des souches types), à Psychrobacter immobilis (96,1 p. cent d'homologie entre les séquences des ARNr 16S des souches types), à Psychrobacter phenylpyruvicus (95,8 p. cent d'homologie entre les séquences des ARNr 16S des souches types) et à Psychrobacter urativorans (95,8 p. cent d'homologie entre les séquences des ARNr 16S des souches types).
Un pourcentage de divergence de 2,6 p. cent dans les séquences des ARNr 16S, résultat observé avec Psychrobacter glacincola, ne permet pas d'affirmer que les deux souches isolées d'agneaux constituent une nouvelle espèce. Aussi, conformément aux conclusion de Stackebrandt et Goebel, Vela et al. ont réalisé des hybridations ADN - ADN.
Le pourcentage d'homologie ADN - ADN entre les deux souches est de 71 mais les pourcentages d'homologies obtenues avec la souche type de Psychrobacter immobilis (espèce type du genre Psychrobacter) ne dépassent pas 38. Les deux souches isolées d'agneaux constituent donc une genomospecies (voir le fichier ¤ "Définitions d'une genomospecies et d'une espèce bactérienne"). Cette genomospecies peut être identifiée par ses caractères phénotypiques ce qui permet à Vela et al. de proposer la création d'une nouvelle espèce, Psychrobacter pulmonis.
Caractères bactériologiques
Les souches de Psychrobacter pulmonis sont constituées de cocco-bacilles à Gram négatif, immobiles, non sporulés, catalase et oxydase positives et strictement aérobies.
Les caractères biochimiques ont été étudiés à l'aide de galeries API 20E, API 20NE et API ZYM.
. Une réponse positive est observée pour les tests réduction des nitrates et VP.
. Les deux souches donnent une réponse négative aux tests ONPG, LDC, ODC, ADH, TDA, indole, hydrolyse de l'urée, hydrolyse de la gélatine, hydrolyse de l'esculine, production d'hydrogène sulfuré, acidification des sucres (amygdaline, arabinose, inositol, glucose, mannitol, mélibiose, rhamnose, saccharose, sorbitol), assimilation de l'adipate, de l'arabinose, du caprate, du citrate, du gluconate, du glucose, du malate, du maltose, du mannitol, du mannose et du phénylacétate.
. En galerie API ZYM, seuls les tests estérase C4, estérase lipase C8, leucine arylamidase, valine arylamidase et cystine arylamidase sont positifs.
La croissance est obtenue à 4, 30 et 37 °C ou dans un bouillon contenant 6,5 p. cent de NaCl. En revanche, le germe ne cultive pas à 42 °C ou sur une gélose de MacConkey.
Après 48 heures d'incubation en aérobiose à 37 °C, les colonies obtenues sur une gélose Columbia au sang de mouton sont lisses et non pigmentées.
Quelques caractères permettant de différencier Psychrobacter pulmonis de quelques espèces du genre Psychrobacter sont donnés dans le tableau I.
Le type respiratoire, l'absence d'acidification du glucose, l'absence d'uréase et l'absence de croissance sur une gélose de MacConkey permettent de différentier facilement Psychrobacter pulmonis des principales espèces de bacilles à Gram négatif, catalase et oxydase positives, classiquement retrouvées lors d'infections pulmonaires chez les petits ruminants. Pasteurella multocida et ¤ Mannheimia haemolytica sont aéro-anaérobies et elles acidifient le glucose. Bordetella bronchiseptica est uréase positive et cette espèce cultive sur gélose de MacConkey.
Le type respiratoire, la présence d'une catalase, l'absence d'acidification du glucose et du saccharose et l'absence de croissance sur une gélose de MacConkey permettent de différentier facilement Psychrobacter pulmonis de ¤ Bibersteinia trehalosi.
La possibilité de cultiver à + 4 °C différencie Psychrobacter pulmonis des espèces du genre Moraxella.
Habitat et pouvoir pathogène
Les deux souches de Psychrobacter pulmonis ont été isolées, en culture pure, de poumons d'agneaux (âgés de 20 jours et de 1 an) morts brutalement. Seul l'animal âgé de 20 jours a présenté quelques signes de détresse respiratoire avant la mort.
L'autopsie et la réalisation des prélèvements ont été effectuées dans l'heure qui a suivi la mort et les prélèvement ont été conservés au froid. L'autopsie a révélé une congestion pulmonaire marquée. Aucune autre lésion n'a pu être mise en évidence.
La reproduction expérimentale de l'infection n'a pas été réalisée. Toutefois, l'isolement en culture pure d'un grand nombre de colonies suggère fortement que Psychrobacter pulmonis est doué d'un pouvoir pathogène.
Orientation bibliographique
JUNI (E.) et HEYM (G.A.) : Psychrobacter immobilis gen. nov., sp. nov.: genospecies composed of Gram-negative, aerobic, oxidase-positive coccobacilli. Int. J. Syst. Bacteriol., 1986, 36, 388-391.
STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.
VELA (A.I.), COLLINS (M.D.), LATRE (M.V.), MATEOS (A.), MORENO (M.A.), HUTSON (R.), DOMÍNGUEZ (L.) et FERNÁNDEZ-GARAYZÁBAL (J.F.) : Psychrobacter pulmonis sp. nov., isolated from the lungs of lambs. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 415-419.
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Le genre Psychrobacter et l'espèce Psychrobacter immobilis ont été proposés en 1986 pour des souches bactériennes isolées de l'eau de mer, de la peau et des branchies des poissons, des volailles, de produits carnés (même après irradiation, congélation ou dessiccation) et de divers prélèvements comme du pus.
La description originelle du genre Psychrobacter est la suivante :
Coccobacilles ou bacilles à Gram négatif, de 0,9 à 1,3 µm de diamètre sur 1,5 à 3,8 µm de longueur, parfois renflés, immobiles, non sporulés, aérobies, catalase et oxydase positives, sensibles à la pénicilline, non pigmentés, généralement capables de cultiver à 5 °C, généralement incapables de cultiver à 37 °C, ayant un optimum thermique de croissance d'environ 20 °C, donnant des colonies lisses et opaques sur une gélose cœur-cervelle.
Le genre Psychrobacter est classé dans la famille des Moraxellaceae.
¤ Psychrobacter faecalis semble pouvoir coloniser l'intestin des pigeons, Psychrobacter frigidicola, Psychrobacter phenylpyruvicus et Psychrobacter urativorans sont isolés de fientes d'oiseaux.
Les infections par des Psychrobacter sp. sont rares et seuls Psychrobacter immobilis (Cf. supra), Psychrobacter phenylpyruvicus et Psychrobacter pulmonis ont été impliqués dans des processus infectieux.
Psychrobacter phenylpyruvicus peut être isolé de l'appareil génito-urinaire ou de l'intestin des mammifères.
Psychrobacter pulmonis est la seule espèce douée d'un pouvoir pathogène pour les animaux.
Les références des publications décrivant les diverses espèces du genre sont données dans le fichier Psychrobacter in List of Procaryotic Names with Standing in Nomenclature.