J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Créé le 23 novembre 2006

PSEUDOMONAS SIMIAE

Voir aussi le fichier : ¤ Pseudomonadales, Pseudomonadaceae, Pseudomonas.

Pseudomonas simiae est la nomenclature validement publiée le 08 novembre 2006 pour cinq souches bactériennes isolées de Callithrix geoffroyii (ouistiti de Geoffroy ou tamarin à front blanc) maintenus en captivité dans un centre espagnol de conservation des primates.
Les cinq souches ont pour origine les poumons, le foie et le cerveau d'un jeune singe ainsi que le foie et le cerveau de sa mère. Ces deux animaux ont été retrouvés morts dans leur cage sans qu'aucun symptôme ne soit observé dans les 24 heures précédentes. L'autopsie a permis de mettre en évidence des lésions de glomérulonéphrite, de pneumonie et de broncho-pneumonie. Une coloration de Gram a permis d'observer des bacilles à Gram négatif dans les alvéoles pulmonaires du jeune individu.

Les caractères bactériologiques permettaient d'orienter le diagnostic vers une espèce du genre Pseudomonas. Les séquences des ARNr 16S des cinq souches présentent 100 p. cent d'homologie et une analyse phylogénétique permet de les placer dans le "sous-groupe de Pseudomonas fluorescens" (voir le fichier ¤ Pseudomonadales, Pseudomonadaceae, Pseudomonas).
Les espèces phylogénétiquement les plus proches sont Pseudomonas poae, Pseudomonas trivialis et Pseudomonas extremorientalis. Les pourcentages d'homologie obtenus entre la souche type de Pseudomonas simiae et les souches types des espèces apparentées sont supérieurs à 99,5. Pourtant, les hybridations ADN-ADN démontrent sans ambiguïté que Pseudomonas simiae est bien une nouvelle espèce (les pourcentages d'hybridation obtenus entre la souche type de Pseudomonas simiae et les souches types de Pseudomonas poae, Pseudomonas trivialis et Pseudomonas extremorientalis sont inférieurs à 30). La description de Pseudomonas simiae démontre, une fois de plus, que des pourcentages d'homologie élevés entre les séquences des ARNr 16S de différentes souches ne permettent pas d'affirmer qu'elles appartiennent à une unique espèce.

Les souches de Pseudomonas simiae sont constituées de bacilles mobiles à Gram négatif, aérobies, catalase positive, oxydase positive, réduisant les nitrates en nitrites, hydrolysant la gélatine, produisant une pyoverdine, synthétisant une arginine di-hydrolase, assimilant (galeries API 20 NE) le caprate, le citrate et le malate et donnant une réponse négative aux tests acidification du glucose, VP, PNPG, production d'indole, hydrolyse de l'esculine, hydrolyse de l'urée, assimilation (galeries API 20 NE) de l'adipate, de la N-acétyl-D-glucosamine, du maltose et du phényl-acétate.
En utilisant une galerie API ZYM une réponse positive n'est obtenue que pour les tests estérase C4, estérase lipase C8, leucine arylamidase, valine arylamidase (réaction faiblement positive) et phosphatase acide.
Quelques caractères permettant de différencier Pseudomonas simiae d'autres espèces du genre sont donnés dans le tableau I.

Pseudomonas simiae cultive à des températures comprises entre 4 et 37 °C et la température optimale de croissance est de 30 °C. Une culture est obtenue sur une gélose de MacConkey ou en présence de 6,5 p. cent de NaCl.
Les colonies obtenues sur une gélose trypticase soja sont circulaires et pigmentées en jaune. Sur gélose Columbia au sang de mouton, les colonies sont non pigmentées et faiblement hémolytiques.

Le pouvoir pathogène de Pseudomonas simiae est encore mal documenté. La lecture de l'article de Vela et al. n'aide pas beaucoup à se faire une opinion : à la page 2672 les auteurs écrivent que toutes les souches ont été isolées en culture pure alors qu'à la page 2674 ils mentionnent que seule la souche isolée des poumons du jeune singe a été obtenue en culture pure.
Si l'on prend en compte l'isolement en culture pure à partir des poumons du jeune animal, la mise en évidence de bacilles à Gram négatif dans les alvéoles pulmonaires et les lésions de pneumonie, il est vraisemblable que Pseudomonas simiae soit une bactérie douée d'un pouvoir pathogène.

Orientation bibliographique

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STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.

VELA (A.I.), GUTIÉRREZ (M.C.), FALSEN (E.), ROLLÁN (E.), SIMARRO (I.), GARCÍA (P.), DOMÍNGUEZ (L.), VENTOSA (A.) et FERNÁNDEZ-GARAYZÁBAL (J.F.) : Pseudomonas simiae sp. nov., isolated from clinical specimens from monkeys (Callithrix geoffroyi). Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2006, 56, 2671-2676.

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