J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 09 juillet 2001
Dernière mise à jour : 03 janvier 2005
Classification de l'ordre des Rickettsiales
Sommaire :
Classification de l'ordre des Rickettsiales d'après Brenner et al. 1993
Classification de l'ordre des Rickettsiales d'après Dumler et al. 2001
Classification de l'ordre des Rickettsiales d'après le NCBI Taxonomy Browser (20 décembre 2004)
L'ordre des Rickettsiales a été proposé par Gieszczykiewicz en 1939 et cette nomenclature a été incluse dans les Approved Lists of Bacterial Names. Au fil du temps, l'ordre des Rickettsiales a connu de nombreux bouleversements dont les principales étapes sont indiquées ci-dessous.
Note: Les taxons considérés comme incertae sedis ne sont pas cités.
I - Classification de l'ordre des Rickettsiales selon la septième édition du Bergey's Manual of Determinative Bacteriology :
Référence : PHILIP (C.B.) : Order I. Rickettsiales Buchanan and Buchanan 1938, emend. Gieszczykiewicz, 1939. In : R.S. BREED, E.G.D. MURRAY et N.R. SMITH : Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, seventh edition, the Williams & Wilkins Company, Baltimore, 1957, pp. 934-984.
Ordre des Rickettsiales
Famille des Rickettsiaceae
Tribu des Rickettsieae
Genres Rickettsia et Coxiella (Coxiella burnetii).
Le genre Rickettsia est divisé en cinq sous-genres, "Rickettsia" (Rickettsia prowazekii, Rickettsia typhi), "Zinssera" (Rickettsia tsutsugamushi), "Dermacentroxenus" (Rickettsia australis, Rickettsia akari, Rickettsia conorii, Rickettsia rickettsii) et "Rochalimaea" ("Rickettsia quintana").
Tribu des Ehrlichieae
Genres Ehrlichia (Ehrlichia canis, "Ehrlichia bovis", "Ehrlichia ovina"), Cowdria (Cowdria ruminantium) et Neorickettsia (Neorickettsia helminthoeca).
Tribu des Wolbachieae
Genres Wolbachia (Wolbachia pipientis, "Wolbachia culicis", "Wolbachia ctenocephali", "Wolbachia pulex", "Wolbachia trichodectae", "Wolbachia linognathi", Wolbachia melophagi, "Wolbachia dermacentrophila", "Wolbachia sericea"), Symbiotes (Symbiotes lectularius) et Rickettsiella (Rickettsiella popilliae).
Famille des Chlamydiaceae
Genres Chlamydia (Chlamydia trachomatis, "Chlamydia oculogenitalis"), "Colesiota" ("Colesiota conjunctivae"), "Ricolesia" ("Ricolesia conjunctivae", "Ricolesia bovis", "Ricolesia caprae", "Ricolesia lestoquardii") "Colettsia" ("Colettsia pecoris") et "Miyagawanella" ("Miyagawanella lymphogranulomatosis", "Miyagawanella psittaci", "Miyagawanella ornithosis", "Miyagawanella pneumoniae", "Miyagawanella bronchopneumoniae", "Miyagawanella felis", "Miyagawanella louisianae", "Miyagawanella illinii", "Miyagawanella opossumi", "Miyagawanella ovis", "Miyagawanella bovis" et "Miyagawanella pecoris").
Famille des Bartonellaceae
Genres Bartonella (Bartonella bacilliformis), Grahamella (Grahamella talpae, Grahamella peromysci), Haemobartonella (Haemobartonella muris, "Haemobartonella microti", "Haemobartonella tyzzeri", "Haemobartonella peromysci", "Haemobartonella sciuri", "Haemobartonella bovis", "Haemobartonella sturmanii", Haemobartonella canis, "Haemobartonella blarinae") et Eperythrozoon (Eperythrozoon coccoides, "Eperythrozoon varians", "Eperythrozoon dispar", Eperythrozoon wenyonii, Eperythrozoon ovis, Eperythrozoon suis, Eperythrozoon parvum).
Le genre Aegyptianella est cité comme un genre pouvant appartenir à la famille des Bartonellaceae. Toutefois, pour D. Weinman (auteur du chapitre concernant les Bartonellaceae) les Aegyptianella sp. n'étaient peut-être pas des bactéries si bien que genre Aegyptianella ne fait l'objet d'aucune étude dans la septième édition du Bergey's Manual of Determinative Bacteriology.
Famille des Anaplasmataceae
Genre Anaplasma (Anaplasma marginale, Anaplasma centrale, Anaplasma ovis).
II - Classification de l'ordre des Rickettsiales selon la huitième édition du Bergey's Manual of Determinative Bacteriology :
Référence : MOULDER (J.W.) : Order I. Rickettsiales Gieszczykiewicz 1939, 25. In : R.E. BUCHANAN and N.E. GIBBONS (ed.), Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology, eighth edition, 1974, The Williams & Wilkins Co, Baltimore, pp. 882-918.
Ordre des Rickettsiales
La famille des Chlamydiaceae est exclue de l'ordre des Rickettsiales pour être placée dans l'ordre des Chlamydiales et la subdivision du genre Rickettsia en cinq sous-genres est abandonnée.
Le genre Aegyptianella est placé dans la famille des Anaplasmataceae.
Famille des Rickettsiaceae
Tribu des Rickettsieae
Genres Rickettsia (Rickettsia prowazekii, Rickettsia typhi, Rickettsia canadensis corrig., Rickettsia rickettsii, Rickettsia sibirica, Rickettsia conorii, Rickettsia australis, Rickettsia akari, Rickettsia parkeri, Rickettsia tsutsugamushi), Rochalimaea (Rochalimaea quintana) et Coxiella (Coxiella burnetii).
Tribu des Ehrlichieae
Genres Ehrlichia (Ehrlichia canis, Ehrlichia phagocytophila), Cowdria (Cowdria ruminantium) et Neorickettsia (Neorickettsia helminthoeca).
Tribu des Wolbachieae
Genres Wolbachia (Wolbachia pipientis, Wolbachia melophagi, Wolbachia persica), Symbiotes (Symbiotes lectularius), Blattabacterium (Blattabacterium cuenoti) et Rickettsiella (Rickettsiella popilliae).
Famille des Bartonellaceae
Genres Bartonella (Bartonella bacilliformis) et Grahamella (Grahamella talpae, Grahamella peromysci).
Famille des Anaplasmataceae
Genres Anaplasma (Anaplasma marginale, Anaplasma ovis), "Paranaplasma" ("Paranaplasma caudatum", "Paranaplasma discoides"), Aegyptianella (Aegyptianella pullorum), Haemobartonella (Haemobartonella muris, Haemobartonella felis, Haemobartonella canis) et Eperythrozoon (Eperythrozoon coccoides, Eperythrozoon wenyonii, Eperythrozoon ovis, Eperythrozoon suis, Eperythrozoon parvum).
III - Classification de l'ordre des Rickettsiales selon la première édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology :
Référence : N.R. KRIEG and J.G. HOLT (ed.), Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, vol. 1, The Williams & Wilkins Co, Baltimore, 1984, pp. 687-729.
Ordre des Rickettsiales
La description de l'ordre des Rickettsiales, telle qu'elle apparaît dans la première édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, est conforme, dans ces grandes lignes, à la description de la huitième édition du Bergey's Manual of Determinative Bacteriology. Parmi les changements, on peut noter la disparition du genre "Paranaplasma" dont l'unique espèce est transférée dans le genre Anaplasma et l'exclusion des genres Symbiotes et Blattabacterium de la tribu des Wolbachieae. Le genre Blattabacterium est étudié dans la section 11 (Endosymbionts of Insects) quand au genre Symbiotes sa description est considérée comme incorrecte et il ne fait l'objet d'aucune étude particulière.
Famille des Rickettsiaceae
Tribu des Rickettsieae
Genres Rickettsia (Rickettsia prowazekii, Rickettsia typhi, Rickettsia canadensis corrig., Rickettsia rickettsii, Rickettsia sibirica, Rickettsia conorii, Rickettsia parkeri, Rickettsia australis, Rickettsia akari, Rickettsia montanensis corrig., Rickettsia rhipicephali, Rickettsia tsutsugamushi), Rochalimaea (Rochalimaea quintana, Rochalimaea vinsonii) et Coxiella (Coxiella burnetii).
Tribu des Ehrlichieae
Genres Ehrlichia (Ehrlichia canis, Ehrlichia phagocytophila, Ehrlichia equi, Ehrlichia sennetsu), Cowdria (Cowdria ruminantium) et Neorickettsia (Neorickettsia helminthoeca).
Tribu des Wolbachieae
Genres Wolbachia (Wolbachia pipientis, Wolbachia melophagi, Wolbachia persica) et Rickettsiella (Rickettsiella popilliae, Rickettsiella grylli, Rickettsiella chironomi).
Famille des Bartonellaceae
Genres Bartonella (Bartonella bacilliformis) et Grahamella (Grahamella talpae, Grahamella peromysci).
Famille des Anaplasmataceae
Genres Anaplasma (Anaplasma marginale, Anaplasma centrale, Anaplasma caudatum, Anaplasma ovis), Aegyptianella (Aegyptianella pullorum), Haemobartonella (Haemobartonella muris, Haemobartonella felis, Haemobartonella canis) et Eperythrozoon (Eperythrozoon coccoides, Eperythrozoon ovis, Eperythrozoon suis, Eperythrozoon parvum, Eperythrozoon wenyonii).
IV - Classification de l'ordre des Rickettsiales d'après Brenner et al. 1993 (Rickettsiales Gieszczykiewicz 1939 (Approved Lists 1980) emend. Brenner et al. 1993) :
Référence : BRENNER (D.J.), O’CONNOR (S.P.), WINKLER (H.H.), and STEIGERWALT (A.G.): Proposals to unify the genera Bartonella and Rochalimaea, with descriptions of Bartonella quintana comb. nov., Bartonella vinsonii comb. nov., Bartonella henselae comb. nov., and Bartonella elizabethae comb. nov., and to remove the family Bartonellaceae from the order Rickettsiales. Int. J. Syst. Bacteriol., 1993, 43, 777-786.
Ordre des Rickettsiales (sous-division alpha de la classe des Proteobacteria)
Le genre Rochalimaea est transféré dans le genre Bartonella.
Les genres Bartonella et Grahamella constituent un unique genre qui, compte tenu des règles de priorité, est appelé Bartonella.
La famille des Bartonellaceae est exclue de l'ordre des Rickettsiales, elle appartient à la sous-division alpha des Proteobacteria et elle est phylogénétiquement apparentée aux rhizobacteries (Agrobacterium, Afipia, Bartonellaceae, Beijerinckia, Bradyrhizobium, Brucella, Methylobacterium, Ochrobactrum, Rhizobiaceae, Rhodopseudomonas, Xanthobacter...).
Les espèces incluses dans les différents genres sont celles ayant un statut dans la nomenclature à la date du 8 octobre 1993 (date de parution de l'article de Brenner et al.).
Famille des Rickettsiaceae.
Tribu des Rickettsieae
Genres Rickettsia et Coxiella.
Tribu des Ehrlichieae
Genres Ehrlichia, Cowdria et Neorickettsia.
Tribu des Wolbachieae
Genre Wolbachia et Rickettsiella.
Famille des Anaplasmataceae
Genres Anaplasma, Haemobartonella, Eperythrozoon et Aegyptianella.
V - Classification de l'ordre des Rickettsiales d'après Dumler et al. 2001 [Rickettsiales Gieszczykiewicz 1939 (Approved Lists 1980) emend. Dumler et al. 15 novembre 2001] :
Référence : DUMLER (J.S.), BARBET (A.F.), BEKKER (C.P.J.), DASCH (G.A.), PALMER (G.H.), RAY (S.C.), RIKIHISA (Y.) et RURANGIRWA (F.R.) : Reorganization of genera in the families Rickettsiaceae and Anaplasmataceae in the order Rickettsiales: unification of some species of Ehrlichia with Anaplasma, Cowdria with Ehrlichia and Ehrlichia with Neorickettsia, description of six new species combinations and designation of Ehrlichia equi and 'HGE agent' as subjective synonyms of Ehrlichia phagocytophila. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001, 51, 2145-2165.
Ordre des Rickettsiales (sous-division alpha de la classe des Proteobacteria)
La notion de tribus est abandonnée.
Les genres Eperythrozoon et Haemobartonella sont considérés comme des représentants de la classe des Mollicutes.
La famille des Anaplasmataceae est maintenue.
La famille des "Holosporaceae" et le genre "Xenohaliotis" (inclus dans l'ordre des Rickettsiales par la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Cf. infra) ne sont pas cités dans la publication de Dumler et al. 2001.
Le genre Cowdria n'est plus reconnu et son unique espèce est transférée dans le genre Ehrlichia sous la forme d'une nouvelle combinaison, Ehrlichia ruminantium.
Famille des Rickettsiaceae
Genres Rickettsia (Rickettsia aeschlimannii, Rickettsia africae, Rickettsia akari, Rickettsia australis, Rickettsia bellii, Rickettsia canadensis, Rickettsia conorii, Rickettsia felis, Rickettsia helvetica, Rickettsia honei, Rickettsia japonica, Rickettsia massiliae, Rickettsia montanensis, Rickettsia parkeri, Rickettsia peacockii, Rickettsia prowazekii, Rickettsia rhipicephali, Rickettsia rickettsii, Rickettsia sibirica, Rickettsia slovaca et Rickettsia typhi) et Orientia (Orientia tsutsugamushi).
Famille des Anaplasmataceae.
Genres Anaplasma (Anaplasma bovis, Anaplasma caudatum, Anaplasma centrale, Anaplasma marginale, Anaplasma ovis, Anaplasma phagocytophilum corrig., Anaplasma platys), Ehrlichia (Ehrlichia canis, Ehrlichia chaffeensis, Ehrlichia ewingii, Ehrlichia muris, Ehrlichia ruminantium), Neorickettsia (Neorickettsia helminthoeca, Neorickettsia risticii, Neorickettsia sennetsu) et Wolbachia (Wolbachia pipientis).
Le genre Aegyptianella (Aegyptianella pullorum) est considéré comme un genre incertae sedis de la famille des Anaplasmataceae.
VI - Classification de l'ordre des Rickettsiales d'après le fichier Taxonomic Outline of the Procaryotes (Bergey's Manual of Systematic Bacteriology).
Les données présentées ci-dessous sont celles disponibles sur Internet à la date du 03 janvier 2005. Voir : GARRITY (G.M.), BELL (J.A.) and LILBURN (T.G.). (2004) Taxonomic Outline of the Procaryotes. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Second Edition., Release 5.0., Springer-Verlag, New York. 401 pages. DOI: 10.1007/bergeysoutline200405.
http://141.150.157.80/bergeysoutline/main.htm.
Ordre des Rickettsiales [phylum (division) des "Proteobacteria", classe des "Alphaproteobacteria"]
La notion de tribus est abandonnée. La famille des Anaplasmataceae est prise en compte par le Bergey's Manual, en revanche la famille des Ehrlichiaceae, incluse dans de précédentes versions, est abandonnée.
L'espèce Ehrlichia equi est considérée comme un synonyme ultérieur et hétérotypique de Anaplasma phagocytophilum.
Le genre Wolbachia est placé dans la famille des Anaplasmataceae.
Le genre Cowdria est aboli et son unique espèce, Cowdria ruminantium, est reclassée dans le genre Ehrlichia.
Les genres Eperythrozoon et Haemobartonella sont placés dans la famille des Mycoplasmataceae.
L'ordre des Rickettsiales s'enrichit de la famille des "Holosporaceae".
Famille des Rickettsiaceae
1) Genre Rickettsia :
Rickettsia aeschlimannii, Rickettsia africae, Rickettsia akari, Rickettsia australis, Rickettsia bellii, Rickettsia canadensis, Rickettsia conorii, Rickettsia felis, Rickettsia helvetica, Rickettsia honei, Rickettsia japonica, Rickettsia massiliae, Rickettsia montanensis, Rickettsia parkeri, Rickettsia peacockii, Rickettsia prowazekii, Rickettsia rhipicephali, Rickettsia rickettsii, Rickettsia sibirica, Rickettsia slovaca et Rickettsia typhi.
2) Genre Orientia :
Orientia tsutsugamushi.
Famille des Anaplasmataceae
1) Genre Anaplasma :
Anaplasma bovis, Anaplasma caudatum, Anaplasma centrale, Anaplasma marginale, Anaplasma ovis, Anaplasma phagocytophilum, Anaplasma platys.
2) Genre Aegyptianella :
Aegyptianella pullorum.
3) Genre Ehrlichia :
Ehrlichia canis, Ehrlichia chaffeensis, Ehrlichia ewingii, Ehrlichia muris, Ehrlichia ruminantium.
4) Genre Neorickettsia :
Neorickettsia helminthoeca, Neorickettsia risticii, Neorickettsia sennetsu.
5) Genre Wolbachia :
Wolbachia melophagi, Wolbachia pipientis, Wolbachia persica.
6) Genre "Xenohaliotis" :
"Candidatus Xenohaliotis californiensis".
Famille des "Holosporaceae"
1) Genre Holospora :
Holospora caryophila, Holospora elegans, Holospora obtusa, Holospora undulata
2) Genres d'affiliation incertaines :
(i) Caedibacter (Caedibacter caryophilus, Caedibacter paraconjugatus, Caedibacter pseudomutans, Caedibacter taeniospiralis, Caedibacter varicaedens) ; (ii) Lyticum (Lyticum flagellatum, Lyticum sinuosum) ; (iii) "Odyssella" ("Candidatus Odyssella thessalonicensis") ; (iv) Pseudocaedibacter (Pseudocaedibacter conjugatus, Pseudocaedibacter falsus, Pseudocaedibacter minutus) ; (v) Symbiotes (Symbiotes lectularius) ; et (vi) Tectibacter (Tectibacter vulgaris).
VII - Classification de l'ordre des Rickettsiales d'après le NCBI Taxonomy Browser (03 janvier 2005) :
Ordre des Rickettsiales [phylum (division) des "Proteobacteria", classe des "Alphaproteobacteria"]
La notion de tribus est conservée pour la famille des Rickettsiaceae.
La famille des Anaplasmataceae est prise en compte par le NCBI Taxonomy Browser et elle inclut le genre Aegyptianella qui n'était pas répertorié dans de précédentes versions
L'espèce Ehrlichia equi est considérée comme un synonyme ultérieur et hétérotypique de Anaplasma phagocytophilum.
Les genres Eperythrozoon et Haemobartonella sont exclus de l'ordre des Rickettsiales car ils appartiennent à la classe des Mollicutes.
Le genre Coxiella est exclu de l'ordre des Rickettsiales car il appartient à la subdivision gamma des Proteobacteria. Ce genre est en fait phylogénétiquement apparenté à la famille des Legionellaceae.
Le genre Rickettsiella est exclu de l'ordre des Rickettsiales car il appartient à la subdivision gamma des Proteobacteria et il est phylogénétiquement apparenté à la famille des Legionellaceae.
Le transfert de Rickettsia tsutsugamushi dans le nouveau genre Orientia, proposé par Tamura et al. en 1995, est pris en compte par le "NCBI Taxonomy Browser".
Famille des Anaplasmataceae
1) Genre Aegyptianella :
Aegyptianella pullorum.
2) Genre Anaplasma :
Anaplasma bovis, Anaplasma caudatum, Anaplasma centrale, Anaplasma marginale, Anaplasma ovis, Anaplasma platys.
Le genre Anaplasma comprend également le groupe phagocytophilum constitué de Anaplasma phagocytophilum et de quelques bactéries encore mal caractériées.
3) Genre Ehrlichia :
Ehrlichia canis, Ehrlichia chaffeensis, Ehrlichia ewingii, Ehrlichia muris, "Ehrlichia ovina", Ehrlichia ruminantium.
4) Genre Neorickettsia :
Neorickettsia helminthoeca, Neorickettsia risticii, Neorickettsia sennetsu.
Famille des Rickettsiaceae.
Tribu des Rickettsieae :
1) Genre Orientia :
Orientia tsutsugamushi.
2) Genre Rickettsia :
À la liste des espèces dont les noms sont validement publiés (Rickettsia aeschlimannii, Rickettsia africae, Rickettsia akari, Rickettsia australis, Rickettsia bellii, Rickettsia canadensis, Rickettsia conorii, Rickettsia felis, Rickettsia helvetica, Rickettsia honei, Rickettsia japonica, Rickettsia massiliae, Rickettsia montanensis, Rickettsia parkeri, Rickettsia peacockii, Rickettsia prowazekii, Rickettsia rhipicephali, Rickettsia rickettsii, Rickettsia sibirica, Rickettsia slovaca, Rickettsia typhi), le NCBI Taxonomy Browser ajoute plusieurs espèces dépourvues de statut dans la nomenclature ("Candidatus Rickettsia principis", "Rickettsia amblyommii", "Rickettsia andeana", "Rickettsia cooleyi", "Rickettsia heilongjiangensis", "Rickettsia heilongjiangii", "Rickettsia honei", "Rickettsia hulinensis", "Rickettsia hulinii", "Rickettsia marmionii", "Rickettsia martinet", "Rickettsia monacensis", "Rickettsia moreli" ...).
Tribu des Wolbachieae :
1) Genre Wolbachia :
Wolbachia pipientis, nombreuses espèces non validement publiées.
Wolbachia melophagi est placée dans la famille des Bartonellaceae et Wolbachia persica est placée dans la famille des "Francisellaceae".
Famille des "Holosporaceae"
1) Genre Holospora :
Holospora obtusa.
Les espèces Holospora caryophila, Holospora elegans et Holospora undulata ne sont pas citées dans la base de données.
Genres d'affiliation incertaines :
"Candidatus Pelagibacter", "Candidatus Hepatincola", "Candidatus Odycella", "Caedibacter".
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