J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 01 avril 2010
STAPHYLOCOCCUS MICROTI
Voir aussi le fichier ¤ Staphylococcaceae.
Le campagnol des champs (Microtus arvalis) provoque des ravages dans les cultures et il peut être un réservoir pour ¤ Leptospira interrogans, ¤ Francisella tularensis et Babesia microti. Depuis 1996, la population des campagnols du sud de la Moravie (République Tchèque) fait l'objet d'une surveillance afin de mieux comprendre la dynamique des populations. Dans les années 1999-2003, les campagnols ont été victimes d'une épidémie de brucellose à ¤ Brucella microti, conduisant à une forte mortalité.
Les examens bactériologiques, effectués sur deux campagnols adultes infectés par ¤ Brucella microti, ont permis d'isoler deux souches de coques à Gram positif.
L'analyse des séquences des ARNr 16S, des gènes rpoB et hsp60 montrent que ces deux souches constituent une unique espèce appartenant au genre Staphylococcus. Les espèces phylogénétiquement les plus proches sont Staphylococcus muscae (pourcentages de similitude respectifs de 99,3, 92,5 et 88,1), ¤ Staphylococcus intermedius, ¤ Staphylococcus pseudintermedius, ¤ Staphylococcus delphini, ¤ Staphylococcus lutrae, Staphylococcus schleiferi subsp. schleiferi, ¤ Staphylococcus chromogenes, ¤ Staphylococcus felis, ¤ Staphylococcus hyicus et ¤ Staphylococcus schleiferi subsp. coagulans. Toutes ces espèces appartiennent au groupe "Staphylococcus intermedius-Staphylococcus hyicus" tel qu'il est défini par Takahashi et al. Au sein de ce groupe, les deux souches isolées de campagnols forment, avec Staphylococcus muscae, le "sous-groupe Staphylococcus muscae".
L'électrophorèse des protéines cellulaires et l'analyse des fragments de restriction obtenus avec EcoRI et HindIII confirment les résultats précédents.
Un pourcentage de réassociation ADN-ADN de 26,8 est obtenue entre la souche CCM 4903 (qui sera désignée comme la souche type de Staphylococcus microti) et la souche type de Staphylococcus muscae.
Les caractères phénotypiques permettent une identification des deux souches isolées de campagnols ce qui conduit Nováková et al. à proposer une nouvelle espèce, Staphylococcus microti, dont la nomenclature a été validement publiée en mars 2010.
Les souches de Staphylococcus microti sont constituées de coques à Gram positif, se présentant de manière isolée ou groupés en amas irréguliers, catalase positive, oxydase négative et coagulase négative.
La plupart des caractères bactériologiques a été étudiée à l'aide de galeries API Staph, ID32 Staph et API ZYM.
. Une réponse positive est notée pour les tests réduction des nitrates, DNAse, hydrolyse de l'esculine, hydrolyse du Tween 80 bêta-galactosidase, lécithinase, phosphatase acide, phosphatase alcaline, arginine arylamidase, pyrrolidonyl arylamidase, acidification du D-fructose, de la N-acétylglucosamine, du D-glucose, du lactose, du saccharose, du tréhalose et du D-xylose.
. Les tests estérase lipase (C8), leucine arylamidase, VP et acidification du D-mannose donnent une réponse faiblement positive.
. Une réponse négative est obtenue avec les tests clumping factor, ADH, ODC, alpha-fucosidase, alpha-galactosidase, bêta-glucuronidase, alpha-glucosidase, bêta-glucosidase, N-acétyl-bêta-glucosaminidase, alpha-mannosidase, hydrolyse de l'urée, hydrolyse de la gélatine, hydrolyse de la caséine, estérase (C4), lipase (C14), cystine arylamidase, valine arylamidase, trypsine, chymotrypsine, naphthol-AS-BI- phosphohydrolase, acidification du L-arabinose, du cellobiose, du méthyle alpha-D-glucoside, du maltose, du D-mannitol, du mélibiose, du raffinose, du D-ribose, du turanose et du xylitol.
. Les principaux caractères permettant de différencier Staphylococcus microti des espèces phylogénétiquement les plus proches sont donnés dans le tableau ci-dessous.
| 1) S. chromogenes ; 2) S. delphini ; 3) S. felis ; 4) S. hyicus ; 5) S. intermedius; 6) S. lutrae ; 7) S. microti ; 8) S. muscae ; 9) S. pseudintermedius ; 10) S. schleiferi subsp. coagulans ;11) S. schleiferi subsp. schleiferi | |||||||||||
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | |
| Coagulase | – | + | – | d | + | + | – | – | + | + | – |
| Clumping factor | – | – | – | – | d | – | – | – | – | – | + |
| Oxydase | – | – | – | – | f | – | – | – | – | – | – |
| ADH | + | + | + | + | d | – | – | – | + | + | + |
| VP | – | – | – | – | – | – | f | – | + | + | + |
| Pyrrolidonyl arylamidase | – | + | + | – | + | – | + | – | + | d | + |
| Uréase | + | + | + | + | + | + | – | – | + | + | – |
| Esculine* | – | – | – | – | – | – | + | – | – | – | – |
| Tween 80* | – | – | – | + | + | – | + | + | + | – | + |
| Caséine* | + | + | + | + | d | + | – | – | – | f | – |
| Gélatine* | + | – | – | + | + | – | – | – | + | + | + |
| Lactose** | + | + | + | + | + | + | + | – | + | d | – |
| D-mannose** | + | + | + | + | + | + | f | – | + | + | + |
| D-mannitol** | f | f | d | – | + | d | – | – | f | d | – |
| Maltose** | f | + | – | – | – | + | – | – | + | – | – |
| Tréhalose** | + | – | + | + | + | + | + | + | + | – | d |
| Croissance à 45 °C | f | + | f | f | + | + | + | – | + | + | + |
* : Hydrolyse. ** : Acidification. + : Réponse positive. - : Réponse négative. d : Réponse positive pour 11 à 89 p. cent des souches. f : Réponse faiblement positive.
Une croissance est obtenue à 15, 37 et 45 °C ou en présence de 10 p. cent de NaCl. Aucune culture n'est observée en présence de 15 p. cent de NaCl.
Sur gélose P, les colonies sont circulaires, à contour régulier, lisses, blanchâtres, légèrement concaves et leur diamètre est compris entre 0,8 et 1,8 mm après 5 jours d'incubation (72 heures à 37 °C et 48 heures à température ambiante). À l'isolement, les colonies sont très petites et visibles seulement après trois jours d'incubation.
Sur une gélose Columbia au sang de mouton, une hémolyse delta est observée en synergie avec une souche bêta-hémolytique.
Les deux souches de Staphylococcus microti sont résistantes à la bacitracine (0.04 U) et au lysozyme (400 mg/L). En revanche, elles sont sensibles à la novobiocine (5 µg), au furazolidone (100 µg), à l'association amoxicilline-acide clavulanique (20/10 µg), à l'oxacilline (1 µg), à la tétracycline (30 µg), à l'association triméthoprime/sulfaméthoxazole (23.75/1.25 µg), à l'érythromycine (15 µg), à la clindamycine (2 µg), à la vancomycine (30 µg), à la ciprofloxacine (5 µg), à la gentamicine (10 µg), au chloramphénicol (30 µg), à la rifampicine (5 µg), à la teicoplanine (30 µg) et à la lysostaphine (50 mg/L).
Une souche de Staphylococcus microti a été isolée du foie et la deuxième souche a pour origine un rein. Les animaux étaient apparemment malades, ils présentaient des œdèmes des membres et des lésions des viscères (présence de granulomes, abcès, adénite des nœuds lymphatiques inguinaux). L'un des deux animaux présentait également une orchite.
Les campagnols étant également infectés par ¤ Brucella microti, il est difficile de se faire une opinion sur le pouvoir pathogène de Staphylococcus microti.
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