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Créé le 22 novembre 2004
STREPTOCOCCUS EQUI SUBSP. RUMINATORUM
Systématique
Voir aussi le fichier ¤ "Streptococcus equi, Streptococcus equi subsp. equi". Des examens bactériologiques, effectués sur des petits ruminants atteints de mammites, ont permis d'isoler six souches de coques à Gram positif, présentant les caractères généraux du genre Streptococcus, possédant l'antigène du groupe C de Lancefield, mais ne correspondant à aucune espèce connue.
Les séquences des ARNr 16S (environ 1000 nucléotides) des six souches présentent entre elles des pourcentages d'homologie compris entre 99,8 et 100. Une recherche effectuée sur les bases de données GenBank et Ribosomal Database Project permet de placer ces souches dans le genre Streptococcus.
En accord avec les conclusions de Stackebrandt et Goebel, de tels pourcentages d'homologie ne permettent pas de caractériser une nouvelle espèce ou une nouvelle sous-espèce et des hybridations ADN-ADN ont été effectuées. Les ADN de deux souches (les souches Mt 167 et Mt 159) présentent 100 p. cent d'homologie. Les pourcentages de réassociation obtenues avec les souches types de ¤ Streptococcus equi subsp. equi et de ¤ Streptococcus equi subsp. zooepidemicus sont respectivement de 82,4 et de 70,6. De tels résultats montrent que les souches Mt 167 et Mt 159 appartiennent à l'espèce ¤ Streptococcus equi (voir le fichier ¤ "Définitions d'une genomospecies et d'une espèce bactérienne").
En prenant en compte ces divers résultats, Fernández et al. proposent la création d'une nouvelle sous-espèce, Streptococcus equi subsp. ruminatorum (souche type Mt 167 = CCUG 47520 = CECT 5772), dont la nomenclature sera validement publiée le 15 novembre 2004.
Caractères bactériologiques
Streptococcus equi subsp. ruminatorum présente tous les caractères du genre Streptococcus. Cette sous-espèce rassemble des coques à Gram positif, non sporulés, immobiles, formant de courtes chaînes, aéro-anaérobies, catalase négative, possédant l'antigène du groupe C de Lancefield, n'hydrolysant pas l'esculine, donnant une réponse positive au test de CAMP*, ne cultivant ni à 10 ou à 45 °C, ni à pH 9,6 ni en présence de 6,5 p. cent de NaCl.
En utilisant une galerie API Rapid ID 32 Strep, les souches de Streptococcus equi subsp. ruminatorum donnent une réponse positive aux tests arginine di-hydrolase, bêta-glucuronidase, phosphatase alcaline, alanine-phénylalanine-proline arylamidase, hydrolyse de l'hippurate, acidification de la cyclodextrine, du maltose, du pullulane et du ribose.
Après 24 heures d'incubation à 37 °C, les colonies obtenues en aérobiose sont non pigmentées et légèrement muqueuses. Sur une gélose Columbia au sang de mouton, elles s'entourent d'une zone d'hémolyse bêta.
Habitat et pouvoir pathogène
Les six souches de Streptococcus equi subsp. ruminatorum ont été isolées, en culture pure, du lait de petits ruminants atteints de mammites. Deux souches ont été isolées de chèvres souffrant de mammites cliniques et quatre souches provenaient de brebis présentant des mammites sub-cliniques (score de 2 au California Mastitis Test).
Diagnostic bactériologique
Streptococcus equi subsp. ruminatorum est facilement isolé du lait après culture sur une gélose Columbia au sang de mouton.
Après avoir montré que le germe appartient au genre Streptococcus l’identification repose sur l’hémolyse de type bêta, sur la mise en évidence de l’antigène C et sur les caractères biochimiques présentés sur le tableau I et sur le tableau II.
Orientation bibliographique
CLARRIDGE III (J.E.): Impact of 16S rRNA gene sequence analysis for identification of bacteria on clinical microbiology and infectious diseases. Clin. Microbiol. Rev. 2004, 17, 840-862. FACKLAM (R.): What happened to the Streptococci: overview of taxonomic and nomenclature changes. Clin. Microbiol. Rev., 2002, 15, 613-630. FERNÁNDEZ (E.), BLUME (V.), GARRIDO (P.), COLLINS (M.D.), MATEOS (A.), DOMÍNGUEZ (L.) et FERNÁNDEZ-GARAYZÁBAL (J.F.) : Streptococcus equi subsp. ruminatorum subsp. nov., isolated from mastitis in small ruminants. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 2291-2296. FERNÁNDEZ-GARAYZÁBAL (J.F.) : Communication personnelle en date du 29 novembre 2004. LAS HERAS (A.), DOMINGUEZ (L.) et FERNÁNDEZ-GARAYZÁBAL (J.F.) : Prevalence and aetiology of subclinical mastitis in dairy ewes of Madrid region. Small Rumin. Res., 1999, 32, 21-29. MENZIES (P.I.) et RAMANOON (S.Z.) : Mastitis of sheep and goats. Vet. Clin. North Am. Food Anim. Pract., 2001, 17, 333-358. STACKEBRANDT (E.), FREDERIKSEN (W.), GARRITY (G.M.), GRIMONT (P.A.D.), KÄMPFER (P.), MAIDEN (M.C.J.), NESME (X.), ROSSELLO-MORA (R.), SWINGS (J.), TRÜPER (H.G.), VAUTERIN (L.), WARD (A.C.) et WHITMAN (W.B.) : Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 1043-1047. STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.
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* : Test de CAMP (Christie, Atkins, Munch-Petersen)
La réalisation du test de CAMP est simple : sur une gélose au sang de mouton on ensemence en strie une souche de Staphylococcus aureus subsp. aureus bêta hémolytique puis la souche à étudier est ensemencée selon une strie perpendiculaire réalisée sans toucher la strie de Staphylococcus aureus subsp. aureus.
Selon Fernández et al., ¤ Streptococcus agalactiae, ¤ Streptococcus canis, ¤ Streptococcus iniae, Streptococcus equi subsp. ruminatorum et ¤ Streptococcus porcinus sont les seuls streptocoques bêta hémolytique capables de donner une réponse positive au test de CAMP.
** : Acidification du sorbitol En utilisant des galeries API Rapid ID 32 Strep, deux souches sur six acidifient le sorbitol, toutefois une réponse positive est obtenue en utilisant une technique classique. Dans la publication de Fernández et al. l'acidification du sorbitol est un caractère noté négatif dans le tableau 1 et un caractère noté positif dans le "protologue" !
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