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Créé le 13 mars 2010
SERINIBACTER - SERINIBACTER SALMONEUS
Le genre Serinibacter et l'espèce Serinibacter salmoneus ont été proposés le 12 novembre 2009 pour une unique souche bactérienne (la souche Kis4-28), isolée de l'intestin d'un poisson. L'analyse de la séquence des ARNr 16S permet de placer la souche Kis4-28 au sein du sous-ordre des Micrococcineae. Les études chimiotaxonomiques montrent cependant que la souche Kis4-28 diffère nettement des espèces phylogénétiquement les plus proches (Salana multivorans et Beutenbergia cavernae).
Le genre Serinibacter est constitué de bacilles à Gram positif, de forme irrégulière, non sporulés, aéro-anaérobies, dépourvus d'acide mycolique. Comme pour les autres représentants de la classe des Actinobacteria, les critères chimiotaxonomiques jouent un rôle important dans la définition du genre. Le nom de Serinibacter est dû la présence de sérine dans la paroi.
L'espèce Serinibacter salmoneus rassemble des cellules immobiles, de 0,4 à 0,5 µm de diamètre sur 1,0 à 2,0 µm de longueur, catalase positive et oxydase négative. Une réponse positive (API ZYM, API Coryne, API 20E et API 50CH) est obtenue pour les tests hydrolyse de l'esculine, VP, estérase lipase (C8), leucine arylamidase, phosphatase acide, alpha-galactosidase, bêta-galactosidase, alpha-glucosidase, pyrazinamidase, pyrrolidonyl arylamidase, acidification de l'amidon, de la N-acétylglucosamine, du cellobiose, du D-fructose, du D-galactose, du gentiobiose, du D-glucose, du glycogène, du lactose, du maltose, du D-mannose, du méthyl alpha-D-glucopyranoside, du méthyl bêta-D-xylanopyranoside, du saccharose, du tréhalose et de D-xylose. Une réponse négative est notée pour les tests réduction des nitrates, ADH, LDC, ODC, TDA, indole, production d'hydrogène sulfuré, gélatinase, uréase, RM, phosphatase alcaline, lipase (C4), valine arylamidase, cystine arylamidase, trypsine, chymotrypsine, bêta-glucuronidase, N-acétyl-bêta-glucosaminidase, alpha-mannosidase et alpha-fucosidase.
Le germe cultive à des températures comprises entre 10 et 37 °C (température optimale de croissance de 28 °C) et à des pH compris entre 5 et 9 (pH optimum de 7). Une culture est obtenue pour des concentrations en NaCl variant de 0 à 10 p. cent (concentration optimale de 0 à 5 p. cent).
Serinibacter salmoneus a été isolé de l'intestin d'un pêche-madame japonais (Silago japonica) capturé au large de Kyonan (baie de Toyo, Japon). L'habitat et le pouvoir pathogène de cette espèce sont inconnus.
Orientation bibliographique
HAMADA (M.), IINO (T.), TAMURA (T.), IWAMI (T.), HARAYAMA (S.) et SUZUKI (K.) : Serinibacter salmoneus gen. nov., sp. nov., an actinobacterium isolated from the intestinal tract of a fish, and emended descriptions of the families Beutenbergiaceae and Bogoriellaceae. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2009, 59, 2809-2814.
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