J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire |
Créé le 20 mai 2005
SLACKIA
Autres dénominations :
. Slackia exigua : Eubacterium exiguum.
. Slackia heliotrinireducens : "Peptococcus heliotrinreducans" (sic), Peptococcus heliotrinreducens (sic), Peptostreptococcus heliotrinreducens (sic).
Le genre Slackia a été validement publié le 20 avril 1999 pour reclasser Eubacterium exiguum et Peptostreptococcus heliotrinreducens*. Ces deux espèces possèdent un G + C p. cent supérieur à 60 et l'étude des séquences des ARNr 16S montrent qu'elles appartiennent à la famille des Coriobacteriaceae. Au sein de cette famille, Eubacterium exiguum et Peptostreptococcus heliotrinreducens sont apparentés au genre Atopobium, mais les homologies de séquence obtenues entre les souches types de ces deux espèces et la souche type de Atopobium minutum (espèce type du genre Atopobium) sont inférieures à 91 p. cent.
Les homologies de séquence entre les souches types de Eubacterium exiguum et de Peptostreptococcus heliotrinreducens sont de 94,7 p. cent et elles constituent donc deux espèces distinctes pour lesquelles Wade et al. proposent les nomenclatures de Slackia exigua et de Slackia heliotrinireducens corrig.
En 2002, Greetham et al. publient les résultats d'une étude de la flore intestinale de quatre chiens de race Labrador et ces auteurs constatent que 29 p. cent des souches bactériennes isolées ne peuvent être identifiées.
En 2005, Lawson et al. soumettent à une analyse taxonomique la souche 5WC12, isolée de la flore fécale d'un Labrador mâle en apparente bonne santé.
Les analyses phylogénétiques montrent que la souche 5WC12 appartient à la famille des Coriobacteriaceae et qu'elle est apparentée aux espèces du genre Slackia. Toutefois les pourcentages d'homologie obtenus entre les séquences des ARNr 16S de la souche 5WC12 et les séquences des souches types de Slackia exigua et de Slackia heliotrinireducens sont inférieurs à 92. En accord avec les conclusions de Stackebrandt et Goebel, la souche isolée des fèces d'un Labrador constitue une nouvelle espèce.
Les caractères phénotypiques permettent d'identifier la souche 5WC12, si bien que le 10 mai 2005, Lawson et al. valident la publication de Slackia faecicanis.
Le genre Slackia regroupe des coques ou des cocco-bacilles ou de courts bacilles à Gram positif, immobiles, non sporulés, anaérobies, catalase négative, hydrolysant l'arginine, sensibles à la bile (caractère non étudié pour Slackia faecicanis), ne fermentant pas les sucres et donnant une réponse négative aux tests uréase, indole et hydrolyse de l'esculine. La valeur du G + C p. cent est comprise entre 60 et 64.
Quelques caractères permettant de différencier les espèces du genre Slackia sont donnés dans le tableau I.
Slackia exigua est fréquemment isolée chez l'homme de périodontites, d'infections pulpaires, d'infections péri-apicales et d'abcès dento-alvéolaires.
L'unique souche de Slackia faecicanis a pour origine les fèces d'un Labrador cliniquement sain. L'habitat de cette espèce pourrait être l'intestin du chien.
Slackia heliotrinireducens est isolée du rumen des ovins. Cette espèce métabolise les alcaloïdes pyrrolizidiniques et notamment l'héliotrine et la lasiocarpine. La présence de cette bactérie dans le rumen des ovins expliquerait que ces animaux soient peu sensibles aux intoxications consécutives à l'ingestion de plantes comme les séneçons, les héliotropes, les crotalaires... qui sont riches en alcaloïdes de type pyrrolizidine. Ces alcaloïdes ne sont pas en eux-mêmes toxiques, mais ils s'oxydent dans le foie et s'y transforment en pyrroles. Les pyrroles se fixent à l'ADN, ils inhibent la division cellulaire et ils provoquent des insuffisances hépatiques et des cancers.
Orientation bibliographique
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* : Peptostreptococcus heliotrinreducens
L'espèce Peptostreptococcus heliotrinreducens a été primitivement décrite sous le nom de "Peptococcus heliotrinreducans" (sic) par Lanigan en 1976. Cette nomenclature n'a pas été incluse dans les Approved Lists of Bacterial Names mais, le 15 avril 1983, elle sera citée dans la liste de validation n° 10 sous le nom de Peptococcus heliotrinreducens corrig. (sic). La correction de l'épithète spécifique a été effectuée par l'éditeur de la liste de validation. En 1986, Ezaki et Yabuuchi transfèrent cette espèce dans le genre Peptostreptococcus sous la forme d'une nouvelle combinaison, Peptostreptococcus heliotrinreducens (sic). Il fallut attendre la publication de Wade et al. pour qu'une épithète spécifique correcte (heliotrinireducens) soit enfin proposée.