J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

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Créé le 02 décembre 1999
Dernière mise à jour le 10 octobre 2002

 

Les taxons bactériens d'intérêt vétérinaire décrits en 1999

 

Au cours de l'année 1999, 424 modifications de nomenclature ont été validement publiées dans International Journal of Systematic Bacteriology (voir : Nomenclatural changes validly published in the 1999 issues of the IJSB). Sur le plan quantitatif, les modifications présentant un intérêt en médecine et/ou en biologie vétérinaires sont peu nombreuses (voir le tableau ci-dessous). En revanche, certains taxons, comme les nouveaux genres Chlamydophila, Coenonia ou Mannheimia, sont d'une très grande importance pour les vétérinaires.

. Les références des publications "valides" et "effectives" ainsi que les nomenclatures types ne sont pas données mais, elles peuvent être aisément trouvées en consultant List of Procaryotic Names with Standing in Nomenclature.
. L'étymologie des noms des taxons figure dans le fichier ¤ Étymologie des principaux noms de genres, d'espèces et de sous-espèces cités.

 

Nomenclatures proposées en 1999

Nomenclatures antérieures

Habitat et/ou pouvoir pathogène*

Abiotrophia balaenopterae Lawson et al. 1999, sp. nov.
Voir Abiotrophia.

 

Abiotrophia balaenopterae a été isolée d'un rorqual de Minke (Balaenoptera acutorostrata) retrouvé mort sur une plage.

Actinobacillus succinogenes Guettler et al. 1999, sp. nov.

 

L'unique souche de Actinobacillus succinogenes a été isolée du rumen d'un bovin et elle présente la particularité de produire de grandes quantités de succinate à partir du phosphoénol pyruvate.

Actinomyces bowdenii Pascual et al. 1999, sp. nov.

 

Actinomyces bowdenii est une espèce isolée de prélèvements cliniques effectués chez les carnivores domestiques.

Arthrobacter rhombi Osorio et al. 1999, sp. nov.

 

Arthrobacter rhombi est présent chez le flétan noir (Reinhardtius hippoglossoides).

Atopobium fossor (Bailey et Love 1986) Kageyama et al. 1999, comb. nov.

Eubacterium fossor Bailey et Love 1986.

Atopobium fossor est un constituant de la flore orale et pharyngée du cheval. Cette espèce est parfois associée à diverses suppurations.

Bartonella alsatica Heller et al. 1999, sp. nov.

 

Les souches de Bartonella alsatica ont été isolées du sang de lapins sauvages (Oryctolagus cuniculus) capturés en Alsace.

Brevibacterium avium Pascual et Collins 1999.
Voir Brevibacterium.

 

Les deux souches de Brevibacterium avium ont été isolées de granulomes du pied de la poule.

Burkholderia cocovenenans (van Damme et al. 1960) Gillis et al. 1995 pro synon. Burkholderia gladioli (Severini 1913) Yabuuchi et al. 1993.

 

Burkholderia gladioli est une bactérie phytopathogène parfois isolée de patients atteints de mucoviscidose. Les souches préalablement connues sous le nom de Burkholderia cocovenenans sont responsables de toxi-infections alimentaires.

"Candidatus Helicobacter bovis" De Groote et al. 1999.

 

"Candidatus Helicobacter bovis" est présent dans l'abomasum des bovins.

"Candidatus Helicobacter suis" De Groote et al. 1999.

 "Gastrospirillum suis".

"Candidatus Helicobacter suis" colonise l'estomac des porcs et sa présence est souvent corrélée à des lésions de gastrite et à des ulcères.

Carnobacterium inhibens Jöborn et al. 1999, sp. nov.
Voir Carnobacterium.

 

Carnobacterium inhibens est un hôte de la flore intestinale du saumon (Salmo salar). In vitro, cette bactérie inhibe la croissance de Vibrio anguillarum et de Aeromonas salmonicida. In vivo, Carnobacterium inhibens pourrait s'opposer à la colonisation du tube digestif par des bactéries pathogènes.

Chlamydia Jones et al. 1945 (Approved Lists 1980) emend. Everett et al. 1999.

 

Voir les indications données pour les différentes espèces.

Chlamydia muridarum Everett et al. 1999, sp. nov.
Voir Chlamydia.

 

Les deux souches de Chlamydia muridarum ont été isolées de la souris et du hamster. L'importance de cette espèce pour les élevages de rongeurs de laboratoire semble faible.

Chlamydia suis Everett et al. 1999, sp. nov.
Voir Chlamydia.

 

Chlamydia suis n'est isolée que chez le porc. Sa présence a été associée à des conjonctivites, des kératoconjonctivites, des rhinites purulentes, des entérites, des bronchopneumonies et des pneumonies.

Chlamydiaceae Rake 1957 (Approved Lists 1980) emend. Everett et al. 1999.

 

Voir Chlamydia et Chlamydophila.

Chlamydiales Storz et Page 1971 (Approved Lists 1980) emend. Everett et al. 1999.

 

Voir Chlamydiaceae et Waddliaceae.
D'autres souches de l'ordre des Chlamydiales sont isolées d'amibes (Parachlamydia acanthamoebae) et de cultures cellulaires (Simkania negevensis).

Chlamydophila Everett et al. 1999, gen. nov.

 

Voir les indications données pour les différentes espèces.

Chlamydophila abortus Everett et al. 1999, sp. nov.
Voir Chlamydophila.

Souches responsables d'avortement et préalablement incluses dans l'espèce Chlamydia psittaci (Lillie 1930) Page 1968 (Approved Lists 1980).

Chlamydophila abortus présente un tropisme pour le placenta des ruminants (bovins, caprins et ovins) et elle est responsable d'avortements et de mortalités néonatales.

Chlamydophila caviae Everett et al. 1999, sp. nov.
Voir Chlamydophila.

Souches responsables de conjonctivite du cobaye et préalablement incluses dans l'espèce Chlamydia psittaci (Lillie 1930) Page 1968 (Approved Lists 1980).

Chlamydophila caviae est une espèce colonisant l'épithélium de la conjonctive et, parfois, les épithéliums des voies génitales du cobaye.

Chlamydophila felis Everett et al. 1999, sp. nov.
Voir Chlamydophila.

Souches isolées du chat et préalablement incluses dans l'espèce Chlamydia psittaci (Lillie 1930) Page 1968 (Approved Lists 1980).

Chlamydophila felis est responsable de conjonctivites et de rhinites chez le chat.

Chlamydophila pecorum (Fukushi et Hirai 1992) Everett et al. 1999, comb. nov., emend.
Voir Chlamydophila.

Chlamydia pecorum Fukushi et Hirai 1992.

Chlamydophila pecorum n'a été isolée que chez les mammifères, notamment les ruminants mais aussi chez les porcs et chez les koalas (Phascolarctos cinereus). L'habitat de cette bactérie semble être l'intestin. Cette espèce est douée d'un pouvoir pathogène.

Chlamydophila pneumoniae (Grayston et al. 1989) Everett et al. 1999, comb. nov.
Voir Chlamydophila.

Chlamydia pneumoniae Grayston et al. 1989 (Approved Lists 1980).

Le biovar TWAR est isolé uniquement de l'homme.
L'unique souche du biovar Equin a été isolée de l'appareil respiratoire du cheval.
Les souches du biovar Koala ont été isolées de l'œil et de l'appareil génito-urinaire de diverses populations de koalas (Phascolarctos cinereus).

Chlamydophila psittaci (Lillie 1930) Everett et al. 1999, comb. nov., emend.
Voir Chlamydophila.

"Rickettsia psittaci" Lillie 1930, "Ehrlichia psittaci" (Lillie 1930) Moshkovski 1945, "Rickettsiaformis psittacosis" Zhdanov et Korenblit 1950, "Chlamydozoon psittaci" (Lillie 1930) Ryzhkov 1950, Chlamydia psittaci (Lillie 1930) Page 1968 (Approved Lists 1980).

Chlamydophila psittaci est responsable de la chlamydophilose (ornithose - psittacose) des oiseaux et de l'homme.

Coenonia Vandamme et al. 1999, gen. nov.

 

Voir Coenonia anatina.

Coenonia anatina Vandamme et al. 1999, sp. nov.

Riemerella anatipestifer-like taxon 1502.

Coenonia anatina a été isolée en culture pure de l'appareil respiratoire, du péricarde et du cerveau de canards et d'oies malades. Son pouvoir pathogène est comparable à celui de Riemerella anatipestifer

Eremococcus Collins et al. 1999, gen. nov.

 

Voir Eremococcus coleocola.

Eremococcus coleocola Collins et al. 1999, sp. nov.

 

L'habitat et le pouvoir pathogène de Eremococcus coleocola ne sont pas encore connus avec certitude. Les deux souches actuellement identifiées ont été isolées de l'appareil génital de la jument.

Gemella palaticanis Collins et al. 1999, sp. nov.
Voir Gemella.

 

L'unique souche de Gemella palaticanis a été isolée, en association avec une pasteurelle, d'une vésicule présente sur le palais d'un chien.

Haemophilus felis Inzana et al. 1999, sp. nov.

 

Haemophilus felis est isolé du naso-pharynx de chats sains et de chats présentant des infections respiratoires ou des infections oculaires ou des pharyngites.

Helcococcus ovis Collins et al. 1999, sp. nov.
Voir Helcococcus.

 

Les deux souches de Helcococcus ovis ont été isolées chez le mouton. L'habitat et le pouvoir pathogène de cette espèce sont inconnus.

Mannheimia Angen et al. 1999, gen. nov.

 

Voir les indications données pour les différentes espèces.

Mannheimia glucosida Angen et al. 1999, sp. nov.
Voir Mannheimia.

Voir : ¤.

Mannheimia glucosida est un hôte de la flore respiratoires des ovins.

Mannheimia granulomatis (Ribeiro et al. 1990) Angen et al. 1999, comb. nov.
Voir Mannheimia.

Pasteurella granulomatis Ribeiro et al. 1990.
Voir aussi : ¤.

Mannheimia granulomatis est responsable de la "lechiguana" des bovins ainsi que de broncho-pneumonies ou de conjonctivites chez les lapins et les lièvres. D'autres souches sont isolées de la bouche des bovins.

Mannheimia haemolytica (Newsom et Cross 1932) Angen et al. 1999, comb. nov.
Voir Mannheimia.

Pasteurella haemolytica Newsom et Cross 1932 (Approved Lists 1980).
Voir aussi : ¤.

Mannheimia haemolytica est isolée des bovins et des ovins et certains sérovars sont certainement des hôtes normaux des voies respiratoires. Chez les bovins, Mannheimia haemolytica est responsable de pneumonies. Chez les petits ruminants, elle est responsable de pneumonies, de mammites et de septicémies.

Mannheimia ruminalis Angen et al. 1999, sp. nov.
Voir Mannheimia.

Voir : ¤.

Mannheimia ruminalis est non pathogène. Cette espèce est isolée du rumen des ovins et des bovins.

Mannheimia varigena Angen et al. 1999, sp. nov.
Voir Mannheimia.

Voir : ¤.

Chez le porc, Mannheimia varigena est associée à diverses infections mais, elle peut également être isolée de la bouche et des voies respiratoires supérieures.
Chez les bovins, Mannheimia varigena peut être à l'origine d'infections mais elle est également isolée de la cavité orale, du rumen et de l'intestin.
Une souche a été isolée chez un homme mordu par un porc.

Mycobacterium tuberculosis subsp. caprae Aranaz et al. 1999, subsp. nov.

 

Mycobacterium tuberculosis subsp. caprae est responsable de tuberculose chez la chèvre. Deux souches ont été isolées d'un porc et d'un mouton et trois souches ont été isolées de l'homme.

Mycobacterium tuberculosis subsp. tuberculosis (Zopf 1883) Lehmann et Neumann 1896, subsp. nov.

 

L'habitat et le pouvoir pathogène de Mycobacterium tuberculosis subsp. tuberculosis sont ceux de Mycobacterium tuberculosis.

Nocardia salmonicida (ex Rucker 1949) Isik et al. 1999, sp. nov., nom. rev.
Voir Nocardia.

"Streptomyces salmonicida" Rucker 1949, "Nocardia salmonicida" (Rucker 1949) Pridham 1970.

Nocardia salmonicida pourrait être pathogène pour les poissons d'élevage.

Paenibacillus lentimorbus (Dutky 1940) Pettersson et al. 1999, comb. nov., emend.
Voir Paenibacillus.

Bacillus lentimorbus Dutky 1940 (Approved Lists 1980).

Paenibacillus lentimorbus est pathogène pour les larves des Scarabeidae.

Paenibacillus popilliae (Dutky 1940) Pettersson et al. 1999, comb. nov., emend.
Voir Paenibacillus.

Bacillus popilliae Dutky 1940 (Approved Lists 1980).

Paenibacillus popilliae est pathogène pour les larves des Scarabeidae. Aux États Unis, cette espèce est utilisée dans la lutte contre les larves de Popillia japonica (hanneton nuisible aux prairies).

Riemerella Segers et al. 1993 emend. Vancanneyt et al. 1999.

 

Les Riemerella sp. sont principalement isolées d'oiseaux malades et parfois du porc. Chez les oiseaux, ces bactéries provoquent des infections respiratoires et des septicémies.

Riemerella columbina Vancanneyt et al. 1999, sp. nov.

Riemerella anatipestifer-like.

Riemerella columbina est isolée des sacs aériens, des poumons, de la fente palatine, de la trachée ou du cerveau de pigeons souffrant d'aérosacculite, de pneumonie ou d'hépatite.

Streptococcus intestinalis Robinson et al. 1988 pro synon. Streptococcus alactolyticus Farrow et al. 1985.

 

Streptococcus alactolyticus a pour habitat l'intestin des porcs et des volailles. Cette bactérie semble non pathogène.

Streptococcus pluranimalium Devriese et al. 1999, sp. nov.

 

Streptococcus pluranimalium est isolé de plusieurs espèces animales et de divers tissus mais, son pouvoir pathogène est incertain.

Treponema brennaborense Schrank et al. 1999, sp. nov.

 

Treponema brennaborense est l'une des bactéries présentes dans les lésions de dermite digitée des bovins.

Vagococcus lutrae Lawson et al. 1999, sp. nov.
Voir Vagococcus.

 

L'unique souche de Vagococcus lutrae a été isolée d'une loutre (Lutra lutra) victime d'un accident de la route. L'habitat et le pouvoir pathogène de cette espèce sont inconnus.

Waddlia Rurangirwa et al. 1999, gen. nov.

 

Voir Waddlia chondrophila.

Waddlia chondrophila Rurangirwa et al. 1999, sp. nov.

 

L'habitat et le pouvoir pathogène de Waddlia chondrophila sont très mal connus. L'unique souche a été isolée d'un avorton de bovin.

Waddliaceae Rurangirwa et al. 1999, fam. nov.

 

Voir Waddlia chondrophila.

 

* : pour de plus amples informations, se reporter aux différents fichiers.

comb. nov. : combinatio nova
emend. : emendavit
gen. nov. : genus novum
fam. nov. : familia nova
nom. rev. : nomen revictum
pro synon. : pro synonymon
sp. nov. : species nova
subsp. nov. : subspecies nova

 

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