J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Nomenclatures proposées en 2002

Nomenclatures antérieures

Habitat et/ou pouvoir pathogène, commentaires

Actinobacillus arthritidis Christensen et al. 2002, sp. nov.

Taxon 9 de Bisgaard.

Actinobacillus arthritidis est un commensal de la cavité buccale des chevaux. Le pouvoir pathogène de cette espèce pourrait être comparable à celui de Actinobacillus equuli et il n'est pas exclu que certains souches baptisées Actinobacillus equuli soient en fait des souches de Actinobacillus arthritidis.

Actinobacillus equuli subsp. equuli (van Straaten 1918) Haupt 1934, subsp. nov.

Actinobacillus equuli subsp. equuli est pathogène pour le cheval et le porc et notamment pour les jeunes animaux. Chez le poulain, l'infection est connue sous le nom d'actinobacillose ou de shigellose.

Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus Christensen et al. 2002, subsp. nov.

Taxon 11 de Bisgaard.

Actinobacillus equuli subsp. haemolyticus n'est isolé que chez les équidés et cette bactérie est responsable d'infections diverses chez les poulains et les adultes.

Actinobacillus genomospecies 1 Christensen et al. 2002.

La majorité des souches d'origine équine, décrites sous la nomenclature de Actinobacillus lignieresii, sont en fait des souches de Actinobacillus genomospecies 1. Cette genomospecies est un commensal de la muqueuse buccale et de la muqueuse pharyngée. Son pouvoir pathogène est encore incertain.

Actinobacillus genomospecies 2 Christensen et al. 2002.

Actinobacillus genomospecies 2 est un commensal de la cavité buccale des chevaux. Le pouvoir pathogène de cette genomospecies pourrait être comparable à celui de Actinobacillus equuli.

Actinomyces coleocanis Hoyles et al. 2002, sp. nov.

L'unique souche de Actinomyces coleocanis a été isolée, en association avec "Corynebacterium genitalium", d'un prélèvement vaginal effectué chez un cocker spaniel. Aucune indication concernant l'état de santé de l'animal n'est donnée dans la publication de Hoyles et al. 2002.

Aeromonas culicicola Pidiyar et al. 2002, sp. nov.

L'habitat de Aeromonas culicicola n'est pas connu avec certitude. Cette espèce est la première du genre Aeromonas découverte dans l'intestin moyen des moustiques. Aucun pouvoir pathogène pour l'homme ou pour les animaux n'a été recherché ou mis en évidence.

Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila (Chester 1901) Stanier 1943 (Approved Lists 1980) emend. Huys et al. 2002.
Voir le fichier Aeromonas hydrophila.

La description de Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila a dû être modifiée après la description de Aeromonas hydrophila subsp. dhakensis.
Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila provoque des infections chez les ectothermes, les endothermes et l'homme.

Aeromonas hydrophila subsp. dhakensis Huys et al. 2002, subsp. nov.
Voir le fichier Aeromonas hydrophila.

Aeromonas hydrophila subsp. dhakensis a été isolée, au Bangladesh, des selles d'enfants et une souche provient du milieu extérieur.

Afipia Brenner et al. 1992 emend. La Scola et al. 2002.

La description du genre Afipia a dû être modifiée après la description de Afipia birgiae, de Afipia massiliensis, de Afipia felis genomospecies A et de Afipia genomospecies 3-related.

Afipia birgiae La Scola et al. 2002, sp. nov.
Voir le fichier Afipia.

L'unique souche de Afipia birgiae a été isolée de l'eau, mais La Scola et al. n'excluent pas l'existence d'un éventuel pouvoir pathogène (possibilité d'infections nosocomiales).

Afipia felis genomospecies A La Scola et al. 2002.
Voir le fichier Afipia.

L'unique souche de Afipia felis genomospecies A a été isolée de l'eau, mais La Scola et al. n'excluent pas l'existence d'un éventuel pouvoir pathogène (possibilité d'infections nosocomiales).

Afipia genomospecies 3-related La Scola et al. 2002.
Voir le fichier Afipia.

Les deux souches de Afipia genomospecies 3-related ont été isolées de l'eau, mais La Scola et al. n'excluent pas l'existence d'un éventuel pouvoir pathogène (possibilité d'infections nosocomiales).

Afipia massiliensis La Scola et al. 2002, sp. nov.
Voir le fichier Afipia.

L'unique souche de Afipia massiliensis a été isolée de l'eau, mais La Scola et al. n'excluent pas l'existence d'un éventuel pouvoir pathogène (possibilité d'infections nosocomiales).

Anaplasma phagocytophilum (Foggie 1949) Dumler et al. 2001 corrig. List Editor (IJSEM) 2002.

Anaplasma phagocytophila (sic) (Foggie 1949) Dumler et al. 2001, Ehrlichia phagocytophila (Foggie 1949) Philip 1962 (Approved Lists 1980).

La nomenclature de Anaplasma phagocytophilum remplace celle de Anaplasma phagocytophila qui était incorrecte.

Arcanobacterium hippocoleae Hoyles et al. 2002, sp. nov.

L'unique souche de Arcanobacterium hippocoleae a été isolée du vagin d'une jument âgée de 3 ans et présentant une vaginite. Le pouvoir pathogène de cette espèce est encore incertain

Arthrobacter nasiphocae Collins et al. 2002, sp. nov.

Arthrobacter nasiphocae a été isolé d'écouvillonnages nasaux effectués chez deux phoques (Phoca vitulina). Le pouvoir pathogène de cette espèce est inconnu.

Bartonella bovis Bermond et al. 2002 non Donatien et Lestoquard 1934, sp. nov.

Bartonella bovis Bermond et al. 2002 est une espèce différente du taxon "Bartonella bovis" décrit en 1934 par Donatien et Lestoquard.

Les souches de "Bartonella weissi" (sic) Marano et al. 1999 ou de "Bartonella weissii" Regnery et al. 2000 appartiennent à l'espèce Bartonella bovis Bermond et al. 2002.

Bartonella bovis est isolée du sang des bovins et cette bactérie peut se transmettre au chat.
Aucun pouvoir pathogène n'a pu être attribué à Bartonella bovis et aucune souche de cette espèce n'a été isolée chez l'homme.

Bartonella capreoli Bermond et al. 2002, sp. nov.

Bartonella capreoli a été isolée du sang de chevreuils (Capreolus capreolus) capturés dans la forêt de Chizé. Son pouvoir pathogène est inconnu.

Bifidobacterium suis Matteuzzi et al. 1971 (Approved Lists 1980) pro synon. Bifidobacterium longum Reuter 1963 (Approved Lists 1980).

Les souches de Bifidobacterium suis constituent en fait un biovar de Bifidobacterium longum. Bifidobacterium longum biovar Suis est isolé des fèces de porcs.

Brackiella Willems et al. 2002, gen. nov.

Voir Brackiella oedipodis.

Brackiella oedipodis Willems et al. 2002, sp. nov.

L'unique souche de Brackiella oedipodis, seule espèce du genre Brackiella, a été isolée d'un tamarin de Geoffroy (Saguinus oedipus) présentant une endocardite.

"Candidatus Mycoplasma haemodidelphidis" Messick et al. 2002.

"Candidatus Mycoplasma haemodidelphis" est à l'origine d'anémies sévères chez l'opossum (Didelphis virginiana).

"Candidatus Mycoplasma haemolamae" Messick et al. 2002.

"Candidatus Mycoplasma haemolamae" infecte les alpagas (Lama pacos). Les animaux présentent des retards de croissance, une perte de poids et une anémie.

Carnobacterium viridans Holley et al. 2002.
Voir le fichier Carnobacterium.

Carnobacterium viridans est responsable du verdissement, observé après ouverture des emballages, de sauces bolonaises emballées sous vide.

Clostridium lactatifermentans van der Wielen et al. 2002, sp. nov.

Clostridium lactatifermentans est isolé des caecums des poulets. Cette espèce pourrait avoir un rôle bénéfique en réduisant la colonisation des caecums par des entérobactéries.

Crossiella equi Donahue et al. 2002, sp. nov.

Crossiella equi est à l'origine de placentites chez la jument. Cette infection, connue sous le nom de "equine nocardioform placentitis" ("placentite équine à bactéries nocardioformes"), n'a été identifiée que dans le Kentucky.

Enterovibrio Thompson et al. 2002, gen. nov.

Voir Enterovibrio norvegicus.

Enterovibrio norvegicus Thompson et al. 2002, sp. nov.

Enterovibrio norvegicus, unique espèce du genre Enterovibrio, est isolé de l'intestin de larves saines de turbots (Scophthalmus maximus). Cette espèce est dépourvue de pouvoir pathogène et elle pourrait même s'opposer à la colonisation de l'intestin par des bactéries pathogènes.

Faecalibacterium Duncan et al. 2002, gen. nov.

Voir Faecalibacterium prausnitzii.

Faecalibacterium prausnitzii (Hauduroy et al. 1937) Duncan et al. 2002, comb. nov.

Fusobacterium prausnitzii (Hauduroy et al. 1937) Moore et Holdeman 1970 (Approved Lists 1980).

Faecalibacterium prausnitzii, unique espèce du genre Faecalibacterium, est l'une des bactéries les plus abondantes dans la flore fécale de l'homme, dans la flore caecale des poulets et dans le tube digestif du rat, de la souris, du chat, du chien, du singe et du lapin.

Flavobacteriaceae Reichenbach et al. 1992 emend. Bernardet et al. 2002.

La modification de la description de la famille des Flavobacteriaceae a été rendue nécessaire par l'inclusion de nouveaux genres au sein de cette famille.

Haemobartonella Tyzzer and Weinman 1939 (Approved Lists 1980) pro synon. Mycoplasma Nowak 1929.

L'espèce type du genre Haemobartonella, Haemobartonella muris, a été transférée dans le genre Mycoplasma. En accord avec la règle 37a du Code de Nomenclature, un bactériologiste approuvant ce transfert doit considérer que toutes les espèces du genre Haemobartonella sont des espèces du genre Mycoplasma.

Halomonas halocynthiae Romanenko et al. 2002, sp. nov.
Voir le fichier Halomonas.

L'unique souche de Halomonas halocynthiae a été isolée des branchies d'une ascidie (Halocynthia aurantium) récoltée à trois mètres de profondeur dans la mer du Japon ou mer de l'Est, près des côtes de la Russie.

Helicobacter aurati Patterson et al. 2002, sp. nov.

Les souches de Helicobacter aurati sont isolées de l'estomac et des caecums de hamsters cliniquement sains mais des lésions de gastrite chronique sont souvent associées à la présence du germe.

Helicobacter canadensis Fox et al. 2002, sp. nov.

Helicobacter canadensis est phylogénétiquement proche de Helicobacter pullorum et ces deux espèces ont des caractères phénotypiques voisins. Helicobacter canadensis n'a pas été identifié chez les animaux, mais, compte tenu des difficultés à différencier cette espèce de Helicobacter pullorum, elle ne peut être ignorée des vétérinaires. De plus, il n'est pas exclu que cette espèce soit l'agent d'une zoonose.

Helicobacter nemestrinae Brondson et al. 1991 pro synon. Helicobacter pylori (Marshall et al. 1985) Goodwin et al. 1989

L'unique souche de Helicobacter nemestrinae, isolée de la muqueuse gastrique d'un macaque sain (Macaca nemestrina), est en fait une souche de Helicobacter pylori.

Helicobacter typhlonius Franklin et al. 2002, sp. nov.

"Helicobacter typhlonicus" Franklin et al. 1999.

Les souches de Helicobacter typhlonius sont isolées des fèces de souris. L'inoculation expérimentale à des souris immunodéficientes induit le développement de lésions inflammatoires du gros intestin. En revanche, l'infection de souris immunocompétentes ne conduit qu'à une synthèse d'IgG.

Isobaculum Collins et al. 2002, gen. nov.

Voir Isobaculum melis

Isobaculum melis Collins et al. 2002, sp. nov.

L'unique souche de Isobaculum melis a été isolée de l'intestin d'un blaireau (Melis melis) victime d'un accident de la route.

Lactobacillus equi Morotomi et al. 2002, sp. nov.

Lactobacillus equi est un germe de la flore intestinale du cheval.

Lactobacillus pantheris Liu et Dong 2002, sp. nov.

Lactobacillus pantheris a été isolé de l'intestin de jaguars (Panthera onca) élevés en captivité au zoo de Beijing (République Populaire de Chine).

Mitsuokella jalaludinii Lan et al. 2002, sp. nov.
Voir le fichier Mitsuokella.

Mitsuokella jalaludinii, isolée du rumen des bovins, produit une phytase capable d'hydrolyser l'acide myo-inositol hexaphosphorique.

Mycobacterium bovis subsp. bovis Karlson and Lessel 1970, subsp. nov.

La sous-espèce Mycobacterium bovis subsp. bovis est automatiquement créée par la description de Mycobacterium bovis subsp. caprae. L'habitat et le pouvoir pathogène de Mycobacterium bovis subsp. bovis sont identiques à ceux préalablement décrits pour Mycobacterium bovis.

Mycobacterium bovis subsp. caprae (Aranaz et al. 1999) Niemann et al. 2002, comb. nov.

Mycobacterium tuberculosis subsp. caprae Aranaz et al. 1999.

L'habitat et le pouvoir pathogène de Mycobacterium bovis subsp. caprae sont comparables à ceux de Mycobacterium tuberculosis subsp. caprae.

Mycobacterium palustre Torkko et al. 2002, sp. nov.

Les souches de Mycobacterium palustre ont pour origine des prélèvements d'eau, des crachats, le nœud lymphatique d'un enfant et des nœuds lymphatiques sous-mandibulaires de porcs.

Mycoplasma haemocanis (Kreier et Ristic 1984) Messick et al. 2002, nom. nov.

Haemobartonella canis (ex Kikuth 1928) Kreier et Ristic 1984.

Les données concernant Mycoplasma haemocanis sont peu nombreuses et le pouvoir pathogène de cette espèce semble faible.

Mycoplasma haemofelis (Kreier et Ristic 1984) Neimark et al. 2002, nom. nov.

Haemobartonella felis (ex Clark 1942) Kreier et Ristic 1984, "Candidatus Mycoplasma haemofelis" Neimark et al. 2001.

Mycoplasma haemofelis est l'agent de l'anémie infectieuse féline.

Mycoplasma haemomuris (Mayer 1921) Neimark et al. 2002, nom. nov.

Haemobartonella muris (Mayer 1921) Tyzzer et Weinman 1939 (Approved Lists 1980), "Candidatus Mycoplasma haemomuris" Neimark et al. 2001.

Mycoplasma haemomuris infecte principalement les souris sauvages et les souris de laboratoire. L'inoculation par voie intrapéritonéale à des souris BALB/c conduit à une infection cliniquement exprimée.

Mycoplasma suis corrig. (Splitter 1950) Neimark et al. 2002, comb. nov.

Eperythrozoon suis Splitter 1950 (Approved Lists 1980), "Candidatus Mycoplasma haemosuis" Neimark et al. 2001, Mycoplasma haemosuis (sic) (Splitter 1950) Neimark et al. 2002.

La nomenclature de "Candidatus Mycoplasma haemosuis", proposée par Neimark et al. en 2001, n'était pas admissible. Aussi, en 2002, Neimark et al. proposent la création d'un nomen novum, Mycoplasma haemosuis (sic).
Mycoplasma haemosuis (sic) (Splitter 1950) Neimark et al. 2002, nom. nov. est illégitime et ce nom a été corrigé en Mycoplasma suis Neimark et al. 2002, comb. nov.

Mycoplasma wenyonii (Adler et Ellenbogen 1934) Neimark et al. 2002, comb. nov.

Eperythrozoon wenyonii Adler et Ellenbogen 1934 (Approved Lists 1980), "Candidatus Mycoplasma wenyonii" Neimark et al. 2001.

Mycoplasma wenyonii est responsable d'infections généralement inapparentes chez les bovins adultes et d'anémies chez les jeunes bovins, chez les bovins affaiblis ou splénectomisés.

Pasteurella skyensis Birkbeck et al. 2002, sp. nov.

Pasteurella skyensis provoque des infections, parfois mortelles, dans les élevages écossais de saumons de l'Atlantique (Salmo salar).

Propionibacterium australiense Bernard et al. 2002, sp. nov.

Propionibacterium australiense semble responsable de la formation d'abcès chez les bovins.

Pseudoalteromonas Gauthier et al. 1995 emend. Ivanova et al. 2002.

La définition du genre Pseudoalteromonas a dû être modifiée à la suite de la description de Pseudoalteromonas translucida (espèce dépourvue d'intérêt en médecine vétérinaire) et de Pseudoalteromonas paragorgicola.

Pseudoalteromonas maricaloris Ivanova et al. 2002, sp. nov.
Voir le fichier Pseudoalteromonas.

Pseudoalteromonas maricaloris a été isolée d'une éponge (Fascaplysinopsis reticulata) prélevée à 10 mètres de profondeur dans la mer de Corail (à proximité de l'île Lizzard).

Pseudoalteromonas paragorgicola Ivanova et al. 2002, sp. nov.
Voir le fichier Pseudoalteromonas.

Pseudoalteromonas paragorgicola a été isolée d'un corail (Paragorgia arborea) récolté à 202 mètres de profondeur au large de l'île Onekotan.

Pseudoalteromonas ruthenica Ivanova et al. 2002, sp. nov.
Voir le fichier Pseudoalteromonas.

Pseudoalteromonas ruthenica a été isolée de mollusques (Crenomytilus grayanus et Patinopecten yessoensis) de la mer du Japon ou mer de l'Est.

Psychrobacter faecalis Kämpfer et al. 2002, sp. nov.

L'unique souche de Psychrobacter faecalis a été isolée d'un aérosol engendré par la manipulation de fèces de pigeons.

Rickettsia felis Bouyer et al. 2001 emend. La Scola et al. 2002.

La description de Rickettsia felis a été modifiée suite à la description de la souche Marseille-URRWFXCal₂.

Streptococcus bovis Orla-Jensen 1919 (Approved Lists 1980) pro synon. Streptococcus equinus Andrewes and Horder 1906(Approved Lists 1980).

Streptococcus equinus est un synonyme antérieur de Streptococcus bovis. Cette synonymie est connue depuis 1984 mais il a fallu attendre 2002 pour qu'elle soit officiellement proposée.

Streptococcus entericus Vela et al. 2002, sp. nov.

Les deux souches de Streptococcus entericus ont été isolées d'un veau atteint de diarrhée.

Streptococcus gallinaceus Collins et al. 2002, sp. nov.

Les souches de Streptococcus gallinaceus sont isolées de poulets de chair reproducteurs atteints de septicémie.

Streptococcus pasteurianus Poyart et al. 2002, sp. nov.

Streptococcus pasteurianus est isolé de divers prélèvements d'origine humaine et des souches de Streptococcus pasteurianus, préalablement qualifiées de Streptococcus bovis biovar II.2, sont isolées de cas de septicémies chez les canards et les dindes.

Teredinibacter Distel et al. 2002, gen. nov.

Voir Teredinibacter turnerae.

Teredinibacter turnerae Distel et al. 2002, sp. nov.

Teredinibacter turnerae vit en symbiose avec les tarets (mollusques bivalves, de la famille des Teredinidae) et cette bactérie permet aux tarets de métaboliser la cellulose.

Vibrio shilonii corrig. Kushmaro et al. 2001 pro synon. Vibrio mediterranei Pujalte et Garay 1986.

L'inclusion des souches de Vibrio shilonii au sein de l'espèce Vibrio mediterranei confère à cette espèce un pouvoir pathogène pour les coraux de l'espèce Oculina patagonica.

Vibrio trachuri Iwamoto et al. 1996 pro synon. Vibrio harveyi (Johnson and Shunk 1936) Baumann et al. 1981

Vibrio trachuri, espèce pathogène pour le chinchard du Japon (Trachurus japonicus), est en fait un synonyme ultérieur de Vibrio harveyi.

Weissella cibaria Björkroth et al. 2002, sp. nov.
Voir le fichier Weissella.

Des souches de Weissella cibaria sont parfois isolées de prélèvements réalisés chez l'homme, chez le chien et chez le canari, mais cette espèce semble dépourvue de pouvoir pathogène.